Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16440 LG4 23904809 23907313 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g24010
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 23904969 missense_variant p.Phe782Tyr
T/A 23904978 missense_variant p.Glu779Val
G/C 23905118 missense_variant p.Asn732Lys
A/T 23905270 missense_variant p.Ser682Thr
C/T 23905337 synonymous_variant p.Gly659Gly
G/T 23905459 missense_variant p.Arg619Ser
G/T 23905501 missense_variant p.Leu605Ile
C/A 23906009 missense_variant p.Lys435Asn
C/A 23906015 missense_variant p.Lys433Asn
A/G 23906040 missense_variant p.Phe425Ser
A/T 23906056 missense_variant p.Leu420Ile
C/T 23906074 missense_variant p.Gly414Ser
A/T 23906232 missense_variant p.Val361Asp
T/A 23906610 missense_variant p.Glu235Val
T/C 23906981 synonymous_variant p.Lys111Lys
T/G 23907044 missense_variant p.Arg90Ser
G/A 23907157 stop_gained p.Gln53*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16440.1
METQKLIIHLILLLLCIPCSSSFTPIDNYLLSCGSQNNASLFNRIFIGDSTNQVSSFLSADKSISLTNQNPPPDLPILYHTARVFPSTGRFRFNVRKHGTQLVRFHFSPFKAQGFDLKAANFSVLVDGNLVLRNFKPSNGVLLKEFILKIESNLLEIVFRPEGNSGFGFVNAMEVFTAPVDFVIDYGARLVGPFGVVEYKNLSSQVLETVHRINVGGAKVTPFNDTLWRTWIPDEEFLVFKDAAKPAVSNQTPNFQKGGATREIAPDSVYMTAQEMDKDHAIIGSQFNITWDFPVAPGGVRHLIRLHFCDIVSPVLNLLYFDVYINGYSAYKDLDLSSLAVHVLASPVYVDFVADSNDSGVIRISVGPSELSGSRGMNAILNGAEIMQLVNVVDSRVVPGKKRLWILVGSIAGGVVVLLLVMSAFVLALKCRKKKKKKKPKQRTLESVGWTPLRVFGGSSLSRMSEGTAFPSPGSYGYFGLRIPFADIQLATNNFDRSLIIGSGGFGMVYKGVLKDNVKAAVKRGMPGSRQGLPEFQTEITILSKIRHRHLVSLVGYCEENSEMILVYEYVEKGPLKKHLYGSAVHAPLSWKQRLEICIGAARGLHYLHTGFAQGIIHRDIKSTNILLDENYVAKVADFGLSRSGPCLNETHVSTGVKGSFGYLDPEYFRRQQLTDKSDVYSFGVVLFEVLCARSAVDPQLDREQVNLAEWALEWQKKGMLEHIIDPHLVGNIKQSSLKKFGETAEKCLAEYGVDRPTMGTVLWNLEYALQLHESDQEEEPFDDSSAQETVNVNTTITPGSPSSNMRREENNDNGYSDISATEVFSQLMKSEGR*


CDS Sequence:
>Vu_16440.1
ATGGAGACTCAAAAGCTAATTATACATCTCATTCTTCTTCTCCTTTGCATTCCTTGTTCATCCTCTTTCACTCCCATAGATAACTACCTTCTTAGCTGTGGATCACAGAACAATGCTTCTCTCTTCAACCGCATCTTCATTGGTGATTCCACCAACCAAGTCTCAAGTTTTCTCTCTGCTGACAAATCCATTTCCCTCACCAACCAAAACCCTCCTCCGGATTTGCCCATTTTGTATCACACTGCAAGAGTTTTCCCCAGCACAGGAAGATTCAGGTTCAACGTGAGAAAGCATGGCACCCAATTGGTTCGTTTTCATTTCTCACCTTTTAAAGCTCAAGGGTTTGATCTAAAAGCTGCTAACTTCAGTGTCTTGGTTGATGGTAATTTGGTGCTTAGAAATTTCAAGCCAAGTAATGGTGTGTTGCTTAAGGAGTTTATTCTGAAGATAGAGTCAAATTTACTTGAAATTGTGTTTAGACCTGAAGGTAATTCAGGTTTTGGCTTTGTAAATGCTATGGAGGTGTTCACTGCTCCTGTTGATTTTGTTATAGATTATGGAGCAAGGTTAGTGGGTCCTTTTGGTGTGGTAGAGTACAAGAACCTTTCATCTCAGGTTTTGGAAACTGTCCATAGGATTAATGTTGGGGGTGCGAAAGTAACTCCTTTTAATGACACCCTTTGGAGGACATGGATTCCTGACGAGGAATTTCTGGTTTTTAAGGATGCTGCTAAGCCTGCGGTGAGTAATCAAACACCAAATTTCCAGAAAGGAGGCGCCACTAGGGAGATCGCGCCAGATAGTGTTTACATGACTGCACAGGAAATGGACAAGGATCACGCCATTATAGGTTCACAGTTCAACATAACCTGGGATTTTCCAGTGGCTCCAGGTGGTGTTCGGCACTTGATTCGGTTGCATTTCTGTGATATTGTTAGTCCTGTTCTTAATTTGCTCTATTTTGACGTGTATATCAACGGGTATTCTGCATACAAAGATTTGGATTTGTCATCCCTTGCAGTCCATGTGCTTGCATCTCCGGTCTATGTGGATTTTGTTGCAGATTCTAATGATTCAGGTGTTATTCGAATAAGTGTTGGCCCTTCTGAACTGAGCGGTTCTAGGGGGATGAATGCCATTCTGAATGGGGCAGAGATAATGCAGCTGGTGAATGTTGTGGACTCACGTGTTGTTCCTGGGAAGAAGAGGTTATGGATATTGGTGGGTTCAATTGCAGGTGGTGTTGTTGTTTTGCTTTTAGTTATGTCTGCTTTTGTGCTTGCTCTCAAATGCAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCAAAACAAAGAACACTGGAAAGTGTAGGATGGACTCCTTTACGTGTGTTTGGGGGGAGTTCACTTAGTAGAATGTCTGAAGGAACAGCTTTTCCCTCTCCTGGTTCTTATGGTTATTTCGGATTGAGAATCCCTTTTGCTGATATACAATTAGCCACAAATAACTTCGATAGGAGTCTAATTATAGGATCTGGTGGGTTTGGTATGGTTTACAAAGGAGTGCTCAAAGACAATGTGAAGGCTGCTGTCAAGAGAGGCATGCCTGGATCAAGACAAGGACTTCCTGAATTCCAGACTGAAATAACAATCTTATCCAAAATTCGCCATCGCCATCTTGTTTCACTGGTTGGATACTGTGAAGAAAATTCAGAGATGATACTAGTCTATGAGTATGTTGAAAAGGGTCCACTCAAAAAGCATCTATATGGTTCAGCAGTACATGCACCTTTGTCTTGGAAGCAGCGGCTTGAGATATGCATTGGTGCAGCTAGGGGTCTCCACTATCTACACACAGGTTTCGCGCAAGGAATCATACACCGTGATATCAAATCAACCAATATTTTGCTGGATGAGAACTATGTTGCCAAGGTTGCTGATTTTGGTCTCTCAAGATCAGGACCTTGTCTCAACGAAACCCATGTTAGTACTGGTGTGAAAGGGAGTTTTGGTTATCTTGATCCAGAGTATTTCCGACGGCAGCAGCTTACGGATAAGTCAGATGTTTACTCATTTGGGGTTGTGCTTTTTGAGGTTCTTTGTGCCAGATCTGCTGTTGATCCACAACTTGATAGGGAACAGGTGAACTTAGCCGAATGGGCACTTGAATGGCAGAAAAAAGGCATGCTGGAACATATTATTGATCCTCATCTTGTTGGGAACATAAAGCAAAGCTCGTTGAAGAAATTTGGTGAAACAGCAGAGAAATGTTTGGCTGAATATGGTGTTGATAGGCCAACTATGGGTACTGTATTGTGGAATTTGGAATATGCACTTCAGCTCCATGAAAGTGACCAAGAAGAGGAGCCATTCGATGATAGCAGTGCTCAGGAAACAGTGAATGTGAATACTACGATAACTCCTGGGAGTCCTTCTAGCAACATGAGAAGAGAGGAAAATAATGATAATGGTTATTCAGACATAAGTGCTACTGAAGTTTTTTCTCAACTAATGAAGAGTGAAGGTAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_16440::LG4:23907313-23909313(-)
TAAAAATTGACTATAAAAAAATATTAAAACTCAGTCGAGATAAAAAAATATATAATAATAAAAACCAAATTACAAATTATATATATATATATATATAATTACATTTTGTAAATAAATATATATTTCTTCAAACTTTCATTTAATGTTATGATTTATTTTGTATTATAATATTGTAGATATATGGTAACATAAATTCTATATATTAAAAATGTTTGCCGTTGAAGATAATATATCTCGTAAATGAAATGATATGCTACTTGAAAATGGATAATCCTTTTATATATTTTATTACTAATTATCATACAAATTATTATAATGCCCTACTTGTACTATACATCATAAATGATGATACAGTGGCACATTTAATGGATGTACAATTGCACATGCATGTTTTTATGCACTTAAATTCTTAGCTATGATTTCGTCATGCATGTGTCATTATGTTATGCACATGTGGATTGCTTTAAGATCACTTTACTAATTCCATAAATTTCTTAACTATTATTTTAAATAATGGTCATATTATTCATTTAAATTAATATATGAGGCATTTATTTTTAAAACCCAAAATAAACACTGATGTTATTTATTAAAACTAAATCCTGATTAAATTCTTCATCAAATACATTTTTATCATGGTGTACAAATTTCTTCTTATAGACATCATGTTCATGAAAAAAAAGCTGTTTTATATCAAGAAGTGTTTGAGACTTTTATTTAATACAGGGAATTATTTAATTGTTAGATAAAGTAATAGTTTCAGCTACAAGTTTACTTTGAAACCAGAAATGAAAATTTAAACTTGAGATAAAGAATTCAAAAGCTGTATCACTTTGGTTTGAAAGTGTGATGCATTTTTCTTGGCTCTAATCTGTGACAGAGTAGTGGATGGCAGCCAAACCACAATTACTTGGAATCAAAATTTCTGTCAACTTTCTTTTCAACCAGTTAAAGATGCCAACCAAACAAGACTCTATGCCATTAATGATTGCTAAATAGATTATAACCAAACAAACCCCACCTACCAGTAAAAGTAATTGAATGAACATTCAGTGCAATTCCACTGTCTTACTATTATTTCTATAACCAGGAGCCATACATTGCCTTTTACTCAATCCAACTGCTTGATGAAATAAAGTCATATTTTCTGCTAAGAATCTATATCTTAATCTGAAATAAAGAATTTAAGTGCCTAAAACAGCTTCCACCATCAACTTTTTGATAGTGTGCTAGTATTTATCTTTCTTCCAGTGTTTACCCTCAAATTATTCCTACAACAGGCAATTTGAAAAGTGATCAGAAATGAATTTTAAATTTAATTTAACTTAATAAAATTGATTTATGCAATAAAGTTTATATTTATTTTGATATTAATTAGAAATTTGTCTTATTTTTTATGGATTGAAATTTTATTTTCATGAAAATTAATATTGACTTTCTATAAACTGTCATGCATTTTTTTTAGTCTAGGTAGAGTAGCAGAACAACTAGAAGTTAATAAGCAGTTATATTAATGTGTTCTAAGATTTGAAGTTTTATATTCAGTATGAGATAAACTATTCTTCAACTTTTAAAGGTGTTCATACTCTAATAAAAAAACTGCATTTCAGTTTCACGATAGCAAACGATCTTAGTATCTTTAATTGCAAATAAAATATGTTACCATTTATCTGTTTTTCCTATATTTTATTACTTCACAAAGGACCTACTAAATCTAGAACAGAACCAAAACAAACTGAACTACTCAATCTAGTACAGTTAGTCCAAACCAGCATCCAGAGACGACACATTTTGTGTGAAACATTCGCAAATGTTGCTTTTTAAACACGACCATTAAGAAAATGAATAGTAGTGGCAGCCACCTTGACTTAATGAGTGACTAAAATTGATGTGAATTTATTGTCTCTTTACTTTCTATATAAGCATTTGCTGCAAATCTTTCACAGTTTCTACTTCCATGTGAGCTCCAAATTCCTTGAGGACCGTATCCTCCTTTTTCC


Gene Sequence:
>Vu_16440(-)
ATGGAGACTCAAAAGCTAATTATACATCTCATTCTTCTTCTCCTTTGCATTCCTTGTTCATCCTCTTTCACTCCCATAGATAACTACCTTCTTAGCTGTGGATCACAGAACAATGCTTCTCTCTTCAACCGCATCTTCATTGGTGATTCCACCAACCAAGTCTCAAGTTTTCTCTCTGCTGACAAATCCATTTCCCTCACCAACCAAAACCCTCCTCCGGATTTGCCCATTTTGTATCACACTGCAAGAGTTTTCCCCAGCACAGGAAGATTCAGGTTCAACGTGAGAAAGCATGGCACCCAATTGGTTCGTTTTCATTTCTCACCTTTTAAAGCTCAAGGGTTTGATCTAAAAGCTGCTAACTTCAGTGTCTTGGTTGATGGTAATTTGGTGCTTAGAAATTTCAAGCCAAGTAATGGTGTGTTGCTTAAGGAGTTTATTCTGAAGATAGAGTCAAATTTACTTGAAATTGTGTTTAGACCTGAAGGTAATTCAGGTTTTGGCTTTGTAAATGCTATGGAGGTGTTCACTGCTCCTGTTGATTTTGTTATAGATTATGGAGCAAGGTTAGTGGGTCCTTTTGGTGTGGTAGAGTACAAGAACCTTTCATCTCAGGTTTTGGAAACTGTCCATAGGATTAATGTTGGGGGTGCGAAAGTAACTCCTTTTAATGACACCCTTTGGAGGACATGGATTCCTGACGAGGAATTTCTGGTTTTTAAGGATGCTGCTAAGCCTGCGGTGAGTAATCAAACACCAAATTTCCAGAAAGGAGGCGCCACTAGGGAGATCGCGCCAGATAGTGTTTACATGACTGCACAGGAAATGGACAAGGATCACGCCATTATAGGTTCACAGTTCAACATAACCTGGGATTTTCCAGTGGCTCCAGGTGGTGTTCGGCACTTGATTCGGTTGCATTTCTGTGATATTGTTAGTCCTGTTCTTAATTTGCTCTATTTTGACGTGTATATCAACGGGTATTCTGCATACAAAGATTTGGATTTGTCATCCCTTGCAGTCCATGTGCTTGCATCTCCGGTCTATGTGGATTTTGTTGCAGATTCTAATGATTCAGGTGTTATTCGAATAAGTGTTGGCCCTTCTGAACTGAGCGGTTCTAGGGGGATGAATGCCATTCTGAATGGGGCAGAGATAATGCAGCTGGTGAATGTTGTGGACTCACGTGTTGTTCCTGGGAAGAAGAGGTTATGGATATTGGTGGGTTCAATTGCAGGTGGTGTTGTTGTTTTGCTTTTAGTTATGTCTGCTTTTGTGCTTGCTCTCAAATGCAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCAAAACAAAGAACACTGGAAAGTGTAGGATGGACTCCTTTACGTGTGTTTGGGGGGAGTTCACTTAGTAGAATGTCTGAAGGAACAGCTTTTCCCTCTCCTGGTTCTTATGGTTATTTCGGATTGAGAATCCCTTTTGCTGATATACAATTAGCCACAAATAACTTCGATAGGAGTCTAATTATAGGATCTGGTGGGTTTGGTATGGTTTACAAAGGAGTGCTCAAAGACAATGTGAAGGCTGCTGTCAAGAGAGGCATGCCTGGATCAAGACAAGGACTTCCTGAATTCCAGACTGAAATAACAATCTTATCCAAAATTCGCCATCGCCATCTTGTTTCACTGGTTGGATACTGTGAAGAAAATTCAGAGATGATACTAGTCTATGAGTATGTTGAAAAGGGTCCACTCAAAAAGCATCTATATGGTTCAGCAGTACATGCACCTTTGTCTTGGAAGCAGCGGCTTGAGATATGCATTGGTGCAGCTAGGGGTCTCCACTATCTACACACAGGTTTCGCGCAAGGAATCATACACCGTGATATCAAATCAACCAATATTTTGCTGGATGAGAACTATGTTGCCAAGGTTGCTGATTTTGGTCTCTCAAGATCAGGACCTTGTCTCAACGAAACCCATGTTAGTACTGGTGTGAAAGGGAGTTTTGGTTATCTTGATCCAGAGTATTTCCGACGGCAGCAGCTTACGGATAAGTCAGATGTTTACTCATTTGGGGTTGTGCTTTTTGAGGTTCTTTGTGCCAGATCTGCTGTTGATCCACAACTTGATAGGGAACAGGTGAACTTAGCCGAATGGGCACTTGAATGGCAGAAAAAAGGCATGCTGGAACATATTATTGATCCTCATCTTGTTGGGAACATAAAGCAAAGCTCGTTGAAGAAATTTGGTGAAACAGCAGAGAAATGTTTGGCTGAATATGGTGTTGATAGGCCAACTATGGGTACTGTATTGTGGAATTTGGAATATGCACTTCAGCTCCATGAAAGTGACCAAGAAGAGGAGCCATTCGATGATAGCAGTGCTCAGGAAACAGTGAATGTGAATACTACGATAACTCCTGGGAGTCCTTCTAGCAACATGAGAAGAGAGGAAAATAATGATAATGGTTATTCAGACATAAGTGCTACTGAAGTTTTTTCTCAACTAATGAAGAGTGAAGGTAGATAG