Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15388 LG4 7434124 7437376 probable serine/threonine-protein kinase At1g01540 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein autophosphorylation, protein autophosphorylation, protein phosphorylation, protein autophosphorylation
Cellular Component   located in   plasma membrane, chloroplast, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 7434221 missense_variant p.Lys404Met
A/G 7434247 synonymous_variant p.Ser395Ser
A/G 7434256 synonymous_variant p.Asp392Asp
C/T 7434277 splice_region_variant&intron_variant
A/G 7434310 intron_variant
T/C 7434347 intron_variant
G/A 7434396 synonymous_variant p.Asp381Asp
A/T 7434602 intron_variant
A/T 7434991 intron_variant
A/T 7435348 intron_variant
A/G 7435388 intron_variant
G/T 7435566 intron_variant
A/T 7435714 intron_variant
A/T 7435719 intron_variant
A/G 7436135 intron_variant
C/T 7436191 intron_variant
T/G 7436223 intron_variant
G/A 7436320 intron_variant
A/T 7436322 intron_variant
A/T 7436325 intron_variant
A/T 7436326 intron_variant
C/T 7436328 intron_variant
G/T 7436433 intron_variant
C/G 7436876 synonymous_variant p.Pro167Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15388.1
MSIFDGAFMNTQLSKHTSIFGLRLWVVIGILIGVFIVFTLFLLSLCLVSRRNRRRSVAGYKVAGSAQAAKEIHTIVHLPGSHMPRPPAKAPEIQVEMGKAEHRVVVHCDRVSSEESKGTMGSGCETTSSFGSGSVGGLGLGPEVSHLGWGRWYTLRELEDATGGLCPENVVGEGGYGIVYHGVLNDGTKIAVKNLLNNKGQAEKEFKVEVEAIGRVRHKNLVRLLGYCVEGAYRMLVYEYVDNGNLEQWLHGDVGPVSPLTWNIRMNIILGTARGYVAPEYACTGMLTEKSDIYSFGILIMEIITGRSPVDYARPQGEVNLIEWLKTMVGNRKSEEVVDPKLPEMPASKALKRALLIALRCVDPDATKRPKMGHVIHMLEADDMLFHNEHKTDGDSSRSYQNEHKDSNLDKRTDGVTDQSEDASSSRNNHQATTWR*


CDS Sequence:
>Vu_15388.1
ATGTCAATCTTCGACGGAGCTTTCATGAACACGCAACTTTCCAAGCACACTTCTATCTTCGGGCTCCGTCTCTGGGTCGTGATCGGAATCCTCATCGGCGTCTTCATCGTCTTCACGCTCTTCCTCCTCTCTCTCTGTCTAGTATCTCGTCGGAACCGCCGCCGTTCTGTCGCCGGCTATAAGGTCGCCGGATCCGCCCAAGCGGCGAAGGAAATTCATACTATAGTGCACCTTCCTGGATCCCACATGCCCCGGCCTCCGGCGAAGGCGCCGGAGATCCAGGTGGAGATGGGGAAGGCGGAACACCGGGTGGTTGTCCACTGCGATAGGGTTTCGAGTGAGGAGAGTAAGGGAACGATGGGGAGTGGTTGCGAAACGACGTCGTCTTTTGGAAGTGGGAGTGTTGGTGGGCTAGGGCTTGGGCCTGAGGTTTCTCATCTTGGGTGGGGGAGGTGGTACACTCTGAGGGAGCTTGAGGATGCCACTGGAGGGTTGTGTCCGGAAAACGTGGTTGGTGAAGGTGGCTATGGCATTGTCTATCATGGGGTGCTCAATGATGGTACCAAAATTGCTGTCAAGAACCTCTTGAATAACAAGGGCCAAGCTGAGAAAGAATTTAAAGTAGAAGTAGAAGCTATTGGTAGAGTGCGACACAAAAATCTTGTTCGGTTGCTTGGATACTGTGTTGAGGGAGCCTACAGGATGCTTGTGTATGAATATGTAGACAATGGTAATCTAGAACAATGGTTGCATGGGGATGTCGGACCTGTCAGCCCTTTGACATGGAACATACGCATGAACATTATTTTGGGAACTGCAAGAGGTTATGTTGCACCAGAATATGCCTGCACTGGAATGCTGACTGAGAAGAGTGATATTTATAGCTTTGGAATCCTTATCATGGAGATAATAACTGGAAGAAGCCCTGTTGATTATGCTAGACCACAAGGAGAGGTTAATTTAATAGAATGGTTGAAGACTATGGTCGGGAATAGAAAATCTGAGGAAGTAGTTGATCCTAAGCTCCCTGAGATGCCAGCTTCAAAGGCTCTTAAACGTGCTTTATTGATTGCTCTTCGGTGTGTTGATCCTGATGCAACAAAGAGACCAAAGATGGGACATGTGATCCACATGCTTGAGGCAGACGACATGTTATTCCACAATGAACACAAAACTGATGGAGATTCTTCTCGTTCCTATCAAAATGAACATAAGGACTCAAATTTAGACAAGAGAACAGATGGTGTCACTGATCAAAGTGAAGATGCTAGTAGTAGTAGAAATAATCATCAGGCCACTACATGGAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_15388::LG4:7437376-7439376(-)
TAGGTACGTAATAAAAGTTTCCAAATATTAAAAAATAATTGCATTTGACAAAATATTATGCCATATTATTCATTAAAAAACCAAATTCAAATATGAACTGATTTAATTGATTATCTGTTAAAAAATTCGATAGATCAAATCTTTTTTTTTTATACCATTTTATTCTTTTAAAGAAAGTCAAAGTTAAACGTGTTTATAAGAAGATTCAAATCCAAATTTGCTCAAATTAACTAACTCTAGTGGAATTTAATTGACTTAATAAAAGCCAGAAAAAAAAAATCACTGAACAAAATAAAAAGCTACAATAGTATGTTTTATTTTTCTTTTTCAAGTACCTTATAAAAGTCTTTTTTTTACAAAGTCAATAAATTAGATACCTTAAACTAAGCCATGTGGAACAGTGCCTTGCTCGATTTCAACAATTTCGAACGTTAATATTCTGTTACTGTTTCTTTCATTTTATTGTACTTCTTTTTTTGGCTTTGTCATTTTGTAGGAGCCTTCTTCCCCTGTCCACATATGTTGAATGATTAATAATAGATGTTGTCAATGATAAATATCAATATTATTTATTATATTAAGAAAATAAACACAATTAATTGCTATTATTTATATCATTTATCATCCTTATACAAAGTTGCATGACCAAAACTAAACAATATAGGTCAAACCACATAACAGTTAAGCAATTAATGTATTTCGAGTATATAATAATGAGATTGTACGCTAAATGTTCTTAAAATATTTTTTGGACAAGTTGATTGATTAATTATTGTTAGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTTAAAAAGTTTCATTGTCATCCTCACGTGGTGTAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATATCTGTGTCTTCCTTTCATACAAAGTACATATATTCATTCTACCTTATCCAATTTAAGGCTTTTCATAGCTCCAGAGAAGTGACATATGAAAGGAAGACACAGAGATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTATACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGAAAAAGGAAGCAATTAAACCTTATTGTTATTAATTGAGTAAATTATTAAATACATATCTTTAAAGACACCTATTCTCTTACCAAAAGTACGTTACATATGATCTGTTAAAAACAAATAAATTTGTCCTTTATTGTTATCAAAGAAAGATGAAAAATAATTTATTTATTGTAAGGGGCAAAGTCTACATAAAAAAATTATATAAATTTGAGATTAAAATACGAATAGTTATTTTAAAAACTATAAACAAACATTAATCTATTTTAGTGGAGCACAGACATATTTAACCTATATTTTTTTCATACAATACTAAAAAGATGTTATAAAGAGAAATTGGAAAAGAGTATAACGTTCTTTTTTTCTGTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGATGTTGTTGTATGAGAAAGAAAACAAAAACAAAAGAGTACACAACCAACATGAAACCCTTTCATCAGCACTCTTTGCTGGCTTCATCACTCAACCTTTTTTGTCTGTCTGTCTCTCTCTTTTACAGACTTCCTTTCATGCTGCTAAATTTTCTATTGATCTCATTTTCTTACAACCCCACATTCTTTTTTCTTTCTCTTTTCTTCTCCTTCATTCAAAGCATTGATTTTCATCTCTTCACTTCACCCTTACCGCGTAGCCGGCGTCGGAAAATCCTCCCTTGTCTTAATTTTCCGGCGAAGCAAATGCTACCCGCTTCCTAGAACCTCGCCGTGTGCCGGAAAGTTCACTCTTTTCTTACTTTTCCGGCGACCCATTGTCCTCTTTAGTCTGCAGCA


Gene Sequence:
>Vu_15388(-)
ATGTCAATCTTCGACGGAGCTTTCATGAACACGCAACTTTCCAAGCACACTTCTATCTTCGGGCTCCGTCTCTGGGTCGTGATCGGAATCCTCATCGGCGTCTTCATCGTCTTCACGCTCTTCCTCCTCTCTCTCTGTCTAGTATCTCGTCGGAACCGCCGCCGTTCTGTCGCCGGCTATAAGGTCGCCGGATCCGCCCAAGCGGCGAAGGAAATTCATACTATAGTGCACCTTCCTGGATCCCACATGCCCCGGCCTCCGGCGAAGGCGCCGGAGATCCAGGTGGAGATGGGGAAGGCGGAACACCGGGTGGTTGTCCACTGCGATAGGGTTTCGAGTGAGGAGAGTAAGGGAACGATGGGGAGTGGTTGCGAAACGACGTCGTCTTTTGGAAGTGGGAGTGTTGGTGGGCTAGGGCTTGGGCCTGAGGTTTCTCATCTTGGGTGGGGGAGGTGGTACACTCTGAGGGAGCTTGAGGATGCCACTGGAGGGTTGTGTCCGGAAAACGTGGTTGGTGAAGGTGGCTATGGCATTGTCTATCATGGGGTGCTCAATGATGGTACCAAAATTGCTGTCAAGAACCTCTTGAATAACAAGTATGTCTTTTTATTTAGTATAATTTCTGTGCTTATTGGAAACTTTCATGAATATGACTTTTACTCTCAACTATAATTTTCATAAATATAGCTTACAAGGTAGTTATTGTAAAAAAAATAACTAACATGTACTAGTGTTTGAAGATTCTTCTCAATGTTGAAGGTGTGGTGAAGGGGAGGGTAGTTTAAGGTAGCCTGATTGAACTCATGATTAGCTGATGATCAAGGTTCAACTGGGCAATTTCTGTAAAAGTCAATATATTTATCATATAATAAGTTGAGTTTAACAGATACATAATTAGTCGGAAATTATTGTTGATATGATTTTTGTTATAGAAGTTAACAAACTTTTTATACATGATAATTTGTTAATGGATGACACTGTAGAAGACTTTACCACTGTGAGATGTATTATTTATTGTAACATGATAGCTTGACTTTTATTCTGTCTCGATTAGTCCTTGTTGCAAGTTTGATGCTTTGGTTGGATGTTGGAATGGTCTTCAGAAATCTCAGGAAAAAATAATTGTCTAATTTATTTGTGTTTGTTGATGTCAATATTTTCTGGTGATTCTGTATCCTACAGATGGATATTGTGTGATGAGTGTTCAAATATTGGTTCCCCTGTGTGAACTGGCTTTTTTCTTAATTTGGCTCACATGATGAAAAAATTTTCATTTGTGATTTTTCAACCCTGTGTTGCCCGTTGATTTGTGAATCTGGGGAAGGACAAAAGCAAATGATTTGCTTTTTGTCGTGTTCTTTTTGGTTGCAAACAAGTTTAGTAAAATTTTGCTTGAAAATACTACTTGTAAATATTCAATTGTCTCTATTATAATTGAAATGATTTAGACATGCTGTTCGTTATTCTCTTCAAAGATTGTCCTGGTGGCAACCAACCTTATATATCCTCGCCAATGATACCAGCTTTTTGCTGTAGGCCAGTGTTTGTTTCTTTTACTTTAACCAGTGTTCTACTTTTTAACTTTTATTTTTGCGTTATCCTTGTCTGGTATGCTAGAAGTTATCCTTGAAGTGAGTCACTCGTGTGAAGAAAAGAATAATTTTTCTTTTGATCTCCTTCTTCCTACCAAATTGATTAGTATTTCATTTCTTGGAGTTTTGTACTCTAATGTATTTTATTAAGAGTCTCTCTCATATTGGATTGACTATTTCATATTTCTATCTTGTGGTTCCATGTTCCTGGTCTTGTGCCTGTCTTTATCTTAAAAACAAGTAATTCATGTTAAACTTTTTTTTCAGGGGCCAAGCTGAGAAAGAATTTAAAGTAGAAGTAGAAGCTATTGGTAGAGTGCGACACAAAAATCTTGTTCGGTTGCTTGGATACTGTGTTGAGGGAGCCTACAGGTATCGATATCTTCTCTTACAAACTAAAGAAAAATAAAAATTGATGCTATAAACTCTGTTTGGTTTGATGAGATGTGAGATTTGAAGTGTGGTATTGTTTTCACAGGATGCTTGTGTATGAATATGTAGACAATGGTAATCTAGAACAATGGTTGCATGGGGATGTCGGACCTGTCAGCCCTTTGACATGGAACATACGCATGAACATTATTTTGGGAACTGCAAGAGGGTACCGAATTTGTTATAAACCTTCGTAGATTGGAATCCATGGTGATGTTTGATTGTATTGATCATGTGCTTTTGTTTATCTTTTCAGATTGGCTTATCTTCATGAGGGTCTCGAGCCAAAAGTTGTTCACCGAGACGTGAAATCAAGCAACATACTCATTGATCGCCAATGGAACTCCAAGGTTTCTGATTTTGGACTTGCCAAGCTTTTGTGTTCTGAGAATAGTTATGTCACAACTCGAGTGATGGGAACATTTGGGTTAGTATGAATAAACCAAACATTTTCCTATCTGTTACCAAATTAGAATTAGTTTCAGTTCCTGTATGATGATTATTGTAGTCAAAAGATAGTGACTCTCTTTTCTCTTTTGGTAGTTATGTTGCACCAGAATATGCCTGCACTGGAATGCTGACTGAGAAGAGTGATATTTATAGCTTTGGAATCCTTATCATGGAGATAATAACTGGAAGAAGCCCTGTTGATTATGCTAGACCACAAGGAGAGGTTAGATGCCATCACCAAGAAAAGACAACTGCTAACATATCTGCCATCTTCTCTCTTTTTTGGGCTAACTATGCATGTTGGAACAATTACAGGTTAATTTAATAGAATGGTTGAAGACTATGGTCGGGAATAGAAAATCTGAGGAAGTAGTTGATCCTAAGCTCCCTGAGATGCCAGCTTCAAAGGCTCTTAAACGTGCTTTATTGATTGCTCTTCGGTGTGTTGATCCTGATGCAACAAAGAGACCAAAGATGGGACATGTGATCCACATGCTTGAGGCAGACGACATGTTATTCCACAATGTATGTTCTTTACCTTCTTAATTTTAACTTATACTTTATTTGACTAAAATAAATCAATGTCATTCAATATGCTACCCACATAAACTTCTTTCCCTTTCCTGTCTTAGGAACACAAAACTGATGGAGATTCTTCTCGTTCCTATCAAAATGAACATAAGGACTCAAATTTAGACAAGAGAACAGATGGTGTCACTGATCAAAGTGAAGATGCTAGTAGTAGTAGAAATAATCATCAGGCCACTACATGGAGATGA