Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15565 LG4 9438750 9441536 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 9438834 intron_variant
G/A 9438836 intron_variant
A/T 9438861 intron_variant
T/A 9439278 intron_variant
C/G 9439282 intron_variant
T/G 9439284 intron_variant
A/G 9439360 intron_variant
T/A 9439381 intron_variant
G/A 9439618 stop_gained p.Arg288*
G/T 9439696 missense_variant p.Gln262Lys
G/A 9439714 missense_variant p.Pro256Ser
G/A 9439811 synonymous_variant p.Phe223Phe
G/T 9439817 synonymous_variant p.Ala221Ala
T/C 9439938 missense_variant p.Glu181Gly
C/T 9439939 missense_variant p.Glu181Lys
A/G 9439947 missense_variant p.Leu178Pro
T/C 9439955 stop_lost p.Ter175Trpext*?
C/G 9439956 stop_lost p.Ter175Serext*?
A/C 9440020 missense_variant p.Ser154Ala
T/A 9440171 intron_variant
C/T 9440182 intron_variant
C/A,* 9440220 upstream_gene_variant
A/C,T 9440226 upstream_gene_variant
G/T,A 9440228 upstream_gene_variant
T/A,* 9440233 upstream_gene_variant
T/C,* 9440235 upstream_gene_variant
T/C,* 9440246 upstream_gene_variant
G/A 9440301 upstream_gene_variant
T/A 9440307 upstream_gene_variant
T/A 9440317 upstream_gene_variant
G/T 9440541 upstream_gene_variant
G/A 9440570 upstream_gene_variant
G/A 9440631 upstream_gene_variant
G/A 9440687 upstream_gene_variant
C/A 9440694 upstream_gene_variant
T/A 9440807 upstream_gene_variant
A/T 9440978 stop_gained p.Leu129*
T/C 9440985 missense_variant p.Ile127Val
A/C 9441426 upstream_gene_variant
A/C 9441466 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15565.1
MDAFKYSKLTLRLYKSSNAVTHACMHGVNGGAKGLSQYYKNEQIGSMLLVSNFHLLIYVFVFMGSVFELGCASTPSQLQLEASAVINSGWWNLSHSQSLHICSKIDGIHCNDAGSVTRITYKYSKQPIELATLNLPAFKNLEHLELSYILKVGHFPFLYGLDLSYNCLSGAIPMPLDSIYDMNLSFNNLSGPIPSGVNPYALIGNKDVCSNNTNIQIKYQFQPCSVNQKKRRQLVIILSITIFLIMAFLLLLYLGHSRIAIKNKHAKITETSKNGDMFCIWNYDGSIAYEDIITVTEDFDLKYCIGTGAYGSVYKAQLPSGKIVAVKKLHGFEAEVPTFDESFRNEAKLRSGGTGNFDGKTS*


CDS Sequence:
>Vu_15565.1
ATGGATGCATTCAAATATTCGAAGTTGACTCTTAGACTCTACAAGTCAAGCAATGCCGTCACACATGCCTGCATGCATGGCGTCAATGGCGGGGCAAAAGGCTTATCACAGTATTATAAGAATGAGCAGATAGGTAGCATGCTTTTGGTTTCCAATTTCCATCTTCTTATCTATGTTTTTGTTTTTATGGGCTCTGTTTTTGAGTTGGGATGCGCGTCTACACCTTCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAGCGCTGTAATCAATAGCGGATGGTGGAATCTGTCGCATTCACAGTCACTTCATATATGTTCAAAGATTGATGGTATACATTGCAATGATGCTGGAAGTGTAACTCGTATAACATATAAGTATTCCAAACAACCGATTGAATTAGCAACACTAAACCTCCCTGCTTTCAAGAATTTGGAACATCTTGAGCTCTCCTATATTCTAAAAGTTGGACATTTTCCATTCTTGTATGGTCTGGATCTAAGCTACAATTGTCTTTCCGGAGCGATTCCTATGCCTCTTGATAGTATCTATGACATGAACCTTTCCTTCAATAATTTGAGTGGTCCTATTCCAAGTGGTGTAAATCCATATGCGCTAATTGGGAACAAGGATGTATGCAGCAACAATACAAATATACAAATCAAATACCAATTTCAGCCTTGTTCAGTCAACCAGAAGAAACGAAGGCAGCTGGTCATAATTCTTTCCATCACCATATTTCTAATCATGGCCTTCTTACTACTTTTATATCTGGGGCACAGCCGCATTGCAATCAAGAACAAACATGCAAAGATAACTGAAACATCTAAGAATGGGGACATGTTCTGCATATGGAACTACGACGGAAGCATAGCCTACGAAGACATCATTACAGTAACTGAAGACTTTGATCTTAAATATTGTATCGGAACAGGTGCGTATGGAAGTGTCTACAAGGCTCAATTACCAAGTGGAAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAAGCAGAGGTCCCCACTTTTGATGAGAGTTTCAGAAACGAAGCCAAACTACGGAGTGGTGGCACTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_15565::LG4:9441536-9443536(-)
TACTTATTTTTTTGTTGTGGTTAATGAATAGAATTTGGATACGGATATTTTTAAACTACATTAGGAACAACAAAAAGTTAATAAAATAATAGCAAATCATCAAATAGCAAGAGACAAAAGTAAGTAATTATCAATAAATTAGAGACTATTTTATAAATTAAAAATTATTAATTTTTAAAATAATTTCTATTATTAATAAAATAATCATAATTAGTTTGTAAGTCAGAATTCAAATTAGTTTCTAACATTAGTTAAGAAGACTAATTATTCACAATAAGTGTTTGATATTTATTTTTGTTAGGATTTATTATTGATATGTGTGCTTTTAATGTGGGTTTGTAAGATTTTTGTTGTGGTTAATGGATAGAATTTGGATATGGGTATTTTGAGACTACATTAGGGACAAGAAATGAAGTTAATAAACGAATAACTTTTAAATTGACCGTATATAGATATAGATATAACTAATATTTAATTTTTTAAATTAGATACGGAACACAAACAAATATATTTATATTTGTTTTGTCCCTGTTCCTATACTCGTTCCATTATCTATCATTGTTCTTATGTCCATCTTCTTTTAAATTACTAAAAACACTTTTAATGTTTTAGATAATTAAAAAACTTGTATTAACTTAATCTTGGTTATTAATTTCGTAATTTATTTATAGAAAAAATAGATTTCATAATTTTTTACTCTTTTTTGTTATTATTTAATCTTTATTTAATTAGTTATTTGTTACTTTTATTTCATATTTATACAATTTTAATTTCTTTCTTAATATTTTATATTAGAGAGAAAGTTTGTATATTTTTGTATTGAATACTTGATAATTTATTTGATATATTTTTTATTTTTTGAAAAAATTATTTAGTTAATATTTTGAACAATAAAGAGACAGATAAGAATGGAAGTTTAACTATACCCGTTATTATAAAAATGAAACAAAAACTTTATGCCTAAAGATAAAGGTAATAGAGATTGAATTTTTATTTTGAAAATATAGATATTGAAACCTTCACGCCCTCCATTATCATCCCATACTCTATTTGAGCATGTATCATATTGGCTTATTTATAATAATTAAATTTTGTTTACATTAATTACATAACAAAATCGATTTTGTTTTATGTTTTACTTTTTATAACGGTGACATCTTGAGATATATATTGATTTAGAATTATATAATTTGCGATGTAGAAAGTATAATATATGGACAGAAGTAGAATTGTTATTTACAAACGGAGTCAAATACAAACTATTTATACAAGTATTAATGTATTAATATGTTGACAGAAATAGAATTGGTGTTTACAGAAGGTTTAGGATGTAATAGCTTTGTGAGAATATCCACTAATTGATACCACCAGAAACCAAAATTAATAAAGAGTAAAGAAAATAAAGAGAATAAAATGAAAATGATAAAATAAGAATGAAATTGAATAATTTGTTTTATTGGAATGGATGAATAATATAAGAAGAATAAGTGAAGACCCGAAAAATAAATATATAAATCTATCCGTAACATCCAATACCCGAAAAATAGATATTTATAGGATTAGAGATTACATATATAATATGTTTTTGGTGAATTAAAATTAAATTGTTAACTATTTTCTACAATTAGAATTTGGACTCAAATCAAGTTTAGAATATGCTTAGTTAATGATGGGTCAAATTAAGTTTATTTGTGATATAAAATTTTATTTTTCTTTTACTTTATTACAAAGAGACAAAACTCTAAAATAAAAATGATATTAAAACATTTCGAAACATTTTTTAGTGTAATAATGGCTAACAGAGAGTCTCCTGTATAAATAAAAAAAATTACCAAAAAAATAAAACAAATATTAAAAAGTGTGTATAAAAGTATCTGTAATACTAAGAACTAAATGAATAAAGCAGTGGATATCTCTAATAATAGTTTATGTGCGACAACCATTTATAAACATTCCTATCCGTGGAACGTGTTTGGGTGAGCAAAGGCAACAACGCAGAA


Gene Sequence:
>Vu_15565(-)
ATGGATGCATTCAAATATTCGAAGTTGACTCTTAGGTCTGCAAAATAACGTAACTAAAGCGTTGGTACCGTCAATGGGGTAAAACGTTGTGGAATTGTTTGCACTAATGGTTCCGTATTAGACTCTACAAGTCAAGCAATGCCGTCACACATGCCTGCATGCATGGCGTCAATGGCGGGGCAAAAGGCTTATCACAGTATTATAAGAATGAGCAGATAGGTAGCATGGTATTGAGTGAACATAATTTAGTGAAACTTGAGTTTCTCATAAATATACCTTCTATTTATTACCTCTATTTCCAAACCATGCAGCTTTTGGTTTCCAATTTCCATCTTCTTATCTATGTTTTTGTTTTTATGGGCTCTGTTTTTGAGTTGGGATGCGCGTCTACACCTTCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAGCGCTGTAATCAATAGCGGATGGTGGAATCTGTCGCATTCACAGTCACTTCATATATGTTCAAAGATTGATGGTATACATTGCAATGATGCTGGAAGTGTAACTCGTATAACATATAAGTATTCCAAACAACCGATTGAATTAGCAACACTAAACCTCCCTGCTTTCAAGAATTTGGAACATCTTGAGCTCTCCTATATTCTAAAAGGTACTATTCCATCTGAAATTGGAAATATGTCAAATCTCCGTCATCTAGATTTCTCTTACAATTTTCTTCAAGGTGAAATACCTCTTACAATAGGAAATCTTTCAAAACTCACTTTTCTTAATTTATCCTTCAATTATCTTCAAAGTCAAATACCTCCATCGGTAAAAAATCTTCTAAAACTTACTTATTTTGATTTAGCCTTCAATTCACTTCAAGGGGAAATACCTCTATCAATAAAAAATCTTTCAAACCTCACTTATCTTAATTTAATGGGGAATTCTCTTGAAGGTGAAATACTTCCATCAATAGGACATCTTTCAAAACTCAATTATCTTAATTTAGCCCGGAATTCTCTTCAAGGTCAAACACCTCTTACAATAAGAAATCTTTCAAAACTCACTTATCTTGATTTATCCCACAATTCTCTTCAAGGTCAAATACCTTTATCACTAGGAAATCTTTCAAAACTCACTTATCTTTATTTATCCCACAATTATCTTCAAGATAAAATACCTCCAACAATAGGAAATATTTCCCAACTCACTTACATTGATTTATCTTACAATTATCTTCAAAGAGAAATACCTCCATTAGGACATCTTTCCAATCTCCATCATCTTGATTTATCCCACAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTCCATCACTAGAAAATCTTTCAAAACTCACTTATCTTGATTTATCCCACAATTCTCTTCAAGGTCAAATACCTTCGTCACTAGGATATCTAACCAATCTATTGACCCTAATAATCTCTAACAACAAAATCAATGGAACCTTTCCCATTTCACTTTCAAACATCATGCACCTTCAAAATATTGACATTTCACACAATCTACTAACTGGTTCCCTCGAACCTTTCTTAGTTGGACATTTTCCATTCTTGTATGGTCTGGATCTAAGCTACAATTGTCTTTCCGGAGCGATTCCTATGCCTCTTGATAGTATCTATGACATGAACCTTTCCTTCAATAATTTGAGTGGTCCTATTCCAAGTGGTGTAAATCCATATGCGCTAATTGGGAACAAGGATGTATGCAGCAACAATACAAATATACAAATCAAATACCAATTTCAGCCTTGTTCAGTCAACCAGAAGAAACGAAGGCAGCTGGTCATAATTCTTTCCATCACCATATTTCTAATCATGGCCTTCTTACTACTTTTATATCTGGGGCACAGCCGCATTGCAATCAAGAACAAACATGCAAAGATAACTGAAACATCTAAGAATGGGGACATGTTCTGCATATGGAACTACGACGGAAGCATAGCCTACGAAGACATCATTACAGTAACTGAAGACTTTGATCTTAAATATTGTATCGGAACAGGTGCGTATGGAAGTGTCTACAAGGCTCAATTACCAAGTGGAAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAAGCAGAGGTCCCCACTTTTGATGAGAGTTTCAGAAACGAAGCCAAAGTATTATCGGAAATAAAGCACCGACATATAGTCAAGCTCCATGGATTCTGCTTGCACAAAAGAATAATGTTTTTGATTTATGAGTACATGGAGAAAGGAAGCTTGCTTTCTGTGTTGCGTTATGACATGGAAGCAATAGAATTTGACTGGAAAAAGAGGGTTAACACAGTGAAAGGAACTGCACATGCTCTCTCATATCTCCATCATGATTGTGTCCCTCCAATAGTGCATAGAGACATATCAGCAAGCAACGTCTTGCTTAACTCCAAGTGGGAGCCCATTGTTTCCGACTTTGGCACTGCCCGATTTCTAAACTTTGATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGGTAAATTGTTTATATGTTCCTCTACTTCTATTTATTTATTGTTTGATGCATATCAAGCCTAATAGCACCTGGTAAATTGTTTATATGTTCCTCTACTTTTATTTATTTATTGTTTGATGCATATCAAGCATAATCAAGATCCATATAACAAACAAATGGAGTAGTTTTCTGCACTTGTATTTTCAATTATTTTTCTTCTGATCTTTCAATGCTATGTTGCAAAAATGCAGAGCTCGCGTATACAATGGTTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTACGGAGTGGTGGCACTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAA