Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15397 LG4 7607916 7609948 PREDICTED: WRKY transcription factor 22
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 7608066 missense_variant p.Val22Met
T/C 7608272 synonymous_variant p.Ser90Ser
A/G 7608290 synonymous_variant p.Gln96Gln
T/A 7608303 missense_variant p.Leu101Met
T/A 7608309 missense_variant p.Ser103Thr
C/T 7608338 synonymous_variant p.Pro112Pro
G/A 7608445 intron_variant
T/G 7608446 intron_variant
T/C 7608534 intron_variant
G/A 7608596 intron_variant
A/G 7608766 synonymous_variant p.Ala161Ala
C/T,* 7609025 intron_variant
G/T 7609058 intron_variant
C/A 7609483 missense_variant p.Pro313Thr
T/A 7609776 3_prime_UTR_variant
A/G 7609919 3_prime_UTR_variant
T/G 7609920 3_prime_UTR_variant
G/C 7609927 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15397.1
MAEDWDLHAVVRGCSTVTSSSVSSSSSSSSGFASCYFHPEGVSSSSSSSGFSIFRGEQGSQVLSLSAYPFEARSPIEELHELCRPFFCKSQPLSLQASSPLSSLSSYSSAPPKTVSSQEKQQQQRNKQPLSVTTPRSKRRKNQLKKVCQVPFENLSSDIWAWRKYGQKPIKGSPYPRGYYRCSSSKGCLARKQVERNRSDPTMFIVTYTAEHNHPAPTHRNSLAGSTRQKPLAPQTATTEQDSDKIKSLTKPSSPATSGAEEEVPAQVEKSESREEKEDVMDDEEEDDFVLSDMVLTDDFFESLDELSQLTAPSVVTGDCFSDPFSAMAIPSWVASGAATAGGCI*


CDS Sequence:
>Vu_15397.1
ATGGCCGAAGATTGGGATCTACATGCGGTGGTCAGAGGTTGCTCCACCGTCACATCATCCTCCGTGTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTGGTTTTGCCTCTTGTTACTTCCACCCTGAAGGAGTTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTGGCTTTTCCATCTTCAGAGGTGAACAAGGAAGCCAGGTTCTGTCGCTTTCTGCGTACCCCTTTGAGGCAAGGAGCCCCATTGAGGAGCTGCATGAGCTTTGCAGGCCTTTCTTCTGCAAATCTCAGCCTCTCTCGTTGCAAGCCTCTTCCCCCTTGTCCTCACTCTCTTCCTATTCTTCTGCGCCTCCCAAAACGGTTTCATCTCAAGAGAAGCAACAACAACAGCGAAACAAGCAGCCGCTCTCTGTCACCACCCCACGATCTAAAAGAAGGAAGAACCAGCTTAAGAAAGTTTGTCAAGTGCCTTTTGAAAATCTCTCCTCGGACATATGGGCATGGAGGAAATATGGCCAGAAACCCATAAAGGGGTCTCCTTATCCAAGGGGGTACTACAGATGTAGCAGCTCAAAGGGGTGTTTGGCAAGGAAACAGGTTGAGAGGAACAGATCAGACCCAACCATGTTCATAGTGACTTACACTGCCGAGCACAACCATCCTGCTCCTACTCACAGAAACTCCCTTGCTGGCTCCACACGCCAGAAGCCACTGGCCCCTCAAACTGCCACCACCGAACAAGACTCTGACAAGATCAAGAGCCTCACAAAACCCTCCTCCCCTGCCACCTCAGGGGCAGAGGAAGAGGTTCCAGCACAAGTGGAAAAGTCTGAGAGCAGAGAAGAGAAAGAGGATGTGATGGATGATGAGGAAGAAGATGATTTTGTTTTGTCTGACATGGTGCTAACAGATGATTTCTTTGAGAGCTTGGATGAGCTGAGTCAGCTCACTGCCCCTTCTGTTGTCACAGGAGACTGCTTCAGTGACCCCTTTTCAGCTATGGCAATCCCTTCTTGGGTGGCCAGTGGTGCTGCTACTGCCGGTGGATGCATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_15397::LG4:7605916-7607916(+)
ACTTTTACAATATTTTTCATTTATATAATTTTAAAAACTGTAAATAATAAGTGTTTTCTTAATAATTTAATTAGAATATACCAGCCATATAAAATAATTTTAGATATTGATATTGTTATAATTGTTAATTTTCGCAATAATTAATTAAATCAATCTAGTTAGAATCTCAAGGTTTCATAGTGACGTTATTTAAAGTAAAATTTTAATAAAAAATAATTAAAAGTCAACTATATTAATAAATAATATAAAAAAGTTATACAAATAATAAATAGTAAAATTTAAATTTATATTCTAATTATATTCCCATATTTACATTGCACAAGAAAGAGACAGAAACTGTATAACACATAATTTTCTATAATAAAAGAAGAACGTTTAATGTGGATGATATCCATAACACTCGATTTTCTACCACTTTTTATTTAACTTTGTATATTTTATAAGCACAAATGACAATCAAACAATAAAAATCAAATTAATTATAGTTTTGTTTCGTATTTAGTTCAAACTTAGACAATGTTTTTAGGAAAAATAGCATAATTGATTTTTGTGAACAAATAGATAAATATTTCAAGAAGTTTAATGTGATTAGTGATCATTAATTATAATTAAAATTTTATAAAATAATGAATACTATGAATTAAAGCATTATTAGTTCATTTAAACTAAGTGCAGGTTACATTATAAGTAGTTTGAAATGGATAAATATTTATTATACAAGTGATTGCAATTTAGGTTCATAATTAGGTTTTAATTTTATTTAGAAAACTCGATTCGAAATGGAATAAATTATGTTCATAAAAAGTAAAATGATTAAAAAAACATTTACACCTTAGGATAATTAAATGCAATGATGCAAAGATAAAGTGAATGTGTATTGTCGTTGCCAGGTCAAAATACTATAATAAATAAGAAATATGTTTAATAGCATTAAATTTATTATTAATCTACAATGCTTTAATATTAAATCTATCAACATATTTTTCAAAGAAGATAAATACTTTCTAGAATGGACACATCGTTATTTAAGGACAATGGGGGAAAAATATAATTAACGAGAAAGAAAATTTAATGAGATATTAATTAACATGAATAAAGAGGCAAAAAGTTAAATATTTTTATCTCAGTTATTTCTGTACATTCTGTAGCCTATTTTGTCGTTTCTCTGTGTCATTTTCATTCGTTTTTGCCCCTTACCTATTTAGTTATCTGTTTTAAATAAACAAAATAAAAATTAGGAAATATTGTTTAAGTATTTACAGAAGTATTAATTTAAACATGAATGTTTAAATTTGAAATTAAGAAATTGAGAAAAAGACACCCTGAAGGTCCATAAATGATCCAACTATTTGTGGCATTATTGTATTACATATCCTGTCGGCAAAACTTACAAAGAAATCCTCATAAAGTGCGTGTGGACTTTCACACCCTCCTCCATCAAATCCAGACCCTTTGACATTTTCAAAAGTCAACTCCATGAAACACAAAAAATAAAAAATATAAATAAATAAAATATATTAAAAGTAAATAGATAAGCATAGAGATGCCAAAATGACATCCACACACTCTCTCTCCCTTCAAAATAAAGCAACTTTTCCTGTTTTTCTATTTTCTTTATTACTTTTTTTTAATAACAATTTTATTCAACTCTGATACCACTATCGTAATAAACAACAAAACCTCAATAACCTGGGCCGATGTTTTTTAATCGGAACACAGTTCAAAATCAACCTTCAGAACCAATTTTTGTATTTAATTTTTAACAGTAAAATTTATTGTATATGAGAAATCATTAAACTGTAATAATTATAAAATTATGGAGCACTGTCATAGTTTTAAGAAAGTTAATTATCTGCTAATTATCCTAATTTTGATTAACAGAAGTGGAACTAGTGAAGGCATTTTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCACTAGACTTTGTGCAAAACTCGCTCTTTTCTCTTTCTATAAATACAAGTCCATCCCCACTCATTGCACCTTA


Gene Sequence:
>Vu_15397(+)
ATCATTTCTCTCTCTGGTGAAAAGTCAGCGCCTTCTTTTGTCTTTTCTCTCTCTCAACAAAGGGCATACACTGCAGAGTTTGTCTCCATGGCCGAAGATTGGGATCTACATGCGGTGGTCAGAGGTTGCTCCACCGTCACATCATCCTCCGTGTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTGGTTTTGCCTCTTGTTACTTCCACCCTGAAGGAGTTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTGGCTTTTCCATCTTCAGAGGTGAACAAGGAAGCCAGGTTCTGTCGCTTTCTGCGTACCCCTTTGAGGCAAGGAGCCCCATTGAGGAGCTGCATGAGCTTTGCAGGCCTTTCTTCTGCAAATCTCAGCCTCTCTCGTTGCAAGCCTCTTCCCCCTTGTCCTCACTCTCTTCCTATTCTTCTGCGCCTCCCAAAACGGTTTCATCTCAAGAGAAGCAACAACAACAGCGAAACAAGCAGCCGCTCTCTGTCACCACCCCACGATCTAAAAGAAGGTACAAAACTTCGTGCCTGCTTTGTTTTGATACCCCAAAGAGGAAAAAAAAACGATCTTGAACTGTGCTATGTCGTAAAACTCATGTCTTTGGTTGAAAATTCTGCGTGTCTTAAGGGTTTAGATTGCGGCTGTGGTTGTAGTTCTGTTAACATGTGGATAATTATAGATAAACGTGACTGATGAGACTGCGATTGTGTTTGCAGACAGTGTTTTGAAATCTTGGTATGTGAGTGTGATTGTTTGTGAGATGTGCTTATGACTGTTCTTGGTCTTTTACAGGAAGAACCAGCTTAAGAAAGTTTGTCAAGTGCCTTTTGAAAATCTCTCCTCGGACATATGGGCATGGAGGAAATATGGCCAGAAACCCATAAAGGGGTCTCCTTATCCAAGGTTTGCTTTGAAGATCTTTTTCACTTGCAATTTTCCAAAAATGTGTTGAAAGTTCATGATTTGGTTCTTTTCTAATTTGGTCACCGTCGATTTAAAGGTTTATAACCCATATGTGCATGGGTTATAAAGGTTTTTGAGATCTCAATAGTGAATTTTGTAATTAATTATCACATGAAAATCCTGCTTTATGCTTTAAGTAATCAAATCCTAGCTTCTAAAGATGGGTACTTTAGGGTCTAATTGAGGTTGCTTTGTTTTTGTAGGGGGTACTACAGATGTAGCAGCTCAAAGGGGTGTTTGGCAAGGAAACAGGTTGAGAGGAACAGATCAGACCCAACCATGTTCATAGTGACTTACACTGCCGAGCACAACCATCCTGCTCCTACTCACAGAAACTCCCTTGCTGGCTCCACACGCCAGAAGCCACTGGCCCCTCAAACTGCCACCACCGAACAAGACTCTGACAAGATCAAGAGCCTCACAAAACCCTCCTCCCCTGCCACCTCAGGGGCAGAGGAAGAGGTTCCAGCACAAGTGGAAAAGTCTGAGAGCAGAGAAGAGAAAGAGGATGTGATGGATGATGAGGAAGAAGATGATTTTGTTTTGTCTGACATGGTGCTAACAGATGATTTCTTTGAGAGCTTGGATGAGCTGAGTCAGCTCACTGCCCCTTCTGTTGTCACAGGAGACTGCTTCAGTGACCCCTTTTCAGCTATGGCAATCCCTTCTTGGGTGGCCAGTGGTGCTGCTACTGCCGGTGGATGCATATGATTCTTTTGGTGACAATTGTTTCATGCTTTTCATTGATGACAATAGGGACCTTTTTTTATCTTTGTTTTTTGTTCTTAGAGGAAATGGAACGTTTTGGAGGAATCTTTACTAACAATGGTTCGTGAAGGGGAGGAAAAATTTTCCCGAGTAGAGAGTAGTAAGGTAGATCAAGCATTTGTATCTATCTCTTTTAATCTTACCATCATCAGAGATTCATAGTTTTATGCATTACCTATGTTAATGTAAAAACAGTTCTAGTTTTTGTTGTTGTATGGGTATGGTCCTTGAGTTGTGATTGAGTTCAATGTATTTGAATTTTGACATTGGTTGTGGTATAAATTGGAAAAGCACTTTTGGGTTGACT