Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16571 LG4 26024484 26027339 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein ANTHOCYANINLESS 2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   sequence-specific DNA binding, DNA-binding transcription factor activity, lipid binding
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 26024549 synonymous_variant p.Arg22Arg
G/T 26024556 missense_variant p.Asp25Tyr
T/C 26024606 synonymous_variant p.Ser41Ser
A/T 26024953 intron_variant
T/A 26025106 missense_variant p.Ile143Asn
A/G 26025111 missense_variant p.Asn145Asp
C/T 26025116 synonymous_variant p.Asn146Asn
G/A 26025123 missense_variant p.Gly149Ser
T/C 26025497 intron_variant
C/T 26025533 intron_variant
C/T 26025674 intron_variant
A/G 26025736 intron_variant
G/T 26026148 missense_variant p.Glu328Asp
T/C 26026277 splice_region_variant&intron_variant
T/C 26026371 synonymous_variant p.Ala374Ala
C/T 26026446 synonymous_variant p.Asp399Asp
G/A 26026694 missense_variant p.Gly450Asp
T/A 26026777 missense_variant p.Ser478Thr
C/T 26026828 missense_variant p.His495Tyr
A/G 26026834 missense_variant p.Ile497Val
C/T 26027282 synonymous_variant p.Val622Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16571.1
MEGRNEMGMMGESFDTSNLLGRIRDDDYESRSESDNFDGGSGDEQDVGDDQPQRKKKKYHRHTPQQIQDLEAFFKECPHPDEKQRTDLSKRLGLENKQVKFWFQNRRTQMKTQLERHENMVLKQENDKLRAENGVMKEALANPICNNCGGPAIPGQISLEEHQTRIENARLKDELNRICTLANKFLGRSLSSLASPMSLTPPNSGLDLAIGRNGIGGSSNFGMPVPIGFDLGDGALGSSPAMARSVARDVFIYGGWCLHFGCVIWWHKWNEKWSFATAELQLLSPLVPTRQMTLLRFCKHHAEGVWVVVDVSIDIMRNASNSHPSMSCRRLPSGCVIQDMPNGLSKITWVEHSQYDESVIHQLCRPLVSSGIGFGAQRWIASLLRQCECLAILMTPPGPSDDPTVLSQSNRRSVLKLAQRMNEYFCSGICASSARKWDVLHIGSLADDMKIMARKIVDDPNEAPGYVLSASTCIWLPVPRQRVFDFLRNEQLRGEWDMLSKGGPMKEMLHVPKGQDHGNCVSILHYANNEGNVLYLQESWTDASGSMVVYSPINMQSLNMMMMNSGDSSFVSLRPSGFAILPDGHSNNSDNNDGGGGSCLLTVGLQMLQNDNPSAKFTLESVQTVNSLLSCTVQKVKEALGVS*


CDS Sequence:
>Vu_16571.1
ATGGAAGGTCGTAATGAAATGGGTATGATGGGAGAGAGTTTTGATACGAGTAATTTGCTGGGGAGGATTAGGGATGATGACTATGAAAGTCGCTCTGAAAGTGATAACTTTGATGGTGGATCTGGTGATGAACAAGATGTTGGCGATGATCAACCACAGAGAAAGAAGAAGAAATATCACAGACACACTCCTCAACAGATTCAGGATCTTGAAGCATTCTTTAAGGAGTGTCCTCATCCTGATGAGAAGCAAAGAACCGATCTCAGCAAGAGGCTTGGCTTGGAGAACAAGCAAGTGAAGTTCTGGTTTCAAAATCGACGAACCCAGATGAAAACACAATTGGAGAGGCACGAGAACATGGTTCTTAAGCAGGAGAATGACAAGCTTCGAGCTGAGAATGGTGTGATGAAGGAAGCTTTGGCTAATCCTATCTGTAACAACTGTGGTGGTCCAGCGATTCCTGGTCAAATTTCACTGGAGGAGCACCAGACAAGAATTGAAAATGCTCGATTGAAGGATGAACTGAACCGGATCTGTACATTAGCAAACAAGTTCTTGGGCAGGTCCCTTTCATCACTGGCCAGTCCTATGTCTCTGACACCCCCAAATTCTGGCCTTGACCTTGCTATTGGAAGAAATGGAATTGGTGGTTCAAGCAATTTTGGCATGCCCGTGCCAATTGGCTTTGATTTGGGTGATGGAGCTTTAGGCTCTTCACCTGCAATGGCAAGATCGGTGGCAAGAGATGTTTTCATCTATGGTGGCTGGTGCTTGCACTTTGGATGTGTTATCTGGTGGCACAAATGGAACGAGAAATGGAGCTTTGCAACTGCTGAACTTCAATTGCTTTCCCCACTGGTCCCTACTCGTCAAATGACTTTGCTCAGGTTTTGCAAGCACCATGCTGAAGGTGTATGGGTTGTGGTCGATGTTTCCATTGATATTATGCGTAATGCTTCCAATTCACATCCATCAATGAGTTGCAGGAGGCTTCCTTCTGGTTGTGTTATTCAGGATATGCCCAATGGTTTGTCCAAGATTACTTGGGTGGAACATTCCCAGTATGATGAGAGTGTCATCCACCAACTTTGTCGTCCATTGGTTAGTTCTGGTATTGGCTTTGGTGCTCAGAGATGGATTGCATCTCTCCTAAGACAGTGTGAATGCTTGGCAATCCTCATGACTCCTCCTGGTCCATCTGACGACCCTACAGTCCTTAGCCAATCCAATAGGAGAAGCGTGTTGAAGCTGGCTCAGCGCATGAACGAGTATTTCTGCTCAGGGATTTGTGCTTCATCTGCACGCAAGTGGGATGTTCTTCACATCGGTAGTCTTGCTGATGACATGAAAATCATGGCTCGGAAAATTGTGGATGATCCAAATGAGGCTCCTGGCTATGTGTTGAGCGCTTCAACTTGTATCTGGTTGCCAGTGCCTCGTCAAAGGGTGTTTGACTTTTTACGTAATGAACAGCTGCGAGGGGAATGGGACATGTTATCCAAAGGTGGTCCAATGAAGGAGATGCTCCATGTTCCTAAAGGGCAAGATCATGGAAACTGTGTTTCCATTCTTCACTATGCTAATAATGAGGGGAACGTGCTGTATCTGCAAGAGTCATGGACCGATGCATCTGGGTCGATGGTGGTGTACTCTCCAATCAACATGCAGTCTTTGAACATGATGATGATGAACTCTGGAGATTCATCATTTGTCTCTCTTCGTCCGTCAGGATTTGCTATTCTGCCAGATGGCCATTCAAACAACAGTGACAACAATGATGGTGGTGGTGGTAGCTGTTTGCTGACAGTTGGATTACAAATGTTGCAGAATGACAACCCTTCGGCCAAGTTCACATTGGAGTCAGTTCAAACTGTCAATTCCCTCCTTTCATGCACCGTTCAAAAGGTCAAAGAAGCATTGGGAGTTTCCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16571::LG4:26022484-26024484(+)
TTTTAATGATTTACAAACATAATAGTAAATGCTATTACATAAAAGTATTATACTAATATTAAGAAAAAAATTAAATGAAAAGAAATTAAAAAAGTAGAAGTGACAGTCTTATCATAAATCTTGCATTATTTTAAGAGGCGTTACACCGTTTAAGAAAGTTTTTGTTTTTTACCTTCTTAGGAAAAAGTGCAAAAATTATTTAAAACATAAAAAATAGGGTATTTTGTGATTTTCTTTCTTTATCTACCCAATCTTCATTTATAGTATAAAATAATATTCAAATTCACCCTTGCATGCAAATTAAGAATTCTTTTTTCATTTCTTTTTTGCTTTTTATAAAATTTTAAAAAAATATATAAATTGAATATTTTTATTTTATCAATTACAGAGTCATGTTACACATGTTTTTGTTTTATCAACAGACCCCACTGATTGAAATTACCATATTGCCCTTGGGCTCAGTAGTCTTTGGTAACTATCCTGGTGGTGCTACTAGAAAGAGAAAACAACATACGTAACTGTTGTCTGTTTGTCGGTGGGACCCACACGGCTTTCACTACTATATATATTGTCAATGTCTGAAGTAAAACAAGCGAGTTTATACAGAGAAAGAACAGAGAAAAAGACTCTCAAATTTAAGAAGATTTTGAGAGAAAAACTCTGCATGCAATTCAGTGAAGAAAGAGAGGATCAACCAGAGTGACACACATAAACATTGGTTTTCAAAATAGGAATTGGGTTTTGAGTTTTGATCCAAAAGGTTATCTTTTTAATTACTTTATTTATTTCTTTAAGAGAATTATGTGGTTTTGAGGCAACAATTATCCACAAATTACTAATTTTTTTTTCTTCCTTTGAGTCTATGCATGTCAATTCTGCTATTATATCTGTTCACTTGTTATTATTGTGGAATAAAAAAATATTTTTTTTATATTTATTTATTTAACATGTGTTAATGTCATTGAATACTAACATATCATCTAATATTTTCTCTATTATTTTCTTTTCGACAGATCCTATTGAGAAAACGTGCTGAAGGATCTGAAGGTATAATTTTTGATTTTGTACCCAAGTTTATTCCTTTATAGTTCATGTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTAAAAACTTGTATTAGATTTGATGCTATGCATTTGAAAAGAAGTGAATCTTGAATTTGTTTGTAGCTGTACAAAGTCAACTCTCCAAATTGTTGTGTTTGTATGGATTTGGTTTTTGAGACCATTTTGGGTTTTGAAAGAAAAAACAAAAGAATTGTTTTGTCACGTAATTTGTGAAACACATGAAAGAGAAACAATTAAGAGCATTTATTTTTGTTTGTGCCTTTTTATTTTTCTACTTTGATGTGTTATGGCAATTGGAGTTGGTAAAAATAATTTTGTTTTTTTGCAACTGGAATAATTTAATTCTATTGATTAAAAGTCATGCATGGAGTCTCAAGAAGGAAAACATTTTTAACTTTTACTTTTTGTGCATGCGTCAAATCTTTTAACCCGAAGGAGTTTAATGTTGTGAACATGTCAAAAACCAGGTTGAAAAGTTACCTTTACAGAAGTAAGATTAACAATTCTAGAAGCAGTCTAGAGAACACTATAAACAACATTGAGAGTACTTGCATGTTTTTTTCCGAGAGAGTAAACGATTCGTGACCTTTTATAGGGTTTGAGATTGAGGGTTTGTTCAGAAACTACAACTTGAATTGTGGTTGGTGATTGAGTAAGAGTTGTAGTTGATAGTTTTCCGTATAATCACTTTAGACCCAGTTTTTTGTGGTTGATCCACTTCTTTTCTTCTGCATGCATCAACATTTTGAAGAAAAAATTGCTTTATCTTGTATTTATATACTGTGATTCATCTCCCATTTGGTTTAGAGCCTTTTCTGTGTGTCTTGTTTGGATTATGGTTTTGATTTGCTGAACGTCTTCTAACTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGGTAATCAGATTATCACTACAACAAGGAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_16571(+)
ATGGAAGGTCGTAATGAAATGGGTATGATGGGAGAGAGTTTTGATACGAGTAATTTGCTGGGGAGGATTAGGGATGATGACTATGAAAGTCGCTCTGAAAGTGATAACTTTGATGGTGGATCTGGTGATGAACAAGATGTTGGCGATGATCAACCACAGAGAAAGAAGAAGAAATATCACAGACACACTCCTCAACAGATTCAGGATCTTGAAGCGTATGCAATTAGGAAATCATTTGTTTCTTGTTTATTTCAAATGTGATTCTTATCATTCGTTAATTTTGCGTTGGTGTTTTTTGTTGTTCATTTGTTTTTGTTTTAGATTCTTTAAGGAGTGTCCTCATCCTGATGAGAAGCAAAGAACCGATCTCAGCAAGAGGCTTGGCTTGGAGAACAAGCAAGTGAAGTTCTGGTTTCAAAATCGACGAACCCAGATGAAAGTAAGTCGAAAGCATTAAAATCACTTGCATATCTTGGTTGTTACATTGAGAATATTGTAGTAAGAGAATCGATTTTGTTGAATCAGACACAATTGGAGAGGCACGAGAACATGGTTCTTAAGCAGGAGAATGACAAGCTTCGAGCTGAGAATGGTGTGATGAAGGAAGCTTTGGCTAATCCTATCTGTAACAACTGTGGTGGTCCAGCGATTCCTGGTCAAATTTCACTGGAGGAGCACCAGACAAGAATTGAAAATGCTCGATTGAAGGATGAACTGAACCGGATCTGTACATTAGCAAACAAGTTCTTGGGCAGGTCCCTTTCATCACTGGCCAGTCCTATGTCTCTGACACCCCCAAATTCTGGCCTTGACCTTGCTATTGGAAGAAATGGAATTGGTGGTTCAAGCAATTTTGGCATGCCCGTGCCAATTGGCTTTGATTTGGGTGATGGAGCTTTAGGCTCTTCACCTGCAATGGCAAGTATGGGTGCTAGAGCACCACTGGGAATGATGGGAAACGAAATCCATCTTGACAGATCTATGCTTATAGATATTGCCATAAATGCTATGGATGAACTGGTTAAGATGGCTCGACAAGATAACCCTCTCTGGATTAAGAGTTCTGATGGTAGGAATGAAGTTCTAAACTGTGATGAATATGCAAGAATGTTTCCTACTTTTGTTGGAACAAAACCTGCTGGATATGTGATTGAAGCTACAAGAGCAACTGGAGTTGTACTAGCCAGCAGCTTGGGCCTTGTGGAAACTTTCATGGATGTGGTATGCTGCCTAATTTCTTAGTGTCAATCAAAGTTTAATTGATTTTGTCGAAAGTTTTGAGCATTTAACTCACTGTATTTGTTTATTTCAACAGGATCGGTGGCAAGAGATGTTTTCATCTATGGTGGCTGGTGCTTGCACTTTGGATGTGTTATCTGGTGGCACAAATGGAACGAGAAATGGAGCTTTGCAACTGGTATATATATATATAGATGTGTGTGTGTGTTTGTGTTTGATCTTTTGCTAGCTTGGCCCAAACTAATTTGGAAATGCTTTTCAGATGTTAGCTGAACTTCAATTGCTTTCCCCACTGGTCCCTACTCGTCAAATGACTTTGCTCAGGTTTTGCAAGCACCATGCTGAAGGTGTATGGGTTGTGGTCGATGTTTCCATTGATATTATGCGTAATGCTTCCAATTCACATCCATCAATGAGTTGCAGGAGGCTTCCTTCTGGTTGTGTTATTCAGGATATGCCCAATGGTTTGTCCAAGGTAAGTGTTAGAAGAGTAAGATATCTTAGGAAATTTATAGTATTTACTAGATTGTTGGTAAGCTAATTCATTGCACTGTTGTAGATTACTTGGGTGGAACATTCCCAGTATGATGAGAGTGTCATCCACCAACTTTGTCGTCCATTGGTTAGTTCTGGTATTGGCTTTGGTGCTCAGAGATGGATTGCATCTCTCCTAAGACAGTGTGAATGCTTGGCAATCCTCATGACTCCTCCTGGTCCATCTGACGACCCTACAGGTATTTCATGTTGTCACTGTCTTAAACATAACCTGTTCACTTTTGATTAATCCGATGAAGTTGAACATAATGGATATCCTTTTATATATATCAGTCCTTAGCCAATCCAATAGGAGAAGCGTGTTGAAGCTGGCTCAGCGCATGAACGAGTATTTCTGCTCAGGGATTTGTGCTTCATCTGCACGCAAGTGGGATGTTCTTCACATCGGTAGTCTTGCTGATGACATGAAAATCATGGCTCGGAAAATTGTGGATGATCCAAATGAGGCTCCTGGCTATGTGTTGAGCGCTTCAACTTGTATCTGGTTGCCAGTGCCTCGTCAAAGGGTGTTTGACTTTTTACGTAATGAACAGCTGCGAGGGGAATGGGACATGTTATCCAAAGGTGGTCCAATGAAGGAGATGCTCCATGTTCCTAAAGGGCAAGATCATGGAAACTGTGTTTCCATTCTTCACGTAAGTGCCTTCAACAATCTTTATGTGTTTGAAGAAAGATTGTTGTTATAATGTATTGTTTTGTTTGCAGTATGCTAATAATGAGGGGAACGTGCTGTATCTGCAAGAGTCATGGACCGATGCATCTGGGTCGATGGTGGTGTACTCTCCAATCAACATGCAGTCTTTGAACATGATGATGATGAACTCTGGAGATTCATCATTTGTCTCTCTTCGTCCGTCAGGATTTGCTATTCTGCCAGATGGCCATTCAAACAACAGTGACAACAATGATGGTGGTGGTGGTAGCTGTTTGCTGACAGTTGGATTACAAATGTTGCAGAATGACAACCCTTCGGCCAAGTTCACATTGGAGTCAGTTCAAACTGTCAATTCCCTCCTTTCATGCACCGTTCAAAAGGTCAAAGAAGCATTGGGAGTTTCCTGA