Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15568 LG4 9456814 9459015 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G,A 9456833 missense_variant p.Gln582His
A/T 9456869 synonymous_variant p.Ser570Ser
G/T 9456946 missense_variant p.Leu545Met
G/C 9456996 missense_variant p.Thr528Arg
T/C 9457095 missense_variant p.Asn495Ser
A/T 9457214 upstream_gene_variant
C/T 9457345 splice_region_variant&intron_variant
A/G 9457351 splice_region_variant&synonymous_variant p.Pro463Pro
A/C 9457611 intron_variant
T/A 9457620 intron_variant
A/G 9457749 missense_variant p.Phe423Leu
G/A 9457834 synonymous_variant p.Tyr394Tyr
A/G 9457844 missense_variant p.Ile391Thr
A/G 9457849 synonymous_variant p.Ile389Ile
G/A 9457861 synonymous_variant p.Leu385Leu
G/A 9457864 synonymous_variant p.Asp384Asp
T/A 9457887 missense_variant p.Ile377Phe
T/A 9457894 missense_variant p.Glu374Asp
T/C 9458043 missense_variant p.Thr325Ala
T/G 9458127 missense_variant p.Thr297Pro
G/T 9458168 missense_variant p.Pro283Gln
G/A 9458332 synonymous_variant p.Ser228Ser
A/T 9458334 missense_variant p.Ser228Thr
T/C 9458371 synonymous_variant p.Thr215Thr
G/C 9458460 missense_variant p.Gln186Glu
A/G 9458516 missense_variant p.Ile167Thr
G/T 9458549 missense_variant p.Ser156Tyr
G/A 9458588 missense_variant p.Ser143Phe
G/A 9458627 missense_variant p.Ser130Phe
C/A 9458771 missense_variant p.Arg82Leu
T/A 9458790 missense_variant p.Thr76Ser
T/A 9458892 missense_variant p.Ile42Phe
C/T 9458937 missense_variant p.Ala27Thr
C/G 9458960 missense_variant p.Gly19Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15568.1
MQFLVSNFHPVIYVLVFIGSVLKLGCASSTPSQLQLEANAIINSGWWNLPHSQSLHICSLIEGIHCNDFGSVTRITYLYSERPIQLANLNLSAFKNLEHLEVSFCSLEGIIPSEIDSLSKLTYLDLSHTSIHGEIPLTIGNLSNLTYLDLSYDSISGQVPPSMGNLIQLSTLIISNNYIEGPVPFQLSFLKNLTIIDLSYNKINGALPISLSNLTNLQNLDISHNLLSGSLEPFLVGYFPLLETLDLSYNSLTGGIPLSLHNVRYVDLSFNNLKGPIPNGVHPFALMGNKGVCSNITNIRIQYQFQPCSVSQKKRRKLVIIPTITIFLIMIFLLLLYLRHNRITIKNKHSRISETSKNGDLFCIWNYDGSIAYEDIIIVTEDFDLKYCIGIGAYGSVFKAQLPSGKIVAVKKLHGFEAEVPTFDESFRNEAKPTVSDFGTARFLNLDSSNRTIVVGTIGYIAPELAYTMVVNEKCDVYSFGVVTLETLMGKHPKEILSSLDSTSTNSDIKLCEILDQRLPHPTFSDLQHIVVAAIMAFACLNPNPCFRPTMKRISQCFLSRLTPFNIPLRLISLQQLISQELRQSLKL*


CDS Sequence:
>Vu_15568.1
ATGCAGTTTTTGGTTTCCAATTTCCATCCTGTTATTTATGTTTTGGTGTTTATAGGCTCTGTTCTGAAGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAATTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGCGGATGGTGGAATTTGCCGCACTCACAGTCACTTCATATATGTTCATTGATTGAGGGTATACATTGCAATGATTTTGGAAGTGTAACTCGTATCACATATCTGTATTCCGAGCGACCCATTCAATTAGCAAATCTAAACCTTTCTGCTTTTAAGAATTTGGAACATCTTGAGGTCTCCTTCTGTAGTCTAGAAGGTATTATTCCATCTGAAATTGATAGTCTTTCCAAACTTACTTATCTTGATTTATCTCATACTTCCATTCATGGAGAGATACCTCTTACAATAGGAAATCTTTCCAATCTCACTTATCTCGATTTGTCCTACGATTCTATTTCTGGTCAGGTGCCTCCTTCAATGGGAAATCTAATTCAACTATCCACACTAATCATTTCTAACAACTACATTGAAGGCCCTGTTCCTTTTCAATTGTCATTCTTGAAGAATCTTACTATCATTGATCTATCTTACAACAAAATCAATGGAGCTTTGCCTATTTCACTTTCAAACCTCACAAACCTTCAAAATCTTGACATTTCACACAATCTACTCTCCGGTTCCCTTGAACCTTTCTTAGTTGGATATTTTCCATTATTGGAAACTCTGGATCTAAGCTACAATAGTCTTACCGGAGGGATTCCTCTGTCCCTACATAATGTCCGCTATGTGGACCTTTCCTTCAACAATTTGAAGGGTCCCATTCCAAACGGTGTACATCCGTTTGCGCTAATGGGGAACAAGGGTGTATGCAGCAACATTACAAATATACGAATCCAATACCAATTCCAGCCTTGTTCAGTCAGTCAGAAGAAACGAAGGAAACTGGTCATAATTCCTACTATCACCATATTTCTAATCATGATCTTCTTACTACTTCTATATCTGAGGCACAATCGCATTACAATCAAGAACAAACATTCAAGGATAAGTGAAACATCTAAGAATGGGGACTTGTTCTGCATATGGAACTATGACGGAAGCATAGCCTATGAAGATATCATCATAGTTACTGAAGACTTTGACCTCAAATATTGTATTGGAATAGGTGCGTACGGAAGTGTTTTCAAGGCTCAACTACCAAGTGGCAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAAGCAGAGGTCCCGACTTTTGATGAGAGTTTCAGAAACGAAGCCAAACCCACTGTTTCCGACTTTGGCACAGCTCGATTTCTCAACCTTGATTCATCCAATCGAACTATTGTTGTTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGAGCTTGCATATACAATGGTTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTCGGAGTGGTGACACTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTGATTCAACTTCTACAAATAGTGACATCAAATTATGTGAAATATTGGATCAACGCCTCCCGCACCCAACATTTTCAGATTTACAACACATAGTTGTTGCTGCTATTATGGCTTTTGCATGTTTAAATCCCAATCCCTGCTTTCGTCCAACAATGAAACGCATCTCTCAATGTTTTCTTAGTCGGCTTACACCGTTCAACATTCCTTTACGTCTTATTTCATTGCAGCAGCTCATAAGTCAAGAACTCAGACAATCCTTAAAATTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_15568::LG4:9459015-9461015(-)
ATATTTTTTTTCATAGTTTTAAAACTAACTTGTACACTTTTCATTGTGAATAAATAATATATTTATTGAAACAATGTCTGTAAAATGTGAACCTTTTTACATCCACTAAGGTTGGTCACTTGGAAACACATTAAATACTAAGTGTTTTCTTTCTGTTTTCTAGGTATAAACTTTCATGTGTGTATCCAATAATATGATTAACTTTTTTCTAGTGTGAAATATCATATTAGTTGTAAGCACGTGACATATTCATATTTTTCTACAATAAAGAACTTGTTATCATTCTTGGATACCATGACAACAAGTGGGATACGACACGAATAATGAGTATTCGTTATTTGATCCAAAAAAAAATGTAGCTGGTACTTGTTTTGTTATTTGTTGGATACTCGTTTAGAAAGTATTTGCGGTATCTATAAATACTTACGAATATTTAAGAAAAAGTATTTTATAATTTTTTAAATAAAATTTAAATAAAGTTAAAAAATATATAAAATATAAATTAAATTAAATTAACTATAAATTAAAATTTAATTTTATAAAATTTAATATAATAAAATATAAATTAATTTAATTTTAATTAAATTAAATTTAATAAAATATAAATTAAATTTTTATTTTTACTTTTTTAGAGTAATAGATACTTTAAGATAATATGATATCCATATCAAACCTATTTATAAACGGATAATAATAATGGATACCCACTTATATCAACTATTCATTTTATCCACGGACTTGCATATATTATTATCATCCCCTTTGATACCATAGTAACAACATAAGAACTCAACTAAAATTGAAAGTAAAACAAGAAATACAATATACAATAATATTTTCTATATTAATTTTTTTCTCAAAAATTTAAGAAATGGAAGAATAAAAAAAGTAAAAGAAAATATTTTCAAATATCTTATTAAAACAACCTTGTGTTCCTCTTCTAATTACTAAAATAATTGTTTTTTCCAATGCTGAGATTTTTTTTCTGACAATAAAAATACTTAAAAAAATATAGATTCATCAACAACTAACTTAATGTTCATAAAATATAAAAAATATTTATAAATCTCTCTACAAAAACGAACTAAATAACTAAAATATCTCCGATAACACTTTATTGGTCAGAACGATTTCTAAACATTCCTATCCATGGAACGTTTCAGAGCAGACGAGTAACAAAGAAATTGTTGCATTCAAATCCTCAAAGTTGACTTTGAAGTCAAGTAATAATAACGTGACAAAAACATGCATACAAACCATTATCTCATAAATATTCCACACTCTTGATATTTTATTCAAACTCTATATAATCTCAAACTTTTATATTAGCCATTTTTCCAACCTTGGCTTTATCTTACTAAGTTTTAGCTTTTTGTGTACTTGTAATTTTATCTTTTACATTTGCACCAACAGAACAATCATCTATAAAGATAAAATTAAAGTTATAATAAAATACCGCTTTTTCATATGTTAGTATTAACTAATAGATTCGAACATTTTAAATTTGGATAAATATGAATTTATTTTGTATTTAATGCTTTTGAAAAAAATGGTTAGTTTTAATTTTTCGAAAATGATTGTGCTAGTAGTGGGTTTTAAGCCTAACTCAACCCCACAAAATTAACTTATAAAATAAGGTTTACACCCACTTATAAACTAAGAATTGATCTTATTTCTAGTCGATGTGGGATTTTCAACAATTGTCTATCTATCGATCGTATGGTTAATTTGTTTGTACAGACGTGTGATCTATCTAGTTACAAAAATTTCAACACATTTCCGTCATGGAACGTGGAAATGGGTTCAGAGTAGACTAAGTCAAGCAATGGCGTGCAGATGCATGCATGCAATGAATGGGGGCAAAAGTCTTTTGGAATTTCATGTTTATGACTTATCACAGTATAAGAATCAGCAGATAACTTACATGGTATTGAGTGAACATAATTTAGTGAAACTCAGTTTCTCATAAATATACCTTCTATTACCTCTATTTGCAAAAC


Gene Sequence:
>Vu_15568(-)
ATGCAGTTTTTGGTTTCCAATTTCCATCCTGTTATTTATGTTTTGGTGTTTATAGGCTCTGTTCTGAAGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAATTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGCGGATGGTGGAATTTGCCGCACTCACAGTCACTTCATATATGTTCATTGATTGAGGGTATACATTGCAATGATTTTGGAAGTGTAACTCGTATCACATATCTGTATTCCGAGCGACCCATTCAATTAGCAAATCTAAACCTTTCTGCTTTTAAGAATTTGGAACATCTTGAGGTCTCCTTCTGTAGTCTAGAAGGTATTATTCCATCTGAAATTGATAGTCTTTCCAAACTTACTTATCTTGATTTATCTCATACTTCCATTCATGGAGAGATACCTCTTACAATAGGAAATCTTTCCAATCTCACTTATCTCGATTTGTCCTACGATTCTATTTCTGGTCAGGTGCCTCCTTCAATGGGAAATCTAATTCAACTATCCACACTAATCATTTCTAACAACTACATTGAAGGCCCTGTTCCTTTTCAATTGTCATTCTTGAAGAATCTTACTATCATTGATCTATCTTACAACAAAATCAATGGAGCTTTGCCTATTTCACTTTCAAACCTCACAAACCTTCAAAATCTTGACATTTCACACAATCTACTCTCCGGTTCCCTTGAACCTTTCTTAGTTGGATATTTTCCATTATTGGAAACTCTGGATCTAAGCTACAATAGTCTTACCGGAGGGATTCCTCTGTCCCTACATAATGTCCGCTATGTGGACCTTTCCTTCAACAATTTGAAGGGTCCCATTCCAAACGGTGTACATCCGTTTGCGCTAATGGGGAACAAGGGTGTATGCAGCAACATTACAAATATACGAATCCAATACCAATTCCAGCCTTGTTCAGTCAGTCAGAAGAAACGAAGGAAACTGGTCATAATTCCTACTATCACCATATTTCTAATCATGATCTTCTTACTACTTCTATATCTGAGGCACAATCGCATTACAATCAAGAACAAACATTCAAGGATAAGTGAAACATCTAAGAATGGGGACTTGTTCTGCATATGGAACTATGACGGAAGCATAGCCTATGAAGATATCATCATAGTTACTGAAGACTTTGACCTCAAATATTGTATTGGAATAGGTGCGTACGGAAGTGTTTTCAAGGCTCAACTACCAAGTGGCAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAAGCAGAGGTCCCGACTTTTGATGAGAGTTTCAGAAACGAAGCCAAAGTATTATCGAAAATAAAGCATCGACATATAGTCAAGCTCCATGGATTTTGCTTGCACAAAAGAATAATGTTTTTGATATATGAGTACATGGAGAAAGGAAGCTTGTTTTCTGTGTTGTTTGATGACATGAAAGCAATGGAATTGGATTGGAAAAAGAGGATTAACACAATAAAAGGCACTGCGCATGCTATCTCATATCTCCATCATGATTGTGTTCCTCCTATAGTTCATAGAGACATATCAACAAGCAACGTCTTGCTTAACTCTGAGTGGGAGCCCACTGTTTCCGACTTTGGCACAGCTCGATTTCTCAACCTTGATTCATCCAATCGAACTATTGTTGTTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGGTAAGTTGTTCATGTTTTTCTCTAGTCCTATTTATTTATGATTTGGTGCATATGAGGCCTAATCAAAATACATGTAACAAGTAGATGGAGTAGCTTTTTACATTTGTATTTTAAATTATTTTTCTTTTGATATTTTAATTTGATGTTGTCAAAACGCAGAGCTTGCATATACAATGGTTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTCGGAGTGGTGACACTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTGATTCAACTTCTACAAATAGTGACATCAAATTATGTGAAATATTGGATCAACGCCTCCCGCACCCAACATTTTCAGATTTACAACACATAGTTGTTGCTGCTATTATGGCTTTTGCATGTTTAAATCCCAATCCCTGCTTTCGTCCAACAATGAAACGCATCTCTCAATGTTTTCTTAGTCGGCTTACACCGTTCAACATTCCTTTACGTCTTATTTCATTGCAGCAGCTCATAAGTCAAGAACTCAGACAATCCTTAAAATTGTGA