Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15825 LG4 12041833 12045870 probable disease resistance protein At4g27220 isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Cellular Component   located in   mitochondrion
Molecular Function   enables   ADP binding, ADP binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 12041876 missense_variant p.Arg15Lys
G/T 12041911 stop_gained p.Gly27*
C/A 12041916 missense_variant p.Phe28Leu
G/T 12041930 missense_variant p.Gly33Val
C/T 12041979 synonymous_variant p.Ile49Ile
G/C 12041990 missense_variant p.Arg53Pro
G/T 12042016 missense_variant p.Ala62Ser
A/T 12042018 synonymous_variant p.Ala62Ala
C/T 12042026 missense_variant p.Ser65Phe
G/A 12042035 missense_variant p.Arg68His
G/A,C 12042040 missense_variant p.Asp70Asn
T/C 12042129 downstream_gene_variant
A/T 12042152 downstream_gene_variant
A/T 12042194 downstream_gene_variant
T/A 12042308 downstream_gene_variant
T/C 12042349 downstream_gene_variant
T/C 12042410 downstream_gene_variant
T/G 12042433 downstream_gene_variant
T/C 12042443 downstream_gene_variant
C/T 12042445 downstream_gene_variant
A/G 12042447 downstream_gene_variant
A/T 12042449 downstream_gene_variant
C/A 12042474 downstream_gene_variant
A/C 12042491 downstream_gene_variant
G/C 12042495 downstream_gene_variant
A/C 12042519 intron_variant
C/G 12042525 intron_variant
T/G 12042544 intron_variant
G/T 12042552 intron_variant
C/T 12042566 intron_variant
A/C 12042569 intron_variant
G/A 12042574 intron_variant
G/A 12042580 intron_variant
C/T 12042584 intron_variant
G/A 12042591 intron_variant
G/A 12042594 intron_variant
G/T 12042606 intron_variant
C/T 12042643 intron_variant
T/G 12042677 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15825.1
MGRKKNEYYWSQVDREEDGGLKCKHCGFKFKGGVSRIKAHIDGVTGKGISICRTPPKDITPANHSHQRIDVPSSQEMDGAASTSLAALFEGNVEECGNGVLTTLKSKLDELRSDLICEEEDIQGQLQLLESHGKKRKRKGEMYLAEQSQKKIQYLTEEIQEHKKWKPLVLSNEYFVGNIARSVVKKCYGLPLGISMMARTMKGKTDIHWWRHVLNKFDKLEMGVDMEEKVFTVLRRSYDNLSGKDLQKCFLYVALLPNSMFRNCLIGKLVNTELLDGNKSVEEIFDETNVIVDELINHSLLEAKEARVPSSVEEHLSTTIILTIMLKKS*


CDS Sequence:
>Vu_15825.1
ATGGGTAGGAAGAAAAATGAGTACTACTGGAGTCAAGTTGATAGAGAAGAAGATGGTGGGTTGAAGTGTAAGCACTGTGGATTCAAATTCAAAGGAGGAGTTTCAAGAATTAAAGCACATATTGATGGAGTAACAGGAAAAGGCATCAGTATATGTCGCACACCTCCGAAAGATATCACACCTGCAAACCATTCCCACCAACGTATCGATGTCCCATCATCACAAGAAATGGATGGTGCTGCAAGTACATCATTAGCTGCTTTATTTGAAGGTAACGTAGAGGAATGTGGTAATGGTGTTTTAACTACTTTGAAAAGCAAATTAGATGAGTTGAGGTCCGATCTAATATGTGAAGAAGAGGACATTCAGGGACAATTACAATTGCTGGAGTCACATGGCAAGAAGCGCAAGAGAAAGGGAGAAATGTATTTGGCTGAACAATCACAAAAGAAAATACAATATTTGACTGAAGAAATTCAAGAGCATAAGAAATGGAAGCCTCTGGTGTTGTCTAATGAATATTTTGTGGGGAATATTGCAAGATCTGTTGTAAAGAAGTGCTATGGTTTACCCCTTGGAATCAGTATGATGGCTCGAACCATGAAAGGGAAAACTGATATCCATTGGTGGAGACATGTGCTAAATAAATTTGATAAATTGGAGATGGGAGTAGATATGGAAGAAAAAGTTTTCACTGTGTTAAGACGTAGTTATGATAATTTAAGTGGAAAAGACTTGCAAAAATGTTTCTTGTACGTTGCATTGTTACCTAATTCTATGTTTAGAAACTGTTTGATTGGGAAGCTTGTTAATACAGAACTATTAGATGGAAATAAAAGTGTGGAGGAAATATTTGATGAGACAAATGTCATAGTGGATGAGCTCATAAACCATTCTTTATTGGAGGCCAAGGAAGCACGAGTTCCATCATCAGTGGAGGAACATTTGTCGACCACGATAATTTTGACAATTATGTTGAAGAAATCCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_15825::LG4:12039833-12041833(+)
GAAACTGTCTCTTCCCGAACGGCGTCCAACCCTTGAACAGCCTATAGAATAATACCACAGACTCAATTCTATATACCCAACGTCAGACAGATGCATCTTTCATTTTTGCTCTCTGTTTTTCAAATCACTCCTAAATTTTGAAACAGAATCAGTAATCAGCCAGCTGGAAGAAGGGCTTTATTCGGTAATTCCTTTTTCTCTATCTGATTTTTCAATGAAAATTATTGCTTCACGGTCCTTTATTGAACTAGTTTTGTTTTTCCTTATTTATCTAATTTAGCATTTCATGATAATTGGATACTCACTTAGTTGTAAATCAAATTTAACGGGTGCTTAAATGATTACTTAAACGCTTCTAACCAGCTTGAATGAAATTTAAACTAATTTAACTCCTTAGAAAGAGATATCTCTTCTACCTTACAGTAGAAAGACAAAAAATTGTTTTAATGTTTTGAGACTAGTACTAAGGCTTCAACGTCTCACGGTTGAAAGTTAAAAAACCAAAATATTAATGTAATAAATGGTTGATGTCATTTTTGTAAATAAAAGTTTAATTAAGATATTGAAATTTAGATTTTTCCGACGTTAATTGGTTATTAGACCTAAGAAATTTGTCATATTAGATAAATTTAACGAAAATCTTTAGCGCAAAAGTGAAAATATACTCATGTATGACATCAAATGTTCTAGTTTCAGACGTCAAAAGACTATAAAACATCGAAATATCACTTTTCAAACTTTGTATATTAGTGAATTCATTCAAAATTTCGGTGAGAGATTGAAAATTCATTAACTTTATATTTGTGCGAGACCGTCTTCATTGCTCAAATCTTTCTCTTTTTCGGATGAAGATTTCGATGACCAGTAATCTTTCTTTCATTTTATACTAATGCATGTTGATTAACTACTTTAGGTATGATTTTCGTTCATTTTAATCGATTGATTGTGTGTATAAGTACTCTTTGGAGCATATGTGCATTCTCCTTTCTCACTCACTACCAACAATACTTTATTCGACGAACTCACCTTCAAGAAGAATAATTTTCGTTTTCATTTTCATTTTCAAGAAGGTTGAACTTGTTGGTATCGATATTGTTGAACTTGCTTATTGTATTGTTGAACTTATTTGTTGTTCATACTATACGTTATACATCAAAGCTTAGGATTAAACTAAGAGTATATTCAAAACAACTCCAAATGACTTGAAAATTTGTTCAAAACACCAAAATATCATGAGAAGCCCCACAAAAAAATTTAAGTTCAAAATTCAAAGTCTAATGTGAAATATTTTTGCAAAGTTTGAAAAAAACAAAAAAAAAATTGACAAAAAATAGAAAACGACATTTTTTAAAATCTAGAAAGACAGCCGAAACAAATGTTATGGTCATTTAAAAATTTATCGCAATTGATTTTTCAAATAATTTTTATACTTCACATAGACCTAAAGTAATTATTGGTGTTTTCTTTGAAATAGAGGTTCTAAAAAGTGGTAAAAAAAATTTAACAAAAATAAAAACTATACTTATCAAAACCAAAAATCACATGTTAATATTATTATTTACTATGACATCACTCACTTGTGGTAGTCTTTTCTAGTTCATAGTTTATACCGTATAAAATATAAAAAATTGGACTACATTTATTGATTTTTTTTACTTTTTAGACATGTACAGAGTTGTAAAAATGAATCACTGTTAATTAAAAAAAAGCAAAATAATTGATCCAATATGACATTTTTTTTACGATAAAAGCCGAGAAAAACACTTGTATTAAGGTGAACTTTGAAAGCATGCTTAAAATCTGAATTGAAATATCATGTTATTATGGCGAAAGCCGAACTCATGTCTGACTCTGCAGCTGCATTTTCTTTGACACTTTCATTAACCCTTTGAGGTGGTGAGCATGAAATTTGATTAAGAAACGAAGTCACATTTTCCAACTGTGGATGAAATGAATATTAATTAGATTTCATTTTGTGGATTCAGGAAATATAGTAATAA


Gene Sequence:
>Vu_15825(+)
ATGGGTAGGAAGAAAAATGAGTACTACTGGAGTCAAGTTGATAGAGAAGAAGATGGTGGGTTGAAGTGTAAGCACTGTGGATTCAAATTCAAAGGAGGAGTTTCAAGAATTAAAGCACATATTGATGGAGTAACAGGAAAAGGCATCAGTATATGTCGCACACCTCCGAAAGATATCACACCTGCAAACCATTCCCACCAACGTATCGATGTCCCATCATCACAAGGTACAACTATTTTTTTATTTCTCACTCACAATCCCACTCTGTATTGTGTATATCCTATTTAAAATGTTTTTTATAATTTTTGCCAAGATTATTAATGTTTTTACTTAATTAATTGAAGGACTTAACTTTAAGATGAAGTCTAAATCCTGCAGCAATGTAAAAATTCTCAAAGAGGAGAAAAATGTAAATAAAAAATAAATCTAAACATTACAACATATTAAAGCTGGGTCCTATAAAATTTTTAGTGTCTCATTATTTGTATTATACTTTTACACTTATATAACACTAATTTTCCTTTATGATATATTAAATATTTCATCCCATTCTTTTATCTGTTCAATATTAAAATTTTATTATTAAAAATTAAAATAGTTTTTTTTCTTATACAAAAGAGTTTAATATAATTTAGACTTTTCTAAAAGATAAACCTATAAAAGATCTTTTAAGAAAAAAAAAATGCACTCGACTTTATATATAGTTGAAGTTGGTGAAAGGTTGGAAAAATAACTTATATTGTTTGTGGTTCAATGATGATGAAAGAGTTATAGGATCATCATTAAAAGTATGCATCTTTATTACAGATCCATCATGTTGATTTCCTTCTCTTCACTCTTGTGTTTGTATTTTTTAAGGTCATATACAACATAGCTTGCTTTATATTTTTCAATCATCACTTAATTATATTAGTTGTGTTAGAGAGAGATATCTTGTGAAACTTACCTCAATACTAGATTTATTATATTTTTTTCTTGAATTTAGTTGAAGTTTAAAAAAAATGGTAGATTTTTTCTTTTGTCTACATCTCTTGCATTAATGGTTTAGAAATGGATGGTGCTGCAAGTACATCATTAGCTGCTTTATTTGAAGGTACGCATTCTAGTTAGCATTCCATTTTGTTCTTTTTCTTATTTTCACATAGCTGTTTTTATCTTTTATTTAGGTGATGCAATATAAATGTATTTTTTATTTTAATTCTCAATTGTCAATTTTGTTTTCACCCAATGAAGATTTTACGTTTCATTACTATGCATTTTAAATTCACAGTTTTTTAATTTCTTACTGCGAGCATGATATAAAAGAGTATATTCATTACATTCCATATATATATTGGAATTGTTTTAAATTATCTATGAGGGCTAATTAAGTTTTCAATCACTTAAAAATTTAAACTTTATTTTAGTTCCTGTAATTATTTTTACCATTTCTAAACTCTCGCTTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCAATATTAGTCTATCTCATGGACTACTTTTGTTTATTTTAAGTATGTCGTGAGGTAATATTGGTAAAAAAAATTTGACTAAAATTAATTAGTAAAGAAAAATCTATTGACTAAAAGAATTAAATATAATAATTTTAACCGAATACTTTAGCTTAAAAAATATGTATATTATTTTGATAAAGTAATATATATTTCAACAACTATTTTGACACGTAATATATTATAAATCGAAGAATTTCTTTTAAAAACTTCTTATTTAAATAGATTTCTATTCTAATATATTATTTCTTAATTAATACTAACTAAAAGGAAAAGTCAACAGACTACTGTTTAATGAGATTTTGTAATATGTATTATTTTTCCATTTGTTTGAATATATCAACACTCTTAAATGAATTAAGATTCACCAAAACAATGAAACAGGTAACGTAGAGGAATGTGGTAATGGTGTTTTAACTACTTTGAAAAGCAAATTAGATGAGTTGAGGTCCGATCTAATATGTGAAGAAGAGGACATTCAGGGACAATTACAATTGCTGGAGTCACATGGCAAGAAGCGCAAGAGAAAGGTTGATCATTGGTTGGAAGAAATACAAAAAACGAAACAAAGAGCTATTGATATGAAAGACTCACTGAATCAATTTGGGTGCTTTAACTTTCATGTACCACAGGGAGAAATGTATTTGGCTGAACAATCACAAAAGAAAATACAATATTTGACTGAAGAAATTCAAGAGCATAAGAAATGGAAGCCTCTGGTGTTGTCTAATGAATATTTTGGTAGGGAATTTGAGAAAAATGTTGAGAAGTTGTGGAAGCTTATGAGAGATGATCGAGTTTTCATCATTGGCATACATGGAATGGGGGGAGTGGGAAAAACATTCCTAGCAAATTACATGCAAAATGAGATAAAAAGGATCAAAACTTTCAAAGATGTCTTATGGGTCACTGTTTCTCATTATTTTACCATTTTCAAATTGCAAGAGCGCATTGCAAAAATAATAAAGGTAGAGAGCTTCACACAGACGATGAGAGGGAAAGAGCAATGATTTTGGCCAAAGAGTTGGAAAAAAGAGAAAACATAACACTTATTTTGGATGATGTTTGGAAATATATTGATCTAGAAAATGTGGGAATTCCTTTAAGAGTAAATGGTATTAAATTGATCATGACAAGTCGGTTGAGAATGTGTTTCAACAAATGAATTGTCTATCAATTAATATAGTAAAAGTGAACCCTTTCTATTATCATTATGATAGTGATAATTATTTTCGTACTTATTATTATCATGATAGCGATGATCCTGATAATGATTCTCATAATGATTTTGATAATGATGATGATGACGACGAGGATTATTGTGATGATTATGAAGAAGATTGGATGTTATTTTTGCTGAAACTCAAATCTTATGGGACACCTTTAACACTTTCCCCTCAAGTGGGGAATATTGCAAGATCTGTTGTAAAGAAGTGCTATGGTTTACCCCTTGGAATCAGTATGATGGCTCGAACCATGAAAGGGAAAACTGATATCCATTGGTGGAGACATGTGCTAAATAAATTTGATAAATTGGAGATGGGAGTAGATATGGAAGAAAAAGTTTTCACTGTGTTAAGACGTAGTTATGATAATTTAAGTGGAAAAGACTTGCAAAAATGTTTCTTGTACGTTGCATTGTTACCTAATTCTATGTTTAGAAACTGTTTGATTGGGAAGCTTGTTAATACAGAACTATTAGATGGAAATAAAAGTGTGGAGGAAATATTTGATGAGACAAATGTCATAGTGGATGAGCTCATAAACCATTCTTTATTGGAGGCCAAGGAAGCACGAGTTCCATCATCAGTGGAGGTACTATCAATGCATGGTTTAGTGAGGAAAATGGCCTTGAATATTTTGAGGGAGAGTGTTAGTAAGATGATGATAAAATGTAATGGAAATATGCCAGACACACAAAAATGGGCAATTGATTTGGAAGTAGTTTCTCTTGCTAGAAACAAGATAAAAACAATTCCAGAGGGCACATCTCCAAATTGTCCACGCCTATTGACCTTACTTTTATTTGAAAATTACATTACACATATTCCAGAGTGTTTTTTCACTCACATGAATGCTCTAACCACGCTTGATCTATCAGAAAATTTTTTCTTAAGATGTTTGCCTCATTCGCTATCTAATTTGAGGTCTCTCACTTCTTTAATGCTCAATGAATGTAACAAATTGGAAGATATACCTCCGTTAGGAGAGCTACAATCATTGTTAAGATTAGAGATTTCAAATTGTTCCATCAGAGCACCACCGGAAGGTTTAGAAAATCTAGTAAACTTGAAATGGCTAGATCTCTCCATGAATAAGAATTTGAAATTAGTATCAGGAAGTTTTCTCCCTAGTTTGACAAAAATTCGATACCTGGATCTTTCGGGCTGTATAGGAGGCATAGGAGTAGAAGATGTGAAGGAAATGACTATGCTGGAATGTTTTGCAGGAACATTTGTCGACCACGATAATTTTGACAATTATGTTGAAGAAATCCTGA