Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15718 LG4 11147011 11148108 PREDICTED: receptor-like protein kinase ANXUR2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 11147028 missense_variant p.Tyr333Ser
A/G 11147033 synonymous_variant p.Ile331Ile
G/T 11147045 stop_gained p.Cys327*
G/A 11147053 synonymous_variant p.Leu325Leu
C/G 11147054 stop_lost p.Ter324Tyrext*?
T/G 11147055 stop_lost p.Ter324Serext*?
T/C 11147064 missense_variant p.Tyr321Cys
C/A 11147091 missense_variant p.Cys312Phe
C/T 11147106 missense_variant p.Gly307Asp
C/T 11147107 missense_variant p.Gly307Ser
A/G 11147134 stop_lost p.Ter298Argext*?
G/C 11147160 missense_variant p.Thr289Arg
T/C 11147169 missense_variant p.Lys286Arg
T/A 11147226 missense_variant p.Glu267Val
G/T 11147241 missense_variant p.Thr262Lys
G/T 11147263 missense_variant p.Gln255Lys
C/G 11147272 missense_variant p.Glu252Gln
G/T 11147403 upstream_gene_variant
T/C 11147691 missense_variant p.Lys140Glu
A/G 11147829 synonymous_variant p.Leu94Leu
T/A 11148004 missense_variant p.Glu35Asp
C/T 11148031 synonymous_variant p.Glu26Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15718.1
MGQCLSFCCFKHTASSQQQYPTVIEELCPQFSLAELRKWTNNFDENQIIGIGGLGVVYKGSLRNSCATECTIAIKRIHAITEKELKQFKNEIELLCQLRHPNLVTLLGFCDHRDEKNIVYEYMTNGSLRDVLYCSDMKKKPLTWKQRLNICIGVAKALHYLHTGLKRTVFHRNVIPYNILLDSNMEAKLSDFRLCLTGPHHASKPKPKTITKDGFSGTYGYEAPEISENNTLTEKCDVYSFGVVILEVVCKEKLNSVEKRQKHPVEENIDPNIKGKIAPESWEVFINITQRCLNFDPNERPSMGEVEVQLELALSLQEEADIRNSCDAYTLLSMTIIS*


CDS Sequence:
>Vu_15718.1
ATGGGACAATGTTTGAGCTTCTGCTGCTTTAAGCATACAGCTTCGTCTCAGCAACAGTATCCAACTGTGATAGAAGAGCTATGCCCTCAATTTTCTCTAGCCGAACTTAGGAAATGGACAAACAACTTTGACGAAAACCAAATAATTGGAATTGGAGGCCTTGGCGTTGTATATAAAGGCTCTCTCCGAAACAGTTGTGCTACTGAGTGTACAATTGCAATCAAGCGAATACATGCGATTACTGAGAAGGAACTTAAGCAGTTCAAGAACGAAATTGAGTTGCTCTGCCAGCTTCGCCATCCAAATTTGGTCACTCTGTTAGGATTTTGTGACCACAGAGACGAGAAGAATATTGTATATGAGTACATGACCAATGGATCTCTCCGTGATGTCCTATATTGTAGTGATATGAAAAAGAAGCCACTAACATGGAAGCAGAGGCTAAACATCTGCATAGGAGTAGCGAAGGCACTACACTACCTTCACACAGGTCTCAAGAGAACAGTCTTTCATCGTAACGTAATACCTTATAATATTCTTTTGGATAGCAACATGGAGGCAAAACTCTCAGACTTCCGACTTTGCTTAACAGGACCACATCATGCATCAAAGCCAAAACCAAAGACAATAACAAAAGATGGCTTTTCAGGTACGTATGGTTACGAGGCTCCTGAGATTTCAGAAAACAATACATTAACAGAAAAATGCGATGTTTACTCCTTTGGTGTAGTTATACTAGAAGTGGTATGCAAAGAGAAGCTAAACAGTGTTGAGAAGAGGCAGAAACACCCTGTTGAGGAGAATATTGATCCAAATATTAAAGGAAAGATTGCACCAGAGAGTTGGGAAGTATTTATAAACATCACACAAAGATGCTTGAACTTTGATCCAAATGAGCGACCATCAATGGGTGAAGTGGAGGTTCAACTTGAGCTTGCTCTGTCACTGCAGGAAGAAGCAGATATAAGAAATAGCTGTGATGCTTATACCCTATTATCTATGACCATTATTAGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_15718::LG4:11148108-11150108(-)
AAATGGAAAAGGATGTTGAACGCTGTTGTACTTTCTATACAAAGTTAAATCTATACTACGTTCCTCCAATCCATGTTCCAGAAACCACAAAAATCCAGTTATGATGTAATTTTGTGCATATGTTACTTCAACAGCAAAGTAAATATCCCTACACTCTCAGAAGCAGACCACAGTTGACTTTGGAAAAATTATGCTCAATAAATTATTGAAGAATATCATATGCTTAATAGCGTATAATTTCATACGAAGCATGATTCTACAGCAGGAAATTTGTCGTTAGCATAAATTTAAAGCCAAAAAGTACAACAGGGAAATTAGTATAGAATCAATTATGGGAGCATAACCAACGAGATCCAGTCAAGGATGACCATATTGGAGAACAAAGAAAAAGATTAAGGAACAACTTGTAGAAGAAGAAGATACACCTTCAGTTCAGAGAATATGGAGTGCCTCTTGTTCAACCAAATACGTGGTGTGGCAGTGCAAGGGAGAAGACGCTTTGGAGTTTGGAAGCTCCATTCATGCTATTTTATTGCATATTTAATAAGAAAAAAAAGTCAGCAAATTGAATCTGTTTTTTTTTTTTATTATAAATAATAATTTTGAATAAAATTGATTTTAAATTTAAATAATCTATGATGATTTTTTTTTAATTTTAAGATAATAATGATATTTTTCTACTTTTATTGAAAATAATTTTTTTCTATAAAATTTTAATTTAAAACTTATTCTAGATCATAACTAATTTTTAATATAAAATTAAATATGTAAACATCTATCTACAATTATGTTAAGTAATATTTCAACATGGTTTTAGATTACGAATGCGGATATTAAAAAAAGTGTTAAATAAATCTTTATATAATAACCTAATGAGTAATTACATTTTTAAATATATATTTCAACTTATTTGATATATATTGCCAGATTTTAATAAATAATTTTAGTAAATAGTAGTTTAATAAATGTTTATTTTATTATTAAATAGGAGATATAAATTTAATCTAGAGAAAAATATAAGAAAACATGCAAGGATTACGGAGATTATAAAAAAAAAAGTTATCTATATAGGTCAAACATCAAATAAAACATAAGAAAAATATATTTAACTATTTTACTTCAAGAAAAAATGTAAATAATGAAGTATTAATAAAGAAATTGATAGTAGCTTATAAATCCAATCCATATAACATGTTGGTTAAACCATAAAGTCAAATAAATTTGTTTGAATAGATTAAAATTTCAATCATTCCTAACTCATTTTATTATCTGAAGCCAACTCTGTTTAATTTCAGGACACCTAACACTGAAAAGGGTTCTATCTATTACTAATGTGGCAAGAGGGAATTATCTGAGGTCAAATTTTTGGGAAACTTGAACAAGAGAAGATACTGAAGCAACAGCATCCCTGCGCTGAACATAACTTTGTTTCTGCCTTTCCCTTCATCTCCAGGTTCTCCAACCAATATGATGTTCTATCTATATTGATTAATTGTTAGTTTTACATCTTACAGTATAAAAGCTGGCCAAGTATCTACTTTACAATTAGTCTAGTTTTATACTCTTATGTAGCTAATTCATATGGCATCTGCAGTTCATATGTTTGTTTCATTGCCACTGTACACTTTTACATATGTAATTTGCTTTCTATTTTTTTCTTTAGATAGATGGATGGCATGTTCTCAGACTACTTTTACTGATATGGGAAATATGAATCTCCATCTATGAAACTATCATCACTTTTAGCTGAATGAACTATTTGATGGTAATAATCAAAATGTTAGAATTAAAGATTCATCTCCCTTTATCTCTCCTTAATTTTCCATTTTGAAATGAAACACAGTGAATATGAAATCAAAACTGGCAGGTTAAGTTTTTAAAACTTGTGGTAGGTGAAAAGCAAGAAATTTTCTCTCATTTCAGGTATACAATCACATTTCAGTTATATACTTTTCTCTCAGTTTTGTCCTATGAATAATCTTTTCTAACAGGTATCTAAA


Gene Sequence:
>Vu_15718(-)
ATGGGACAATGTTTGAGCTTCTGCTGCTTTAAGCATACAGCTTCGTCTCAGCAACAGTATCCAACTGTGATAGAAGAGCTATGCCCTCAATTTTCTCTAGCCGAACTTAGGAAATGGACAAACAACTTTGACGAAAACCAAATAATTGGAATTGGAGGCCTTGGCGTTGTATATAAAGGCTCTCTCCGAAACAGTTGTGCTACTGAGTGTACAATTGCAATCAAGCGAATACATGCGATTACTGAGAAGGAACTTAAGCAGTTCAAGAACGAAATTGAGTTGCTCTGCCAGCTTCGCCATCCAAATTTGGTCACTCTGTTAGGATTTTGTGACCACAGAGACGAGAAGAATATTGTATATGAGTACATGACCAATGGATCTCTCCGTGATGTCCTATATTGTAGTGATATGAAAAAGAAGCCACTAACATGGAAGCAGAGGCTAAACATCTGCATAGGAGTAGCGAAGGCACTACACTACCTTCACACAGGTCTCAAGAGAACAGTCTTTCATCGTAACGTAATACCTTATAATATTCTTTTGGATAGCAACATGGAGGCAAAACTCTCAGACTTCCGACTTTGCTTAACAGGACCACATCATGCATCAAAGCCAAAACCAAAGACAATAACAAAAGATGGCTTTTCAGGTATTTGTTCTTGTTTTGTTGTATTGTTTATTGAAAAAGAATTTTACTGAGTACTACTCCAAATAATACTTTCACTTCTAGGTACGTATGGTTACGAGGCTCCTGAGATTTCAGAAAACAATACATTAACAGAAAAATGCGATGTTTACTCCTTTGGTGTAGTTATACTAGAAGTGGTATGCAAAGAGAAGCTAAACAGTGTTGAGAAGAGGCAGAAACACCCTGTTGAGGAGAATATTGATCCAAATATTAAAGGAAAGATTGCACCAGAGAGTTGGGAAGTATTTATAAACATCACACAAAGATGCTTGAACTTTGATCCAAATGAGCGACCATCAATGGGTGAAGTGGAGGTTCAACTTGAGCTTGCTCTGTCACTGCAGGAAGAAGCAGATATAAGAAATAGCTGTGATGCTTATACCCTATTATCTATGACCATTATTAGTTAA