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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16629 LG4 26927813 26932258 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 26927876 missense_variant p.Pro22Ser
C/T 26928049 synonymous_variant p.Gly79Gly
T/A 26928071 missense_variant p.Ser87Thr
T/G 26928526 missense_variant p.Ser238Arg
C/A 26931052 missense_variant p.Ala565Glu
G/C 26931681 intron_variant
T/C 26931879 intron_variant
T/A 26931892 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16629.1
MASYKIFIFFILNFLNFAITEPQHYAPLYQYCSSEQTTDNTSLQLNVKILLNNLSSLSSGHTQYHTNFSCANPSDSIYGLFMCRGDSSPHDCQKCVQGAKNKLSSDCSLSKESVTWYEDCMVRYSTNYFFSTVATTQCNTGKVFSNPESFMQLYFLTMNQTADAAARAPMVNNNTKMFSTREARVSDSHNQTLYCMAQCSPDLSPNDCRTCLGEAIRNVPNSPQCSGVRLGGKVLYPSCNIRYESYPFYLVPPTNLSPELVPETKTSHHADLTFSKDPLYLSHNCSSNKTLASNNTSQISLITLFSYLSSNATKRKYYEADVNSTVYGLFMCRGDVPYDVCEKCVQNATHRIALECNSLQEGIVWFSQCMVRYSDRKFFRTVKTSPMFSELNFTQGNEKQSSFSVTLAKTLDKVAVMAGDSDERFGKYSMKLNDQQILYTLAQCTHDLPTDDCKGCLGILIGTEIPWPFLESTAGRVLYPSCNIRFEFSQFYFDKVPSARPVNLESEKSDVFSFGVMVLEIITGRKNIYPPEPHHIADGLLSYVWKQWRAQTPLRTLNSNIRENYAEIEVIKCIQIGLLCVQESPDVRPTMLGLRFSLIMALSSFDPRKFTKTLEVAVAIDKLLLYQGLKKAKKE*


CDS Sequence:
>Vu_16629.1
ATGGCTTCATACAAGATTTTCATCTTCTTTATCCTTAACTTCCTCAACTTCGCAATCACCGAGCCACAACATTATGCTCCACTCTACCAATATTGTTCCAGTGAACAAACCACCGACAATACCTCTCTCCAACTTAATGTCAAAATCCTCCTTAATAACCTGTCTTCTTTGTCCTCTGGCCACACGCAATACCACACCAATTTCTCATGTGCAAACCCCTCAGACTCTATCTATGGCTTGTTCATGTGTAGGGGTGACTCTTCACCTCATGACTGTCAAAAATGCGTTCAAGGTGCAAAAAACAAACTATCCTCAGATTGTTCTCTGTCCAAAGAATCTGTCACTTGGTACGAAGACTGCATGGTTCGCTATTCCACCAACTACTTCTTCTCCACCGTCGCCACAACCCAATGCAACACTGGCAAGGTGTTCTCAAACCCTGAAAGCTTCATGCAATTATATTTTCTGACCATGAACCAAACAGCGGATGCAGCAGCACGTGCTCCTATGGTTAACAACAATACCAAGATGTTTTCTACGAGGGAAGCACGCGTGTCTGATTCCCACAACCAGACCCTTTATTGTATGGCTCAATGCTCACCTGATCTATCACCTAATGATTGCAGAACCTGCCTCGGTGAAGCCATAAGGAATGTTCCAAACTCTCCACAATGTTCTGGGGTGAGACTTGGAGGGAAAGTTCTTTATCCCAGTTGTAACATTAGGTATGAATCTTATCCTTTTTATCTCGTTCCACCGACAAACCTTTCACCTGAGCTTGTTCCCGAAACAAAAACCTCTCATCATGCAGATTTAACGTTTTCAAAAGACCCTCTTTATCTCTCTCACAATTGCTCGAGTAACAAAACCCTCGCTTCCAATAACACTTCACAAATAAGCCTCATCACCCTCTTTTCTTACCTATCTTCCAACGCCACCAAAAGGAAATATTACGAAGCTGATGTGAACAGCACAGTTTATGGCCTCTTCATGTGCCGAGGTGACGTTCCCTATGACGTGTGTGAAAAATGCGTCCAAAACGCAACACATCGAATAGCATTAGAATGCAACTCCCTCCAAGAGGGTATAGTTTGGTTCAGCCAATGCATGGTTCGCTATTCCGACAGAAAATTTTTTAGAACAGTAAAGACAAGTCCTATGTTTTCGGAGCTGAATTTCACTCAAGGAAACGAGAAACAAAGTTCCTTCAGTGTTACATTAGCGAAGACGCTAGATAAGGTGGCAGTTATGGCAGGAGACAGTGATGAAAGATTTGGAAAATACTCAATGAAACTGAATGATCAACAAATCCTTTACACTCTTGCACAATGCACGCATGATTTGCCTACTGACGATTGCAAGGGTTGCTTGGGAATTTTGATAGGAACAGAAATTCCATGGCCTTTTTTGGAAAGCACAGCGGGAAGAGTTCTATATCCTAGTTGCAATATCAGATTTGAATTTTCACAGTTTTACTTCGACAAAGTTCCATCTGCAAGACCAGTTAATCTCGAATCAGAAAAATCAGATGTTTTTAGTTTTGGAGTAATGGTTTTAGAGATTATTACGGGAAGAAAAAATATATATCCTCCTGAACCACATCATATAGCTGACGGCCTCCTAAGTTATGTTTGGAAACAATGGAGGGCTCAAACACCATTAAGAACCTTGAACTCAAATATTAGAGAAAACTATGCAGAAATTGAAGTTATAAAGTGTATTCAGATTGGTCTATTATGTGTTCAAGAAAGTCCTGATGTTAGACCAACAATGTTAGGGTTAAGATTTTCTCTAATCATGGCTTTGTCTTCCTTCGATCCTAGAAAGTTCACAAAGACGTTGGAAGTTGCGGTGGCAATTGATAAGCTCTTGCTCTATCAAGGATTGAAGAAAGCGAAGAAGGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16629::LG4:26925813-26927813(+)
TCTTCAAGTTGGGATGATAAAATATGTAAGGTTAGGAAGTTTATAAGAGGGAGATATATTCCACATGGTGGCAAGTTTTTTCTTTTTCTCATTGTGCATATTTCTTTTGTAAATAAGACGGGACAACCCCACTTGTTCCTTTAGAATTTTGGAACTTTGTTATGGTATTCTATTTAAAAGACACCTTAAAAGGATTAAGAAAGAAATGTGTTAAGAATTTAAGTGAGTCTAAGTTTTATATTAGATAGAAATGAGAAAGTGAAATACTATATAAATAATTCATTGCTTTAAAGATTTTGGTTGAGAGTGTTATTAATTCCTTACATGTGTGTACTCATGTCTAATTGGTGTTGTATCTCTCTAGTGAACTTTCTCCTTTTCAATAAATCTAATAAGTGGTCTCAAAGTCGATGGTTAATTTTGGTGACCATCTCAACGAGTACAATGGTCCTACGAAAAGGTGTACTCGTGGTTAGAAATATTTTTGTTGGAGGAGGAATGTAGCAATGTGGAAGAAACTCACTCTTGAGGGAAAGATTGTTGGGAATTCAACTCTGAGTCTAAGTTTAACATAGGGTAGAAATGAGAAAGTGGAGCACTGCATAACGATGAAGACTCATTAACTCATTGTTTTAAAGTTTTGGATTGAAAGAAATGTCAATTTCTTATTTTGAATTCAGGTCTCATTAATATTGTATCTCCTAGTAAACCTTCTCTCTTGATAAACCTAATAGAAGGTCCAAAGACAAACCATCATTCCCTTATCCCTCACTTCAGAGGACAATTTTAATATATTGTTCTCATGCTCTTAAACGTCTTTTAAAAATAAAATTGTGATAGAATTCTAAGTTTCAAAGCAAATAATATTTTATATGCTATCTTAATAGACTTATGTCAGAATATTTATAATTTATAATGGAATAATATATCTTATGCATAAACTTAAAACCAAGTATAACTTATATTATTTTTATTTTATAAACTTTGGTACTGGTAAAAAAAACTCTATATATTAATATTATAGGAAGTACTTACTGAATTCTCTTATGCACTTCTAAACTCATATTTTACAATTTTTACTCTTACGTGAAAGTTGAAAATTATTTTACAAGTGGATCTAAGATACGTGTTTATCAACAACTGCAATGCAATGATTAATTAATAATGTTATCTTACCATACTTTAAAAAGTGTTAACATGGAATTTAAGAGTATGAGATTTTTGTTGAACAATAGTGTGCTTTGATTTCGGTAATATAATACAAGTGGATTCAGGATTGCCATGCTTTTTATGTTGATTTTTCTCTCCAACACAAATAAGACACTCCAATATATTTAAGTAAATAACTATTGAATTAAAATGACGATAAATTTTTATCCATAATGAGAATTTGGAATTTTTTTCGTGTTTTGTATGACCTATAATGATAAATATTTTCCAAAAGACAATATAAACGTGTAAGAAAGTCTAACCCTTGTTGAGCTTGAGAAACTGGTAGGAGAACCAGAATAATAATTGATTGTGACATAAATAAAATGTAGTATATAGTTTTTATAAAAACAAAAATCTGTCTTATTTATTACATATCGTCCTAAATTTTCCAAAATTTATAGAAATTTTTTGTAGAGAAAATTAAAATCTTAAAAGCCATGGAAAAAATCGTATAAGAAGTCCGCAATAATTAAGTGAGCTATCCCTTATTTTGCACCACAAGCTAAGCTTTCCAAGTTTTATTCACCTTATCAGTTGACCTATCTCCTGGTTGACTAATTATCATCCCTTTCATCTATTGAAGGATTAAAAGATATCGGTGGACATGAATAATGCTAATAAAACTTAACAAAAACACATGTTAGAAAAAATATATATATATAAAAATACGACATGGATGTTTAAAATTAATGGATTATGGAATATTTGATTATAAATAAAAAAATAGTTGCAGTAGTGACTTGCTTCATATGACAGTGCTCTGAACAAATTTTCTTACAAAGCATGCA


Gene Sequence:
>Vu_16629(+)
ATGGCTTCATACAAGATTTTCATCTTCTTTATCCTTAACTTCCTCAACTTCGCAATCACCGAGCCACAACATTATGCTCCACTCTACCAATATTGTTCCAGTGAACAAACCACCGACAATACCTCTCTCCAACTTAATGTCAAAATCCTCCTTAATAACCTGTCTTCTTTGTCCTCTGGCCACACGCAATACCACACCAATTTCTCATGTGCAAACCCCTCAGACTCTATCTATGGCTTGTTCATGTGTAGGGGTGACTCTTCACCTCATGACTGTCAAAAATGCGTTCAAGGTGCAAAAAACAAACTATCCTCAGATTGTTCTCTGTCCAAAGAATCTGTCACTTGGTACGAAGACTGCATGGTTCGCTATTCCACCAACTACTTCTTCTCCACCGTCGCCACAACCCAATGCAACACTGGCAAGGTGTTCTCAAACCCTGAAAGCTTCATGCAATTATATTTTCTGACCATGAACCAAACAGCGGATGCAGCAGCACGTGCTCCTATGGTTAACAACAATACCAAGATGTTTTCTACGAGGGAAGCACGCGTGTCTGATTCCCACAACCAGACCCTTTATTGTATGGCTCAATGCTCACCTGATCTATCACCTAATGATTGCAGAACCTGCCTCGGTGAAGCCATAAGGAATGTTCCAAACTCTCCACAATGTTCTGGGGTGAGACTTGGAGGGAAAGTTCTTTATCCCAGTTGTAACATTAGGTATGAATCTTATCCTTTTTATCTCGTTCCACCGACAAACCTTTCACCTGAGCTTGTTCCCGAAACAAAAACCTCTCATCATGCAGATTTAACGTTTTCAAAAGACCCTCTTTATCTCTCTCACAATTGCTCGAGTAACAAAACCCTCGCTTCCAATAACACTTCACAAATAAGCCTCATCACCCTCTTTTCTTACCTATCTTCCAACGCCACCAAAAGGAAATATTACGAAGCTGATGTGAACAGCACAGTTTATGGCCTCTTCATGTGCCGAGGTGACGTTCCCTATGACGTGTGTGAAAAATGCGTCCAAAACGCAACACATCGAATAGCATTAGAATGCAACTCCCTCCAAGAGGGTATAGTTTGGTTCAGCCAATGCATGGTTCGCTATTCCGACAGAAAATTTTTTAGAACAGTAAAGACAAGTCCTATGTTTTCGGAGCTGAATTTCACTCAAGGAAACGAGAAACAAAGTTCCTTCAGTGTTACATTAGCGAAGACGCTAGATAAGGTGGCAGTTATGGCAGGAGACAGTGATGAAAGATTTGGAAAATACTCAATGAAACTGAATGATCAACAAATCCTTTACACTCTTGCACAATGCACGCATGATTTGCCTACTGACGATTGCAAGGGTTGCTTGGGAATTTTGATAGGAACAGAAATTCCATGGCCTTTTTTGGAAAGCACAGCGGGAAGAGTTCTATATCCTAGTTGCAATATCAGATTTGAATTTTCACAGTTTTACTTCGACAAAGTTCCATCTGCAAGACCAGTTAATCTCGAATCAGGTTATAATAATATATTTTTCATGAAAATAAAAATAATGTTATATATATATGTAGTAATTGTATAAAGCTTCTTCACAAAATCACTGAATTACTTGCAAAGATTATAATACTTTTGAATGACTGTGATGATGTTTTTATGATTGTGGTTCCATGTGTATAAAAATTATCATAAATAATACTTGTCTGGAATTTTCTACAATCTGATGCTCAAAAGCTAACGTGGACTAACCACAAACAACCATGTTAAGTCAACGTTATCAGTAGTCTATAATGGCATTTTTGTGACTTGTTTTATGCAGGAAATAAAAGAATCAATGTACGAAGAATTATATTGATTACTGTGCCCACAATTATTTTGATGACGCTCTTCTTCGTGGCTTTTTATTTTCAAAGGAGAAATACAAGAAAGAGCCATGCGACCATTCTCAAGGAAAATTGTACGTGCTGTAAAAGATTGCTTTCACTGATTCAAGAAGTATAACAACTTACTTAACAATTTGATCATATTTGCTAGTTGGTCATGAAACTGCCACTTTGGAGCCCTTACACTTCAATTTGACAGCAATTGAGTTAGCAACTAATAACTTTTCCAACGAAAACAAGATAGGTAAAGGTGGATTTGGAGAAGTTTATAAGGTAAAAGATCGATAATAATCTTTTCATTGGGTAAACATTTGGATATATTTAATGTTTTTAATTTACACGTACGTAAAAATGGTTATATTGTAGGGTATTCTTCCTAATGGACGTCGAATTGCGGTAAAAAGACTCTCAAAAAGTTCTAAACAAGGTGTTGCTGAGTTCAAGACCGAAGTATTATTAATTGCCAAACTTCAACATAGAAATTTAGTAGAATTCATTGGTTTTTGTCTTGAAGAAGAAGAAAAGATACTTATTTACGAATATGTGCCCAACAAGAGTCTTGATCACTTTTTATTTGGTTAGATACTTTCAACCTAAACTTTCCTAGTCAACATTTATATTCATCCTTATGTAATCTCTTTTGACCAAGTTGATGTAATTTCATCCATATATTACAAATTAAGTTTCATACTCACATATTTCATTTACACTATTTTGTAGATCCTCAACCACATAGATCATTAAGTTGGTATGAAAGATATAAAATTATTGGAGGTATTGCACGAGGAATTGTTTATTTACATGAACACTCTCGACTTAAGATCATACATCGTGATCTTAAACCGAGTAATGTTCTACTTGATGAAAATATGACTCCAAAAATTTCAGATTTTGGCATTGCTAAAATTATTGAAATAAGTCAAGACCAAGAAAGCACAGATTTAATTGTTGGAACATGGTAAGTTGATAATGTTTATCTATCTTTGCCCTTTTGTTTTTACAAAAGATATACTTGAATAAATGTTAATTTGTGTAATTTTATTTTATAGTGGTTATATGTCTCCAGAATATGCAATGTTTGGACAATTTTCAGAAAAATCAGATGTTTTTAGTTTTGGAGTAATGGTTTTAGAGATTATTACGGGAAGAAAAAATATATATCCTCCTGAACCACATCATATAGCTGACGGCCTCCTAAGTTATGTAAGTATTGTAATTAAACAATTTATTTCTTGGTTTCAAACATAAATCCATGTACTTTTTTTAACATTTAGTTTGATATTTTTACAGGTTTGGAAACAATGGAGGGCTCAAACACCATTAAGAACCTTGAACTCAAATATTAGAGAAAACTATGCAGAAATTGAAGTTATAAAGTGTATTCAGATTGGTCTATTATGTGTTCAAGAAAGTCCTGATGTTAGACCAACAATGGTAACAATTGTTTCATATCTTGATGGTCATTTTAGTGAATTGCCAACTCCACAAAGACCAGCATTTTTCTTGCACGAAAGAATGGATTCCAAATCTATTGGGAGGAAATCTAGTTCTAGAAGATTTATGAATATTTCTAAGCCATTATCAATCAATGAAATGTCTACAAGTGAATGTTTTCCTCGTTAATGAACTAGTTGTCTTTATTGTATATGAGTATTTTTATTGAATGATATTGCCTTGTCATATATTTTCTAAGAATATCCTTTTTTTCAAATACTTTTTTGTTTATTTTTATATCATAGTGCAATAAAAAGACAATTATATATGAGATAAAGAAATTCGAACATTTCAAACAAGTATAAATTTTTATTGAGGAGATGCCTCAAACAAAACAAACTAATGTTGTGTTCTCTTTGGGGAATATCATTTCACGAGCAATGGAAAGCATGGATTTTTGTGTTCCTTTTCAATTATTTAAGGCACTAATAGAAAAATTGTTTTCTATGATAACTTATTATGATATTTATTATGACAGGTAAAAGGGTACCTGTCATAATAAGTGGACGCAATGACAAACTTGAAATTGTGATAAAAACTTACTATATTTGTTCTAGTAAGTATTTATTACGATAGTTAGTTCATCACCTCTCATAATAGGTTGAGTTTAGTGGAAAATTTGAAATTATGTTTCAAAACCTATCATGACATGTCTAGGAAGACTTGTCACAGTAATGCTTTATTATGATGTCATACATCTCAATCCCTAATTTTTTTAGTTCATTAACGCATCATCTTTTCTTCTCTACGTTCACGCATCATTTCTTCTTCTCTTCACGGACATCCCACAAGTCATTGCCTCCATGCCATTTCACCCTCACTCACTATCATGTAGTTTTCCCCCTCACTCACTCCTACTCCCATTTCACTTCATTTCCATTCCCAAATTCCAATCACTATCACTTAAACGAACATATGCACTTTTCTCTCTCAAGTTAGGGTTAAGATTTTCTCTAATCATGGCTTTGTCTTCCTTCGATCCTAGAAAGTTCACAAAGACGTTGGAAGTTGCGGTGGCAATTGATAAGCTCTTGCTCTATCAAGGATTGAAGAAAGCGAAGAAGGAGTGA

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