Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16460 LG4 24318887 24324681 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA-like isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A,* 24319132 synonymous_variant p.Pro82Pro
A/G 24319472 intron_variant
G/T 24319658 intron_variant
A/C 24320202 missense_variant p.Asp304Ala
T/A,* 24320399 missense_variant p.Phe370Ile
T/A 24320400 missense_variant p.Phe370Tyr
G/A 24320836 intron_variant
C/A 24320876 intron_variant
C/A 24321317 missense_variant p.Ser520Tyr
C/G 24321318 synonymous_variant p.Ser520Ser
G/A 24321319 missense_variant p.Gly521Arg
A/T 24321366 intron_variant
T/A 24321452 intron_variant
A/C 24321461 intron_variant
T/C 24321563 intron_variant
T/A 24321725 intron_variant
A/T 24321923 intron_variant
T/C 24322246 intron_variant
G/C 24322625 intron_variant
T/C 24322899 intron_variant
T/C 24322904 intron_variant
C/T 24323143 intron_variant
T/C 24323915 intron_variant
C/G 24324044 intron_variant
A/T 24324082 intron_variant
C/T 24324428 synonymous_variant p.Leu802Leu
G/C 24324448 missense_variant p.Met808Ile
T/A 24324537 missense_variant p.Leu838His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16460.1
MPTWWGKSSSKETKKKANKESFINSFHRRFKIPSESKSSSRSGGSRRHCNDSISEKGAQSPPESRSPSPSKVARCQSFAERPHAQPLPLPVLHPSNISRADSEISISAKSRLEKGSKPSLFPLPKPACMRGRLNPADLDGDLVTASVSSESSADSDEPVDSRNLSPLATDCENGARTAAGCPSSSMPKDLSSTVSQINSRETKKPANILGNHMSSTSPKRRPLSNHVSNLQIPPHGAFCSAPDSSKSSPSRSPLRVFGTEQVLNSAFWAGKPYSEVNLGGSGHCSSPGSGHNSGHNSMGGDMSGQLFWQPSRGSPEYSPVPSPRMTSPGPSSRIQSGAVTPIHPRAGGTLNESQTGRVDDGKQQSHRLPLPPLAVTNILPFSHSNSAATSPSMPRSPGRADNPISPGSRWKKGKLLGRGTFGHVFVGFNKESGEMCAMKEVTLFSDDAKSKESAKQLMQEIALLSRLRHSNIVQYYGSETVGDKLYIYLEYVAGGSIYKLLQEYGQFGELAIRSFTQQILSGLAYLHAKNTVHRDIKGANILVDTNGRVKLADFGMAKHITGQSCPLSFKGSPYWMAPEVIKNSNGCNLAVDIWSLGCTVLEMATTKPPWSQYEGVAAMFKIGNSKELPAIPDHLSSEGKDFVRKCLQRNPHNRPSASELLDHPFVKYAAPLERPILGPDASSDPAVSGITQGATALGIGQGRSPSTLDSDRLSRHSSSEIHIPRNISCPVSPIGSPLLRPRSPQHMNGRMSPSPISSPRTASGASTPLNGGSGAIPFSNHLVYIQEGLGNLPKSSNGVYISGPTHHDLNVDIFRGMQQAPHISSELVPGESDVLGKQFARSPRNEAYDVQSVLADRVCRQLLGDNGKINPSLDLNPNSLLSRANGL*


CDS Sequence:
>Vu_16460.1
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Promoter Sequence:
>Vu_16460::LG4:24316887-24318887(+)
TGAAAATATCACTTTTTAAAAGATTCTAATCAACATGTTTTAAAAAAAAAAACCACTTGGATTGTAATATCACACTATCCAGTTCTGTGGATTATTTTATTCCGTTTTCTCATTTTATTTTCAACAGCTGATTAATTCAAATAATTTAATTAAAATACTATCTTTATTATTTTACCATTAAACTTGTCCCAATAACCTTTAAGGTAAGGTTTCATCATTGAATGTTGATATGCCTTAGTGACTCAGATTACAAATAACTATGTATCAATGTTCATAATAGTAATAATAATAATAATAATAAAAAAGTGTAACCCAAGAATCTCTACCCAAACAATCTCCAATACATTGTACAAAAAAATATATAAATAATATGTAGTTGTGGGTTGTAATAATTTCCAACAGCAAAAGATGTAATAATAAAAACAATGTAATAATTAGGTTCCATATTTTTTTAATTATTTTATTGCAATTTGTAATTAATTAATTAATATTAACTATTAAGAATCAAGGCTGAAAGTCCCTCTTCATCGATGTCTTAAGCAGGAGAAAACACACACTCTCTCTTCTCTCTCTCCCTCTCCTTCTCTTCCTCTCTCTTCTTTTCCTTCTTCCGTACACGATCTCTTTCACTATCTTCCAATTCCCAATTTTTTCAACATACGCCACTGCAATCCTCCTTCATTTTCTTGCATTTTCGGTTTCTGGGTCTGTTTTCCTTTTAGGGTTCTCAGTGGTTCAGAAAAAAAAATGTTTTCTTTTTCTTCCCTTTATCCATACTCAGATTTGAGTTGAGCATCACACAGTGGGGTTGAGTTCAGATTCACTGGCGTGGAGCAATTCGCAGTAAGTTTCCAGCTTTGTTGCATTTTGGGCTTGTTCTAATTTCAGTGAACCATGATCGAGTTGATTGATTTAACTGTTTTCTGTGTCCAGTGTTATGTGTGGGTGATGAGTGGATCTGGGGTTTGATGTGATTTCTTTTAGTAATGGGGGTATGGTTTCACTTGGGGGTATGAGTAATTTGGTGTAGTTGGACTGTGTGAAGTTGAAAGGTTGAATTTTTTTTAGGCAGGGTTTAGTAAGCTGGGTATTGGAGAACATTCAAAGGGTAATCTATATGTGAATAATAGTTTGATTTGGAGATGAATTTCTACTGTTTCGACTATCTGTATACAAATTTTTATGGCGTTGATATTTTCGTATGCATTATTTACTTATTTTGTATTTCTAGGTTATAACTTTGCAGTTGGGGCATGTTAAACTGTGTATTTTTAAGTTGCTAAATAAGGAGTTTGAGCTGATGTGAAGTAGTGGATGTTGTTGTCTAACTAAGGCTTTAAAGTTTCGGGGAGTTGTAGAATCTGTATACGAGATTTGTATTGCAAATGATGTCACGTTGCATTAGTCTATGCAGATTAGGATTAGCAAGGTTAGAGGTGTTTAGAGTTGACTATATTTGATTAATACAGTATTGGGTTTTGGGCTTGGGATTCTGGGTTAGTCTGATGGAATTGTTGATTTTTTATAGTTAATTTGTTGTTGTGTTGTATCCAGTTTAAGATGTTTCTCTTTCCGTACACTGTTTGATCAGCTTATTGGAAAAAGTAGATAAATTAGTTACAGAGCATAAACTAGAGATTCGTTGGATTGTTAGTTTATGCTATCACCGTTTGGAAATATATGATTTAGGACAGTATTATCATAGTTTTACATATGTAGAAGAGTTTGGATACATTATGTACACAAAGTTGTGAAAATATTGATTTTATAGTGATTGAGTATATGTGTTATTCTTTGATGCAGGGTTTTAGTAACCATTCAGTCCCTAATTTCTGTCTCTAACTCTAATACTGCTTTTGGAATTATTGGATTCTTCATTTGATGAGGGTTTTGGCCGGATTGCGTGTAACTCCAGATAGTAATTTGAAGTGATAGATATTCCAAACTATCAATGGTACTAATTTAAGAAACTTGTTTACTGCCTATACAAATTACAAATA


Gene Sequence:
>Vu_16460(+)
ATGCCTACATGGTGGGGGAAATCATCGTCAAAAGAAACCAAGAAGAAAGCAAATAAGGAAAGTTTTATCAATTCATTTCACCGCAGATTTAAAATCCCATCTGAAAGTAAATCAAGCAGTAGATCTGGAGGATCTCGTAGACATTGCAATGATTCAATTTCTGAGAAAGGGGCTCAGTCTCCTCCTGAATCAAGATCTCCGTCACCTTCCAAAGTGGCAAGGTGTCAAAGTTTTGCTGAAAGGCCTCATGCTCAGCCGCTACCACTTCCTGTCCTGCACCCATCAAATATAAGCCGGGCAGACTCTGAAATTAGCATATCAGCTAAATCAAGACTTGAAAAAGGCTCCAAACCATCATTGTTTCCACTACCAAAACCAGCATGCATGCGTGGTAGGTTGAACCCTGCAGATTTGGATGGAGACCTGGTCACTGCTTCAGTCTCTAGTGAGAGCTCTGCTGACAGTGATGAGCCAGTGGACTCTCGCAATCTTAGTCCTTTGGCAACTGACTGTGAAAACGGGGCTAGAACTGCTGCAGGCTGTCCTTCCAGGTATACTCTATAAGCATTCACTATAATATGCTTCAAGCTTGCATATTTTGTTGCATAAGCATGCCTAGGGTGTGTATTTTTAGACATAGGGAACAGAGTTGTGTCTTCACTTAAAAGCTTAAGCTTTAGGGATAGTTGGTTCATGGCATGTTATCAAAGCCTCAGCTCAATCCTTGCTGCCCCATTCTATAAAAAAGTTGAATATTGGCATAAGGTAGGGGACCAAGGAATTATCCATGCAGGAAGTTCAATGGTATATAGGGTGTGTTGGAGATATAACATAAAACCATTCTTGAGTCATCATCTTAAGCTTAAGCTTTTGGGATGGCTAGTTCATGAAATTTATGATTACTAGCAAATAATTTTTTATTTTACTCATTTTGGATGTTGGCCTTTTTATGAAGCTCGATGCCCAAGGATCTATCATCTACTGTTTCCCAAATAAATTCAAGAGAAACCAAAAAACCGGCAAACATTCTGGGTAATCACATGTCTTCTACTTCACCAAAACGGAGGCCTTTAAGCAACCATGTTTCAAATTTGCAGATTCCTCCTCATGGTGCCTTCTGCAGTGCACCTGATAGTTCCAAATCAAGTCCGTCTAGAAGTCCATTGAGAGTATTTGGCACTGAACAGGTGTTGAACTCTGCCTTTTGGGCCGGAAAGCCATATTCGGAGGTCAATTTAGGTGGATCTGGGCACTGCTCAAGTCCAGGTTCTGGTCACAATTCTGGACATAATTCAATGGGAGGAGACATGTCTGGACAGTTATTTTGGCAACCTAGCAGGGGTAGCCCTGAATATTCTCCTGTACCTAGTCCCCGAATGACTAGCCCTGGACCTAGCTCTAGAATTCAGAGTGGTGCAGTTACACCTATTCATCCTAGAGCTGGGGGAACACTCAATGAATCACAGACAGGACGGGTTGATGATGGAAAACAACAGAGTCATCGTTTGCCCCTTCCTCCTTTAGCAGTTACCAATATTTTACCTTTCTCTCATTCAAATTCTGCAGCAACTTCTCCATCCATGCCAAGAAGTCCGGGAAGGGCAGATAATCCAATAAGCCCTGGATCACGTTGGAAAAAAGGAAAACTGCTTGGCAGAGGCACATTTGGACATGTCTTTGTTGGCTTTAATAAGTACGAGTTCTAGACCAATTGTTCTTTGATTCTATTACAAAGAATTTTTTTTCTACTTTTAAATCCACTATCTTATGCATCTTATAAATTGTTTGGTTAAAATATTTTGATGTTTAGGGAAAGTGGTGAAATGTGTGCTATGAAAGAGGTGACTCTGTTTTCAGATGATGCCAAATCTAAAGAAAGTGCTAAGCAATTAATGCAGGTAAATATATTTCCTTTTTTGACCCTGGAATTTTTTGTTTGATGTGCAACCGTTATTCTCATTGGAAATACATTAGTGTCTATTTCTGTTTCAAATTTAGTGTAGCTTTGAAAAGCTAACTCCCATATTGTGGCAGGAAATTGCCTTATTAAGTCGATTGCGGCATTCAAATATTGTGCAGTACTATGGTTCTGAAACAGTAAGTTGCCCATTTCCTTATTGGTTTGCGTTCTGTTTATATTAGCTACTTTTAAGTGATCATATTTATTTTGGGCATTTTATCCCAATTTGTAATGCTTGTATGATCATCTAGTTACAAGATTATTAGTTGGTTTATATATTTACCTGACACCAGAATATTATAAATTTGTCTACAGTTTGTCATTTTATAATGAATCATCCCTTAAACAGGTCGGTGACAAGCTTTACATATATCTGGAGTATGTCGCTGGAGGCTCCATATATAAACTTCTTCAAGAGTATGGACAATTTGGTGAACTAGCTATTCGTAGTTTTACACAACAAATTTTGTCCGGACTTGCTTATTTACATGCTAAAAATACTGTCCACAGGTGAACTAAACACATTTATTTTTAAAACTTAAAATTTTACTAATTCCTTATAATGTGACTGCTTTTCTATGCTTATGAGTTCTGATATCTATCTCTTAAATTGCATTTCTTGTAAAGGGACATCAAAGGAGCAAATATACTGGTAGATACTAACGGTCGGGTTAAGTTGGCGGACTTTGGCATGGCAAAACATGTAAGCTTGGGGATAAAAATTATCCTTTTTATTTGCATATAAGCCAATTGGTAGGATATGAAATTTGGTTTTTGTTGCTTGTGAAATTATGAATCAAGGTTTAAAACTTCCTAATTCACCAATTCAAGAGAGTTGCTAATTCAGTGGGTTTCTTTTCAGGTTTCTTTCTTGTATTTTTTTACCTTTTTTTGGAAGATATCTTTCCTGTCACACCTCCAACAAGTGTATCATGCATGACTTCAACTTGGAAAAATATCTCTATGAATCCAAAAGACATTGTTTTCCTTCATAATTGCCATTTGATATCACATCTGGTATAAATAATCGCAAGATTGCATGATCTATCCTGTTCCCTCAACTATTAACCTGCATAATTTTGCAGATAACAGGGCAATCATGTCCATTATCATTCAAGGGAAGCCCCTATTGGATGGCTCCTGAGGTAGTAATCTTTTCTGTTAGTTTCAGTTCTTTATAGTTTCAATTACATCTTGCTTTTGATGACATGATAGCTTGTCGTTCTAATATTTTAGGTTATAAAAAACTCCAATGGTTGCAACCTTGCCGTTGATATATGGAGCCTGGGATGCACAGTTTTGGAAATGGCTACAACTAAACCTCCTTGGAGTCAGTATGAAGGGGTTAGTAATTTATGTCAATATATTGGAAGTTTTAGCTAGCTTTTTTATATTCTATTTCCCGACTATTATTTTATGTAGTTTATTATTTTCATTTATAAAGCATTGATGATATTTCTTGTTTTAATTTATGTGTTGACTTGATGTATTATTGGCTTTGCATGATAACAAAAAAGGTTGCTGCAATGTTCAAGATTGGTAATAGCAAGGAACTCCCAGCAATCCCGGATCACCTATCTAGTGAAGGAAAGGATTTTGTTAGGAAATGTCTCCAACGGAATCCACACAATCGCCCTTCGGCAAGTGAATTATTGGACCACCCTTTTGTAAAATATGCTGCACCTTTAGAGAGACCTATTCTAGGTCCTGATGCTTCTTCAGACCCAGCCGTATCTGGGATCACACAGGGAGCTACAGCTCTGGTAAGGAAGCTACTGGCAACATTAATCACGTAAAAAAATTGTCTATTTTCATATTAGTGTGAAGTTGGGGATTGCCTGTTTATCTTGCATTCCATGTGTTAAATATTTGTGCCCCCTTATTCCCCATGCACATGATAGGAATGAAATAGGAAGCCATCTTCTCTTCTACTTGAAAATGTAAGACATTTTTGTGTGCTTCATCCATTCAAATTCCTCGGTTGATGAGTCATTTTTCTTGGTATTATGTTGTGTAGACATTTTGTTCTCTTGGAAATATAAATTTGAATAATTGAATCTATCAGAGACTATAATAATAATATTTCGGAGGGGGGATTACGTACAAAATTGTAATATTTATGAATGAAAAATATAGTTTCCAAACCCTTAACAAGCCTTTATTTGGATTTGCTTGGATAAATTTTTCCATAACTTCTGGTAGAAAAGTATTAGGAAAAATGGAATAAACCTCTCTACCAGCTTTTGTTTTTGCATAGCTTCCCCAAAACTAATTTATGTACAAGTTAATTTTAGCTCAGCAAGAGATTTATTTCATTTTTTCTTATTTTTTCCATGTCACTGTTTGCAGAGACATTAATTTAAACAGGTCCATTGACATACTATACTTGATGGGCTCTTCTAGGGCTTCCTGATCAATTTGTGTCATAGTTTATAATCAGTATCACCTTTAAATTATTTAAATAGGTTCTCATAAAATTGAAAAAACAAATCCTTGAAAAATTGCTGAAATATTCAAAATCAAACTTCACTATTATTTCCCTCCCTTTGTCATGCATCAATATATTTTTGTTGTCTTGATTACCCAACTGATTAAACTCATAAATGGCCTGTATTCAGCTGATATATTTCTATTTTGGAATCATGACATAGTAATAACTTAAGCCTTTTTGTGTTATTGTTTGGAGAAAAGGATTTGTATTCTTGTTGAAATGTGTGATTCCCATCAATGCTTCATCCTGTCTCACTGATTCCCTTGGAAGTAGAGAATAAAAAAGACAGGGTTAGGCATAGACAACTAGAGAAACTTTACGAAACCATTTGCTTTCTACAAATTATAAGATAGAATCGCTCCATTAACTTGGAGGAAAGTACACACATGGAGGTTGGAGAAACAACTGCTGATGAAGACTGTTGCCGTCAGCAGAATTGTGGTTATGATTAAGCAAAATAAATTTTCTTATCTGGGTGTTCATTTGAACTATATCTCAATTGTATAATACTGGAAAATTTGGCTGTCATAATGGAATGATCTTTGAAGT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