Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15564 LG4 9427138 9430211 putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g08850
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 9427564 intron_variant
A/T 9427687 missense_variant p.Tyr267Asn
C/T 9428035 intron_variant
T/C 9428271 missense_variant p.Lys164Arg
G/A 9429306 intron_variant
A/T 9429320 intron_variant
T/C 9429374 intron_variant
G/A 9429404 intron_variant
G/A 9429466 intron_variant
T/C 9429514 intron_variant
C/G 9429517 intron_variant
G/T 9429666 intron_variant
G/T 9429772 intron_variant
A/T 9429776 intron_variant
A/T 9429779 intron_variant
A/C 9429783 intron_variant
G/A 9430092 intron_variant
A/T 9430140 intron_variant
A/T 9430175 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15564.1
MLGCASSTPSQLQLEANAIINSGWWNLSHSDSNHICSLIDGISCNDARSVTGITYLYTKRRIQLATLNLSAFKNLETLEGPIPDGLHPSVLVGNEGVCSNISDIQTIYKFKPCSIQAKKLKHNQLVIAIFITIFLIMTFSLLLHLRKNQMEIKNKHARITETPKNGDYFCIWNHDERIAYEDIVAVTEDFDLNYCIGTGAYGSVYRAQLPSGKIVAVKKLHGFEAKVPKFDESFRNEAKPTVSDFGTARFLNLNSSNRTIVAGTIGYIAPELAYTMDVNEKCDVYSFGVVALETLMGKHPKEILSSLQSNCIDDAIKLGEILDQRLSPPSFSILQDIVAVAIVAFVCLNLNSCSRPTMKCISQCFLGQLTPFNIPLRDISLQQLMSQELRHCLKL*


CDS Sequence:
>Vu_15564.1
ATGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAATCTGTCGCACTCGGATTCAAATCATATCTGTTCATTGATTGATGGTATAAGTTGCAATGATGCTAGAAGTGTAACCGGTATCACATATCTGTATACCAAGCGACGGATTCAATTAGCAACTCTAAACCTTTCCGCTTTCAAGAATTTAGAAACTCTTGAGGGTCCTATTCCAGATGGTTTACATCCATCTGTGCTAGTGGGGAACGAGGGTGTATGCAGCAACATTTCGGATATCCAAACCATTTACAAATTCAAACCTTGTTCAATCCAAGCCAAGAAACTAAAGCATAATCAGTTGGTCATAGCTATTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTCGCTGCTTCTACATTTGAGGAAAAATCAAATGGAAATCAAGAACAAACATGCAAGAATAACTGAAACACCTAAGAATGGAGACTATTTTTGCATATGGAACCATGACGAACGCATAGCCTATGAAGACATCGTTGCAGTAACTGAAGACTTTGACCTCAACTATTGTATTGGAACAGGTGCCTACGGGAGTGTTTATAGGGCTCAACTTCCAAGTGGCAAGATTGTCGCGGTGAAAAAACTTCATGGCTTTGAAGCAAAGGTCCCCAAATTTGATGAAAGTTTCAGAAACGAAGCCAAACCCACTGTTTCTGATTTTGGAACAGCCCGATTTCTCAACCTTAATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGAGCTTGCCTATACAATGGATGTTAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTTGGAGTGGTGGCGCTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTCAATCAAATTGTATTGATGATGCCATCAAATTAGGAGAAATATTGGACCAACGCCTCTCACCCCCATCATTTTCAATTTTGCAAGATATAGTTGCTGTTGCCATTGTGGCTTTTGTGTGCTTAAATCTCAACTCTTGCTCTCGCCCAACAATGAAATGTATCTCTCAATGTTTTCTCGGTCAGCTCACACCATTCAACATTCCTTTACGTGATATTTCATTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTTAGGCATTGTTTAAAATTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_15564::LG4:9430211-9432211(-)
ATCTCCATATAACAATTAACTAAAATATCTCCAATAAAGACGTTATTGGTGACAATGATTTCTAAACATTCCTATCCATGGAACGTTTGATAGAGCAAACCCAGCAACGTAGAAATGGTTGCATTAAAATCTCCAAAGTTGACTTTGAAGTCAAGCAATAATAATAGGACAAATGCGTTTGCACCGTCAATGGGGCAAGACACTCGAATTCTTTGCACAAACAATAATTACATGCGTACAAATCATTATGTCGTAAATATTCCACTCTTGATTTTTAGTAGATTCAAACATTTTAAAATTCTATATATATATATATATATATATATATATATATGATTTCTCAGTTGGATATATCTGCCATTCTTGAAAAGTTTGGATCTAAGCTACAATAATCTTATTGGAGCAATTCCTCTACCTCTTCTTAGTATCTATTATGTGGACCTTTCCTTCAACAATTTGAATACAACAACATTTCATATATTCAAACCAAATACAGATTCCAGCCTTCTTGAATTCATGACAAGAAAGCAAGGCAAAATTAGTTGGTCATAATGCTTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTTACTACTATATATGAGGCACAACTGCATTGCAATGAAGAATAAACATGTAAGCATAACTGAAATATCTAACAGCGGGGACTTGTTTTGCATGCATCATTTTTTACCTCAAATATTGTATTATTAGATATTTATAAAATTAGAGATTACATATATAATATATTTGGTGAAGTAAAATTAAATTGTTGAATTATTTTTTACAATTACAATTTGGACCCAAATCAAGTTTAGAATATGCTTACTAAATGATGGGTCAAATTAACTTTATTTGTGATATAAAAATTTAAATATAATCTTTCGCTGGTAATGTATATAGTTCTACAATGTCATTAGAATTTGAACGATGCACTCCATTCTATTGAAATCAAACCAAATACGAATGTCGCTACAGGTACATGAATGCAAAGGGCGAATTTCAGCGAGAGATTCCAAAACCCAGCGAAGCTTGGTGCAATAATGGCAACACAGAGACAGTCTCTTATTGTAGATTTGCAAGATGATGGATGAGAAAAGATGTGAAACAATCCTCAAAGAATAATGAAAGGATTCATATTATCCATAATAGTCATGATAAAAAAATCATAAAATAACTAGTGATACCATATTAAAGAACACAAAAATAATTATTCAATTGATGCAAAATACAAAAGATATCTTGTGCTTCACCAAAAGAATAAAAAAAATATTAAAAAATATGTATAAATATGTCTATAAAAACTAAATAAGGTAGTGGATATCTCTAATAATACTTTATATGCAACAACCATTTCTAAACATTCCTACGCGTGTTTGTGTGAGAGGCAACAACGCAGAAATGGTAGCCTTCAAATATTCAAAGTCGACTCTTAAGTCAGCCAAAATAAAGTGATCAAAGCGTTCGCACCGTCCTTTTGACAAAACATTGTGGAATTCTTTGAACCATCAAAACATAATAGTAGTACATGCATCCGAATCAACTTTTCATCAATATTCCATTCATGACAGTTAGTATTATACAAACTCTTCATACTCTCAAACTTTTACTCTACACCCAGATTTTCCCAACCTATCTATTAAACCTATTTATAGATTTTTTTTTTAAATTTACTAAAACCGTAACTAACAAATAAGTTTTGTGAAATATAAAAAGAAATTGAAGTCATACTAATACAGACTATAATTACATTTTATCTTAATTAGTATATATATATACAGTGAATTACTATAATATCGTTTACTTAATATTACTTTTATTGTATTTATTATTATAATTTATTTCAAAATTTCACAATAACTAAAAAGTATAAGAAAGAAATATTTTAAATTTATTTAAACTAGTCTCTAAGTCAAGCAATGATGGCCTTCTGGAATTCTACGTTTGGGCTCTTCTACTCAACACGGCTTATCGCAGTATAAAAATCAGCAGATAGCTAGC


Gene Sequence:
>Vu_15564(-)
ATGGTATTGAGTGAACATAATTTCGTGAACCTTGAGTTTCTCATAAATATACCTCTATTTCCAAACCATGCTTTTTTTGGTTTACAACTTCCATCTTTTTATTTATGCTTTGCTTTTTACGGGCTCTGTTTTGCAGTTGGGATGCGCGTCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAATCTGTCGCACTCGGATTCAAATCATATCTGTTCATTGATTGATGGTATAAGTTGCAATGATGCTAGAAGTGTAACCGGTATCACATATCTGTATACCAAGCGACGGATTCAATTAGCAACTCTAAACCTTTCCGCTTTCAAGAATTTAGAAACTCTTGAGGTCTGTTACTCTAGTCTAGAAGGGACTATCCCACCTGAAATTGGCAGTATTTCTAAACTAAGTCGTCTTCGTTTGTCTCACAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTTTCACATTAGAAAATCTTTTCAACCTCACTTATCTTGATTTATCTTATAATTATCTTCACGGTAAAATACCTACCACGATAGGAAGTCTTTCCAAACTCATTCATCTTGATTTATCCTTTAATTTTCTTTCGGGTGAAATATCTCACATAAAAAATATTTTCGAACTCACTCATCTTTATTTGTCCAATAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTTTCACAGTAAAAAATCTTCCCAATCTCACGTATGTTGATTTGTCCCACAATTACTTTCATGGGGAAATCCCTATTGCAACAGGAAATTTTTCCAAACTCATATATCTTGATTTATCTTTCAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTATCACAATGGGAAGTTTTTCCAAACTCACTCATCTTAAATTGTCTCACAATTCTATTTTTGGTGAGATACCTCCTACAATAGGATATCTTTCCAAACTCACTCATCTTGAATTGTCCCACAATTCTATTTTTGGTGAGATACCTCCTACAATAGGAAATCTTTCCAAACTCACTTATCTTGATTTGTCCCACAATTATATTCATGGAGAAATACCTCCTACAATGGGAAATCTTTCCAAACTCACTTATCTTGATCTGTTCGACAATTCTCTCCAAGGTGAAACACCACTCACAGTTGGAAGTCTTTCCAAACTTACTTATCTTGATTTGTCATACAATTCTCTTCAAGGTGAAACACCTCTTATGGTAGGAAATCTGTCTGAACTCACTTATCTTAATTTATCCTACAATTCTCTTGAAGGTGAAATACCTTCAAGTGTAGGAAATCTTTCTACACTCACTTATCTTGATTTGTCCCACAATTCTCTTAATGGGAAGATGCCTCCTACCATAGGAAATCTTGTAGGACTCACTTTTCTTTATTTATCCCATAATTCTATTCATGGGGAAATACCTCCTACAATAGGAAATTTAACCCAATTAAGTCGCCTAATCATCTCTAACAACTACATTCAGGGGCCTATCCCTTTTGAATTGTCATTCCTGGTAAATCTCAATTTTGTAGATGTATCTTACAACAAAATCAATGGAACCTTGCCCATTTCCCTTTCAAACCTTAGGAACCTTCAACATCTTGATATTTCACACAATCAACTTGCTGGTTCTCTAAAACCCTTCACAGTTCAATATTTGTCACTCTTAAAAAGTTTGGATCTAAGCTTCAATAATTTTCAGGGTCCTATTCCAGATGGTTTACATCCATCTGTGCTAGTGGGGAACGAGGGTGTATGCAGCAACATTTCGGATATCCAAACCATTTACAAATTCAAACCTTGTTCAATCCAAGCCAAGAAACTAAAGCATAATCAGTTGGTCATAGCTATTTTTATCACCATTTTTCTAATAATGACCTTCTCGCTGCTTCTACATTTGAGGAAAAATCAAATGGAAATCAAGAACAAACATGCAAGAATAACTGAAACACCTAAGAATGGAGACTATTTTTGCATATGGAACCATGACGAACGCATAGCCTATGAAGACATCGTTGCAGTAACTGAAGACTTTGACCTCAACTATTGTATTGGAACAGGTGCCTACGGGAGTGTTTATAGGGCTCAACTTCCAAGTGGCAAGATTGTCGCGGTGAAAAAACTTCATGGCTTTGAAGCAAAGGTCCCCAAATTTGATGAAAGTTTCAGAAACGAAGCCAAAGTATTATCGGAAATAAAGCATCGACATATCATCAAGCTTCATGGATTTTGCTTTCACAAAAGAGTCATGTTTTTGATTTATGAGTACATGGAGAAAGGAAGCTTGTCTTCTACCTTGTTTGATGACATGGAAGCAATTAACTTGGATTGGAGGAAGAGGGTTAACATAGTGAAAGGCACTGCACATGCTCTTTCATATCTCCATCATGATTGTGCCCCTCCTATAGTGCATAGAGACATATCAGCAAGCAACGTCTTGCTTAACTCTAAATGGGAGCCCACTGTTTCTGATTTTGGAACAGCCCGATTTCTCAACCTTAATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGGTAAATTGTTCATATTTTTCTCTACTTCTATTTATTTATGATTTGGTGCAGATTAGGCCTAATCAAAATACATATATAACAAGTAAATAGAGTAGTTTTTTACACTTGTATTTTCAATTATTTTTGTTTTGATCTTTTGATGTGATTTGTAAAAATGCAGAGCTTGCCTATACAATGGATGTTAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTTGGAGTGGTGGCGCTGGAAACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTCATCACTTCAATCAAATTGTATTGATGATGCCATCAAATTAGGAGAAATATTGGACCAACGCCTCTCACCCCCATCATTTTCAATTTTGCAAGATATAGTTGCTGTTGCCATTGTGGCTTTTGTGTGCTTAAATCTCAACTCTTGCTCTCGCCCAACAATGAAATGTATCTCTCAATGTTTTCTCGGTCAGCTCACACCATTCAACATTCCTTTACGTGATATTTCATTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTTAGGCATTGTTTAAAATTATGA