Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15448 LG4 8063912 8067444 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 33
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 8064027 missense_variant p.Glu653Asp
C/A 8064555 intron_variant
T/C 8064768 synonymous_variant p.Ser473Ser
T/G 8064889 intron_variant
C/T 8064961 intron_variant
G/A 8064984 intron_variant
A/G 8064989 intron_variant
C/T 8065100 intron_variant
G/T 8065436 missense_variant p.Leu410Ile
A/G 8066229 synonymous_variant p.Gly174Gly
C/A 8066405 missense_variant p.Gly116Trp
T/A 8066772 intron_variant
A/C 8066778 intron_variant
G/T 8066853 missense_variant p.Leu103Met
T/G 8066873 missense_variant p.Asn96Thr
G/A 8066897 missense_variant p.Thr88Met
G/C 8066918 missense_variant&splice_region_variant p.Ala81Gly
G/T 8066923 splice_region_variant&intron_variant
T/C 8066968 intron_variant
G/T 8066999 intron_variant
A/G 8067041 intron_variant
C/T 8067180 intron_variant
A/G 8067185 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15448.1
MGENDDHNNHCNEETESKDAKRSLAERRGFNSNAAKINTALFCSDTTTNPSPSPATHLTIPPGISPTALLDSPIMLPNSQATPSSPTTGSFFVMSNLLPYSALNQVSSNFHSVKGGNRESQLPPQVQSPLDFSFPADFSKGHSVKNSEVNSYNDMKMVNDKIVNGNNVEKPISGSEEVSDESAVPKNGINSEDIVGQPASEGELKEASHATGVVRTSEDGYNWRKYGQKQVKGSEYPRSYYKCTQPNCLVKKKVERSHDGQITEIIYKGNHNHVKPHSSHRGSALSTDEVSDMAEEGALAKVDGGFMWRNIQSGIKDSKNSLDWKADGQERTSPTSGVTEISDPISTNKAKSLSVFESEETPELSSSLASHDMEEDGATQAIVEDEAENDESEPKRRKKENYAAESNLPPRSVREPRVVVQIESDVDILDDGYRWRKYGQKVVKGNPNPRSVVYSADWLDSFSMFFIHIKLFLNRAMLAFTSSLPTARTNNQINSSDGGLHPNGVNGQVGLALPGSAGIKHETHQTLAHHFDRKPEFSNDFLRPSLIGSFGSDMKFPPSSLCQMKYPSLNNTMPYSSYGLNPDRCAAPQSGSISSMFPDFPMPLPLNLPSSGKFSIAGLNFNCAKPINPIQSFLSGQQVKDIDAVFLRPKQEQKDDAIYGSCIPSLDANASLSSSSAPPSIYQRVMQNFPS*


CDS Sequence:
>Vu_15448.1
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Promoter Sequence:
>Vu_15448::LG4:8067444-8069444(-)
CTGAAAAACAGACGTACGCGCGTTAGCAAACCCCATATATATATATATATATAATTAACAGTATTATTTTATGGGAACTTTGAAATTTAATCAATATTTAAAACATTTTATAAGTTTTCATGAGATAATTTTAAATATTTAATCCTATATATAAATTTAAATATTCATGTAATTAATAATGGTTGCAAAAGACATTTGTGATGTGTATAAACTAAATAAAGAGATAGACAAATGAAGTGAGAAAAATTTTAATTTAAGAAAAAGGTAAATGAAATATATGTAAATAGAAAAAGTATAAAAAATAATATTTATGAAAATGAAAAGTTATCATGAAATAGTTAGTCTTTTTTAAATTATAAGAACATTCATGCATTGAATAAATTATTTAATAAATAATAAATTGGAGGTAATTAAATTTCTATTTAATTAAGAAGGAAAATATTTAAATATTTAAAAATGTGTCATTAAATAATTAATTCTAAAATAATAAAATAATTAATATGTCATTAATATTGGTCAAGTCAAATTTTGTTATACAGGTAATACATGGATATGTAGATGGGTAAAAATTTATGGGAAATGAACTGTTACTCGCAATTTTTAATTGTTTTTTTAAGAGAAACATTTTTATTTAAGTTAAATAAGATTATCATGAGCAATATTTTTTTTTAAATATTGAACGCACATTTCTCTTTTTTTAATATTATTATTTAAAAAGAAATAAAGGTTTGTAGAGTAATATTTGAAATTGTGAATTTATTGCAAGAAATAAAATAAAAATAAAAAAGTGTGATAAGAATGTGTGACTTTGTAACCAGTTTGAGACATTAAAGGCAAATAAAAAAAAAGACACGATTCATTATAACAGAAAATGAAATTTGTTAGAACATGGAAAACAATAAATAGCAGATTGAGATCTAATCTAAGAATTATGATCCGAAAATTTCTGCATGTAGATTTAGAAAACAGAAAGTAAATTTCGCAAAGCAAAAAGTGCTTTTCCGAGGTAACAACACGTGTGTGGTTGTGTTAATTCGGAATTTTCGCATGTCATTTTTTCCGAAACTAGTGATTGCAATTTTTGTATTATGTTACATAACCTTCTAAGCGCGTTACAACAACTTTTACTTAAATAGCCCTAACCTTCATTAATTAATTTATTAATCTAACTTCGTTATAATTTTTCGTTTATACCAACTAAAATATACTATTAAATAAGTATCCATAATTAACATTGATTTATATATCTAACTATGTACTTCTCCCCTCTCTTTTAACAAAACTTTATGATAATTTTTTTTTTGTTGAGAAATTACATTTTCCCGTTCAATCTTTTTTAACATAAAAAAAGATTCCATTTTAAAATTCAAATAAATATTTTCTTAATTTATTTCGTGAAGTTAGAAAATAAAAAAACAATACGCATGAAAGAATATAATTCCTTGTACTAATTGCAAGGGATATATCAGGAAATTAAATTATAATTTTTTTGGTATAAACTATGATATTAATTTAATTTATTAATCCTTGTATAAATATAAAGAATTTATGCATAAAAAAAATGAATTGAAAAGATACGTGATGTTTTTTAGAACCTAAAATATTAATTATAGTTGTTAATCTTATCCCAAAACCTTAAATGCCATGGTGCGAAAGCGCAAAACTTTAAATTAATCGAGTGCAATGATTAATACGAAGTGTATGAACCTTGTTTACTAAATTGACACTATTGGCTAAGTTTTATTTATTTGTTTTGTTTATTTATTCATTATTTAATTTTTGTTTGTTGCACAAAAAGACAAAAACTAATATTTTGTATATATACGTGCACAGAGATCAGTGTGGAAGAAATGTATCATGTTTGGGTTGTGTGTTGTAGGTGGAAGCAAAGATTTCACTACAGAAACAACTTCAAATCTTCACTTTCATTAGCTGAACCTCACCTTCGTCATCATAATCTCCATTTCCTATATAAATTCTGATTTTTTTTTTCTTTCAAA


Gene Sequence:
>Vu_15448(-)
ATGGGAGAAAATGATGATCACAACAACCATTGTAATGAAGAAACAGAATCAAAAGATGCAAAAAGAAGCCTGGCTGAGAGAAGAGGGTTCAATTCAAATGCTGCAAAAATCAATACAGCACTGTTTTGTAGTGACACTACAACAAACCCTTCTCCTTCTCCTGCTACTCATCTCACCATTCCTCCTGGAATCAGTCCCACTGCATTGCTGGACTCTCCTATTATGCTTCCAAATTCTCAGGTTTGGATATATATGTATTTATATGTAATATACACAAATCACACAAAACAAAACTTATATGCGTTTTTTATAGGTACTTTGGGTGTGTTTTTCAATCAAAATTCCAGTTTCTACCCAATGATCTACAAAATAAGAATTTGCATTAAAGATCATAGATTTTGTCTGGGTAATATTTCAATCTTGATTGGAGAACGGTTTGCTGCATCTGGATTTGTTTTTGGGTTTGTTTTTTTGTCATTTCCTTGTTTTGAAATTTGCTTTGATTTTTTTTAATTGGTGTTCTAGGCAACACCATCATCTCCCACCACGGGGAGTTTCTTCGTGATGTCAAATCTTCTTCCCTATTCTGCTCTGAATCAGGTACCTTTGTTTTTTAATTATTAACAAATCCGGTTTCTGTCACGGTGAAAATAAATTTTATTAAATTGTTGAAGCTTGATGTTGCAAATGCATTATTCTGCAATCTATTCCGCCATTTTTTTGCATGATCTGAATATTGAAAACCATTCAGTTGGATGTATTTGATGCAGAGAATGGGAGTAGAAATCTGTGTCAATTAAGCACGATGACTCACAATAAGCTTGAAACATTTGCTTTGATTGATAGTGTGAATCTTTTAAACAAATATCAAGCCAAGCTTTTTGTGTAGTATTTGTTGAAAAATCCCATGACCTATATTTCTTTCTCAGATATTATCTTAAATGAATCTATTTAGTTTGTATTTTCTGACAATACTAGTGAATTTGGTTGATAACCTTGAACTCAATAGGTTTCTAGTAATTTCCACTCGGTAAAGGGAGGGAATAGAGAAAGCCAACTACCTCCTCAAGTTCAGTCACCATTAGATTTTTCATTCCCAGCAGATTTTTCAAAAGGGCATTCTGTGAAAAATAGTGAAGTAAATTCATACAATGATATGAAAATGGTAAATGATAAGATTGTTAATGGCAATAATGTTGAGAAGCCAATCTCTGGTTCTGAAGAAGTAAGCGATGAAAGTGCTGTGCCGAAAAACGGTATCAACAGTGAGGATATTGTAGGACAACCTGCTTCAGAAGGAGAACTGAAAGAAGCATCTCATGCAACAGGAGTGGTAAGGACCTCAGAGGATGGTTACAATTGGAGAAAGTATGGACAAAAACAGGTAAAAGGTAGTGAGTATCCCAGAAGCTATTATAAATGTACACAACCTAATTGTCTGGTCAAGAAAAAGGTGGAACGATCCCATGATGGTCAAATTACAGAAATCATCTACAAGGGTAATCATAACCATGTAAAACCACACTCTAGTCATAGAGGATCTGCACTTTCTACAGATGAGGTTTCAGACATGGCTGAAGAAGGTGCATTGGCTAAAGTTGATGGTGGGTTCATGTGGAGAAATATTCAGTCAGGAATAAAAGATTCAAAAAACAGTTTAGATTGGAAGGCTGATGGTCAGGAAAGGACATCACCAACTTCTGGTGTGACTGAGATTTCAGATCCTATATCAACCAACAAAGCTAAATCTCTATCCGTGTTTGAATCGGAGGAGACTCCAGAGCTTTCTTCTTCACTTGCTAGTCATGATATGGAAGAAGATGGAGCCACTCAAGCAATTGTTGAAGATGAAGCTGAGAATGATGAATCGGAACCTAAAAGAAGGTATTATATTCCATCTGGTAGTGTCCTTATGGCCCCATCTCAAGTGGAAAGAACTAAAATCTCTCTACATTAATTTGTCATTGCAGAAAGAAAGAGAACTATGCAGCTGAATCAAATTTGCCCCCTAGGTCTGTTCGTGAGCCAAGAGTGGTAGTCCAAATTGAGAGTGATGTGGACATACTTGATGATGGTTACCGCTGGCGTAAGTATGGACAGAAGGTTGTCAAAGGAAATCCAAATCCTAGGTAATGGTCGTCCTTCTTTCTTCACTTGCTAACCTGTTTATACTTGTCCACAATTGATTGAAACATACATCTGATGTAGCGTTTCTATCTTTAAGGAAGTATTATATTTAGTTTTGGGGCATTGTGCTCAATGATGTCATGTTTCCAATGACATCCAGTTATTCATGTAGCTGATTTCATTTGTAATATAAGGTTTTTGTTTTTCTCTTTGTTGGGCTATTGTGATCTCAGAAGAAGTTTCAACTTTTCAACTATTTGAAAATGCATATTGATCAAATTATTGTAGATTCTTATTTCTTATGGTTGAATACTGATATTTTCTGTTTTTTGTCCACTGCTCTTTTTGAATAGGGTGGACAATTTTCGTTCTTAAGTTGAAAGTGTGCTTGTTTGATACTGTGTATGGATATTTATGAAGTTGTCATTATGTTCTGGCTTCCTAGCTGTATATTTGAACGAGTTTTGTGTTTTAAGAAGATCAGTGGTCTATTCTGCAGACTGGCTTGATTCTTTCTCTATGTTTTTCATTCACATCAAGCTTTTTCTCAATAGGGCTATGCTTGCATTTACATCAAGCTGTTACGAAACAGCATTCATGCATTTTTCACTTGAGCTTATAGGCTGATATGTATTCAACATTTTCTCATGGATCTCTTCCATTTCAGGAGCTACTACAAATGCACAAGTGCTGGGTGTATGGTAAGGAAACATGTGGAAAGGGCTTCACACAATCTAAAATATGTTCTTACTACTTATGAGGGAAAACACAATCATGAAGTGCCCACTGCAAGAACCAACAATCAGATAAACTCAAGTGATGGTGGTTTACACCCCAATGGTGTCAATGGGCAAGTGGGTCTTGCTTTACCAGGGAGTGCTGGCATTAAGCATGAGACTCATCAAACTCTTGCACATCATTTTGATAGAAAACCTGAATTCAGCAATGATTTTCTCAGGCCTAGTTTGATTGGAAGTTTCGGTAGTGACATGAAGTTTCCTCCTTCTTCCCTTTGCCAAATGAAGTATCCTTCCTTGAATAACACCATGCCTTATAGCTCCTATGGACTGAACCCTGATCGTTGTGCTGCACCTCAATCTGGATCCATTTCCTCAATGTTCCCTGATTTTCCAATGCCACTACCATTGAATCTTCCCTCATCTGGAAAATTTTCAATTGCTGGACTTAACTTTAACTGTGCCAAACCAATAAATCCTATCCAATCTTTCCTTTCTGGACAGCAAGTGAAGGACATTGATGCAGTATTTCTGAGGCCTAAGCAGGAACAGAAGGATGATGCTATATATGGCTCCTGCATCCCCTCACTAGATGCAAATGCCTCACTCTCTTCTTCTTCAGCACCACCGTCCATTTATCAACGAGTCATGCAAAATTTCCCTTCATAA