Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15578 LG4 9619734 9623101 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g15080 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 9619835 stop_gained p.Cys34*
T/A 9619842 missense_variant p.Phe37Ile
T/C 9619988 intron_variant
G/T 9620008 intron_variant
T/A 9620309 intron_variant
G/T 9620328 intron_variant
G/T 9620329 intron_variant
G/A 9620418 intron_variant
A/G 9620419 intron_variant
T/G 9620425 intron_variant
A/G 9621365 intron_variant
G/T 9621867 missense_variant p.Met242Ile
G/A 9621878 missense_variant p.Gly246Asp
G/T 9622033 intron_variant
G/T 9622159 intron_variant
T/C 9622172 intron_variant
T/C 9622271 intron_variant
G/C 9622289 intron_variant
G/A 9622327 intron_variant
A/G 9622332 intron_variant
A/G 9622342 intron_variant
A/G 9622417 intron_variant
A/G 9622470 intron_variant
G/A 9622481 intron_variant
T/C 9622638 synonymous_variant p.Ser269Ser
A/T 9622639 missense_variant p.Thr270Ser
A/G 9622682 missense_variant p.Gln284Arg
T/C 9622759 stop_lost p.Ter310Argext*?
A/T 9622825 missense_variant p.Met332Leu
C/A 9622834 missense_variant p.Pro335Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15578.1
MGFGNNAIQAGSLDVGKSKVKMQKAGADKEIGCCVKFCFIGSCIPSRSKVDTSISGTSANSVEKTSAYEKNKKETNALPGSSTTTSNAESIPSTPKFSEELKVSSRLRKFTFNELKLATRNFRPESLLGEGGFGCVFKGWIEENGTAPVKPGTGLTVAVKTLNHDGLQEGSLPLPWSIRMKIALGAAKGLSFLHEEAQRPVIYRDFKTSNILLDAEYNAKLSDFGLAKDGPEGEKTHISTRVMGTYGYAAPEYVMTGHLTSKSDVYSFGVVLLEMLTGRRSIDKNRPNGEHNLVEWARPVLGDRRMLLRIIDPRLEGHFSVKGAQKAAQLAAQCLCRDPKSRPMMSDVVHALKHLQNLKDMAISTYHFQVARVDRTMSMPTSKNGMQAQLTITRKGQAARSLSSPKGPHGSPYHHYIKSPKPNG*


CDS Sequence:
>Vu_15578.1
ATGGGGTTTGGGAATAATGCAATTCAAGCAGGGAGTTTGGATGTGGGGAAGTCAAAGGTAAAGATGCAAAAGGCTGGTGCAGACAAGGAAATTGGGTGCTGTGTTAAATTCTGTTTCATTGGGAGCTGTATACCTTCAAGATCAAAGGTTGATACTTCCATAAGTGGCACTAGTGCTAACAGTGTGGAAAAAACATCTGCATATGAGAAAAACAAGAAGGAAACAAATGCTCTTCCAGGGTCCTCTACAACAACCAGTAATGCAGAAAGTATCCCTTCCACCCCAAAATTCAGTGAGGAGTTGAAGGTTTCTTCTCGTTTGAGAAAATTTACATTCAATGAGCTTAAGTTGGCCACTAGGAATTTCAGACCAGAGAGTCTTCTTGGTGAAGGAGGGTTTGGATGTGTTTTCAAGGGTTGGATCGAAGAAAATGGTACTGCACCTGTGAAACCTGGTACCGGGCTTACTGTAGCTGTGAAAACTCTCAACCATGATGGGCTTCAGGAAGGGTCGTTGCCTCTTCCTTGGTCTATCAGAATGAAAATTGCACTTGGTGCTGCAAAAGGTCTTTCTTTTCTCCATGAAGAAGCTCAGCGACCTGTAATATATCGTGATTTTAAGACATCTAATATTCTGTTGGATGCGGAATACAATGCAAAGCTCTCTGATTTTGGACTCGCCAAAGATGGTCCTGAAGGGGAAAAGACACACATATCAACAAGAGTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAGTATGTGATGACTGGACACTTGACATCAAAAAGTGATGTCTATAGTTTTGGAGTAGTACTGCTGGAAATGCTGACCGGCCGGCGATCCATCGATAAGAACAGACCAAATGGGGAACACAATCTTGTGGAGTGGGCAAGGCCTGTGCTTGGCGACAGGAGGATGTTACTACGGATCATTGATCCTCGCCTTGAAGGTCACTTCTCTGTTAAAGGGGCACAGAAGGCTGCACAGCTGGCTGCTCAATGCCTTTGCCGTGATCCAAAATCCAGACCTATGATGAGTGATGTAGTTCATGCTCTGAAGCATTTGCAAAACCTCAAGGATATGGCCATCTCAACTTATCATTTCCAAGTTGCACGAGTGGATCGAACCATGTCCATGCCAACTTCTAAAAATGGTATGCAAGCACAGTTAACAATAACAAGGAAGGGTCAAGCTGCAAGGTCCTTGTCAAGTCCAAAAGGCCCTCATGGTTCTCCTTATCATCATTATATCAAGTCTCCAAAACCAAATGGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_15578::LG4:9617734-9619734(+)
TTGCTTTCGTCGATGGGATACTAAAGTTTCCAACATCTTTTGTCTTTATGTTAATTATTTTATTAACCCCAATATAACGTTTCATTTTCTTTTTTCTCTCTCATTTATTTCTCCCATCTTTCCTCTCATTTCCTCTTACAGTTTTTCCTTCTGCCTCATTTAAAAAAAAGAAATTCTTTTTAATACACTCTTTTCCGTTGATTAAAAATAAAAATATTATTAAAAACTATAACATTCATTAAAGAAAATTTAAATTTAACTTAATCTTTGTAAAGTAAAATTTACACCTACTTTTTTTTATATATATATATATATTAAATTAATTTTATTTTTAGTCTATGTAAAACTTCTTACAAACACTGAAAAAAAATAATTTAACCAATTAAAGAATATGAAAAATAAAAATAAAATTTGTGTTACTAATTTCTTCTATTAAAAGAAACAGTACTGAGATATGAGCACTGGCCACACACTCACACACAGAACCCAACAATTTAAAGGCCCAGGGAGGCACTATGAAAATGATTGATTCCATTGTCTCTTCTGCTTCTTTCTTACTCCACAAATTGGCTCAAAAAACGTTTCAAAAGTTAGGCACCATCCTATATTGGTCACGAGTCATGAGTTGTCCCATTCCAGTACACCAAATATGGGTAAAAATATATGTTGCAGACAAAAAAATAACACTAATGAGAGTAACGTGGCATATTCTGAATGATGGAACAACTCATAGTGCAATTGCTCCTAAGTCCCAAATTGCCTTACACCACTATGTAAACAGTTTCCATAATTATTGTCTCTAAGCATAATTACATAATTAAAAAGTTAAACGCTTTTACCAAAAAATATTGTCTAATCATATACATATAGACTTTAAAAAAATGGAGAACAAATATATGCTATATAGGTTAAGTCATCATCTAATTATAATATTTATTTTGTTACATAATCTTTTTTGAAAAAAATTGTGGTTATCCAATAATTAGATCGATCGATATATGAGTTATCTATTATTCATAATTCTTTGTTGAGTGACGAGCGATTCAACAATATTAAATGCTTGTATTTACATCGTTCAATCATTTTATATAAAAGCTAAATTAATTAATAAAACCATTATTTTTTTATCATGTGTATTAAACTTCTAAACTTCACTTAAGTTTATTTTTTTTATATAGTTTTTAGTTCAGACAATTTACAACGGTTGTTGGTATGTGGTACACTAATAACATTTGTTGGTATTATAAATAGTATTCGAGAAAACAAAATAATGTAATGAAGTAGTCTATTAATTAGTTGTGTGTGTACAAAATATAATATAAGAGGTTGTGTACGAAGATAAGCTACCAACAATGGGTATTAATTTATTAACAAGCGTAACACTTGATTATGGTTTTGATTTAATGATTGAGATATTTGATATATAAATCTTGGGGAAAAAGAAGATTATCTTGTGTGAAATAATTCAGAGTGCAAAAATAAAGTCAAACAAATAAGAGGAAAGTAGATATTGTAAGTTGTAACTAGGAAGTGCTCTTCTCAAAAAAGCAAAAACATAAAGAAATGGCTGTCACTTTCTCTCTCCTGCCCGCACTGCCCGGCTGCCAACTTTCACATTTGAAGCCTACCCGGCCGGCCCGTTGTTGAAAAACTCTCTCTTTCACATGCAGTTTCCCATTGCCTCTCTCCTCCACCACCTACACCCCTTCTGGACTGATTTTCAGAACTGGTTTTGTGTGTGTTTGTTTTTTACCCATTTATCTGTGTACTTGTGTTGATCCTTTTGTTCTGATTCACTACAGTGATGTTCTTCTTTTAGTTCTGTTGATTGTGACTGTGATCACGGTCGTGATCATCATATGGGTTGCAGAGTCTTCAATTATTGGAAGTGGGTTTGCTTGAACAGGCTTTTTATTTCCGTTTTTCCTTTTTGAATCCTAAAGTCGGAAACTTGTGGGGACTTTGAGCATGAAAAGCTCTTTCTAAGACTTTGTGGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_15578(+)
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