Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15892 LG4 12756451 12759683 PREDICTED: disease resistance protein RPP13-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 12756789 missense_variant p.Trp836Arg
G/T 12757028 missense_variant p.Ser756Tyr
T/A 12757032 missense_variant p.Asn755Tyr
G/T 12757063 synonymous_variant p.Thr744Thr
T/C 12757107 missense_variant p.Thr730Ala
C/T 12758476 synonymous_variant p.Val273Val
C/T 12758497 synonymous_variant p.Leu266Leu
C/A 12758674 missense_variant p.Lys207Asn
G/A 12758683 synonymous_variant p.Asn204Asn
T/A 12758684 missense_variant p.Asn204Ile
G/A 12758687 missense_variant p.Ser203Phe
G/A 12758703 stop_gained p.Arg198*
G/A 12758709 missense_variant p.Leu196Phe
C/G 12758729 missense_variant p.Gly189Ala
C/T 12758730 missense_variant p.Gly189Ser
G/A 12758737 synonymous_variant p.Val186Val
C/T 12758739 missense_variant p.Val186Ile
C/T 12758766 missense_variant p.Asp177Asn
C/T 12758767 synonymous_variant p.Ser176Ser
G/A 12758774 missense_variant p.Thr174Met
C/T 12758802 missense_variant p.Asp165Asn
C/G 12758803 synonymous_variant p.Leu164Leu
C/T 12758806 synonymous_variant p.Ala163Ala
C/A 12758814 missense_variant p.Gly161Trp
C/A 12758821 missense_variant p.Glu158Asp
C/A 12758843 missense_variant p.Arg151Met
C/T 12758849 missense_variant p.Arg149Lys
C/T 12758858 missense_variant p.Arg146Gln
T/C 12758866 synonymous_variant p.Glu143Glu
C/T 12758874 missense_variant p.Glu141Lys
C/T 12758880 missense_variant p.Gly139Ser
G/A 12758890 synonymous_variant p.Asp135Asp
T/A 12758891 missense_variant p.Asp135Val
A/C 12758893 missense_variant p.Asp134Glu
C/T 12758900 missense_variant p.Gly132Asp
C/T 12758908 synonymous_variant p.Glu129Glu
G/A 12758920 synonymous_variant p.Phe125Phe
C/G 12758928 missense_variant p.Glu123Gln
T/A 12758930 missense_variant p.Lys122Ile
C/T 12758936 missense_variant p.Arg120Lys
G/T 12758939 missense_variant p.Ala119Asp
C/A 12758941 missense_variant p.Lys118Asn
G/A 12758950 synonymous_variant p.Asp115Asp
C/T 12758955 missense_variant p.Val114Ile
G/A 12758970 stop_gained p.Gln109*
G/A 12758982 missense_variant p.Leu105Phe
G/A 12758986 synonymous_variant p.His103His
C/T 12759006 missense_variant p.Gly97Ser
C/T 12759015 missense_variant p.Gly94Arg
G/A 12759030 missense_variant p.Arg89Trp
G/A 12759031 synonymous_variant p.Ser88Ser
C/G 12759037 missense_variant p.Lys86Asn
G/A 12759213 missense_variant p.Arg28Cys
C/T 12759279 missense_variant p.Val6Ile
C/T 12759289 synonymous_variant p.Ala2Ala
G/A 12759290 missense_variant p.Ala2Val
C/T 12759297 5_prime_UTR_variant
A/G 12759553 5_prime_UTR_variant
T/A 12759565 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15892.1
MADSIVVFLIDKLTRLLVEEAKLLTGVRDQVTSLQSELRFMNIFLRNSSKGKRKEHDMVAELVSQIRDVAHEAEDVIDTYVACIIKQSRRNVIGKVGFRGVDHALMLHQVAVKVDGIKARIKEIFDNKERYGIDDGKRGSEEEAERIRRQRREVEEEEVVGFALDSKVVIEKLTVSDSRLKVVSVVGMGGLGKTTLARKVYNSNRVKNMFPCRAWGYVSNDYRPREFFLSLLKCLMSTSKYSNLFKKREETSVSDEELKMKVRECLNRSKYLVVVDDVWQKQVWNEVKGAFPDDQNGSRILMTTRSAEVASHAGPVPPYALPFLTKEESWELLSKKVFRGEDCPCDLESLGKLIADSCDGLPLALIVMAGILANKKSPRDWSRIKDHVNWHLGRDNTLKDILKLSYDSLPARLKPCFLYFGMYPEDYRIPVKQLIQLWISEGLLTQETSGGQDIPEPEYIAEEYLDELVDRSLIQVVSRTNDGGVKTCRIHDLLRDLCISESREDKFFEVCGEIDIQNLNSCPRKLSLQGTLFHFSSSIVSDYTISATRSLLCFGQEVYKVKANHWRWLLKSFRLARVLDLGRMNVNSIPTDLEKLIHLRYLRIHSHNLETIPPSICRLWNLETLDLRGSPIKSFSGELWQLKQLRHLLLFGPVGLPEMPSESKTMPNLQTLSTVALDPRTASLLDSRRFPGMTKLGIHYERRDKCNAKIQLQSLHRLSHLQKLKVIGTTEIPQNANVFPSNITKISLTKFGFFNSTVMHTLGKVPNLQVLKLSSQTNDTRFDLHCATGGFLQLQVFEMIAIKVKMWRVDRGSMPRVRRLVVRSCKSLTQLPKEVWSLNTLREVQVLWPCTELAKGLQNLVMNNACKLVVYPLSANDELDFL*


CDS Sequence:
>Vu_15892.1
ATGGCGGATTCGATTGTTGTGTTTCTGATCGACAAATTGACGAGGTTGTTGGTGGAGGAAGCCAAACTTCTCACCGGCGTGCGCGACCAAGTTACGTCGTTGCAGAGCGAGCTCAGGTTCATGAATATCTTCCTCAGGAACTCCTCCAAAGGGAAGCGCAAAGAGCATGACATGGTCGCGGAGCTCGTCAGCCAGATCAGAGACGTCGCGCACGAGGCCGAAGACGTCATCGACACCTACGTCGCCTGCATCATCAAGCAAAGCCGGAGAAACGTGATCGGGAAAGTCGGTTTCCGCGGTGTGGACCACGCGCTCATGCTTCACCAGGTGGCTGTGAAGGTCGACGGGATCAAGGCCAGAATCAAAGAGATCTTCGACAACAAAGAGAGGTACGGCATCGATGACGGAAAGAGAGGCAGCGAAGAGGAAGCGGAGCGGATTCGGAGGCAGAGGAGGGAGGTGGAGGAGGAAGAGGTGGTAGGGTTTGCGCTGGACTCCAAGGTTGTGATTGAGAAACTCACGGTGTCGGATTCTCGTCTTAAAGTTGTTTCCGTCGTCGGTATGGGTGGTTTGGGAAAAACCACGCTTGCTCGAAAGGTATATAACTCTAACCGAGTGAAGAACATGTTTCCTTGTCGGGCGTGGGGTTATGTGTCTAATGATTATCGACCAAGGGAGTTTTTCTTGAGCCTGCTCAAGTGTTTGATGTCCACGTCCAAGTACAGTAATTTGTTCAAGAAAAGAGAAGAGACTAGTGTGAGTGATGAAGAGCTGAAGATGAAGGTGCGAGAATGCTTGAACAGAAGCAAGTACTTGGTGGTGGTGGACGATGTTTGGCAGAAACAGGTGTGGAATGAGGTTAAAGGGGCATTTCCTGATGATCAAAATGGAAGCAGGATATTGATGACTACTCGTTCGGCTGAGGTGGCTTCTCACGCTGGTCCTGTTCCTCCCTACGCTCTTCCTTTCCTCACCAAAGAAGAAAGCTGGGAGCTGCTTTCCAAGAAGGTGTTTAGAGGAGAAGATTGTCCTTGTGATTTAGAATCCCTGGGAAAATTGATCGCTGATAGCTGTGATGGGTTGCCACTTGCCCTTATTGTGATGGCAGGGATTTTGGCTAACAAGAAGTCACCGAGGGATTGGTCTAGAATCAAGGACCATGTGAATTGGCATCTTGGGAGGGACAACACACTGAAGGACATACTCAAACTCAGCTATGACTCCTTGCCCGCGAGGTTAAAGCCTTGCTTTCTGTATTTTGGCATGTACCCTGAAGATTATAGGATCCCCGTGAAGCAGTTAATCCAGTTATGGATATCCGAAGGATTATTAACACAAGAAACTTCTGGAGGCCAAGACATACCAGAGCCGGAATACATTGCGGAAGAGTACTTGGATGAACTGGTGGATCGAAGCTTGATCCAAGTGGTAAGTAGAACCAATGATGGGGGTGTCAAAACATGTCGGATTCACGATCTTCTTCGTGACCTTTGCATATCTGAGAGCAGGGAAGACAAGTTTTTCGAGGTTTGTGGAGAGATTGATATTCAAAACCTCAATAGTTGTCCCCGTAAGTTGTCTCTCCAGGGTACTCTTTTTCATTTCTCTTCGAGTATCGTATCTGATTACACCATCTCGGCGACGCGTTCCTTGTTATGCTTTGGGCAAGAGGTGTACAAGGTTAAGGCAAATCACTGGAGATGGCTTCTCAAGAGCTTCAGGTTGGCTCGCGTGTTGGATTTAGGACGAATGAATGTTAACTCAATACCCACTGATTTGGAGAAGCTCATTCATTTAAGGTACTTGAGAATACACTCTCATAATCTTGAAACTATTCCACCTTCTATATGCAGATTGTGGAATCTAGAAACCTTGGATTTAAGAGGTTCGCCTATAAAATCCTTTTCTGGTGAATTATGGCAACTTAAACAACTAAGGCATCTTCTGTTGTTTGGACCCGTTGGGCTCCCAGAAATGCCCTCAGAAAGTAAAACTATGCCCAATCTTCAAACCCTCTCAACCGTGGCTCTTGATCCTCGCACAGCATCGTTGTTGGATAGTCGTAGATTCCCAGGGATGACAAAATTGGGTATACATTACGAAAGACGTGACAAGTGCAATGCTAAAATACAGTTACAGAGTCTCCATCGCCTGAGCCATCTCCAGAAGCTGAAAGTGATAGGCACTACTGAGATTCCTCAAAATGCAAATGTGTTTCCGTCGAACATCACCAAGATATCCCTCACAAAGTTTGGTTTCTTCAACTCCACTGTCATGCATACGCTAGGAAAGGTTCCCAACCTTCAAGTTCTGAAATTGTCATCGCAGACGAATGATACTAGATTTGACCTGCATTGTGCCACGGGAGGGTTCCTTCAGCTTCAAGTGTTTGAGATGATTGCAATCAAGGTCAAAATGTGGAGAGTAGACAGAGGTTCAATGCCACGTGTTCGTCGTTTGGTCGTCAGAAGCTGCAAATCCTTGACTCAGCTTCCAAAAGAAGTGTGGTCTTTGAATACCTTGCGGGAAGTGCAGGTCTTGTGGCCCTGTACAGAATTAGCAAAAGGACTCCAAAATTTGGTGATGAACAATGCTTGTAAGCTCGTCGTCTATCCTCTCTCAGCAAATGATGAATTAGATTTTCTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_15892::LG4:12759683-12761683(-)
TTAACTTTAATAACATGTTGATATATATTTTGTTTATCTAGGTTTCGTGTGTTTTTAATTTTTTTGGCAAATATAGTTAACCTTGTTGTAGATATAACATTAACAATACGCAAAAAAATACATGCAACTATTATGTACGGTAATTTCATCATTTTCATAATAATGGTTTCAAAATTTATATTTATATATAATGAATTTTGATTCGTTAATATCATTAAAAACAACTTCAAAATACTGTGTTACCTTGAAACTTGTTCCTCTTTTCTCTTACACGTTTATTTTTTTCATTACCAAACACAAGAACAATTGCCCCCGTGAGTCACAGCATTTATGTTGACAACTAAAACTTTTCCGTTTAAAAAATAAAATTACGTGTTTTATTCCGATGCATTTTTGTAAAGTTAGATATTGCGAACTAAACTTACAACTAATTCTACATTAGCAAAAACCAAACATAGGAAAAATCCTTAAAGAGAATTAAAATATAACATTAATTTTATCGTTCACAAGTGGATTTTTGACAATTTAATTTACTTATAATTTTATTACTCGCTTTTATTATTGAGTTTGATATCATGGTTTTCTTCATAAATAAATCGCTATTTCATATCAAACAGTTACATTTTTCAAACTATTTATTTATACTCCTAACTCACAAATCATGCACTTCTATGATATCTTTTATATACATATATATTCTCATGATACATTATTAAGAAAATGAAGTTTGAACAAACCATAATTTTTGGAAGAAAAAAACACAACAAAATTAATAGAGAATTGGGTTTAACTGATTCTGGGCCGAGCCCACTTATACGGAGTAGTAGCCTCTCTAAGTTCAACACCGTGGGTCTCAAAATTCTGACAAAACGAAGAGGATTACTCCTACACCACCGAAGCTTACTCGCTGCGCCATCACCATTTTAAAAAACTCTAAAATTATCCTATATGTTTTAAAAAACCATACACTCGTACTTCTCTTTTTTTAACAGATGTGAATAGAAGAAAAATTTCTTCATCAAATATGTCACATCCGCCACATCCGACTTTCTGTTTTCTTTTTAGCTTTTAATTTATTAATTTATTATATTTTAAATTAATATATACATATTATTTAACTTTTTTCTAAATTTGTTACATATTATATATAAATTAATTTATTTTATTTAATGAAATAATTATATTATATTAATTTAATTTAATTATATTATTTTTTAAATAATTATAATCAACGGATATGTCACATCTGTTTAAATTTTTTTTAATTTTTAGTTTACTAAAATATTATATTTTAAATTAATTTATAGATTATTTAATTTTTTTTTGTTTTTATAATATATTACATAAATTAATTTTATTTTATTTAATTAAATAATAATTATTAATTTAATTAATTTGATCTTTATTTTACTTTAAATTAATAATAATTATTTAATTTTATAAATTAAAATTAATTTCGTAATATATTATAAAAAAATTAAAAATAACCTATAAATTAATTTAAAATATAATATTTTAATAAACTACAAACTTAAAAAAGTAAAGAAAAACTTAACGGATGTGCATATACGTTTATTATAATTAATTAAAAAATAATTTAATTAAATTAAATTAGTAATAATTATTTAATTAAATAAAATAAAATAAATTTACATAATATTATAAGAAAATAAAAAAATTTAAATAATATATAAATTAATTAAAGTATAATATTTTAATAAATTAAGAATTAAAAAAGAATATAAAGCTTAAACGGACGTGATGTCCCTTGAAGATAAGAAGTGGAAGTGTAGAATTGTTTAAAATGTGAAGGATAGAATTAGAATTTTTAAAAAATGTGGTCGTACAGGAGCAATTGGGACGGTGCAGGGAGTAATCCTCCAAAATGAAACAAGAGGGAACCAAACTATTCAAATTGGGTCGCGCCAGTAAGACTATTACTTTCTGCACCCACAATGATGGAAAAAAAAATATAAACATGGTTGTTCCCTGCGGTAGAG


Gene Sequence:
>Vu_15892(-)
AAAGAAGAAAAGAGAGAATGCTATAAAGAAAGAATAAAAGAAAAAAAATATTCGAAAAGTTCTTACTGAAATTCATTTCATATGTTTTGAATTAACATGCATTTTGATGTAATTCCTGATTTTTAATTTCTTATAAAACAGAGAGAGATTAAAAAAAAATCGAAAAGAAAAAATATCTGAGAAAAAAACAGAATCATGAGATGAGAATGGTCCAGAAAGTATTGTCCAGAGAAAGAGGTTGGATTGTTAGTGGAAGGTGTTGACTATGGAGAGAATGCTACGACGTTGACCTTTGTGTTTAGATAGAGAACACGGAAACTAGCGAGTGCAGTGCAGTGGGGTGCACCAAGATCGCTCCATTTCCAATCCAAACTGTAGAGTGCAGAGAAATGGCGGATTCGATTGTTGTGTTTCTGATCGACAAATTGACGAGGTTGTTGGTGGAGGAAGCCAAACTTCTCACCGGCGTGCGCGACCAAGTTACGTCGTTGCAGAGCGAGCTCAGGTTCATGAATATCTTCCTCAGGAACTCCTCCAAAGGGAAGCGCAAAGAGCATGACATGGTCGCGGAGCTCGTCAGCCAGATCAGAGACGTCGCGCACGAGGCCGAAGACGTCATCGACACCTACGTCGCCTGCATCATCAAGCAAAGCCGGAGAAACGTGATCGGGAAAGTCGGTTTCCGCGGTGTGGACCACGCGCTCATGCTTCACCAGGTGGCTGTGAAGGTCGACGGGATCAAGGCCAGAATCAAAGAGATCTTCGACAACAAAGAGAGGTACGGCATCGATGACGGAAAGAGAGGCAGCGAAGAGGAAGCGGAGCGGATTCGGAGGCAGAGGAGGGAGGTGGAGGAGGAAGAGGTGGTAGGGTTTGCGCTGGACTCCAAGGTTGTGATTGAGAAACTCACGGTGTCGGATTCTCGTCTTAAAGTTGTTTCCGTCGTCGGTATGGGTGGTTTGGGAAAAACCACGCTTGCTCGAAAGGTATATAACTCTAACCGAGTGAAGAACATGTTTCCTTGTCGGGCGTGGGGTTATGTGTCTAATGATTATCGACCAAGGGAGTTTTTCTTGAGCCTGCTCAAGTGTTTGATGTCCACGTCCAAGTACAGTAATTTGTTCAAGAAAAGAGAAGAGACTAGTGTGAGTGATGAAGAGCTGAAGATGAAGGTGCGAGAATGCTTGAACAGAAGCAAGTACTTGGTGGTGGTGGACGATGTTTGGCAGAAACAGGTGTGGAATGAGGTTAAAGGGGCATTTCCTGATGATCAAAATGGAAGCAGGATATTGATGACTACTCGTTCGGCTGAGGTGGCTTCTCACGCTGGTCCTGTTCCTCCCTACGCTCTTCCTTTCCTCACCAAAGAAGAAAGCTGGGAGCTGCTTTCCAAGAAGGTGTTTAGAGGAGAAGATTGTCCTTGTGATTTAGAATCCCTGGGAAAATTGATCGCTGATAGCTGTGATGGGTTGCCACTTGCCCTTATTGTGATGGCAGGGATTTTGGCTAACAAGAAGTCACCGAGGGATTGGTCTAGAATCAAGGACCATGTGAATTGGCATCTTGGGAGGGACAACACACTGAAGGACATACTCAAACTCAGCTATGACTCCTTGCCCGCGAGGTTAAAGCCTTGCTTTCTGTATTTTGGCATGTACCCTGAAGATTATAGGATCCCCGTGAAGCAGTTAATCCAGTTATGGATATCCGAAGGATTATTAACACAAGAAACTTCTGGAGGCCAAGACATACCAGAGCCGGAATACATTGCGGAAGAGTACTTGGATGAACTGGTGGATCGAAGCTTGATCCAAGTGGTAAGTAGAACCAATGATGGGGGTGTCAAAACATGTCGGATTCACGATCTTCTTCGTGACCTTTGCATATCTGAGAGCAGGGAAGACAAGTTTTTCGAGGTTTGTGGAGAGATTGATATTCAAAACCTCAATAGTTGTCCCCGTAAGTTGTCTCTCCAGGGTACTCTTTTTCATTTCTCTTCGAGTATCGTATCTGATTACACCATCTCGGCGACGCGTTCCTTGTTATGCTTTGGGCAAGAGGTGTACAAGGTTAAGGCAAATCACTGGAGATGGCTTCTCAAGAGCTTCAGGTTGGCTCGCGTGTTGGATTTAGGACGAATGAATGTTAACTCAATACCCACTGATTTGGAGAAGCTCATTCATTTAAGGTACTTGAGAATACACTCTCATAATCTTGAAACTATTCCACCTTCTATATGCAGATTGTGGAATCTAGAAACCTTGGATTTAAGAGGTTCGCCTATAAAATCCTTTTCTGGTGAATTATGGCAACTTAAACAACTAAGGCATCTTCTGTTGTTTGGACCCGTTGGGCTCCCAGAAATGCCCTCAGAAAGTAAAACTATGCCCAATCTTCAAACCCTCTCAACCGTGGCTCTTGATCCTCGCACAGCATCGTTGTTGGATAGTCGTAGATTCCCAGGGATGACAAAATTGGGTATACATTACGAAAGACGTGACAAGTGCAATGCTAAAATACAGTTACAGAGTCTCCATCGCCTGAGCCATCTCCAGAAGCTGAAAGTGATAGGCACTACTGAGATTCCTCAAAATGCAAATGTGTTTCCGTCGAACATCACCAAGATATCCCTCACAAAGTTTGGTTTCTTCAACTCCACTGTCATGCATACGCTAGGAAAGGTTCCCAACCTTCAAGTTCTGAAATTGTCATCGCAGACGAATGATACTAGATTTGACCTGCATTGTGCCACGGGAGGGTTCCTTCAGCTTCAAGTGTTTGAGATGATTGCAATCAAGGTCAAAATGTGGAGAGTAGACAGAGGTTCAATGCCACGTGTTCGTCGTTTGGTCGTCAGAAGCTGCAAATCCTTGACTCAGCTTCCAAAAGAAGTGTGGTCTTTGAATACCTTGCGGGAAGTGCAGGTCTTGTGGCCCTGTACAGAATTAGCAAAAGGACTCCAAAATTTGGTGATGAACAATGCTTGTAAGCTCGTCGTCTATCCTCTCTCAGCAAATGATGAATTAGATTTTCTCTAAATCAGTGGCTAATTAGTTCAAATACGCTTCATTTTTTTCCTTGGTTCATAGAAAAGTGTATTATTGTTATATTGTCACATTGGTCCAAACTATACCACTGCAGAATCGGAAGTAAATGAATATAAGATAAGTTAAGCAGTTTCTTAGCTTTCTTATCTGAAGGCCCACTTATTCACAGGTGACACCTTTTCCCTC