Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15563 LG4 9411891 9414347 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 9411981 stop_lost p.Ter396Glnext*?
G/A 9412025 missense_variant p.Pro381Leu
T/G 9412041 missense_variant p.Met376Leu
G/A 9412101 missense_variant p.Pro356Ser
T/A 9412161 missense_variant p.Thr336Ser
G/T 9412162 synonymous_variant p.Ile335Ile
G/T 9412180 synonymous_variant p.Ser329Ser
A/T 9412288 intron_variant
G/C 9412327 intron_variant
G/C 9412337 intron_variant
G/A 9412420 splice_region_variant&intron_variant
A/G 9412716 intron_variant
T/C 9412964 missense_variant p.His241Arg
G/A 9412974 stop_gained p.Arg238*
C/A 9413017 missense_variant p.Trp223Cys
T/A 9413046 missense_variant p.Ser214Cys
T/A 9413060 missense_variant p.Asn209Ile
G/T 9413062 stop_gained p.Cys208*
C/G 9413068 synonymous_variant p.Pro206Pro
T/A 9413108 missense_variant p.Asn193Ile
T/C 9413176 synonymous_variant p.Ser170Ser
T/C 9413185 missense_variant p.Ile167Met
C/G 9413312 stop_lost p.Ter125Serext*?
G/A 9413335 synonymous_variant p.Phe117Phe
A/G 9413654 intron_variant
G/T 9413656 intron_variant
T/G 9413657 intron_variant
T/A 9413661 intron_variant
T/C 9413707 intron_variant
G/A 9413712 intron_variant
G/T 9414095 intron_variant
A/T 9414111 intron_variant
A/G 9414116 intron_variant
A/T 9414166 intron_variant
C/T 9414167 intron_variant
C/T 9414272 missense_variant p.Val26Ile
C/G 9414336 missense_variant p.Leu4Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15563.1
MDALKYSKLTLRSAKRCGIVCTNGSVLDSTSQAMPSHMHGVNGGAKGLSQYYKNEQIGSVLELESASSTPSQLQLEANAIINSGWWNLSHSDSNHICSWIVGHFPFLYGLDLSYNCLSGAIPMPLDSIYDMNLSFNNLSGPIPSGVNPYALIGNKDVCSTNTNIQMEYQFQPCSVNQKKRRQLVIILSITIFLIMAFLLLLYLRYSRIAIKKKQAKITETSKNGDMFCIWNYDGSIAYEDIITVTEDFDLKYCIGTGAYGSVYKAQLPSGKIVAVKKLHGFESEVPTFDEIAGTIGYIAPELAYTMVVNEKCDVYSFGVVALETLMGKHPKEILLSLQSTSTHDDIKLCEILDQRLPHPTFSILQDIVVVAIVTLACLNPNPCSRPTMKHISQCFLSQFTPLSIPLHHISLQQLMSQELRHSLKL*


CDS Sequence:
>Vu_15563.1
ATGGATGCATTGAAATATTCGAAGTTGACTCTTAGGTCTGCAAAACGTTGTGGAATTGTTTGCACTAATGGGTCCGTATTAGACTCTACAAGTCAAGCAATGCCGTCACACATGCATGGCGTCAATGGCGGGGCAAAAGGCTTATCACAGTATTATAAGAATGAGCAGATAGGCTCTGTTTTAGAATTGGAATCCGCATCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAATTTGTCGCACTCAGATTCAAATCATATCTGTTCATGGATTGTTGGACATTTTCCATTCTTGTATGGTCTGGATCTAAGCTACAATTGTCTTTCCGGAGCGATTCCTATGCCTCTTGATAGTATCTATGACATGAACCTTTCCTTCAATAATTTGAGTGGTCCTATTCCAAGTGGTGTAAATCCATATGCGCTAATTGGGAACAAGGATGTATGCAGCACCAATACAAATATACAAATGGAATACCAATTTCAGCCTTGTTCAGTCAACCAGAAGAAACGAAGGCAGCTGGTCATAATTCTTTCCATCACCATATTTCTAATCATGGCCTTCTTACTACTTTTATATCTGAGGTACAGCCGCATTGCAATCAAGAAAAAACAAGCAAAGATAACTGAAACATCTAAGAATGGGGACATGTTCTGCATATGGAACTACGACGGAAGCATAGCCTACGAAGACATCATTACAGTAACTGAAGACTTTGATCTTAAATATTGTATCGGAACAGGTGCGTATGGAAGTGTCTACAAGGCTCAATTACCAAGTGGAAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAATCAGAGGTCCCCACTTTTGATGAGATTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGAGCTTGCGTATACAATGGTTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTCGGAGTGGTGGCATTGGAGACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTTATCACTTCAATCAACTTCTACTCACGATGACATCAAATTATGTGAAATATTGGATCAACGCCTCCCACACCCAACATTTTCAATTTTACAAGACATAGTTGTTGTTGCCATTGTGACTCTTGCATGCTTAAATCCCAACCCTTGCTCTCGTCCAACAATGAAACACATCTCTCAATGTTTCCTTAGTCAGTTCACACCACTAAGCATTCCTTTACATCATATTTCGTTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTCAGACACTCCTTGAAATTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_15563::LG4:9414347-9416347(-)
GAGGTGGGTTTGTATTTATTTTTTTGTTGTGGTTAATGAATAGAATTTGGATACGGATATTTTTAAACTACATTAGGAACAACAAAAGGTTAATAAAATAATAGCAAATAATCAAATAGCAAGAGACAAAAGTAAGTAATTATCAATAAATTAGAGACTATTTTATAAATTAAAAATTATTAATTTTTAAAATAATTTCTATTATTAATAAAATAATCATAATTAGTTTGTAAATCAGAATTCAAATTAGTTTCTAACATTAGTTAAGAAGACTAATTATTCACAATAAGTGTTTGATATTTATTTTTGTTAGGATTTATTATTGATATGTGTGCTTTTAATGTGGGTTTGTGAGATTTTTGTTGTGGTTAATGGATAGAATTTGGATATGGGTATTTTGAGACTACATTAGGGACAAGAAATGAAGTTAATAAACGAATAACTTTTAAATTGACCGTATATAGATATAGATATAACTAATATTTAATTTTTTAAATTAGATACGGAACACAAACAAATATATTTATATTTGTCTTGTCTCTTTTCCTATACTCGTTACATTATCTATCATTGTTCTTATGTCCATCTTCTTTTAAATTACTAAAAACACTTTTAATGTTTTAGATAATTAAAAAACTTGTATTAACTTAATCTTGGTTATTAATTTCGTAATTTATTTATAGAAAAAATAGATTTCATAATTTTTTACTCTTTTATGTTATTATTTAATCTTTATTTAATTAGTTATTTGTTACTTTTATTTCGTATTTATACAATTTTAATTTCTTTCTTAATATTTTATATTACAGAGAAAGTTTGTATATTTTTGTATTGAATACTTGATAATTTATTTGATATATTTTTTATTTTTTGAAAAAATTATTTAGTTAATATTTTGAACAATAAAGAGACAGATAAGAATGGAAGTTTAACTATGCCCGTTATTATAAAAATGAAACAAAAACTTTATGCCTAAATATAAAGGTAATAGAGATTGAATTTTTATTTTGAAAATATAGATATTGAAACCTGCACGCCCTCCAATATCATCCCATACTCTATTTGAGCATGTATCATATTGGCTTATTTATAATAATTAAATTTTGTTTACATTAATTACATAACAAAATCGATTTTGTTTTATGTTTTACTTTTTATAACGGTGAGATATATATTGATTTAGAATTATATAATTTGCGATGTAGAAAGTATAATATATGGACAGAAGTAGAATTGTTATTTACAAACGGAGTCAAATACAAACTATTTATACAAGTATTAATGTATTAATATGTTGACAGAAATAGAATTGGTGTTTACCGAAGGTTTAGGATGTAATAGCTTTGTGAGAATATCCACTAATTGATACCACCAGAAACCAAAATTAATAAAGAGTAAAGAAAATAAAGAGAATAAAATGAAAATGATAAAATAAGAATGAAGTTGAATAATTTGTTTTATTGGAATGGATGAATAATATAAGAAAAATAAGTGAAGACCCGAAAAATAAATATATAAATCTATCCGTAACATCCAATACCCGAAAAATAGATATTTATAAGATTAGAGATTACATATATAATATGTTTTTGGTGAATTAAAATTAAATTGTTAACTATTTTCTACAATTAGAATTTGGACTCAAATCAAGTTTAGAATATGCTTAGTTAATGATGGGTCAAATTAAGTTTATTTGTGACATAAAATTTTATTTTTCTTTTACTTTATTACAAAGAGACAAAACTCTAAAATAAAAATGATATTAAAACATTTCGAAACATTTTTTAGTGTAATAATGGCTAACAGAGAGTCTCCTGTATAAATAAAAAAAAATTACCAAAAAAGTAAAACAAATATTAAAAAGTGTGTATAAAAGTATCTACTCAGAACTAAACGAATAAAGCAGTGGATATCTCTGGTAATAGTTTATGTGCGACAACCATTTATAAACAATCCTATCCGTGGAACGTGTTCGGGTGAGCAAAGGCAACAACGCAGAA


Gene Sequence:
>Vu_15563(-)
ATGGATGCATTGAAATATTCGAAGTTGACTCTTAGGTCTGCAAAACGTTGTGGAATTGTTTGCACTAATGGGTCCGTATTAGACTCTACAAGTCAAGCAATGCCGTCACACATGCATGGCGTCAATGGCGGGGCAAAAGGCTTATCACAGTATTATAAGAATGAGCAGATAGGTAGCATGGTATTGAGTGAACATAATTTAGTGAAACTTGAGTTTCTCATAAATATACCTTCTATTTATTACCTCTATTTCCAAACCATGCATTTTTTGCTTTACAATTTCCATCTTTTTATTTATGCTTTGCTTTTCATAGGCTCTGTTTTAGAATTGGAATCCGCATCGTCTACACCATCGCAGCTTCAGTTGGAAGCAAACGCTATAATCAATAGTGGATGGTGGAATTTGTCGCACTCAGATTCAAATCATATCTGTTCATGGATTGGTATACATTGCAATGATGCTGGAAGTGTAACTCGTATCACATATATGTATCATGAAGGGCCTATTCAATTGGCAACACTAAACCTCTCTGCTTTCAAGAACTTGGAACATCTTGAGGTCGTCGAATCTAGTCTAAACGGGACTATTCCATATGAAATTGGAAATCTTTCAAAACTCACTTATCTTGATTTATCCCACAATTCTTTTCAAGATAAAATACCTCCATCACTAGGAAATCTTTCAAAACTCACTTATCTTGATTTATCCCACAATTCTCTTCAAGGTAAAATACCTCCATCACTAGGAAATCTTTCAGAACTCACTGATCTTGATTTATCCCACAATTCTCTTCAAGGTCAAATACCTTCATCACTAGGATTTCTAACCAATCTATTGACCCTAATAATCTCTAACAACAAAATCAATGGAACCTTTCCCATTTCACTTTCAAACATCATGCACCTTCAAAATATTGACATTTCACACAATCTACTAACCGGTTCCCTTGAACCTTTCTTAGTTGGACATTTTCCATTCTTGTATGGTCTGGATCTAAGCTACAATTGTCTTTCCGGAGCGATTCCTATGCCTCTTGATAGTATCTATGACATGAACCTTTCCTTCAATAATTTGAGTGGTCCTATTCCAAGTGGTGTAAATCCATATGCGCTAATTGGGAACAAGGATGTATGCAGCACCAATACAAATATACAAATGGAATACCAATTTCAGCCTTGTTCAGTCAACCAGAAGAAACGAAGGCAGCTGGTCATAATTCTTTCCATCACCATATTTCTAATCATGGCCTTCTTACTACTTTTATATCTGAGGTACAGCCGCATTGCAATCAAGAAAAAACAAGCAAAGATAACTGAAACATCTAAGAATGGGGACATGTTCTGCATATGGAACTACGACGGAAGCATAGCCTACGAAGACATCATTACAGTAACTGAAGACTTTGATCTTAAATATTGTATCGGAACAGGTGCGTATGGAAGTGTCTACAAGGCTCAATTACCAAGTGGAAAGATTGTTGCGGTGAAGAAACTCCATGGCTTTGAATCAGAGGTCCCCACTTTTGATGAGAGTTTCAGAAACGAAGCCAAAGTATTATCGGAAATAAAGCACCGACATATAGTCAAGCTCCATGGATTCTGCTTGCACAAAAGAATAATGTTTTTGATTTATGAGTACATGGAGAAAGGAAGCTTGCTTTCTGTGTTGCTTTATGACATGGAAGCAATAGAATTTGACTGGAAAAAGAGGGTTAACACAGTGAAAGGAACTGCACATGCTCTCTCATATCTCCATCATGATTGTGTCCCTCCAATAGTGCATAGAGACATATCAGCAAGCAACGTCTTGCTTAACTCCAAGTGGGAGCCCATTGTTTCCGACTTTGGCACTGCCCGATTTCTAAACTTTGATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACCATTGGATACATAGCACCTGGTAAATCGTTTATATGTTCCTCTACTTCTATTTATTTATTGTTTGATGCATATCAAGCCTAATCAAGATCCATATAACAAACAAATGGACTAGTTTTCTCCACTTGTATTTTCAATTATTTTTCTTCTGATCTTTCAATGCTATGTTGCAAAAATGCAGAGCTTGCGTATACAATGGTTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGCTTCGGAGTGGTGGCATTGGAGACTTTGATGGGAAAACATCCTAAGGAAATACTCTTATCACTTCAATCAACTTCTACTCACGATGACATCAAATTATGTGAAATATTGGATCAACGCCTCCCACACCCAACATTTTCAATTTTACAAGACATAGTTGTTGTTGCCATTGTGACTCTTGCATGCTTAAATCCCAACCCTTGCTCTCGTCCAACAATGAAACACATCTCTCAATGTTTCCTTAGTCAGTTCACACCACTAAGCATTCCTTTACATCATATTTCGTTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTCAGACACTCCTTGAAATTGTGA