Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15433 LG4 7908103 7911067 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit A-3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 7908123 synonymous_variant p.Gln7Gln
G/A 7908132 synonymous_variant p.Gly10Gly
T/C 7908153 splice_donor_variant&intron_variant
G/A 7908169 intron_variant
G/A 7908221 intron_variant
G/A 7908269 intron_variant
C/T,* 7908413 intron_variant
T/A 7908415 intron_variant
A/G 7908568 intron_variant
C/T 7908600 intron_variant
G/A 7908651 intron_variant
C/T 7908654 intron_variant
G/A 7908656 intron_variant
T/C 7908675 intron_variant
C/T 7908676 intron_variant
G/A 7908823 intron_variant
G/A 7908824 intron_variant
T/A 7908877 intron_variant
A/G 7909448 intron_variant
G/T 7909522 intron_variant
A/T 7909546 intron_variant
C/G 7909629 intron_variant
A/C 7909652 intron_variant
C/T 7909668 intron_variant
T/C 7909669 intron_variant
G/A 7909701 intron_variant
T/A 7909853 intron_variant
G/A 7910837 missense_variant p.Glu202Lys
A/G 7910866 synonymous_variant p.Arg211Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15433.1
MLKTLRQLFGRRKVQKGQFSVQCSNSSACSTLNTAGRKSIEGVIRSSVRGQDFTLPPSQMCHSQPLAHTAFHLAEPCFSGLLASPYGPQPNIHPAQLIGMPTARIPLPLDLSEEPIFVNAKQYHVILRRRQYWAKLESQNKLIKERKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNTKKHEESKPTSQNHDIDVSRCTHLNLRGNMSESKARQLNYRDDASTTTCSDISSASNSGDLFQQHQPDIRLCGYPSHIGRNMQGYSADISGSGGGGGANQHRLSVLM*


CDS Sequence:
>Vu_15433.1
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Promoter Sequence:
>Vu_15433::LG4:7906103-7908103(+)
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Gene Sequence:
>Vu_15433(+)
ATGCTAAAAACACTAAGGCAGTTATTTGGGAGGAGGAAAGTGCAGAAAGGTTTGGAAAGATCTCCAGCCTAGTGCCACACACACAACAGCTGCCAGTGGAAGGAGAGATGTTGCTGCAGCAGAGAGCTGGGAAGGAGGAAGGCAAGGAAGCCATGGAGACACTGCTGAAAAGAGTGGCTGAGCATAGGAGATTAAAACCAATAAGCCATTTCTTTCCTTTTCTTTTCTATTATAGTGATAAATTTTTGTTATTAGCTTGCATAGTCATAGATAGCATAGTTAATAATAGGATAGAAAATATGTTGTTCTACATAAAACTAAAAAGAATTAATTTTGATCTTTGGCCTATTTGAACAAATTTTCTTCTTAGTTATATCTGTGGTTTGTCTGTGTTGTTATTAGGAAGCCTTACTCACTCACACATTGAGGACAATGTGCCTCTTAAGTGTGGGGGTGGGAAGGTATAAATTTAAAAATACTTGTTCTGATGTAAATAACTGTGTTTAGCATTAGTTTTAGTAATAAAATAGGGATAATTTTTTTTCTCTGAGCTGTTTTTCCTTTAGCTTAGGTCTGGTTTAGTTTTAAATACTTAGTGTAGTTTACTATTCTTGTTTTAGTGTGTAAATACCTTTCATAATCTGTTTTGGTTTTTTTAATAGGAATTAGCTAGTTTTTAGTTTTGATTGTTAATACTTCTTAGATTCTTTTACTTTCATTGGTTCTGTTAGAACTTCTTTTAGGTTTCTTTCTTTTCTTGTTCCTATTTTCTCTTCCTTCTTCTAGTTTCTTGTTCTGTTGTTGTTTTCTTAGTAGTTATTTTAGATTCTTTTCATTTTCTAGGTTCTGTTTGAGCTTGTAAATTAGGATTTGCTGTTTTAAGATTTCTTTTGTTAGATTGTTTAGTGCATGTTTGGTTTAAAGCTCTAGAAGTACTTTTTGTGTTATCAGAAAACACTTTTTGCTTAATGGATGTTGGTAAATACTTGCTGTAGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAGCTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATTTTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAGCCAGCCACTTGTAAGTTGATGTATGATTGTATCTCAGTGGACTGATATTGTTTGCAAATCTCTTTTCTTATAATTTGCTTTTCAGGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATGTAAGATATTGGAATTTATTCATTTTTTTTCACTATTTTCTTATTCTTGTCAGCTTGTCTTCAGCACAGTGAGTTAAAGATTTATCATTCAAACAAATTGATAAAATAATTGTATGAGTATGAGTGGCATCAGGTTATGGTGTATTTGGAAAGTACTTTGTTTAGATCTGGTGTACTGAGTTTTTCACTTTTTAATTGCTCCACTCTGTGATTTTTGATTTTGTTATGATGTCGACTTACAAATAGGTTAAAGGTATTTCGGGAAAGCATGCTGCCCTTATTATTAGCAGTTTTAATTTGATTGGAAGCTTTCTGAGAGACTTTTGGATATATGTTACTATAAGTAGATGCTATTGTGGTTGATTCCTGTATTAATGACATCATTATGCATAAATGAATCACCAATAGTGCCTTTATTTTACTTATTATTATACGTGCTTAATTAGTTTTTACTATTTGTTGTGCCACTGTTAGCTTGCCAACCTTACAGATTCTCATAGTTCATAAAGTATGCTTATGAAGAATCTTTTTGGTTTAAAAATGTTTCTTTGCTCTCCTTTGCACCTCATTTGTTCTTATTCTTTCATCCTTTGTATTATTATTTACTAAAGCACTTTTTTATTATGGTGGAGAGCTTGTTTCTTATCTTTGACTCAAGGTGTTCTTTATTTTATAGACTTAACAATCTGACATGCATTCTTTACCAGACAGCATGGTTACTCTTGCTAACCTTTATGCTGAGTTGTTGGAAAAAGAAATTGAGCCTTCTATGGATAATCAAGCTTTTGAGTATTTGGATTCTCTTATGACGTGTTCATTCTTTATTTTAATTAAATGACCTAACAAAGTTACATAATGCCTTCAAACTTCCATCATGTTAGTAACACTAAGACATTATGTGCATTTCTATAATCTAAACCATGCTATCAAAATATGGCCAGATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACTGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCAGTACCATGTTATTCTGAGGCGCAGACAATACTGGGCAAAACTTGAATCACAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAAGTAAGTGCACTTCTGCATTTTAGAAATGCTGTAAAATCACTCTTTAACACAAGTGTTTGATAAAACATAAAAGAGTGATTTTACAGCATTTCTCATACTTCTCTTTTGTTTCCTTTTCCTTCTAAGTTCAACTTCTCTCCTTAACGTTACCATGTTTGTTTTTCAGCCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGCATGAAGAGTCTAAACCCACTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGATGCTTCCACAACCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCATCGTCTATCAGTCCTTATGTGA