Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15783 LG4 11657901 11661747 PREDICTED: transcription factor BIM2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 11657979 missense_variant p.Ala27Thr
G/A 11658017 downstream_gene_variant
T/A 11658018 downstream_gene_variant
T/A 11658752 downstream_gene_variant
T/G 11658758 downstream_gene_variant
C/T 11658924 downstream_gene_variant
G/T 11658930 downstream_gene_variant
G/A 11659088 downstream_gene_variant
A/T 11659108 downstream_gene_variant
C/A 11659123 downstream_gene_variant
T/A 11659132 downstream_gene_variant
G/A 11659198 downstream_gene_variant
G/A 11659207 downstream_gene_variant
C/T 11659604 synonymous_variant p.His216His
T/G 11659841 downstream_gene_variant
T/A 11659912 downstream_gene_variant
T/C 11659915 downstream_gene_variant
A/T 11659940 downstream_gene_variant
A/G 11659986 downstream_gene_variant
A/G 11660105 downstream_gene_variant
A/C 11660188 downstream_gene_variant
A/G 11660278 downstream_gene_variant
C/T 11660557 downstream_gene_variant
T/C 11660695 downstream_gene_variant
C/G 11660812 downstream_gene_variant
T/G 11660968 downstream_gene_variant
G/T 11661179 missense_variant p.Val302Phe
A/C 11661215 downstream_gene_variant
C/T 11661414 downstream_gene_variant
A/G 11661675 synonymous_variant p.Ser316Ser
T/A 11661698 missense_variant p.Ile324Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15783.1
MARSAKGHQDELEDDEEEEFLTANTSASLNKVKVDEPSTGKRGNTHRSKHSETEQRRRSKINERFQVLRDLIPQNDQKRDKASFLLEVIEYIQFLQDKLQIYEKSYEGWSQEPTKLIPWRNPHAPAENTTDPSQSIQNGSVDEKNNSASPLFPGNVPNPMESDFSMLTVQKGHLPGSSTEAVPLTMQMRLDMFDPVVSSGMATQHLQESVSNVDMHSHTQPQLWLDKSNKGNYILPHDSTMKEQEELVIESGSDSISSAYSQGILDTLTQVLQSSGVDMSQTNLSVQIDVGRRANAGLVPSAYSSKVHENQFESNPAISVSGFDYCIIESEQSSKRLRQEAS*


CDS Sequence:
>Vu_15783.1
ATGGCTAGGTCTGCAAAAGGGCATCAAGATGAATTGGAGGACGATGAAGAAGAAGAATTCCTAACTGCAAACACCTCTGCCTCTCTCAACAAAGTGAAGGTGGACGAACCCAGCACGGGGAAGAGAGGGAATACGCATCGTTCGAAGCATTCAGAGACTGAGCAACGTAGAAGGAGCAAGATTAATGAAAGGTTTCAAGTTCTGAGAGATCTCATTCCTCAAAATGATCAAAAAAGAGACAAGGCATCCTTCTTGTTGGAGGTTATTGAGTATATTCAGTTCCTACAGGACAAGTTACAAATTTATGAGAAGTCTTATGAAGGATGGAGTCAGGAGCCAACGAAGTTAATTCCATGGAGAAATCCTCACGCACCTGCAGAAAATACTACAGATCCTTCTCAAAGTATACAAAATGGGTCTGTTGATGAGAAAAATAACAGTGCATCTCCACTGTTTCCCGGAAATGTACCGAACCCTATGGAGTCTGACTTCTCAATGTTGACTGTTCAGAAGGGTCACCTCCCTGGTTCATCTACAGAAGCAGTTCCCCTGACCATGCAAATGCGGTTGGACATGTTTGATCCAGTTGTTAGCAGTGGTATGGCAACCCAACATCTTCAGGAATCTGTTTCTAACGTTGACATGCATTCACACACCCAGCCACAACTGTGGCTTGATAAATCAAACAAGGGCAACTATATTCTTCCACATGATAGTACAATGAAGGAACAGGAGGAGCTAGTGATTGAATCTGGATCAGATAGCATTTCTAGTGCCTATTCTCAGGGAATTTTAGATACTCTCACGCAAGTGCTGCAGTCTTCCGGGGTAGACATGTCCCAGACTAATCTCTCGGTGCAAATTGATGTTGGTAGACGAGCAAATGCTGGATTGGTCCCCTCTGCATATAGTTCAAAGGTTCATGAAAATCAATTTGAGAGCAATCCAGCAATTTCAGTTTCCGGATTTGATTACTGCATTATTGAATCCGAACAAAGTTCAAAGAGGCTCAGACAAGAAGCAAGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_15783::LG4:11655901-11657901(+)
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Gene Sequence:
>Vu_15783(+)
ATGGCTAGGTCTGCAAAAGGGCATCAAGATGAATTGGAGGACGATGAAGAAGAAGAATTCCTAACTGCAAACACCTCTGCCTCTCTCAACAAAGGTTTTTTTTTTCTCTCTCTGTGGTTTGTCTGTGCATCACCCCACAGGGTTTATCGATTGATTCATTGATGGGGGTCTCAAAGTTCTTATCTTTTTGCCTTTACGATAGCATTCTGCAATTCAATTTTCAATTTTGAACATAATTATTTATTACGTTTTGTGACTTGGCAGTGAAGGTGGACGAACCCAGCACGGGGAAGAGAGGGAATACGCATCGTTCGAAGCATTCAGAGACTGAGCAACGTAGAAGGAGCAAGATTAATGAAAGGTGAGCTTTGAATTAAAAAATAGTTATTGAGTTAATAGTTCGTGTGTGTAGTGTAGATTTTGACTGGAAGTATGATGTGATTCTGTTAGTATTTATTGTTAGGCAATGTTTGGTTGCTTGAAAGAAAAACTATATTTGTGTGCCAGGTTTCAAGTTCTGAGAGATCTCATTCCTCAAAATGATCAAAAAAGAGACAAGGCATCCTTCTTGTTGGAGGTGCTTCGTTCGACATTTAACCATTTGTTTCTTGTGTACATCTTAATGGATAATTCTTTTTCTTGTAAACTAAATTAGATTTTTTTTTTCAGGTTATTGAGTATATTCAGTTCCTACAGGACAAGTTACAAATTTATGAGAAGTCTTATGAAGGATGGAGTCAGGAGCCAACGAAGTTAATTCCATGGGTAAAGTTATATGCAATGTTGTAATGTAAATATTTTTCAGTGTGTGTTCAGTCTGGACCTTGATTTATGAAATCTTGCGAAATGAATGGCAATAGCTTTCCTGACTGATATGGTTCTACCTAGTATCCGAAATTGGATCTGCAAATGCAGTATAATTGAAATTTGGACTGACACAATTGCTCGACATTGTGAGACTTGCAATTCTCTCTGATTGTATAAGGATTCATTTTATATAGACTGCAAAGAAACAACAATGATCACAAAGCCTTACTCTCATTAAGCAGGCTCACCAACATGGATTTCGGCACACCTATGTACTTGGTCATATGTCATGTACTCATGGCACCTCTGCATAAAATTTCTTATACAAGAGTTTAAGTTCCTTTCATGCTTAGGATTTCACTACTTTATGCTGTTTCTGTGAATTCATACGTCTGCTTGTAGTGTTTTTTTTTTTCATTTACAATATCCTTTTTCTTCCAGAGCAAGTAGCCCAGTATGCATATTTGAATGAATTCAGGGATGGCATTGTGGCAACTTCGGTGAACTATTTGTCACAATGGTTGGTTATGGCTTACTGCCTTGAAATAGTGACAGTCACTTTTAATCTAAAGTTTATTGTTTTCATCTTGTTTTTTTCAGAGAAATCCTCACGCACCTGCAGAAAATACTACAGATCCTTCTCAAAGTATACAAAATGGGTCTGTTGATGAGAAAAATAACAGTGCATCTCCACTGTTTCCCGGAAATGTACCGAACCCTATGGAGTCTGACTTCTCAATGTTGACTGTTCAGAAGGGTCACCTCCCTGGTTCATCTACAGAAGCAGTTCCCCTGACCATGCAAATGCGGTTGGACATGTTTGATCCAGTTGTTAGCAGTGGTATGGCAACCCAACATCTTCAGGAATCTGTTTCTAACGTTGACATGCATTCACACACCCAGCCACAACTGTGGCTTGATAAATCAAACAAGGGCAACTATATTCTTCCACATGATAGTACAATGAAGGAACAGGAGGAGCTAGTGATTGAATCTGGATCAGATAGCATTTCTAGTGCCTATTCTCAGGGGTGAGTTTGTTATATAAGTTCAACAGTAGTTTTTCTTCATCAATCTTGTGTTAATTATTTGCTTGAAACTACATTTACAATGCGTGAGCAATGTGTTAGGAGTTCATAATTAATAATTCTCCCCGAATAATAACCTATATAAATCTAGATCAAGCCTATTCCTGAATGATTCATAATTAAAAAAAACCAGAATAGTATCCCATCACCTGCTACACTGTATTGGAACCCCAAAGTTTGTCCACACAACAATTACTCTCCCTATATGCATGTGATACATGGGAATTCATACTGATAAGTTTATACAAAATATTCTGTTCTTATTTCTAAGTTGCCAGGGGACAGTATTTTGGTTCTCAAATGTGGTCGAAAATTAAGATGGACCAAGGATGTCTGCAATTAAGTGGGCTTTCAGAAAAAAATAGAGTCCACATATAATTTTAAAAAACAAAAGAAGAGGACAGACCCAGGTCAAGTTAGTCTTCAATTTTACCCCAATTAACGTAGGTTTAAAACTATTTTACTTGGGTGAGAAGCATCCAATGGGAGAGTGCAGGATAGAGATGGAGTGTGATACGCGATTCAAATCAGAGTAACTTATATGACAGTGAGAAGAATGGTATATGTAACCATTTATAGCTCGAAGTGTCATATGTATAAGCTATTTTGTCAATCACATCTGCAATTAATCCCTTCATGTGTGTTGTTGTCCATTGCATGGAATTATGCTCTTTGAAACCAATCAGGAGTTATCTTGTTTGTTTCTTTATCTGAGTATAGTAACTCTGCAGAAGACAATTTTCGTCTCTTTTTCTGTATAACATAATTTATAGGTACAATAGTATGTTTAATTCCCCAACTAACTTGTTAGGACTGTTACTGGCAGTTGGAGGTTCGTTACTGGTAGTTATATGTTTGTTACAGGCAGTTAGAGCTCTCTTGTAATCTGGAATCTCCTTTATCTTCTCTCTCAACCGTACAAATCTTACATTGTTGATTGAAATTACTACAATCGATTTAAATCTTGTATTAAAGTGAATGAATTCATCTTGTCAAAAGTAAATTGTTGGAAATTCCTTGTACTTACAATTGAGCGTGGGAATCTATCCTCAAAAAGAGGGGAGAAAATTTGGCAAGAGAATTTTTTCGGTTCCCACAAACTTGTTGCATTTGACATTGCTTTCTTCTTCGCCTGTTTAGTATGCAACTGCACCTTTTAGGGACATTAATTTTTTAGCACTTGAGTCAATTCCATCAAGCATCATTGAAGGGAATATATCATTCATGCCACTGTTGATCCAGTTTTTATGTGTTTTAACAGAATTTTAGATACTCTCACGCAAGTGCTGCAGTCTTCCGGGGTAGACATGTCCCAGACTAATCTCTCGGTGCAAATTGATGTTGGTAGACGAGCAAATGCTGGATTGGTCCCCTCTGCATATAGTTCAAAGGTTCGTTTATGCTCCATTGTTTTAGCACAAACTTTGTTCTGACTTGAATTGAATTGAATTACTTTTGGAGGATACTTTACAGCGTTGTTATTGCCCTTTTGTCATAGAATTAGTGTATGACAGTATTATTCATTAGAAAGAACGAGATAGAATAATTTGCTGTCAACGTATATCTCTATACTTGAACTGACCAATTTAGAACTAGTAAATCAATACTGTCACTGTTTCAGTGTATTCTAATCAAATTCTAAAATTAATGCCATATGTTATTTGTTCATTCAGGTATGACAGTATTATTCATTAGAAAGAACGAGATAGAATAATTTGCTGTCAACGTATATCTCTATACTTGAACTGACCAATTTAGAACTAGTAAATCAATACTGTCACTGTTTCAGTGTATTCTAATCAAATTCTAAAATTAATGCCATATGTTATTTGTTCATTCAGGTTCATGAAAATCAATTTGAGAGCAATCCAGCAATTTCAGTTTCCGGATTTGATTACTGCATTATTGAATCCGAACAAAGTTCAAAGAGGCTCAGACAAGAAGCAAGCTAG