Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15567 LG4 9449416 9452369 putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g08850
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 9450020 missense_variant p.Ala340Thr
C/T 9450032 missense_variant p.Asp336Asn
T/C 9450466 stop_lost p.Ter283Trpext*?
G/T 9450621 missense_variant p.Leu232Ile
C/T 9450732 missense_variant p.Gly195Arg
G/T 9451078 intron_variant
G/T 9451243 intron_variant
T/C,G 9451304 intron_variant
C/T 9451448 intron_variant
G/A 9451582 intron_variant
G/A 9451938 downstream_gene_variant
T/C 9452265 synonymous_variant p.Ser35Ser
G/A 9452277 synonymous_variant p.Asn31Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15567.1
MGSVLQLGCASSTPSQLQLEANAIINSGWWNLSHSDSNHICSLIDGISCNDARSVTGITYLYTKRRIQLATLNLSAFKNLETLEVCYSSLEGTIPPEIGSISKLSRLRLSHNSLQDVSYNKINGTLPISLSNLRNLQHLDISHNQLAGSLKPFTVQYLSLLKSLDLSFNNFQGPIPDGLHPSVLVGNEGVCSNISDIQTIYKFKPCSIQAKKLKHNQLVIAIFITIFLIMTFLLLLHLRKNQMEIKNKHARITETPKNGDYFYIWNYDERIAYEDIVAVTEDFDLNYCIGTGAYGSVYRAQLPSGKIVAVKKLHGFEAKVPKFDESFRNEAKPTVSDFGTARFLNLNSSNRTIVAGTIGYIAPELAYTMDVNEKCDVYSFGVVALETLMGKHPKEILSSLQSNCIDDAIKLGEILDQRLSPPSFSILQDIVAVAIVAFVCLNLNPCSRPTMKCISQCFLGQLTPFNIPLRDISLQQLMSQELRHCLKL*


CDS Sequence:
>Vu_15567.1
ATGGGCTCTGTTTTGCAGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAACCTGTCGCACTCAGATTCAAATCATATCTGTTCATTGATTGATGGTATAAGTTGCAATGATGCTAGAAGTGTAACCGGTATCACATATCTGTATACCAAGCGACGGATTCAATTAGCAACTCTAAACCTTTCCGCTTTCAAGAATTTAGAAACTCTTGAGGTCTGTTACTCTAGTCTAGAAGGGACTATCCCACCTGAAATTGGCAGTATTTCTAAACTAAGTCGTCTTCGTTTGTCTCACAATTCTCTTCAAGATGTATCTTACAACAAAATCAATGGAACCTTGCCCATTTCCCTTTCAAACCTTAGGAACCTTCAACATCTTGATATTTCACACAATCAACTTGCTGGTTCTCTAAAACCCTTCACAGTTCAATATTTGTCACTCTTAAAAAGTTTGGATCTAAGCTTCAATAATTTTCAGGGTCCTATTCCAGATGGTTTACATCCATCTGTGCTAGTGGGGAACGAGGGAGTATGCAGCAACATTTCGGATATCCAAACCATTTACAAATTCAAACCTTGTTCAATCCAAGCCAAGAAACTAAAGCATAATCAGTTGGTCATAGCTATTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTTGCTGCTTCTACATTTGAGGAAAAATCAAATGGAAATCAAGAACAAACATGCAAGAATAACTGAAACACCTAAGAATGGAGACTATTTTTACATATGGAACTATGACGAACGAATAGCCTATGAAGACATCGTTGCAGTAACTGAAGACTTTGACCTCAACTATTGTATTGGAACAGGTGCCTACGGGAGTGTTTATAGGGCTCAACTTCCAAGTGGCAAGATTGTCGCGGTGAAAAAACTTCATGGTTTTGAAGCAAAGGTCCCCAAATTTGATGAAAGTTTCAGAAACGAAGCCAAACCCACTGTTTCTGATTTTGGAACAGCCCGTTTTCTCAACCTTAATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGAGCTTGCCTATACAATGGATGTTAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTTGGAGTGGTGGCGCTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTCAATCAAATTGTATTGATGATGCCATCAAATTAGGAGAAATATTGGACCAACGCCTCTCACCCCCATCATTTTCAATTTTGCAAGATATAGTTGCTGTTGCCATTGTGGCTTTTGTGTGCTTAAATCTCAACCCTTGCTCTCGCCCAACAATGAAATGTATCTCTCAATGTTTTCTCGGTCAGCTCACACCATTCAACATTCCTTTACGTGATATTTCATTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTTAGGCATTGTTTAAAATTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_15567::LG4:9452369-9454369(-)
ATATTCAAACCAAATACAGATTCCATCCTTCTTCAATTCATGACAAGAAAGCAAGGCAAAATTAGTTGGTCATAATGCTTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTTACTACTATATATGAGGCACAACTGCATTGCAATGAAGAATAAACATGTAAGCATAACTGAAATATCTATCAGCGGGGACTTGTTTTGCATGCATCATTTTTTACCTCAAATATTGTATTATTAGATATTTATAAAATTAGAGATTACATATATAATATATTTGGCGAAGTAAAATTAAATTGTTGAATTATTTTTTACAATTACAATTTGGACCCAAATCAAGTTTAGAACATGCTTACTAAATGATGGGTCAAATTAACTTTATTTGTGATATAAAAATTTTATTTTTCTTTTACTTTATTACAAAAAGGAGACAAAACTCTAAGTTAAAAATGGTATTAAAATATTTTAGAATTTAGAAAAAGGGACAAATAGTTTTAAGAAAAGTTAAAATATTTCTGTGCTAGGAATTTTTCCCTACATTTTCGTATCTAATCAAGAATTTGTGTATTAGACTTGTCAAACTTGGCTTTTACTATTTTTTTATCCAGGTTTTTGTTATTATATTTTCAATTCCTAATTTCCTTATGTCCAAATTGAGTACCAATTTTTTTTGTTGCTGCAATGGTAAGAACACAATTTAAAGTTAAGTTAATTAGCCCTTGAAGAAAGAGTGTTGGAAAAATTAGTATCAGCTTGTTAAATACAATCTTTCGCTGGTAATGTATATATAGTTCTACAATGCCATTAAAATTTGCACGATGCACTCCATTCTATTGAAATAAAACCAAATACGAATGTCGCCACGTGTACATGAATGCAAAGGGCGAATTTCAGCGAGAGATTCCAAAACTGAGAGAAGCTTGGTGACAGAGAGAGTCTCTTATTGTAGATGAGAAAAGATGTGAAACAATCCTCAAAGAATAATGAAAGGATTCATATTATCCATAATAGTCATGATAAAAAATCATAAAATAACTAGTGATACCATATTAAAGAACACAAAAATAATTATTTGATTCATGCCAAATACAAAAGATATCTTGTGCTTCACCAAAAGAATAAAAAAAATCTTAAAAAATATGTATAAATATGTCTATAACAACTAACTAAATAAGGTAGTGGATATCTCTAATAATACTTTATATGCAACAACCATTTCTAAACATTCCTACGCGTGTTTGTGTGAGAGGCAACAACGCAGAAATGGTGGCCTTCAAGTATTCAAAGTCGACTCTTAAGTCAGCCAAAATAAAGTGATCAAAGCGTTCGCACCGTCCTTTTGACAAAACGTTGTGGAATTCTTTGAACCATCAAAACATAATAGTAGTACATGCATCCGAATCAACTTTTCATCAATATTCCATTCATGACAGTTAGTATTATGCAAACTCTTCATACTCTCAAACTTTTACTCTACACCCAGATTTTCCCAACCTATCTATTAAACCTAATTATAGATTTTTTTTTTAAATTTACTAAAACCGTAACTAACAAAATTAAGTTTTGTGAAATATAAAAAGAAATTGAAGTCATACTAATACAGACTATAATTACATTTTATCTTAATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGTGAATTACTATAATATCGTTTACTTAATATTACTTTTATTGTATTTATTATTATAATTTATTTCAAAATTTCACAATAACTAAAAAGTATAAGAAAGAAATATTTTAAATTTATTTAAACTAGTCTCTAAGTCAAGCAATGGCCTTCTGGAATTCAACACGGCTTATCGCAGTATAAAAATCAGCAGATAGCTAGCATGGTATTGAGTGAACATAATTTCGTGAACCTTGAGTTTCTCATAAATATACCTCTATTTCCAAACCATGCATTTTTTGGTTTACAACTTCCATCTTTTTATCTATGCTTTGCTTTTT


Gene Sequence:
>Vu_15567(-)
ATGGGCTCTGTTTTGCAGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAACCTGTCGCACTCAGATTCAAATCATATCTGTTCATTGATTGATGGTATAAGTTGCAATGATGCTAGAAGTGTAACCGGTATCACATATCTGTATACCAAGCGACGGATTCAATTAGCAACTCTAAACCTTTCCGCTTTCAAGAATTTAGAAACTCTTGAGGTCTGTTACTCTAGTCTAGAAGGGACTATCCCACCTGAAATTGGCAGTATTTCTAAACTAAGTCGTCTTCGTTTGTCTCACAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTTTCACATTAGAAAATCTTTTCAAACTCACTTATCTTGATTTATCTTATAATTATCTTCATGGTAAAATACCTACCACCATAGGAAGTCTTTCCAAACTCATTCATCTTGATTTATCCTTTAATTTTCTTTGGGGTGAAATATCTCACATAAAAAATATTTTCAAACTCACTCATCTTTATTTGTCCAATAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTTTCACAGTAGAAAATCTTCCTAATCTCACGTATGTTGATTTGTCCCACAATTACTTTCATGGAGAAATCCCTATTGCAACAGGAAATTTTTCCAAACTCATATATCTTGATTTATCTTTCAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTATCACCATAGGAAGTTTTTCCAAACTCACTCATCTTAAATTGTCTCACAATTCTATTTTTGGTGAGATACCTCCTACAATAGGATATCTTTCCAAACTCACTCATCTTGAATTGTCCCACAATTCTATTTTTGGTGAGATACCTCCTACAATAGGAAATCTTTCCAAACTCACTCATCTTGATTTGTCCCACAATTATATTCATGGAGAAATACCTCCTACAATGGGAAATCTTTCCAAACTCACTTATCTTGATTTGTTTGACAATTCTCTCCAAGGTGAAACACCACTCACAGTTGGAAATCTTTCCAAACTTACTTATCTTGATTTGTCATACAATTCTCTTCAAGGTAAAACACCTCTTATGGTAGGAAATCTGTCTAAACTCACTTATCTTAATTTATCCTACAATTCTCTTGAAGGTGAAATACCTTCAAGTGTAGGAAATCTTTCTACACTCACTTATCTTGATTTGTCCCACAATTCTCTTAATGGGAAGATGCCTCCTACCATAGGAAATCTTGTAAGACTTACTTTTCTTTATTTATCCCATAATTCTATTCATGGGGAAATACCTCCTACAATAGGAAATTTAACCCAATTAAGTAGCCTAATCATCTCTAACAACTACATTCAGGGGCCTATCCCTTTTGAATTGTCATTCCTGGTAAATCTCAATTTTGTAGATGTATCTTACAACAAAATCAATGGAACCTTGCCCATTTCCCTTTCAAACCTTAGGAACCTTCAACATCTTGATATTTCACACAATCAACTTGCTGGTTCTCTAAAACCCTTCACAGTTCAATATTTGTCACTCTTAAAAAGTTTGGATCTAAGCTTCAATAATTTTCAGGGTCCTATTCCAGATGGTTTACATCCATCTGTGCTAGTGGGGAACGAGGGAGTATGCAGCAACATTTCGGATATCCAAACCATTTACAAATTCAAACCTTGTTCAATCCAAGCCAAGAAACTAAAGCATAATCAGTTGGTCATAGCTATTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTTGCTGCTTCTACATTTGAGGAAAAATCAAATGGAAATCAAGAACAAACATGCAAGAATAACTGAAACACCTAAGAATGGAGACTATTTTTACATATGGAACTATGACGAACGAATAGCCTATGAAGACATCGTTGCAGTAACTGAAGACTTTGACCTCAACTATTGTATTGGAACAGGTGCCTACGGGAGTGTTTATAGGGCTCAACTTCCAAGTGGCAAGATTGTCGCGGTGAAAAAACTTCATGGTTTTGAAGCAAAGGTCCCCAAATTTGATGAAAGTTTCAGAAACGAAGCCAAAGTATTGTCGGAAATAAAGCATCGACATATCATCAAGCTTCATGGATTTTGCTTTCACAAAAGAGTCATGTTTTTGATTTATGAGTACATGGAGAAAGGAAGCTTGTCTTCTACCTTGTTTGATGACATGGAAGCAATTAACTTGGATTGGAGGAAGAGGGTTAACATAGTGAAAGGCACTGCACATGCTCTTTCATATCTCCATCATGATTGTGCCCCTCCTATAGTGCATAGAGACATATCAGCAAGCAACGTCTTGCTTAACTCTAAATGGGAGCCCACTGTTTCTGATTTTGGAACAGCCCGTTTTCTCAACCTTAATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGGTAAATTGTTCATATTTTTCTCTACTTCTATTTATTTATGATTTGGTGCAGATTAGGCCTAATCAAAATACATATAACAAGTAAATAGAGTAGTTTTTTACACTTGTATTTTCAATTATTTTTGTTTTGATCTTTTGATGTGATTTGTAAAAATGCAGAGCTTGCCTATACAATGGATGTTAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTTGGAGTGGTGGCGCTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTCAATCAAATTGTATTGATGATGCCATCAAATTAGGAGAAATATTGGACCAACGCCTCTCACCCCCATCATTTTCAATTTTGCAAGATATAGTTGCTGTTGCCATTGTGGCTTTTGTGTGCTTAAATCTCAACCCTTGCTCTCGCCCAACAATGAAATGTATCTCTCAATGTTTTCTCGGTCAGCTCACACCATTCAACATTCCTTTACGTGATATTTCATTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTTAGGCATTGTTTAAAATTATGA