Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16053 LG4 14148654 14150311 PREDICTED: somatic embryogenesis receptor kinase 1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 14148901 downstream_gene_variant
G/T 14148983 downstream_gene_variant
T/C 14149032 downstream_gene_variant
T/C 14149287 downstream_gene_variant
A/T 14149624 downstream_gene_variant
A/T 14149643 downstream_gene_variant
A/G 14149768 missense_variant p.Phe91Leu
G/A 14149769 synonymous_variant p.Ala90Ala
A/G 14149838 downstream_gene_variant
A/T 14149870 downstream_gene_variant
C/T 14150102 missense_variant p.Glu34Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16053.1
MRVPFYVLAIFLLLSDPFAVINANSEGDALFAFRRAVKDPNNVLQSWDPTLVDPCTWFHVTCDDDKRVTRLDLGHAKLSGHLVPELGRLQRLQFLELYKNDLKGPIPRELGDLKNLVSLGLYQNNLTGSIPASLSNLSNIKFLRLNSNMLTGRIPRELTKLGNLKILDLSNNDLCGTFPTSGSFSKFSEQSFKNNTRLKGPELMGFVRYDTGESCK*


CDS Sequence:
>Vu_16053.1
ATGAGGGTACCTTTTTACGTTCTTGCAATTTTTCTTCTCCTATCAGACCCTTTTGCTGTTATAAATGCAAACTCTGAAGGTGATGCTCTGTTCGCATTCAGGAGAGCTGTGAAAGACCCAAATAACGTTCTGCAGAGCTGGGATCCAACTTTGGTGGATCCTTGTACATGGTTCCATGTTACCTGTGATGATGATAAGAGAGTAACCCGACTGGACCTCGGACATGCAAAACTGTCTGGTCATTTGGTTCCAGAACTAGGGAGGCTCCAGCGCCTTCAGTTTCTAGAACTATACAAGAATGATTTGAAGGGTCCAATACCAAGGGAACTTGGAGACCTCAAGAACCTGGTTAGCTTGGGTCTCTACCAGAATAACCTCACTGGCTCCATTCCCGCCAGCCTGTCCAACCTCTCCAACATCAAATTCTTGCGGCTCAACAGCAACATGCTCACTGGAAGAATACCGAGGGAACTCACTAAGTTGGGAAACCTCAAGATCTTAGACCTATCAAACAACGATCTGTGTGGTACTTTCCCTACATCCGGCTCTTTTTCAAAGTTCTCTGAACAAAGTTTCAAGAATAACACAAGACTTAAAGGACCAGAATTAATGGGATTCGTCAGATATGATACTGGAGAAAGCTGCAAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_16053::LG4:14150311-14152311(-)
CGGAAAGATGTTGGATTGAATTTGATTTGAAGAGAGCAATGGGAATTGGGGTCCATTGATGTGAACATGACAAACATTTATTCATGTCCAATAATATTAATACTTTGAGTAATGGTAAATGACACGTTTTACTTTAATTTGATACATAGTGGTATAAAGGTAAAATAGTTTTAAAGGAATAATTTTTTGTATTTTATTTTAGATGATAATATCAAATAAATATAAAAAAGTTACGTGTGTCAAAGTATTATTTTTCTAACACTTTTACATCTTAAAAAACAATATTAACATCCTCCTAACCAAATGTTTACACTACATAATAGAAAAATGATACTTTGACACACATATTTTACATTCATTTGATATTATTCATTCTATTTTTTATTTTTATTTTTTAAAAATAAAAAAAATCACTCATTTATGACTACTTTACTCTTGTAGTGTGTCATCTTATAATTAACTTACATAATAAGGATTATAATTACTTTTTAGTTCAAAATTTTGTTCCCTCCCTTTCTCCTTGGTGGGACATAATATTACAACTTTATCTTTCTAAATGTGGTGGTCAATGGTCAAAGACCATTATAATTTCTTTTACACGTGAGGTGTTGATTATACACTCAACAATAATTATGCGTATGGAAAGCTTTTATCGTTTGGCCGAAGAAAGAGAGACTAAGTAGAGAGGGCTTTTTGTTTCGTACAGTAATACTATAATAACTTTTTCCCAAGCTTATGGTTGGTGAGTGTGAGAATGAAAAGGAGTTAACATGATGTGGTCTAAGTCTGAAATCTCCAAGTCACTTCTTTTAATGAGGAGATCATTGCATTATCTGTCTAAGATCACACAAAGGAACCCTTTCATGCTTTTGTGTCCCTCCACTATCAAAAAAGAAGATACAAAGTACAGTAACTTGAAACAGAACAAACCATGCTGTCAACCAATTCAACCCATTGAGCCGTCCCAAGTCAAAACTATAGTGTTGGATTTGGACCCATTAACATAAAATGCATTAAAAGACGAGTATTTCATTTGCATCTATAATCTTTCTATTCACTTTCTTCATTCCTAGCTAGTGCCTTACTTTTACGTGTCCAATCACAAAGCTTACTATGATGCTTCCAGTTAACTAATTTGCCATCATGGTTGACTAATCAAAAACCAATTTAACTTTATCATCTTTGTCATTTTATTACTTACAGTTTTCAATACCATTATTAATATTCCTTGCTGCTTTGTGTCAGAGATAATTTTTTCTAATAAAAGAAAACAGAATGAACAAGTATTCTCCTTCTTTGAAATCACACCATCCATCATCGAATCTAAAGTACATTTTTTTATTTTGTTTTCAAATACAAGAGGAAGAACAACAATTTAGTTTAGTCTGTGTAATCGCCTGAAACATTCTTTGTATTGCTACTGCGATAGCCTTAAACCATATTGCTTGAATACTGAATAATCTAATTGATATCGTACAGTTTATCTTTACCTTTAACGTAATTGTTTTAATCCTTTTCTCGTATACATGCATTCCAGAAATGTTCCTTTAAATTACAAAAATAATAATAATGAACATATCTCACTTTTAAATGCACGTAAATATTTTCCTTACTAAAAATTCAAATAGTGTTTATAGTCTTTGACCTAACTAAATATCGAGAATAACAATTTTAATTATCATTTGAAAAAGAGTAATGATATTTACACGTAAGACTACAATGCTAGTTGAGTGTGAATAGACAAACTAAAGAGGTAGCATCTCATATCCATTTACGGGCACTATAAAATTCTCCATATATCTGTGATTCCATTCCAAAAGCATAATTGCATTAAAGAAAGAGGAAGATTTGGTCTCTATTACATGTTTTTGTTATTAGTATTATTACTATTAGGCGCACTTCGACTACAAATAGAACCATCAATTGGTCTCAGCCGGTGTGAGGGGTGAGGCTCTAAAATCTCTACCAACTTTCAGGGCTGCTACTTCATGGAGAGGAGC


Gene Sequence:
>Vu_16053(-)
ATGAGGGTACCTTTTTACGTTCTTGCAATTTTTCTTCTCCTATCAGACCCTTTTGCTGTTATAAATGCAAACTCTGAAGGTAAACCCACCCTTTTGTATGTATGCGTTCCATATGTATCCAGCCACAAATTTTGAAGAATCTTGTCACAATAGTATATTCTGCTTTTTTGAACTTGAAAACGAACAGGTGATGCTCTGTTCGCATTCAGGAGAGCTGTGAAAGACCCAAATAACGTTCTGCAGAGCTGGGATCCAACTTTGGTGGATCCTTGTACATGGTTCCATGTTACCTGTGATGATGATAAGAGAGTAACCCGACTGTAATTAACTCCATCTTGTCTTTTCAGTTTCTCACGTTTTTATTTGGAATGTATTATTTGTATTTTTTATTTTATTATGTATTCTTTGTAACATGTTTGTTTGATAAGTGTTGATTATTTCTCTGGGTTGGGTTAAGTCTGATAATTGCGTACTCATGCAGGGACCTCGGACATGCAAAACTGTCTGGTCATTTGGTTCCAGAACTAGGGAGGCTCCAGCGCCTTCAGTTTCTGTAAGCGCCATAGCGAAGTTTGTATTTATCTATTTTCTGAAAATGTCTGACAGACATCACTAAAGATCAAATATGAGGGTTTATTTCTCCAAAGTTCCTTTTGAATGTGTTATGCTAAGACAGAACGTAAGATTTGGTTTGCCAATGTGCAGAGAACTATACAAGAATGATTTGAAGGGTCCAATACCAAGGGAACTTGGAGACCTCAAGAACCTGGTTAGCTTGGGTCTCTACCAGAATAACCTCACTGGCTCCATTCCCGCCAGCCTGTCCAACCTCTCCAACATCAAATTCTTGTAAGTTAATTAAAATAAATAGCAAGTGGACCGTTCACCAAGCATAACCCTTTTATGATACAATATTACAGGCGGCTCAACAGCAACATGCTCACTGGAAGAATACCGAGGGAACTCACTAAGTTGGGAAACCTCAAGATCTTGTGAGTCTCTCTGTCCTATACTTTTCAATATCATACATCTTTTCATTCTGCTCCGTCAATTCTAATTTCTCACGTTTAAATTCGTTTTTCTTATGTTATGCAGAGACCTATCAAACAACGATCTGTGTGGTACTTTCCCTACATCCGGCTCTTTTTCAAAGTTCTCTGAACAAAGGTGAGTCCATCTAAAACTTATTAATCTGAGTACTTCACAAGGTCGACTTCGTTACTACTTGGAAAATTGATATTATTACTTGCACAAATTTTGTCACAGATTCTGTAAATAAATTGAAGCCGCTATATCTGCAGGGTGATAACAGTAATAATAACATATGACTTGAACTCAAATCATTGGTGACAAGAAATTATATAAATACCATTAAAATAGGAACATGGCGATTATAATTTACGTTTTACTTTTCGATGCTGATCATTTGTAGAATTTAGCTATTACTTTCATGCTTCTATATAACATTGATGACATTCCCCTGTTATGATTTCATGCTTCTCTTACCTCTAGATCCATGCTCAAGTAGTTGATTTACATGTGTGAGAGCATGAGCTAATAATAGTTTATATTCCTGCAGTTTCAAGAATAACACAAGACTTAAAGGACCAGAATTAATGGGATTCGTCAGATATGATACTGGAGAAAGCTGCAAATGA