Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15768 LG4 11540586 11541841 PREDICTED: receptor-like protein kinase FERONIA
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 11540765 synonymous_variant p.His60His
A/T 11541014 synonymous_variant p.Ile143Ile
G/A 11541023 synonymous_variant p.Ala146Ala
T/A 11541138 intron_variant
A/T,* 11541186 intron_variant
C/G,* 11541187 intron_variant
A/T 11541383 missense_variant p.Asp193Val
G/A 11541544 missense_variant p.Asp247Asn
G/A 11541641 missense_variant p.Gly279Glu
T/A 11541759 stop_gained p.Cys318*
C/T 11541818 missense_variant p.Ala338Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15768.1
MFLKCFGDSSSSRRQYPTVIEELCRHFSLADIRKSTNNFDHNREIAEGAVGKVYRGCLQHNDGSYYEVAVKRFHGQSCEILKREVELLCQLRHPNCVSIVGFCNHETESIIVYENMSNGSLDRHLRSEVREALPWKKRIQICIGAARGLHYLHAGLKRTIIHHDIKPRKILLDDNMHPKLSGTCGYLPVESFTTDNVTDKWDVYSFGMTLLEVVGVRRIFERVYFEIEKELLEKCIEENIDPKIKGEIAPECWQVFIDIALRCINKQPDERPAMGEVEVELELALLVQEQEDIINTDSDYTLLSKTVIIPKSEGGFEYVIGLKEQETVYSDSEDMFHRQFSELLK*


CDS Sequence:
>Vu_15768.1
ATGTTTCTGAAATGTTTTGGTGACTCAAGTTCATCTAGGAGACAATATCCAACCGTAATAGAAGAGTTGTGCCGTCATTTTTCTCTTGCTGATATTCGGAAATCAACCAACAATTTTGATCATAACAGAGAAATTGCTGAAGGAGCAGTCGGTAAAGTATACAGAGGTTGTCTCCAACACAATGATGGTTCTTATTACGAAGTCGCAGTGAAGCGATTTCACGGGCAAAGCTGTGAAATATTAAAAAGAGAAGTAGAGTTACTGTGTCAGCTTCGCCATCCTAATTGTGTGTCTATCGTAGGATTTTGCAACCACGAAACAGAGAGCATTATTGTGTATGAGAACATGTCCAATGGATCTCTGGATCGACACCTGCGAAGTGAGGTTAGGGAAGCACTTCCATGGAAAAAAAGGATACAGATTTGCATAGGAGCGGCGCGTGGACTACACTACCTTCATGCCGGACTCAAGCGCACCATCATTCACCATGACATCAAGCCTAGAAAAATTCTTTTGGACGACAACATGCACCCAAAACTCTCAGGTACTTGTGGTTACTTACCTGTTGAGTCATTTACGACCGATAATGTCACAGATAAATGGGATGTTTACTCATTTGGTATGACTCTACTGGAAGTTGTGGGAGTAAGAAGAATTTTTGAACGGGTTTATTTTGAAATAGAAAAAGAATTACTGGAGAAGTGTATTGAGGAGAATATTGATCCGAAAATCAAAGGAGAGATTGCACCAGAGTGTTGGCAAGTCTTTATAGACATCGCCTTAAGATGCATAAATAAGCAACCTGATGAACGACCAGCAATGGGTGAAGTGGAGGTGGAACTTGAGCTTGCTCTGTTGGTGCAGGAACAAGAAGATATCATAAATACCGATAGCGATTATACCTTATTGTCCAAAACCGTTATTATCCCAAAATCAGAGGGGGGATTTGAGTATGTCATTGGCCTGAAAGAACAGGAAACCGTATACAGTGACTCAGAAGACATGTTCCATAGGCAATTTAGTGAGCTTTTGAAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_15768::LG4:11538586-11540586(+)
ATTATTCTGTAAATTATAAACAAAAAAATATGATATTCAATAGTTATATGTTATTTTAAACAAAAATATATTTATCAAGACAAAAATATGCTAATATATGAGATAAAATTAAAACTCATGTAAATCAGTAAAACCTACTTATAATTTTACAAACCAACCTATTTTGACAAAGACTAAGCTTGATATGGTGAGAAAGTTCTCAAACTAAATAAATTATTCCTTACAACTCATTCTAGACTTATAATACTATTTTGAAAAATATTCAAGATTTTAAATTATAAGATATTGTTCATAGTCAAATAGTATTTTCATCATGTTATATAACATCATAGAACAATTATAGGATTTTTATAAAGAATTTACCATCAAAATATCACTTCTCAGAAACCTATGTCCAATTTCATTAACCCATGACACCTGCAAAATAGAAAGCATGGAGTCATAATTAATTACACAATTAAGCATATCTTGTAACCAATTTCACAATAAAACTCATGAAATTGCATACATAATATGTTACTCTTAGTTTTCTGCAAAATTATTATCTGTATTAGTATGTTTAAAAGTATTGCTTAACAACTTTTTAAGATAGATAATCATCAATATTTCAATCCAAAAACTTCATCATAATTGTCATTGATAGCATAATCTTCCAAAACAATATACAGTACTACTCCAGGCAACTGACAAAATTTAGTAAATATCAACAACCATGTACATCATTTCCAAATTTAGTAAATTTATCATCTATATGTTTAGAAAGAAAACTCAACCATACCACCAATGACAAAATTAAATAATTGATAATCTCTCAACTTTAATATTCTACCTTTCCATTTATGAAATACATCTTGATTTTTTTCTTCCATAACAAACTTTAAATATATTTCTCCTTAGGAATACTTTTAAATATCTAAACATCAAAATAATCAAAGACTATATATAATATCACAGGTATACAAAAGATATAAAAGAATAGAAATACCTTTAAATAACTATTCAAATTAATACTGCCATTATTGACCAACTTCAAAAAGCCTTTAGAGTAAATGTTATCAAATTCATAAATTTATTATACCTGATAATTTGTAACTGGTGTTTATAGTGGGAGTGAAATAAGGACACAACTACCCATAAACCCGTCGGATTAAAGAAGAAAAAAAGCAAGTTGAATTAATAAATTGGAGACAAATTAAATCATATCTTTGATGATAAAATTAAACAATAAAATACTTAAAAAATATATTTTAAACACTCAACATAATAATATTTTAATTTTAATTTAATTGAAAATACTCAAATTGATGAAATGGTTATAATTAAATAATGCTAAGAATTACTTCCATCCTTAATTGAAAGCACTTATAATTAATTCATATTTTAGAAATTTTGAATAATTTAGTCAGTACTAGTAATCTGTCTATAATTGTAATTAGTATTTCCCTAATGATCATTAAAACTAAATTTTAATGACAAAAAATTGTAATTAATAATTCAATTTTTAAATTATTAATGAAAAAAAAACAATAGCAGTAGCAGAATTTTAATCTTTAAAACTAAATTTTTTGATATCATAAAAACCAATTCATAATATTTATTATTTATAAATTAAAATAATTGAAAATTTTTCTGAAAATATTTAATCAAATAACAACTAAAAGAATGCTATAAAAAAAACTCTGAAGAATAACTTATAAACTAGAGAAAAAAAATATTATAATTTTTATAAACTACATGTTTGAAGCAATTATTTTGTGCTTCACTTTACCTTTTCAAAAAGGAAAAGAAACACACACCTTATCTTGACAGTCCCACCACCTTCGATGATGAAACAACAAAAGCTGTCCATATTTTTCATTTGATATTAATCAATATATTAAACTCTTTTTTATCAAAACTAACAAAAAATATAGTGTTTAGCAAGAAATTTAAAATGTAACCATGGGTGTCGGTACTAATTAGACACTCAGTTTCAATCTCTGTGCCAAGAAATCTAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_15768(+)
ATGTTTCTGAAATGTTTTGGTGACTCAAGTTCATCTAGGAGACAATATCCAACCGTAATAGAAGAGTTGTGCCGTCATTTTTCTCTTGCTGATATTCGGAAATCAACCAACAATTTTGATCATAACAGAGAAATTGCTGAAGGAGCAGTCGGTAAAGTATACAGAGGTTGTCTCCAACACAATGATGGTTCTTATTACGAAGTCGCAGTGAAGCGATTTCACGGGCAAAGCTGTGAAATATTAAAAAGAGAAGTAGAGTTACTGTGTCAGCTTCGCCATCCTAATTGTGTGTCTATCGTAGGATTTTGCAACCACGAAACAGAGAGCATTATTGTGTATGAGAACATGTCCAATGGATCTCTGGATCGACACCTGCGAAGTGAGGTTAGGGAAGCACTTCCATGGAAAAAAAGGATACAGATTTGCATAGGAGCGGCGCGTGGACTACACTACCTTCATGCCGGACTCAAGCGCACCATCATTCACCATGACATCAAGCCTAGAAAAATTCTTTTGGACGACAACATGCACCCAAAACTCTCAGGTTTCAGCTCTAGCTTACTGGGAGCACATTTCAAGGAAAAACCAAAACCAATAAAAACGGATTTTTTAGGTAATTGTTCATATCTATGTTATTGTATAATAATATATCTTATAATTATATGCTGCTACAGAATAGTTTTCGGTTTTATTGAGCTTACTTACTGCAATGAATTTGTGTGAATTAAACTGAACAAAGCTGATGATAGTTTCTCTTTTTAGGTACTTGTGGTTACTTACCTGTTGAGTCATTTACGACCGATAATGTCACAGATAAATGGGATGTTTACTCATTTGGTATGACTCTACTGGAAGTTGTGGGAGTAAGAAGAATTTTTGAACGGGTTTATTTTGAAATAGAAAAAGAATTACTGGAGAAGTGTATTGAGGAGAATATTGATCCGAAAATCAAAGGAGAGATTGCACCAGAGTGTTGGCAAGTCTTTATAGACATCGCCTTAAGATGCATAAATAAGCAACCTGATGAACGACCAGCAATGGGTGAAGTGGAGGTGGAACTTGAGCTTGCTCTGTTGGTGCAGGAACAAGAAGATATCATAAATACCGATAGCGATTATACCTTATTGTCCAAAACCGTTATTATCCCAAAATCAGAGGGGGGATTTGAGTATGTCATTGGCCTGAAAGAACAGGAAACCGTATACAGTGACTCAGAAGACATGTTCCATAGGCAATTTAGTGAGCTTTTGAAGTAG