Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16715 LG4 27878423 27882575 PREDICTED: TMV resistance protein N-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 27878730 missense_variant p.Gln103Leu
G/T 27878746 missense_variant p.Leu108Phe
A/C 27878936 intron_variant
T/A 27880196 intron_variant
T/G 27880539 missense_variant p.Tyr516Asp
A/G 27880543 missense_variant p.Lys517Arg
C/A 27880686 intron_variant
T/G 27880690 splice_region_variant&intron_variant
C/T 27880710 missense_variant p.Thr527Met
A/T 27880819 missense_variant p.Arg563Ser
C/A 27880887 missense_variant p.Ala586Glu
T/C 27880896 missense_variant p.Leu589Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16715.1
MAQKQAPSSASFMSKYSYDVFLSFRGADTRFGFTGNLYSALSQRGIFTFIDDEALRKGEEITPSLRKAIQESMISIIVFSKNYAFSAFCLDELLHIIECHKNQNMWILPVFYDVEPSQVRHQTGSYQEAFAKHGERFKHDIQKLQQWSLALRHAADLAGFPFKTGNKEYESEIVKKITEEISTKLNRPPLHIADYPVGLKVRMQQIQELMGGEFDKKVTMLGIHGMGGIGKSTLSRAMYNLMAHQFEASHFLANVREKSDKDGLVHIQETMLSELVGERNIKLGDVHRGIPILQHRLCGKKVLLVLDDISKKEQLHATAGGLDWFGPGSIIIITTRDKHLLDVHGVQKQYMVGGINFMEALELFKWNAFKSKEVDPCYKEVTERAMYYANGLPLALETIGSNLFGKTLDEWESAMWFYEDVVCVLEKNMENDKIEAVMLEMPEHQEEMQCTPKFGKMKSLRMLIIEKKVSFLGSPATLPNSLRVLEWRGYPATSLPSNFHFKNLVILNLSHSYFGWYKPLQACCKNIRRIPDISGFPNLTKLCVRECTNLFEIHDSVGSLLHLKEFCAEGCTKLTIGPSRIKLISLEHLCFRGCSSLVMFPEVLAPMHKLKYVDLGGTGIRNLPPSMQNLKDITILPASIEECHSLKFLHVTNCKKLQEIRGLPLNINQFYAANCSVKANSLILKLRQAIDCGAMGICVLPGRKIPELFDHSSRGNSVSFWFRKELPTLAVCAIIGVWDNVKPPFVAFFSMEDVRFEDPYDLNKASTMENKLVLLGEASDTQQQAQSSALFNLTTSLESLIGEQPLNYEYNNSYSKESASTVDSNNQGVLVDDQPILAPSSAETQNAEAKREMAQLISEVSSEFTAQVSMKIESTASQSPKVDEVEAGLETQNQFRNTMVLENQIHQRLTRIKKMKEELGEKFSAIKADISAIEANNSSIKANISDIKAIFLQIDQRYNN*


CDS Sequence:
>Vu_16715.1
ATGGCTCAAAAACAAGCACCTTCTTCTGCTTCTTTTATGTCAAAATACAGTTATGATGTTTTTCTTAGTTTTCGTGGTGCAGATACACGTTTTGGTTTCACTGGTAATCTTTACAGTGCTTTGAGTCAAAGAGGAATCTTTACCTTCATCGACGACGAAGCTCTCAGAAAGGGAGAAGAGATCACACCTTCTCTTCGCAAGGCAATCCAAGAATCCATGATATCCATCATCGTTTTCTCCAAAAACTATGCTTTCTCAGCATTTTGTTTGGACGAACTTCTCCATATCATTGAGTGCCACAAAAATCAGAACATGTGGATTTTGCCAGTGTTTTATGACGTAGAGCCATCACAAGTGCGACATCAAACAGGGAGTTACCAAGAAGCATTTGCAAAGCATGGTGAAAGATTCAAACATGACATTCAGAAGCTTCAACAATGGAGTCTGGCTTTGCGTCATGCTGCCGATTTGGCTGGTTTTCCTTTCAAAACTGGTAATAAAGAGTATGAGTCTGAGATAGTGAAAAAGATCACAGAAGAGATCTCCACTAAGCTTAATCGACCTCCCTTGCATATTGCTGATTATCCTGTTGGTTTGAAAGTTCGGATGCAACAGATACAAGAACTAATGGGTGGTGAGTTTGATAAGAAAGTGACTATGCTTGGGATTCATGGAATGGGAGGAATAGGAAAATCAACTCTTTCACGTGCGATGTACAACTTGATGGCACATCAATTTGAAGCTTCGCACTTTCTTGCTAATGTAAGGGAAAAATCAGATAAGGATGGTCTGGTGCATATCCAAGAGACAATGCTGTCTGAGTTGGTGGGGGAAAGAAATATCAAGTTAGGAGATGTGCATCGTGGAATTCCAATACTACAACACAGACTTTGTGGGAAAAAGGTCCTCCTTGTGCTTGATGATATTAGCAAAAAAGAACAATTGCATGCAACTGCTGGAGGACTTGATTGGTTTGGCCCTGGTAGCATCATCATCATAACAACAAGGGATAAGCATTTGTTAGATGTTCATGGAGTTCAAAAACAGTACATGGTTGGTGGAATTAACTTTATGGAAGCCCTTGAATTGTTTAAGTGGAATGCTTTCAAAAGCAAAGAAGTTGATCCATGTTACAAGGAAGTCACAGAGCGTGCAATGTATTATGCCAATGGCCTTCCATTGGCTTTGGAAACGATAGGCTCGAACTTGTTTGGCAAAACCTTGGATGAATGGGAATCTGCGATGTGGTTTTACGAGGACGTTGTTTGTGTGTTGGAGAAAAACATGGAAAATGATAAAATTGAAGCGGTGATGTTGGAGATGCCAGAACACCAAGAAGAAATGCAATGCACTCCAAAGTTTGGAAAAATGAAAAGCTTACGGATGCTTATTATAGAAAAGAAGGTTAGCTTTCTTGGAAGCCCTGCTACTCTGCCAAACAGTTTGAGAGTGCTGGAATGGCGTGGATATCCTGCAACTTCTTTACCGAGCAATTTTCATTTCAAGAATCTTGTCATACTCAACTTGTCACACAGTTACTTTGGATGGTACAAACCACTACAGGCATGTTGTAAGAATATTAGACGAATACCTGACATCTCTGGTTTCCCCAATTTGACAAAACTTTGTGTTCGTGAATGCACAAATCTGTTTGAGATTCATGATTCAGTTGGATCTTTACTTCATCTTAAAGAGTTTTGTGCTGAAGGATGTACCAAGCTCACAATTGGTCCAAGTCGCATAAAGTTGATATCTTTGGAGCATCTGTGCTTTCGGGGCTGCAGCAGTCTTGTCATGTTTCCAGAAGTATTGGCTCCAATGCACAAACTAAAGTACGTTGACTTGGGAGGAACTGGCATAAGAAATCTGCCACCATCAATGCAAAATCTTAAGGACATTACAATCCTTCCTGCCAGCATTGAAGAATGTCACTCTTTGAAATTTCTGCACGTCACCAACTGCAAGAAGCTTCAAGAAATTAGAGGACTTCCATTGAATATTAATCAGTTCTACGCAGCAAACTGTTCTGTTAAAGCCAACTCTTTGATATTAAAACTCAGGCAGGCCATTGATTGTGGTGCAATGGGAATCTGTGTTCTTCCAGGTCGGAAAATCCCAGAATTGTTTGACCACTCTAGCAGGGGAAACTCTGTAAGTTTTTGGTTTCGTAAAGAATTGCCCACTCTGGCTGTGTGTGCTATTATTGGAGTCTGGGATAATGTCAAGCCTCCTTTCGTTGCCTTCTTTAGCATGGAGGATGTTCGATTCGAAGATCCTTATGATCTCAATAAAGCAAGCACTATGGAAAATAAACTTGTGTTGCTTGGTGAGGCATCTGATACACAACAACAAGCACAATCCTCTGCTTTATTCAACCTCACAACCTCATTAGAATCTCTTATTGGTGAACAACCTTTGAATTATGAGTACAACAATTCATATTCAAAAGAATCGGCATCCACTGTTGACTCCAATAACCAAGGAGTACTTGTAGATGATCAACCAATATTAGCTCCAAGTTCTGCAGAGACGCAAAATGCTGAGGCCAAAAGAGAAATGGCACAACTGATATCGGAAGTTTCAAGTGAGTTCACAGCTCAAGTAAGTATGAAAATTGAGTCAACAGCATCCCAATCACCTAAAGTTGATGAAGTAGAAGCAGGTTTGGAAACTCAGAATCAGTTCAGAAATACTATGGTTTTGGAAAACCAGATACACCAAAGGCTGACCAGGATTAAGAAAATGAAAGAAGAATTAGGAGAGAAATTCAGTGCTATTAAAGCCGACATCTCTGCCATTGAAGCTAACAACTCTTCCATTAAAGCTAACATCTCAGACATTAAAGCTATATTTTTGCAGATTGATCAGAGGTACAACAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16715::LG4:27876423-27878423(+)
TAATTTTTTTAAGAGGTTTAATGTTATGTTGCCAAAAGAAACTCTCCATGTTTTAAAAAAAAGCTTTATAAGATCTAGTGTGAGTAGAGCAAGAACTATCAACGAGTGTGTCTTAAGTGATTGAGTGTTTATGTTGTGGTGAGGAAAAACTATTCATCCTTTGTGTGTTCAAAGAAAGTGTCCGTTCATCTTTTATGTCTTCAATTTTATGTCTTCAAGAGAGGTGCTTTCTAACCTAAACTTTATTATCTATGATTATAAGTTGTGATTGTTGTTAATGATTGATTCATCTCTCTATAGAGAGATTAACAACTAGATATAAAATCTTTTAATCCGAACTAGTATAAAATTATTTGTGTAATTTTCTCTTTTCTTATACTTTTTATTTTCTTTAAAGAGATTAAATTTATTCAAAAATTCAATTTTAAAAAGGAAAAACTTTTAAAAGGCACGATTTTATTAAAGAAATCAACTCACCTTGTTTTGATTTTTGTCTAAATGTTTTGTTACACAATTCTAACAATGATGTCAATCTCATGTTTAGATTGAACTCATGTCTCATTAATGTTGTATTTTTGTAATTATCCTGATCCATCAACGTCTTATACTTCACTATGATATCCTCAGTTACAATAAGCCTTCAACACATGATCATGGTATTGAACCTTATTTTTGTTGTTGATCTATTTGTACAACATATGCTTAGAATGATTCCACATCATAACTTCTTCTAAACATGTTCACCTTTCACATTTATGTTGGGAGAAATGCTTTTCAATTGAATTTCTTGGTCTGCTCTTTCGAAAAGAAAGTTGTAGCTCATCTAACATATAAGAAGCTCGGATGTGATATTTTTGTGGGTTTTGGATGGTGTAATTCGTAATATACTTTTTAATTTATTTCGGAATGTCTATTATATATAACCAAAAACATCAACCGAAACTAAATTTTTAATAGTTAAATAAAAATAATAATAATTAATAATAAATGTACATAATATTCATATGATTAGAAACATTTTGAAACAATATATGCCGAATGTGAGTATGCGAACGCATGCATAGTGAATCATATATATAACTTTTAAATTCTGTAATGCGAAAGGAACACTTTTCTTTGTGAAGATTTTATGTTTCGCTTTTCCATTGATTTAACTGATTACAATTTCTTTTCAGTTTTTAAATTGCTATCCATTAGTAGGTTTTTATAATATAAGCTTTTGCATTGTTTTTGCTGTTAATCAATTCTAAAAATGAACAACACCAAATTCTAAAAATTGAAAAAAAAAATCAACTTAAATATCACTCCTCTAAGATCAAATTCTCAACATATTCATTTCCAGGAAAGCTTATTAGAATTTGATTTCAAAAGATCAAATTCCAACATCATTTTTTAAATTTTATATTAAACTGGGCAAAAAAGTGAGTGAGAGTTGTTTCAAGTTATGAATTCGGCTTCTAGTGACTAGTAAATATATCTATCTTAAGAATTAAAATAGAAATATTTGAGTAATTTATTTTTAAATGAGTTTTTTGTAGGAGAAAATTATTAAAATTGAGTCCACATCATCCCTGTATTATGTTACTCTACGTCAATGTTGGCATGCTACCAAAAGGAATTTAAAATATTTTTACATGCTCAGCAAAATATTTTATATAATTTACTATTTATTATACTATTTTTTTTTTGTGTTTTTCCAATTCTCTTCTTTTATATTTTAAAATTTTTGCCGTGTTTTTGGTGACAATTTTGTTTTTTCCCCTGGAATGTATGCACCAAGAGGGAATTAAATAAAATAAAAAAAAGGTTATGCCATAGCAGTTATACTGGGTGGCAAAAAAGAAAAACCAAGAGAAAGTAGTATGAACAACAAGAACGGAAAATTATTTGAAAATGATGATTCAATTTAAAAATAACGACTTTGACTTTTGAAAGCACCCTTATATGATCGATTGAAGACATGAACCAAAAACCAAAGCATTTTGCGAGTTTCGTTATTA


Gene Sequence:
>Vu_16715(+)
ATGGCTCAAAAACAAGCACCTTCTTCTGCTTCTTTTATGTCAAAATACAGTTATGATGTTTTTCTTAGTTTTCGTGGTGCAGATACACGTTTTGGTTTCACTGGTAATCTTTACAGTGCTTTGAGTCAAAGAGGAATCTTTACCTTCATCGACGACGAAGCTCTCAGAAAGGGAGAAGAGATCACACCTTCTCTTCGCAAGGCAATCCAAGAATCCATGATATCCATCATCGTTTTCTCCAAAAACTATGCTTTCTCAGCATTTTGTTTGGACGAACTTCTCCATATCATTGAGTGCCACAAAAATCAGAACATGTGGATTTTGCCAGTGTTTTATGACGTAGAGCCATCACAAGTGCGACATCAAACAGGGAGTTACCAAGAAGCATTTGCAAAGCATGGTGAAAGATTCAAACATGACATTCAGAAGCTTCAACAATGGAGTCTGGCTTTGCGTCATGCTGCCGATTTGGCTGGTTTTCCTTTCAAAACTGGTAAGTCATCTCTGTTACAAATTATCAGTATATAGCAATAGCTCTCTGATTTGCAAAATGAATGTGACAGTGGTTTGATTGCTCTTGTATGAATTGCAGTAAAGAGTATGAGTCTGAGATAGTGAAAAAGATCACAGAAGAGATCTCCACTAAGCTTAATCGACCTCCCTTGCATATTGCTGATTATCCTGTTGGTTTGAAAGTTCGGATGCAACAGATACAAGAACTAATGGGTGGTGAGTTTGATAAGAAAGTGACTATGCTTGGGATTCATGGAATGGGAGGAATAGGAAAATCAACTCTTTCACGTGCGATGTACAACTTGATGGCACATCAATTTGAAGCTTCGCACTTTCTTGCTAATGTAAGGGAAAAATCAGATAAGGATGGTCTGGTGCATATCCAAGAGACAATGCTGTCTGAGTTGGTGGGGGAAAGAAATATCAAGTTAGGAGATGTGCATCGTGGAATTCCAATACTACAACACAGACTTTGTGGGAAAAAGGTCCTCCTTGTGCTTGATGATATTAGCAAAAAAGAACAATTGCATGCAACTGCTGGAGGACTTGATTGGTTTGGCCCTGGTAGCATCATCATCATAACAACAAGGGATAAGCATTTGTTAGATGTTCATGGAGTTCAAAAACAGTACATGGTTGGTGGAATTAACTTTATGGAAGCCCTTGAATTGTTTAAGTGGAATGCTTTCAAAAGCAAAGAAGTTGATCCATGTTACAAGGAAGTCACAGAGCGTGCAATGTATTATGCCAATGGCCTTCCATTGGCTTTGGAAACGATAGGCTCGAACTTGTTTGGCAAAACCTTGGATGAATGGGAATCTGCGTTAGAAACTTATGAGAGAATTCCAAATAGAGATGTTCAGGAAGTTCTTAAAGTTAGCTATGATAGTTTGGATGCTTATGAGAAAGAAATATTCCTTGACATAGCTTGCTTCTTTAGAAGATGCTCTCTTGGATACGTTACAGATAAGCTTGAAGCAAGAGGATTTCCTCCAAAATTTGGTCTGAGAGTGCTAGAAGAAAAATCTCTCATTAAAATTCGGGAATGTCCACATGAAACTGTGACAATGCATGACATGATTCGGTGTATGGGAAAAGAAATAGTTAGACAACAAAACCTCTGCCTCACAAACGGAATAGGATGTGGTTTTACGAGGACGTTGTTTGTGTGTTGGAGAAAAACATGGTAAGAGTCCTATTCCTTTCCGTTTCTTGTATTACATCATGAGTTGAATCTGTACACATTTCATGATTCTTAACTCTCGATAGTAAGAGCCAACAAAGCATTTACATTTTGTGAATTCTAAATTTTATGGCTCCTTTTCTGCTTTTGGCCTGAAAGGAAAATGATAAAATTGAAGCGGTGATGTTGGAGATGCCAGAACACCAAGAAGAAATGCAATGCACTCCAAAGTTTGGAAAAATGAAAAGCTTACGGATGCTTATTATAGAAAAGAAGGTTAGCTTTCTTGGAAGCCCTGCTACTCTGCCAAACAGTTTGAGAGTGCTGGAATGGCGTGGATATCCTGCAACTTCTTTACCGAGCAATTTTCATTTCAAGAATCTTGTCATACTCAACTTGTCACACAGTTACTTTGGATGGTACAAACCACTACAGGCATGTACAATTTTATTCGTCATCTAAAATTAATTTTAGGTTTTGGATTAACACTTGATTCTTCAAAAAAACCAAACTAATAACCGTAGACTTGTTATTTTGCAGAATTCAAAGGTTTTGAGACACTTGATTCTCATAGGTTGTAAGAATATTAGACGAATACCTGACATCTCTGGTTTCCCCAATTTGACAAAACTTTGTGTTCGTGAATGCACAAATCTGTTTGAGATTCATGATTCAGTTGGATCTTTACTTCATCTTAAAGAGTTTTGTGCTGAAGGATGTACCAAGCTCACAATTGGTCCAAGTCGCATAAAGTTGATATCTTTGGAGCATCTGTGCTTTCGGGGCTGCAGCAGTCTTGTCATGTTTCCAGAAGTATTGGCTCCAATGCACAAACTAAAGTACGTTGACTTGGGAGGAACTGGCATAAGAAATCTGCCACCATCAATGCAAAATCTTAAGGGTATTAAAGTATTGTCCATGGGGAAAGGCCAAATGCTTGAAATTAATGAATCGTCCAATTTCTTTCAAAACCTGCCAATGTTCTTTCCTAATTTAGAAACATTATATTTACAAAACTTAGACATTACAATCCTTCCTGCCAGCATTGAAGAATGTCACTCTTTGAAATTTCTGCACGTCACCAACTGCAAGAAGCTTCAAGAAATTAGAGGACTTCCATTGAATATTAATCAGTTCTACGCAGCAAACTGTTCTGTTAAAGCCAACTCTTTGATATTAAAACTCAGGCAGGTGGGTGTGTCTATCTTCTTTGAGTGATTCCATTAACTAGCTATGACTTTCTTTTTCCAAACTCACGATGCATATAACATGACCCGTTTCACAGGCCATTGATTGTGGTGCAATGGGAATCTGTGTTCTTCCAGGTCGGAAAATCCCAGAATTGTTTGACCACTCTAGCAGGGGAAACTCTGTAAGTTTTTGGTTTCGTAAAGAATTGCCCACTCTGGCTGTGTGTGCTATTATTGGAGTCTGGGATAATGTCAAGCCTCCTTTCGTTGCCTTCTTTAGGTTCGTTGTTGGAGTAGAAAAGAATATTTATAAGTGTGTTTGTTGTTTCCGTTGTCGTAATATACGTTGGACAACTGAGGATAGTCACATAATTATACTCAACTCTCGAAATGATTTTCAACATACGTTGAATACGGATATTCAGACAGTGCTTCTGACGAATGAGTGGATTCCTGGGAAAATACTGTTGACGATACGTCCAAAAAGTGATTTAGGTAAGTCGGGAGAAATCAGAAGGACAGGAGTTTTATGTAAATCGAACACTTAGTAGCATGGAGGATGTTCGATTCGAAGATCCTTATGATCTCAATAAAGCAAGCACTATGGAAAATAAACTTGTGTTGCTTGGTGAGGCATCTGATACACAACAACAAGCACAATCCTCTGCTTTATTCAACCTCACAACCTCATTAGAATCTCTTATTGGTGAACAACCTTTGAATTATGAGTACAACAATTCATATTCAAAAGAATCGGCATCCACTGTTGACTCCAATAACCAAGGTAAAATGTACTTTGTCCTTCCTTTCTTACTCTTTGATCAAATTACTTCTGCTTCTATTGATATTATCCTTTGGTTCTGAAGGAGTACTTGTAGATGATCAACCAATATTAGCTCCAAGTTCTGCAGAGACGCAAAATGCTGAGGCCAAAAGAGAAATGGCACAACTGATATCGGAAGTTTCAAGTGAGTTCACAGCTCAAGTAAGTATGAAAATTGAGTCAACAGCATCCCAATCACCTAAAGTTGATGAAGTAGAAGCAGGTTTGGAAACTCAGAATCAGTTCAGAAATACTATGGTTTTGGAAAACCAGATACACCAAAGGCTGACCAGGATTAAGAAAATGAAAGAAGAATTAGGAGAGAAATTCAGTGCTATTAAAGCCGACATCTCTGCCATTGAAGCTAACAACTCTTCCATTAAAGCTAACATCTCAGACATTAAAGCTATATTTTTGCAGATTGATCAGAGGTACAACAATTGA