Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15349 LG4 7024165 7024557 probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 7024192 missense_variant p.Thr10Ala
T/G 7024226 missense_variant p.Ile21Ser
C/T 7024228 missense_variant p.Arg22Cys
G/T 7024235 missense_variant p.Arg24Ile
C/T 7024311 synonymous_variant p.Asn49Asn
A/T 7024315 missense_variant p.Ile51Leu
G/A 7024321 missense_variant p.Gly53Ser
T/C 7024339 synonymous_variant p.Leu59Leu
C/T 7024344 synonymous_variant p.Phe60Phe
T/G 7024347 missense_variant p.Asp61Glu
G/A 7024356 synonymous_variant p.Ser64Ser
G/A 7024369 missense_variant p.Ala69Thr
A/T 7024382 missense_variant p.Asn73Ile
G/A 7024429 missense_variant p.Gly89Arg
G/T 7024466 missense_variant p.Gly101Val
G/A 7024476 synonymous_variant p.Leu104Leu
T/C 7024477 missense_variant p.Ser105Pro
G/A 7024488 synonymous_variant p.Pro108Pro
G/A 7024489 missense_variant p.Ala109Thr
G/A 7024509 synonymous_variant p.Ser115Ser
A/G 7024515 synonymous_variant p.Leu117Leu
C/T 7024550 missense_variant p.Pro129Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15349.1
MHFSLGCIATNFGSCIIIVIIRLRVENLKLLSGLVWKLNYLEVVDLTANRISGVVPFALFDLPSLQQVALSFNKFSHLEAPYALEMQSGVIAVDLSNNELGEFLSLFPALMPRLSSLSLENNKFVGMIPT*


CDS Sequence:
>Vu_15349.1
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Promoter Sequence:
>Vu_15349::LG4:7022165-7024165(+)
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Gene Sequence:
>Vu_15349(+)
ATGCATTTTTCTTTGGGATGTATAGCAACAAATTTTGGAAGTTGCATAATCATAGTTATTATTCGTTTGAGAGTTGAAAATTTGAAATTATTAAGCGGATTAGTTTGGAAATTGAACTACTTGGAAGTAGTGGATTTGACTGCCAACAGGATAAGCGGTGTCGTTCCGTTTGCGTTGTTCGATCTTCCCTCGTTGCAGCAGGTGGCGCTCTCTTTCAACAAGTTCTCGCACCTGGAAGCGCCTTACGCTTTGGAAATGCAAAGCGGAGTTATAGCGGTTGATCTGAGCAACAACGAGCTTGGGGAGTTTCTGTCGTTGTTCCCGGCGTTGATGCCGAGACTTTCGTCTCTATCGTTGGAGAACAATAAGTTCGTGGGAATGATTCCGACCTAG