Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15755 LG4 11438491 11441363 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 11438495 missense_variant p.Glu2Val
G/C 11438501 missense_variant p.Ser4Thr
T/C 11438714 missense_variant p.Val75Ala
A/T 11438717 missense_variant p.Asp76Val
T/C 11439949 missense_variant p.Cys271Arg
G/A 11440798 intron_variant
G/C 11440850 missense_variant p.Asp425His
A/G 11440857 stop_retained_variant p.Ter427Ter
C/T,* 11440909 synonymous_variant p.Ser444Ser
A/G 11440916 missense_variant p.Asn447Asp
A/G 11440917 missense_variant p.Asn447Ser
A/G 11440977 missense_variant p.Glu467Gly
G/A 11441023 synonymous_variant p.Ala482Ala
A/G 11441114 missense_variant p.Ile513Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15755.1
MEDSVVGFLVQRLSQLLESEIKLLSGVEEKIKSLSNELKFMDIFIKSSEGKYKDAVVKEVVTQIRDVAHKAEDVVDTYILNIAKHKHHSFSVSVDLGAGIINGVEAVGAIERRSDTYSLIGDPFNLGSTMMNSDCLRNDKETKQNNSANRPFNSERDSSVERKLDEDILSSQVRRVRDWHYTHLEHDCAASLNNVSLSDGNHDKVYRSFGGDHGMIIRGHSFVVEYLGERITIPLNHIVTNVSNDIKEPGQNYKIKVSTANNNDFFGDSVLVTVLLGSLKAGTIQWYPPLPQWKCFSGKRFSYGTLNTVVLEFPSEVWDYAGDYLAATNARRNTGHYFMFCNVRNAVGVPALIALEVGKVAIDGQSWSSSGHLKHAIKVLRKFFGQDSVPDHVTYVVTDWDTVWGAMMSGLLDAEIEKIKSRIDEIYKNQERYGIKEGEFQSEEAVSTEWRRKRRMDVEEEDVVGLVNESDIVIQQLQKDDVRLNVASIVGMGGLGKTTLARKIYNKDNVKRIFPCRAWGNVSNDYRPKELFQSLLRSLNLSGFENLSEEDLKKEVVKGLKGKTYLIVLDDIWETRVWDDIKGAFPDDNIGSRVY*


CDS Sequence:
>Vu_15755.1
ATGGAAGACAGTGTTGTTGGCTTCCTGGTGCAGAGGTTGTCACAACTACTTGAAAGTGAAATAAAGCTCCTTTCTGGTGTGGAAGAGAAAATAAAGTCCTTGAGTAATGAATTGAAGTTCATGGATATCTTCATCAAGAGCTCAGAGGGGAAGTACAAAGATGCAGTGGTGAAAGAAGTGGTGACGCAAATAAGAGATGTCGCCCACAAAGCAGAAGATGTGGTGGACACTTACATTCTCAACATCGCCAAACACAAACATCACTCATTTTCTGTTTCTGTCGATCTTGGAGCTGGCATTATAAATGGTGTTGAGGCTGTGGGGGCTATTGAGCGAAGATCAGATACTTATTCGTTGATTGGTGATCCGTTCAATCTTGGGTCGACAATGATGAACAGTGATTGCCTTCGCAATGACAAAGAAACCAAACAAAACAATTCGGCAAATAGACCATTTAATTCCGAAAGGGACAGTTCGGTGGAAAGAAAGCTTGATGAGGATATTTTGAGCTCTCAGGTGAGGAGGGTTAGGGATTGGCACTACACTCACTTGGAGCATGATTGTGCTGCTTCACTTAATAATGTTTCTCTTTCCGATGGGAATCACGATAAAGTGTATAGGAGTTTTGGAGGAGATCATGGTATGATTATAAGGGGTCACAGTTTCGTTGTTGAGTATCTGGGAGAAAGAATCACAATTCCCTTGAACCACATTGTAACAAATGTGTCAAATGATATCAAGGAGCCTGGTCAAAATTATAAAATCAAAGTTTCTACAGCAAATAACAACGATTTCTTTGGTGATTCTGTTCTTGTTACTGTTTTACTGGGCAGTTTGAAGGCTGGAACTATACAGTGGTACCCACCTTTGCCACAATGGAAATGTTTTTCGGGGAAGCGTTTTAGTTATGGAACTCTAAATACAGTGGTTCTGGAATTTCCTAGTGAAGTTTGGGATTATGCTGGGGACTACTTGGCAGCAACAAATGCGAGGAGAAACACTGGTCACTACTTTATGTTTTGTAATGTTAGGAACGCAGTTGGGGTTCCTGCCCTTATTGCATTAGAAGTTGGTAAAGTAGCCATAGATGGTCAAAGCTGGAGCTCTTCGGGTCATCTCAAACATGCAATTAAGGTTCTCCGAAAATTTTTTGGGCAGGATTCAGTTCCAGATCATGTTACATATGTGGTGACTGATTGGGATACTGTTTGGGGGGCGATGATGAGTGGACTACTCGATGCTGAGATAGAGAAGATCAAGAGTCGTATCGATGAGATTTATAAAAACCAGGAGAGGTATGGCATCAAAGAAGGTGAATTCCAAAGCGAAGAAGCAGTTTCAACAGAATGGCGCCGCAAAAGGAGGATGGATGTGGAGGAAGAAGATGTTGTGGGCTTAGTGAATGAGAGCGACATTGTCATTCAACAGCTCCAGAAAGACGATGTGCGTCTTAATGTTGCTTCTATAGTCGGAATGGGAGGATTGGGTAAAACCACTCTTGCCCGTAAGATCTATAACAAGGACAATGTGAAGAGGATATTTCCTTGTCGTGCATGGGGTAACGTGTCTAACGATTACAGGCCCAAGGAGCTTTTTCAAAGTCTCCTGAGGAGCTTAAATCTTTCTGGATTTGAAAATTTAAGCGAGGAGGATTTGAAGAAGGAGGTAGTCAAAGGGTTGAAGGGGAAGACATATTTGATAGTGCTTGATGACATATGGGAAACACGAGTTTGGGATGACATAAAAGGAGCCTTTCCAGATGATAATATAGGTAGCAGAGTGTACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_15755::LG4:11436491-11438491(+)
TGCTAGAAGAAAACAAATTTTAAGGTAGGTAGGTATGACATGCATATATAAAAATTTATTATACCATTACGTAACTTGAGTTTTGTTGCCCTAATGTTACTTGAATCGGCAAAGGAGGTAGAGCTATGTTTATGCACAAAAAGTGAAGAAGGTGAAACTCGACCACTGTATCTAAGAGGTAAGTTCACTGTTATTTCATATCTAATATGCTATTATGAGCTCATTTTATATAAGTAATGATTTGTAAAGTTCATCATAAAGTAATGATTTAAGAACTAAACTAATGTTTGAGAATGATGAAAACTGTAAAAGTTGTGTGAACAAAATTGTTGTGTAAACAAAAGTATATGTTTACTTGTGAAGGAACAATTTTTAGATTATGGACCAAATCACTCAAAAGATTACATTACAAATTTGAGATATGAATTGTATAGATTAGTGAAACTAAAAGTAAATATTAGTTAGTGATTCTAGAAGTTAGGAAAAACATTAGAAAATGCATTTTTAACGAATGATTTGTCTGCCAAAAATTTTAATTAGGGTAAATGGCTTAATAAGGATTTTAACCTTCAATTATATAAAAATAAACATCATTTAATTTTTTTTTGTAGTGTTATATATAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAACTATTGGTCGTTTCTGATTTTCGTCCCTCTTTCAAAATAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCGAAAAGTTTGTTTTAGTCCTCAAAACTTTGGTTTTAGTCATTATTTTGTTGACTAAATGAGGACTTAACGGTCTTAGTTTTCGAGGACTAAAACGAATGTTTCGAAAAGAATGAGAACCAAATTGTACCTTATTTTGAAAGAGGGACGAAAACCAGAAACGACCAATAATTTATGGACTAAAAACATATTTAACCCTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGATAATCACAAGATCTGTGAGTAGAAAACAATGTTAAACAATTTGTTAAAATTTTGTTTGGTAGTAATTAAGAAGAGTAAAACATGAGAGAAAAATTATATCTTTTGGACTATAGGATATGATAATTCAAGTAGCTTTTTAGTTGAAACTAACTTACAAAGTGATCCAATTATTCCCTAATAAAAGAAAGTGACTTAGACATCACAATTTAAATAACTTTTCCTTTTATTAAGGTTGTTTATACCTATGGTTGAGATGTTTAATTAATTGTAATAGTAAAATAGATAATTTTTTGTGTATAATATCTTATTTTTAAAAGTTATGCAATAGTCATAATATCCTTAAAAATATAATAGATAAACTAATTCAAGTGTGTATGTAAATATTAAAATTTTTGTAAGTATTATTACTATTATATTTTTTACTTTTATAATTTACTGCTATTGTATGAAAGCAAATAAAAAAAATTAATGAATGACCAAACTTATTGAAAGATACATTGACACCCCTTCTTAAAAGGTGTACTGTAAAATGGATTTTAAATAAACTGGCATGATAATCACAGTTTAAACGTTACATCATAGGAAAAATATTATACTTTAATATTATGGCGTTTCCTTAAGTTCTTTTTTCATGTCTAAAAGTAACAATTATGTTAAATAGTTTATAATTTGGTAAAGATGTTGTTGATTTCGTTATTAACCAAGCTTTATTTAAATTTGTATAATTTAATATAAGATTAAACAAAATAAGGCAAAATCAAGTTTTCAAATAACTCTGGATAACCTAAACAATGAGTCTACGAAACATAGTGATCAAGAATTCATCATTATTGTATTTTTCGTCTTCTCTCTTTGCATGTTAAAGAGATAGTTTCAAAGGTATAAATCACAAACCCACATATTGAGAATAAGAATGTTTTTCATAAATGTAAAAACTGGATATTACTTATTACTCCCTGTTGTAAATTGACGAATGCTCGTACTTAGATACAGAGATAACAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_15755(+)
ATGGAAGACAGTGTTGTTGGCTTCCTGGTGCAGAGGTTGTCACAACTACTTGAAAGTGAAATAAAGCTCCTTTCTGGTGTGGAAGAGAAAATAAAGTCCTTGAGTAATGAATTGAAGTTCATGGATATCTTCATCAAGAGCTCAGAGGGGAAGTACAAAGATGCAGTGGTGAAAGAAGTGGTGACGCAAATAAGAGATGTCGCCCACAAAGCAGAAGATGTGGTGGACACTTACATTCTCAACATCGCCAAACACAAACGTAGAAACAAACTGTGTCGGTTATTCCACCTCAAAGAAAAACTCGTTGTAAAAGTGGGAAGGAAGATTTGATTCCATGGAGGCGACGTTGGAGGATATTCAAGCGGAGTGGAGGGGAATGGCTCGAAAAGCAAATCGTGACCGTGGAAGACGAAACATTAATCGCGACCGTGGGAGAAGAAGGAACCAGCGTCGGAGCTCCGAAGGGAGTCGCGATTCCGTCAACGCTGAACGCAAACGGCGACCACCAGAGAAGTCGGAGGACGAAGCGGAAGAGGACAGAGGAGACGTGCAACGTAGCGGGATGAAGCGCATTGAACTCCCAACATTCGAAGGAGTGGACCCCATGGGCTGGATCGCGAAGGCAGAGAAATTTTTCGATCTACAGAACTTGACGGAGAGGAAGAAGATGAAGTTGGTATATACCTGTATGGAGAGAGGCGCGAGCTACTATTGGATTCGTTTCTGGCGGAAGAAAACCCGACATCCAAATTGGAAGATATTCACGGAAGCGCTGACGCGGAGGTTCGGCGAACTGAATCGAGACACCGTTTGTGAGGAGCTGGCAGCGGAGCGACAGGAGGGAAGCGTCAACAAGGACTTCCAGGAGTTGGGAAATTCGGTGCCACAAGCATCGGGAAAACCAGATCACTCATTTTCTGTTTCTGTCGATCTTGGAGCTGGCATTATAAATGGTGTTGAGGCTGTGGGGGCTATTGAGCGAAGATCAGATACTTATTCGTTGATTGGTGATCCGTTCAATCTTGGGTCGACAATGATGAACAGTGATTGCCTTCGCAATGACAAAGAAACCAAACAAAACAATTCGGCAAATAGACCATTTAATTCCGAAAGGGACAGTTCGGTGGAAAGAAAGCTTGATGAGGATATTTTGAGCTCTCAGGTGAGGAGGGTTAGGGATTGGCACTACACTCACTTGGAGCATGATTGTGCTGCTTCACTTAATAATGTTTCTCTTTCCGATGGGAATCACGATAAAGTGTATAGGAGTTTTGGAGGAGATCATGGTATGATTATAAGGGGTCACAGTTTCGTTGTTGAGTATCTGGGAGAAAGAATCACAATTCCCTTGAACCACATTGTAACAAATGTGTCAAATGATATCAAGGAGCCTGGTCAAAATTATAAAATCAAAGTTTCTACAGCAAATAACAACGATTTCTTTGGTGATTCTGTTCTTGTTACTGTTTTACTGGGCAGTTTGAAGGCTGGAACTATACAGTGGTACCCACCTTTGCCACAATGGAAATGTTTTTCGGGGAAGCGTTTTAGTTATGGAACTCTAAATACAGTGGTTCTGGAATTTCCTAGTGAAGTTTGGGATTATGCTGGGGACTACTTGGCAGCAACAAATGCGAGGAGAAACACTGGTCACTACTTTATGTTTTGTAATGTTAGGAACGCAGTTGGGGTTCCTGCCCTTATTGCATTAGAAGTTGGTAAAGTAGCCATAGATGGTCAAAGCTGGAGCTCTTCGGGTCATCTCAAACATGCAATTAAGGTTCTCCGAAAATTTTTTGGGCAGGATTCAGTTCCAGATCATGTTACATATGTGGTGACTGATTGGGATACTGTTTGGGGGGCGATGATGAGTGGACTACGTGAGTCTGTTAGCAAAATGGACATATTGAGCACTGGAAATGAATATATTGTTGAGATGAAGGGATTAGAAATCAGAGACAAACTTTATCTCTTTGAGTCGGGAGGTTTGGATGGGAATTTAGGAGCTACCTGTTTGGCATCCCTGGGAAAAATGAAAGTAGATTGGTGGCAGTTGAGCATGGAGATTGAGCAGGAAGAATGGAAGACATCGGTGGAGGATTCGAGGAGCAGAATGTTGGAAGTTGATAGAATCCAGGAAGAATGGAAGATATTGGAGGAGGATTTGCCACCACCCAAGCCTCCAGACTTGAATTGGAGGGCATCACCTGGGAAGGGAAGAGGAGCATTACGGCAAATAACAGTTCCCTAACTTCAACCTTGAGGACAAGGTTGATTTTGAGGGGGAGAGTAATGTTAGGAATAAAAGGCCCCATGAAGTCGATGCTGAGATAGAGAAGATCAAGAGTCGTATCGATGAGATTTATAAAAACCAGGAGAGGTATGGCATCAAAGAAGGTGAATTCCAAAGCGAAGAAGCAGTTTCAACAGAATGGCGCCGCAAAAGGAGGATGGATGTGGAGGAAGAAGATGTTGTGGGCTTAGTGAATGAGAGCGACATTGTCATTCAACAGCTCCAGAAAGACGATGTGCGTCTTAATGTTGCTTCTATAGTCGGAATGGGAGGATTGGGTAAAACCACTCTTGCCCGTAAGATCTATAACAAGGACAATGTGAAGAGGATATTTCCTTGTCGTGCATGGGGTAACGTGTCTAACGATTACAGGCCCAAGGAGCTTTTTCAAAGTCTCCTGAGGAGCTTAAATCTTTCTGGATTTGAAAATTTAAGCGAGGAGGATTTGAAGAAGGAGGTAGTCAAAGGGTTGAAGGGGAAGACATATTTGATAGTGCTTGATGACATATGGGAAACACGAGTTTGGGATGACATAAAAGGAGCCTTTCCAGATGATAATATAGGTAGCAGAGTGTACTAG