Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15843 LG4 12288150 12291764 PREDICTED: trihelix transcription factor ASR3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 12288514 stop_gained p.Ser122*
T/G 12288841 intron_variant
A/G 12288843 intron_variant
T/C 12288910 intron_variant
A/G,* 12289651 intron_variant
T/C 12290122 intron_variant
G/T 12291494 stop_gained p.Glu233*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15843.1
MALDQPSNPNAVDGAGNGAAPCSAADGGDDGRPAARLPRWTRQEILVLIQGKSDAENRFRPGRGSGSAFGLSEPKWALVSAYCKKHGVNREPVQCRKRWSNLAGDYKKIKEWESQVRDEGESFWLMRNDLRRERKLPGYFDREVYNILDSPSTAAAATVETPTAAVEEEVHLYDSNRRVGSDDGLFSDCEKEEVLLSAPSKDVPAPVPISEKQFQPLLQLCEREGNAEGTTNEKRATPNPEMGSTSQGGRKRKRFSTDAEEESLQSQLIDVLEKNGKMLRDHLEAQNTNFQLDRQQQKDTATNIVAVLDKLADALGRIADKL*


CDS Sequence:
>Vu_15843.1
ATGGCTCTGGACCAGCCTTCCAACCCCAACGCCGTTGACGGGGCGGGTAACGGCGCCGCGCCGTGCTCCGCCGCGGACGGAGGCGACGACGGAAGGCCGGCGGCGAGGCTGCCGCGGTGGACGCGGCAGGAGATTCTGGTGCTGATTCAGGGGAAGAGTGACGCGGAGAACCGGTTCAGACCGGGTCGGGGGAGCGGTTCGGCGTTCGGTTTGAGCGAACCGAAATGGGCGCTGGTCTCGGCGTACTGCAAAAAGCACGGCGTGAACCGGGAGCCGGTGCAGTGCCGGAAGCGGTGGAGCAACCTCGCCGGCGATTACAAGAAGATCAAGGAGTGGGAGTCGCAGGTCAGGGACGAAGGGGAGTCGTTTTGGCTCATGAGGAATGATTTGAGGAGGGAGAGGAAATTGCCCGGTTATTTTGACAGGGAAGTGTATAATATTCTCGATTCTCCGTCCACGGCGGCTGCTGCGACTGTGGAGACTCCTACGGCCGCGGTGGAGGAGGAAGTGCACCTGTATGATAGTAATCGGAGAGTTGGGAGTGATGATGGGTTGTTCTCTGATTGTGAGAAGGAGGAGGTTTTGCTTTCGGCCCCTTCCAAGGATGTTCCTGCACCCGTTCCAATCTCAGAGAAGCAGTTTCAACCACTCCTTCAACTATGTGAACGGGAAGGCAATGCTGAAGGTACTACCAATGAGAAACGGGCAACCCCAAATCCAGAAATGGGTTCTACATCTCAAGGAGGACGGAAGAGGAAGCGATTTTCAACCGATGCAGAAGAGGAAAGTTTGCAAAGTCAATTAATTGATGTCTTAGAAAAGAATGGCAAAATGCTTCGTGATCATCTTGAAGCTCAGAACACCAATTTCCAATTGGACCGCCAGCAGCAGAAAGACACTGCAACTAACATAGTTGCCGTACTTGATAAGCTGGCAGATGCTCTAGGGAGAATTGCTGATAAATTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_15843::LG4:12286150-12288150(+)
CTAAAAAACCATTAGAGAAAACAAACATTTCATTAAAACACAAAGAAGACCTGTTGAATAAAACTAAATAGCCACATGAATTCAATTTTTTTCCTTGAAAATATCACATACCATAAGAAATGGATGAAACTTAAAAAATAAACACAAGTTGAAAGCAATAAAGATCCATAACGCTATTTAGACTATGTAGTCAAAATTAGTTGAATTTAATCTAGCTTATACTTTGTTTAACTCGCTCTTCAACCTATTTTAGGAGTTTTATTTGCACGCATCCAATTCTTGAGGATTTGAGAGAAAAAAAAAGAGATCAAAAGAAAAAAAGAGGGAAAGAGAAAGAAAAATAGAACATATGTCAGCAGTGAATTTTTTAATCTCAATTATAACCAGAAGATAACAAAAGTTGTCAGATGTTATTAAATATTCAATTAAAAAATTCGAGAATTTTTGTCTCTTTGTCTATTACAACCATGTTAATAACTTTTTCAGACTCCATCATAACAAAAATTATCTTAAATATGAGTGTCACAAACAAGTCATGAAAGAAGTAATTTTCTCAATCCATTGAAACCATGTTAGTAACAAAAATTATTTTGAGTATGAGTAGTTGAGAATTTAAGTGTGAGTCTAAGTTTTATATCGAGTAAAAAAGAAAAAGTAAAGTGCCACATATAAAAATAAAAACTCATTATCCAATTGTCTTAAGATTTTGGATAGATAATGTTGTCAATCTTTTATAAAATTTGACTTAAATCTCATTAATATCGTATTTTCTTTTATTAAACTTCTTTCTTTGATAAATCCAACATAAGTGTCACAAACAAGTCATGATGTACCATAATTAAAATTAGATTTAGACGTTATTAGTATTGGGTGTCTTCATTTATACATTTCCTGTAAGACTACAAATTTAAATGAAGAATGTTTTTTTGTGAAGTTGTGTGAGAATCATGTTTGTTTGGGTTATTACCTGATTTTGAAGATTTGATTTCGTAAGGCAGAAATTGTTTTGGTTTATTTAGCGAGAATGTGTGAATGGCACCTTACGTAAGAGGCGTGCGATAAATTATAATTGAGTGAGAGTAGTGAAAGCAGAAAGGGGAAAAAAAAGAAGAAAGTGGGTTTAATGGAGGGGGCCATGGAAATGGAGATTAAGCATTGAGCATTAAGCAAAGATTAGAGGGAAATTATTCGATAAGATAAGAGAGGTTGAGAAAGGAAAGAAAGGATTAGTGAGTGGTAGGGTAGCATGCCCTTGTCAACTCATCAACAACAACTATTTAAAAGGGGATTTGGAGTTATTCCTCCTTTGATTGATACCACATTTATTAAAAAATATTTATTAAAAAGTATTTATAAAAAAGGGTGAAAAAAAGAAGAAGAAAAAGCTCATAGTAACATCAAGGGGTTGAAGGTGGAATTTTAGACGTTACATGGAAACCCCAAACAGGAAGGGAGAGTCAGAATTTCACATCTCATAGGGTTTGGAAAATGACCAAAAACAGGAATAGAAAAAAAAACTGAGGATGGACAATGAAATGAAAGTGCTGTTTGGGGAATTTTATGTCAAACCAACCCAACAAGTAACCTTTACAAACAAAGAAAATGCCATTAATTCAGAATTAAAGATAAGGATATGACCCCAATAAATAGTAATCAATAATAATTGTTAATAGCAATAATAAATTAAAGAAACCCTTGTTAAGGGGTTAAGGGTCAAAACATGATTAGTGAAGTAAAAAAATTAAAAATAAAAACCCCAAATTCACTGGCAAAAGCCACAAAACACAAAACACAAAACACAAAAACAAAAACCCACTCTCTCTTTCTCTCTAATTTTTTTTTTCTTCTCTTCCTCTCTTCGTTCTTACGGAGAGAAACATAAATAAACAAAACCTAAACCCTCTTTTTTTTTTTTCTTAACGCCGTAACGGGCATTCCCAAAGGCACCGTCACAAATTCTCACGTGCCAGTCACGTGTTTTTTCACAATTCTCTTTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_15843(+)
ATGGCTCTGGACCAGCCTTCCAACCCCAACGCCGTTGACGGGGCGGGTAACGGCGCCGCGCCGTGCTCCGCCGCGGACGGAGGCGACGACGGAAGGCCGGCGGCGAGGCTGCCGCGGTGGACGCGGCAGGAGATTCTGGTGCTGATTCAGGGGAAGAGTGACGCGGAGAACCGGTTCAGACCGGGTCGGGGGAGCGGTTCGGCGTTCGGTTTGAGCGAACCGAAATGGGCGCTGGTCTCGGCGTACTGCAAAAAGCACGGCGTGAACCGGGAGCCGGTGCAGTGCCGGAAGCGGTGGAGCAACCTCGCCGGCGATTACAAGAAGATCAAGGAGTGGGAGTCGCAGGTCAGGGACGAAGGGGAGTCGTTTTGGCTCATGAGGAATGATTTGAGGAGGGAGAGGAAATTGCCCGGTTATTTTGACAGGGAAGTGTATAATATTCTCGATTCTCCGTCCACGGCGGCTGCTGCGACTGTGGAGACTCCTACGGCCGCGGTGGAGGAGGAAGTGCACCTGTATGATAGTAATCGGAGAGTTGGGAGTGATGATGGGTTGTTCTCTGATTGTGAGAAGGAGGAGGTTTTGCTTTCGGCCCCTTCCAAGGATGTTCCTGCACCCGTTCCAATCTCAGGTTCGTTTTTTGGAATCAATTTCGGACATGCCCTTTGTGATTCTGTGAACTATTGTTATGTTATAGTAAGGGTTCTTTTTTTTTTCCCTTTTCCTCCACTTTTGCTATTGTTGATTTGTTGAGAATGATTGCATTACAGAAAAGTTACGGTGAAATTTATGGTAAAAAATTGCCTTATGATAGAGAAAATCCATTGGTGAGTAAGTGTGTATTTTGAATTTCAGTTTTTCAGCTGAATTTGAATCAATCCAACACTCATAATGCTCCTCTGTTTATGCATTGGATAGTACCATATCTACGAACAATGCTGTTCTAATGGATTTCCAGACATACTCAGTGACTTAGTGCGTATTTGTAAAACCGATGTCTCACATTTCGATGATGCAGTTGAACAAAAGTTTAAACGTCACTGAAAGTACCAAAGGATGAAGAAAATTGATAAAAACTTAAAATTCTTAAGAAGGATTTATTGAGTATTTGGATTTATCATTTATAATTACGTTGAAATACAACTAAGATGGTTTTAGTTAAATATTCATGTATTTGGTTCCATGTTAAGAAATTGAATATGAATCTGTAGTTGATTTTAGGTTGAAATAACTTTTTTGCTGGTTCATACAAATTCCTTACTATGATTTTTTATCATCTGGATCTAGAATGAAAACATAGTACTTCAGTTTAGTTTAAAATCAATTTTAGCTAATTGTGTGCTTGGTTGCGAGTGACTTTCTCCAGCAAAAAATATTTTTTTTTTGTGGTGATTTCGTGTCGATTTTTTCTTGAATATTGTTTTTTCTATGGCCGATCCAAACAGACAATTAATCTTGCGAAATCAATTTTGAGTTACTCATATATACAGTGTGTGCTTTGAGATACTCATCTATAGAGTGTGTTTGGTTTGGTTTTTGCAAGACACTGAATGTTTTTCACTTGTTCCGAAGCTGAAAATAGAGAAGCAAGTATGTTGTTGGATTGGAAAAAAGTGGCTTAGGTTAAACCCCACATTTCTTCTAACACTCACACACAGTGAGTTGAAAGTTAAGTATATTCACTAATATGTAATTTATGCGACAGATGCAACTCAGTGAAAAAAGTTTTTGCTGATATCATTGTTGTTGGTAATGTCTAGCATTTATTGGTATATGCTAATGTTGTTGGGTTGTCTTTTGTGAAGTTGGAAAGTGTCTAGACATGCTACTGGCTTTCATGGTTTTGGGAACACTTTTCTTTTGTTATGAAAGACTAAATTTTAGTGGGCTTTTTCTTTTCGGAATTTTTTTTCGATTCTAGCAATGATGTTGTAAAGTTGGAACTTTGGAGTCAAGGGTACTGGGATTCCCATGTGGCATTCTTGAACTATATATATATATATATATATATATATTTCCTTGATTTTTCTCTTCCTTCTGATTTGCAGAGAAGCAGTTTCAACCACTCCTTCAACTATGTGAACGGGAAGGCAATGCTGAAGGTAACAGAGTTTTTTACTCTTTTATTCTTAATGCATTTGAATATTTAACGATGGATTAAAAATCATGATTATTGTTTTAAGATTGGAATAATACGATTAGCAGTTGTATTTGCACTGGCACCATTCTCATTGAAAGTTGAAACCTTATATTTTTCCGAAATGGATTCTTGTTGTGTTCTGTAGACAGCCTTGATATTTTGGCATAAAAGCTTAGGCCCAGGGTCTGCTGATGTGACCAACATGATGTAGTAGGCCCTAAACCTAGTGTCTTTGTTTGTTAAAGGGCATCCAATGTCAATGACAGGATAGCCAAACAAAAACGTGGAAGCTACTTCGGTGTCCTTTCCATGTCTTCAAAATATCATGAATTCAGTGCTTATACAAAGCAAGCTAAAAACTCGTTAGTGACAGCTTGCTACCTTGTCCGCTGTGTTTGTTTCCCATTCTTTCTGTTGCTGCTGCATTCTAATTAATTGGTTACCTATTTTGTGCCATAAATTTTTGCTATTGCATTTAGAATTTCAATAATGCCAGGTCCCTTATTTTTCATTCATTTGTTATCCATACTGGTACCATGTTGCTTTTACTGGAATCTAAATCCGATTCCTGCATATCAAATTTGTCTACTTTAGTACAAACAGAATGATGGCTTATCTGAAGATGAAAATGGTACTAGGCTTGCAGTTAGCCCACCTTTTTACTTTTGGGATTAAGAATTGATAGGATTGGAGCATTCAATGTATGATTGGTTACTTAATAATATATTGGATGCTAGGTATAAAACATATATCTCTACAAAGTGAATTTGATTAGGATTAAATACATTGAATTGGATGATGTTTACTCGTATAATTGCCAGAGTAATGGTGCTTACTCATGCTTAACGTTAGCACTTTCCTGGGAAGTCATTGTATTGCACTTTATATCTCATTGTCACTTTTCTGTTAACATTCCACATTCTAAACCTACCCTAATAAATGAAAAACTATTTTCCGCAATTCATGTCTGAAAAGAAAGTTCTTCTCTTTTAATAAATGCCAAGCTATGTTATAGGCACAAGCTTTCATTATGCTATCACCTAAACTTTTGAGCTTTAGCTGCTAGGCCGTAGCTTACTTAAATAGGTATAGGTATAAGACCAAAGCTTCTATTATGACAGTCACAGTATCCAGTACTTAACTGATGACATTATTGTAACTTTAATGTCTTTACATTCCTTAATTCTACAGGTACTACCAATGAGAAACGGGCAACCCCAAATCCAGAAATGGGTTCTACATCTCAAGGAGGACGGAAGAGGAAGCGATTTTCAACCGATGCAGAAGAGGAAAGTTTGCAAAGTCAATTAATTGATGTCTTAGAAAAGAATGGCAAAATGCTTCGTGATCATCTTGAAGCTCAGAACACCAATTTCCAATTGGACCGCCAGCAGCAGAAAGACACTGCAACTAACATAGTTGCCGTACTTGATAAGCTGGCAGATGCTCTAGGGAGAATTGCTGATAAATTGTAG