Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15393 LG4 7497823 7501378 PREDICTED: protein REVEILLE 6 isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 7497881 downstream_gene_variant
T/C 7497888 downstream_gene_variant
A/G 7497905 downstream_gene_variant
C/A 7497994 downstream_gene_variant
A/T 7498043 downstream_gene_variant
A/T 7498146 downstream_gene_variant
G/T 7498312 downstream_gene_variant
C/A 7498517 downstream_gene_variant
G/A 7499265 synonymous_variant p.Val111Val
T/C 7499489 downstream_gene_variant
T/C 7499509 downstream_gene_variant
G/T 7499512 downstream_gene_variant
A/T 7499519 downstream_gene_variant
A/G 7499687 synonymous_variant p.Pro75Pro
T/G 7499742 missense_variant p.His57Pro
C/G 7499745 missense_variant p.Ser56Thr
A/G 7499751 splice_acceptor_variant&intron_variant
A/G,* 7499841 intron_variant
A/G 7499855 intron_variant
T/C 7499882 intron_variant
T/C 7499884 intron_variant
T/C 7499886 intron_variant
G/T 7500161 intron_variant
G/A 7500671 intron_variant
T/A 7500680 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15393.1
MDDLNKKVRKPYTITKSRENWTDHEHDKFLEALHLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFMKVQKNGTSEHVPPPRPKRKAAHPYPQKASKNALTISKVTRPLQSSSALSESSFIYRPDSSSVLRTAVSSLPLPSWGYNLPPQVGLLPKATKEHMVLNQKVNPFNYCYSSSNESKQTDQGDQGQPIKGIAADEKPLHQFKKS*


CDS Sequence:
>Vu_15393.1
ATGGACGATCTCAATAAGAAGGTTCGGAAACCTTACACCATTACCAAGTCCAGAGAGAACTGGACCGACCACGAACATGACAAGTTTCTCGAAGCTCTTCACTTATTCGACCGTGACTGGAAGAAGATTGAAGCATTTGTGGGTTCAAAAACAGTCATCCAGATAAGAAGTCATGCACAGAAGTATTTCATGAAAGTTCAGAAGAATGGAACAAGTGAACATGTACCTCCCCCTCGACCCAAAAGAAAAGCTGCTCATCCATACCCACAAAAGGCTTCTAAAAATGCTCTCACTATATCCAAAGTTACAAGGCCTTTGCAATCTTCATCTGCTTTGTCGGAATCGTCATTCATTTATAGGCCAGACTCGTCATCTGTGCTTAGAACTGCAGTTAGCAGTCTGCCATTGCCATCTTGGGGTTATAATCTTCCGCCACAAGTTGGTCTTCTTCCTAAAGCGACAAAAGAACATATGGTGTTGAATCAAAAAGTCAACCCCTTCAATTACTGCTACAGCAGTAGTAATGAGAGCAAACAGACAGATCAGGGTGACCAAGGCCAGCCAATTAAAGGTATTGCTGCTGATGAGAAACCTCTCCACCAATTTAAGAAGTCCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_15393::LG4:7501378-7503378(-)
TGGTAATAATCTCACAAATTTATGCTTCAAATAATCACTACATGTAAACGTGACAAATCATCTTATTTTCATTTTCACTACTAATATGCAATTACAATAAAATCATTTCAAAGGAACATAGAATTAAGGTATTTTATCTTTCTTCTATCTTTCGAAATATATCCATCATTTGCAATTCTTCTTTATAACTTAATAAATATTAATTTAATTGATCAAAAATTACTTTATATGTATTAAATTAAATTTAAATATAAAATTTATGAAACTTTTCATATTTCGTAAAAATAAAAAAATGTTATAAAATATTTAATATTAAAATGATATTTATATTCTTTTCTTCAAAATTAATAACAAAGATATAATTATATTAAATTTTAAAATAGATTATCAAATAATTTAAGAATATTTTAATTATTTAAAGAAAAAAACTATTACTAAAATAAGTTAGGAATTAGTTCATTTCTCATCTCTAATTCTAAAACTAGTTCTAAGATGAAAAGTTTTAAATGATATAATCATATCTAGAATAATTATTTGAATTGAAACATCATAATTACCATCATCAGAACTCAACTTATAAGTTTTACGTATATTTTTGTCAATCATAAAATATAAATATCGAAAATCCAAAAAAGAATACAATATTGAAAACGTATAACTTTGTTTATACTATTCCTTCACTACCATAATCACTACGGTGAACATGGTATGGTGCGGCAAACTCCACTCTCTACTAACTTATGTAATAAAATAGAAATAACATGTTTTGGAACTTGTTATTAAGAACCACGAATTATTAAGTTGACAAATTATTTGTATTTTTAATCTTCACAACTATTTTATATAATATTAATTACTTTTGGTTTCAGATTACTATGATTTATAATTAAATATATTTATTGTTAATCAAATTAAACAAATTTTTTTAATAATTAAAAAAATAAAATTAATTGTATCATTGACAGTTTCTAAAACCTCAAGTAAGTAAATGTAGAAAATTTTTGCGATTTTAGGTAACCCACACAAGTTCTGATGATTTTGGACAATTCATACAAGTCTCGGCGGTTTTAGTAAACACCTACTAGCAGTTTCTGTAAAAATCGCGCAATTGGCCATGGTTTCCAAAACCCTTGTAAATGACGACAGTTTTGAATAAAATTGTCAAAAATTATTTGCGGACGATAATTTTTCCAATGTTTTTGTCAACCGCGAGATGTGCATTTATGAGGGATTAAAATAAATAACCAATAACGCAAAAATAAACCCATGGTATAATTATATAATTTTGTAGTGATATATAAGATAACAAATAACAAATTTTATTGAAATAATTTTTTTAAATAATTATAATATTATACTAAAAAATATATTTTAAATCTAATTAAATACTACAAAAGTAACTAATAAGATTATATTTATACTTATTATAATTCTAATTTATCTTGTGAGATCTCTAACATATTTATACTATTTATACAATAAAAAAAAACTCAAGAAACAAAAATCAAACCATTTTCATAGATAAAAGAACATCTAAAAGTTATCGTGTTGAAGTATTTAAGATAAAAGTATACTTTTAACTGGAAAAATACCAGAAATGGCGACTAAACAATAGCACAAAGTTCTGTCGTTTTATGGAGTGCATATAAATTTGTGTAAAAGAAGAAAATAAAAGGAAAAAGAAAAGGTTGTTTTTGGGTGAACCTCAAACGTTGTTGTCTGAGAAAGAATAACGACCCACTAACTGTTGCCACATGTCTTAGTGCCATGTTTGTGTGTCTGTATATAAAGGGTGAGAGAAAGGTTGGTTCTAATAACTTGTGGAAAAAATCAAAGTTAAAATCACTGCCTCTCATTGTTCCACTCAACTTCTCTAAGCTAAGTTACCAACACCAACAACACTTGAAAACTGAAGAGGTTCTTGAACAGTGTTGGTGTCATTAATGGTGTCCCTCAACTCAAACCCCCCTCAAACTTTTCCCTTCTTCGACCCCTTCAAC


Gene Sequence:
>Vu_15393(-)
ATGGACGATCTCAATAAGAAGGTTCGGAAACCTTACACCATTACCAAGTCCAGAGAGAACTGGACCGACCACGAACATGACAAGTTTCTCGAAGCTCTTCACTTGTAAGTCTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTCTTCTCTGTAACTTGTATGATTCGTTCATGGTATTGAAGTTTCATTTTGCTCTCAAGTTTCAATTCGTGATAAAGTTTAAGACTTGTTTGGATGCTGTATTGGGTTTTGTTATCCATGATGAGTTGATTTTGGGTTCTGTTTGTGCTTGTGATTTTTGCTGCAGTGGAGACCCTTTTGGTTTTTGGGTTCCTTTTTCAGTTGGGTGGCTAAAAAAATTTCAATTTTGTTTGCATAATTTTGCTTATGGGTTTTTTCTCTTTACTGATTTCAGATTCGACCGTGACTGGAAGAAGATTGAAGCATTTGTGGGTTCAAAAACAGTCATCCAGGTATTTTTACACCAGCGATAAGAGCGTCTGTGTGCTTGAAAATTTGCAATTGGACATTTATTTGTTGTTGCACATTGTTTTCATTCCCATATTGGGCATCTGGGTAACTATTCAGTGTTAATGACACTAATGGCTTTAAGATTGCCTCAGAAAATGAGAATATTGGTGCACACTCTTCTATTTATTTAAAGTTCATTTCAAATCATGAAGTTTTACTTGTCACACATCTTATTGATAAACCTTCATCATAATTTTATAGTTTTCAATAATTCTAACTATCAGTAAAAAAAAAATGTGTTCCAGTGGTTCTAGCGCTCGTCCTCAAGAAATTGTCAGTTAAAGATCAAGCATAGCTGGTAGGTGATCACGTTTCTTATATATACTAACATAGTTTGATTCCTACCTGAACTTATGGATAAAGCTTTGTTAAGAGAACCTTTACCACTTTCGTGATTTTTTCCACCTGAAAAGGGTCAGGTTCTGGTTTGGAATATATACCTTTTATGTGCACACTGACACACAAACAAAAGAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAAATGAATAAAGGTTGACATGATAGTTTCCTTAAAAAAGCCAATTGAAACCTCAAACCTGAGTTTGGCTTTTAAGAAATATCATCCATCATTAGAAAGCTGATTTAACCTTTTTCTCCATCAAATCAATACTTACATCTTCTTAGTAAGCATTTTTTAAATTGAATACAATCTACTCATCTGTGCTTTTCTTTACATTCCTAGGGGCAGGGGATGTGATATGTTCATCATCTCATAGTGAAATACACGTATATAGTGTAGCTTTTCTATTTGAAAAGCTATACTAAAGAAAGAGAAAATCTTGTAAAAACTGTTTTTTGATGTATTCTGAAAAGTAGGACAGGTTCTCCTAGTCTGAACTGGACATCTGAATCTTCTCTTGTACTCTTTTTACAATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTACTGCTGCTGAGTGTTGAGATTACACTTATTCAAATATTCAACACTTCTGAATTGAATTTTTTCATCCCCTCCTCTTTTTGGAAGATAAGAAGTCATGCACAGAAGTATTTCATGAAAGTTCAGAAGAATGGAACAAGTGAACATGTACCTCCCCCTCGACCCAAAAGAAAAGCTGCTCATCCATACCCACAAAAGGCTTCTAAAAATGGTTAGTGTGACCAACTTCATTTCAAGTATATGTGACCTTAGGTCTTGTTTGAATAAACTTTCATCAAAAACTTATAGAAGAAAAAAATATAAGAAGTAAATGAATTAAGTTTCTTCCATAAATTAAAATTAACTTTTGGAAGAAGTTGAATGAGGTAGTTTCTAAGTACATAAGTTGATTTTAACTTATGAAAGAAGTTTGATTTATTTTGTATTTTTATTTTCTTCTGTTGTGAGTGTTTGATGAGAAGTATATCCAAACAGGGTCATAATCAATGCATGAATAAGTCTTTTATTGTTTGCATTTTATCAGCTCTCACTATATCCAAAGTTACAAGGCCTTTGCAATCTTCATCTGCTTTGTCGGAATCGTCATTCATTTATAGGCCAGACTCGTCATCTGTGCTTAGAACTGCAGTTAGCAGTCTGCCATTGCCATCTTGGGGTTATAATCTTCCGCCACAAGTTGGTCTTCTTCCTAAAGCGACAAAAGGTATTCTTTAGCCTGAACTGTATTTTTTAAAATCTTAAATTATGTCATTACATATCTTTTTTATGTATTCTTTGACAAATTTAGATATGTTGAAATTTATGTTAACATGAATTTTCACTTTTATGGTTAGAACATATGGTGTTGAATCAAAAAGTCAACCCCTTCAATTACTGCTACAGCAGTAGTAATGAGAGCAAACAGACAGATCAGGGTGACCAAGGCCAGCCAATTAAAGGTAGGAATGCGTGTTTTTACTCAAATCTTAATTTGGTACAGCCGAAAACTTACTGAAAAGCGTGAATAATGGACACCGGATATTCATTTGGATAATTTTTGGATAGCTTTTTTAGAAGAAAATAAGAAAAAATTGAAATAAATTTCTTTATAGGCTAAAATTAGTTTTTATATAAATTAAAATAACCTTTTAGAAAAGCAGCATGGGAACTTTTACAAACTAATTTGTATATAAGCTATTTTTAGTTTATGGAGAAACTGGTTTAATCTGTTTTGGTATTTTCTTCTCTTAGCAGTATTTATAGAGAAGTATATCCAAAGAGACAGTTTTTATTCCATATATCCGTTTTTTACTATGACTCCTTGTACCTTATCTCTTCTTGTTGGTGTTCTCAAGGAATTTCTAATAATCAGATTAGTTGGGGGTTGTACTTCAGTTTAACAGATTTAAGTATCGAGCGTTTATAGGAAACAGGCCTTGGGAATCCATGGTGTTTCTTGTTGAAGCTGTCATTTCAAGGAAGTACAAAAAAATTAAGACAAAGTATCTTTCAAGTTTCCATTTGTTCATTGGAAAAGAGTATTCTAAGCATGCAGACAGATGTGTGGCATGCAAGATGCCTGGTGTTTCCTTCCAGTGTTCATAATCTGTTTAATTACTATGCACATGCGTTTTGTTTTCCATGCTGTTTGACAAGTTCACCTGTCCTATTAAACAGCAATGCCAGATTTTGCACAAGTATATAGCTTCATTGGTTGTGTGTTCGATCCAAATGTGACTAATCATTTACAAACACTGCAACAGATGGACCCAATAAATGTGAAAACCGTAAGTGACCGCAAGTCTTTTATTTTTTTTTGGCCACATACCATTTGTTTATTTATTTATTTCTCTGCTATCTTATGGTGTCTTGGTGAGTGAGTATCCAAGGTTTGAGCTATCAGACTACAATTGATAGGGAAGCCTACTGTTTATATAGCTTAAATTATTGGCCAATGTAGCAGATTTATATGACGATTTTCTCTTTAGCAGGTATTGCTGCTGATGAGAAACCTCTCCACCAATTTAAGAAGTCCTGA