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Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15232 LG4 4919177 4928953 receptor-like protein 12 isoform X4
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 4919181 5_prime_UTR_variant
G/C 4919189 start_lost p.Met1?
A/C 4919201 missense_variant p.Arg5Ser
G/T,A 4919204 synonymous_variant p.Val6Val
C/T 4919233 missense_variant p.Thr16Ile
T/G 4919237 missense_variant p.Ile17Met
C/G,* 4919287 missense_variant p.Pro34Arg
G/T 4919295 missense_variant p.Asp37Tyr
A/T 4919298 missense_variant p.Thr38Ser
C/A 4919303 missense_variant p.Phe39Leu
T/A 4919317 missense_variant p.Phe44Tyr
C/G 4919333 missense_variant p.Ile49Met
C/A 4919335 missense_variant p.Ser50Tyr
G/A 4919343 missense_variant p.Val53Ile
G/T 4919359 missense_variant p.Cys58Phe
G/C 4919361 missense_variant p.Glu59Gln
G/T 4919414 missense_variant p.Gln76His
G/T 4919418 missense_variant p.Asp78Tyr
T/G 4919421 missense_variant p.Phe79Val
T/G 4919422 missense_variant p.Phe79Cys
T/G 4919430 missense_variant p.Trp82Gly
T/A 4919973 intron_variant
C/T 4920041 missense_variant p.His186Tyr
G/C 4920105 missense_variant p.Gly207Ala
A/G 4920107 missense_variant p.Arg208Gly
T/C 4920128 missense_variant p.Phe215Leu
A/G 4920161 intron_variant
A/G 4920192 intron_variant
A/G 4920207 splice_region_variant&intron_variant
G/C,* 4920218 missense_variant p.Trp221Cys
G/A 4920227 synonymous_variant p.Leu224Leu
G/T 4920240 missense_variant p.Val229Phe
G/A 4920251 synonymous_variant p.Leu232Leu
T/A,* 4920257 missense_variant p.His234Gln
C/T 4920263 synonymous_variant p.Asn236Asn
T/C 4920264 missense_variant p.Phe237Leu
A/G 4920268 missense_variant p.Asn238Ser
A/C 4920272 missense_variant p.Gln239His
A/C 4920286 missense_variant p.Tyr244Ser
G/A 4920288 missense_variant p.Ala245Thr
T/A,C 4920293 synonymous_variant p.Leu246Leu
T/G 4920321 missense_variant p.Tyr256Asp
A/G 4920327 missense_variant p.Ile258Val
C/A,G 4920330 missense_variant p.His259Asn
C/A 4920332 missense_variant p.His259Gln
T/C 4920335 synonymous_variant p.Ser260Ser
G/C 4920349 missense_variant p.Arg265Thr
T/C 4920359 splice_region_variant&synonymous_variant p.Tyr268Tyr
C/A 4920393 intron_variant
A/T 4920397 intron_variant
C/G,T 4920404 intron_variant
C/T,* 4920423 intron_variant
G/C 4920465 missense_variant p.Ser274Thr
A/C 4920477 missense_variant p.Asn278Thr
T/G 4920482 missense_variant p.Phe280Val
T/A 4920483 missense_variant p.Phe280Tyr
C/A 4920484 missense_variant p.Phe280Leu
T/A,C 4920488 missense_variant p.Tyr282Asn
G/A 4920492 missense_variant p.Gly283Glu
G/C 4920505 missense_variant p.Lys287Asn
T/A 4920507 missense_variant p.Val288Glu
T/C 4920511 synonymous_variant p.Ser289Ser
G/A 4920670 synonymous_variant p.Glu299Glu
A/G 4920678 missense_variant p.Lys302Arg
G/A 4920682 stop_gained p.Trp303*
G/A 4920704 missense_variant p.Asp311Asn
C/G 4920706 missense_variant p.Asp311Glu
T/C 4920708 missense_variant p.Leu312Ser
G/A 4920748 synonymous_variant p.Leu325Leu
C/T 4920784 synonymous_variant p.Ser337Ser
T/G,C 4920785 missense_variant p.Tyr338His
G/T 4920818 stop_gained&splice_region_variant p.Glu349*
C/T 4920830 intron_variant
C/A 4920850 intron_variant
T/A,* 4920862 intron_variant
G/C 4920919 intron_variant
C/T 4920939 intron_variant
A/C 4920951 intron_variant
A/C 4920953 intron_variant
C/G 4921002 intron_variant
A/G 4921025 intron_variant
T/C 4921088 intron_variant
T/C 4921194 intron_variant
G/A,T 4921196 intron_variant
G/T 4921197 intron_variant
A/T 4921198 intron_variant
C/G 4921209 intron_variant
G/A 4921229 intron_variant
T/C 4921233 intron_variant
G/T 4921236 intron_variant
A/C 4921245 intron_variant
A/T 4921288 intron_variant
T/C 4921743 intron_variant
A/G 4921749 intron_variant
T/A 4921755 intron_variant
A/T 4921762 intron_variant
T/A 4921775 intron_variant
A/G 4921794 intron_variant
T/C 4921889 intron_variant
A/G,* 4921975 intron_variant
G/A,* 4921976 intron_variant
T/G 4922007 intron_variant
G/A 4922019 intron_variant
G/T 4922712 intron_variant
C/T 4922723 intron_variant
C/T 4922763 synonymous_variant p.Thr357Thr
T/C 4922773 missense_variant p.Tyr361His
G/T 4922795 missense_variant p.Ser368Ile
T/A 4922796 missense_variant p.Ser368Arg
C/T 4922860 missense_variant p.His390Tyr
C/G 4922872 missense_variant p.Gln394Glu
G/A 4922876 missense_variant p.Gly395Glu
C/A 4922881 missense_variant p.Leu397Ile
C/T 4922888 missense_variant p.Thr399Ile
C/T 4922982 intron_variant
T/C 4923050 missense_variant p.Tyr413His
T/A,G 4923056 missense_variant p.Tyr415Asn
C/T 4923066 missense_variant p.Ser418Leu
G/A 4923072 missense_variant p.Arg420His
T/C 4923091 synonymous_variant p.Leu426Leu
G/C 4923100 synonymous_variant p.Leu429Leu
T/C 4923118 synonymous_variant p.Leu435Leu
T/G 4923230 intron_variant
G/A 4923400 intron_variant
G/T 4923665 intron_variant
C/T 4923696 intron_variant
A/T 4923901 intron_variant
A/G 4923915 intron_variant
A/T 4923928 intron_variant
A/T 4923935 intron_variant
G/A 4923980 intron_variant
T/A 4923982 intron_variant
A/C 4924056 intron_variant
T/G 4924082 intron_variant
A/C 4924085 intron_variant
C/G 4924097 intron_variant
G/A 4924145 intron_variant
A/C 4924156 intron_variant
T/A 4924166 intron_variant
G/A 4924172 intron_variant
A/T 4924194 intron_variant
T/C 4924205 intron_variant
G/C 4924209 intron_variant
G/A,T 4924214 intron_variant
C/T 4924215 intron_variant
G/T 4924270 intron_variant
C/G 4924285 intron_variant
G/C,A 4924293 intron_variant
A/G 4924295 intron_variant
G/T 4924584 intron_variant
A/T 4924588 intron_variant
C/T 4924927 intron_variant
T/C 4924945 intron_variant
T/C 4924946 intron_variant
G/A 4926339 intron_variant
A/G 4926366 intron_variant
C/T 4926487 intron_variant
T/C 4927693 intron_variant
A/C 4927711 intron_variant
A/G 4927725 intron_variant
A/T 4927727 intron_variant
C/T 4927728 intron_variant
C/T 4927750 intron_variant
C/A,G 4927767 intron_variant
C/G 4927770 intron_variant
G/A,* 4927786 intron_variant
C/A,T 4927788 intron_variant
T/A 4927794 intron_variant
T/A 4927803 intron_variant
G/T 4927815 splice_region_variant&intron_variant
A/G 4927823 synonymous_variant p.Leu454Leu
T/A 4927830 missense_variant p.Ser457Thr
C/T 4927831 missense_variant p.Ser457Leu
A/C 4927846 missense_variant p.Asn462Thr
T/C 4927874 synonymous_variant p.His471His
A/C 4927885 missense_variant p.Asn475Thr
G/T 4928009 intron_variant
A/G 4928325 intron_variant
C/T 4928358 intron_variant
C/T 4928364 splice_region_variant&intron_variant
T/C 4928380 synonymous_variant p.Leu533Leu
C/T 4928388 synonymous_variant p.Asn535Asn
T/C 4928409 synonymous_variant p.Asp542Asp
A/T 4928434 missense_variant p.Ile551Phe
T/C 4928782 synonymous_variant p.Ile621Ile
G/A 4928787 missense_variant p.Arg623Lys
T/C 4928794 synonymous_variant p.Asp625Asp
A/G 4928799 missense_variant p.Asn627Ser
A/G 4928813 missense_variant p.Thr632Ala
G/C 4928825 missense_variant p.Glu636Gln
A/T 4928827 missense_variant p.Glu636Asp
G/A 4928837 missense_variant p.Glu640Lys
A/C 4928838 missense_variant p.Glu640Ala
A/G 4928854 synonymous_variant p.Glu645Glu
G/C 4928855 missense_variant p.Val646Leu
T/C 4928858 missense_variant p.Ser647Pro
A/G 4928861 missense_variant p.Ile648Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15232.1
MKSVRVCFLIFLLLETICCEGCWKEEKQALLGLPLDDTFSWNFFPDSFISWNVDTDCCEWYGVFCNSSTGRVAQLQLDFVWWKSTEQYINYSDFSVFKDLKNLSLPVNNIVGCVGDAELPNLELLDMSVNKLDTAASIISCLDGLPSLKYLYLGYNRLNTPSLNHVFESVPKLRSNLKALDISENHLTNDILPYLEGFTSLKKLYLGRTELDSDFHFEGLWSTLRNLEVLDLSHNNFNQTDIGYALSGLSSLNSLYLIHSGLSWRSIYNISKLSSLENLFLYGNDLKVSESILWGSENETFKWPTNLQHLDLSENSLSNRFLLSLMGLPHLQFLDLSYNQLQGVLDISENETFKWPTNLQYLHLSSNSLSNEFLSSLKNLPHLQYLDLNHNQLQGALDTSENETFKWPTNLQYLYLSSNRLSNKSLSSLNDLPHLQYLDLSQNQLEGALDIRGLSTSSNLTNLYLRHNNIHNFVNHQGLKGLSGLDVLDLDWNMIDGNKLRESLRALSLSIRKLSISYNNFKGTILAEDFHDLSNLERLTLDGNNNMENEIFESIGNLTSLKALSLSYCDMNDTLPEADWSRMKKLEELYLIGNGFEGSLPNSFVNMTSLQILKLSQNNFIGRFDSNIATLTSLEEFGFEENQFEVSISFSSFANHSNLKVIRGKGNKIIVDSQHNLR


CDS Sequence:
>Vu_15232.1
ATGAAGAGTGTGAGAGTGTGTTTCCTCATTTTCCTTTTATTGGAAACAATTTGCTGTGAAGGATGTTGGAAAGAAGAGAAACAAGCACTTTTGGGTCTACCTTTAGATGATACTTTCTCATGGAACTTCTTCCCAGATTCTTTCATCTCTTGGAACGTCGACACAGATTGCTGTGAATGGTATGGAGTGTTCTGCAACTCCTCCACAGGGAGAGTGGCCCAACTCCAGCTTGACTTTGTCTGGTGGAAGTCAACAGAACAATATATTAATTACTCGGATTTTTCTGTCTTCAAAGATTTGAAGAACCTCTCCTTGCCAGTTAACAATATAGTTGGTTGTGTTGGGGATGCAGAGTTGCCAAATCTCGAACTCCTTGACATGTCTGTTAACAAGCTGGATACTGCTGCCAGTATTATATCTTGTTTGGATGGCCTTCCATCTCTTAAGTATCTTTATTTAGGATATAACAGGTTGAATACACCTTCATTAAACCACGTTTTTGAAAGTGTACCAAAGCTGCGTAGTAATCTGAAGGCCCTTGACATAAGTGAGAACCATTTGACTAATGACATCTTGCCATATCTGGAGGGATTCACATCTTTAAAGAAACTTTATTTGGGTAGAACTGAATTGGACTCGGATTTTCACTTTGAAGGTTTATGGTCAACATTGAGGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCCCATAACAACTTCAACCAAACTGATATTGGCTATGCTCTTAGTGGACTCTCATCCCTCAACTCTTTATATTTAATACACAGTGGATTGAGTTGGAGATCAATTTATAATATATCAAAATTGAGTTCTTTGGAGAACCTTTTCTTATATGGGAACGACTTGAAGGTGTCTGAAAGTATATTGTGGGGTTCAGAGAATGAGACATTTAAATGGCCAACCAATTTACAACATCTAGACTTGAGTGAAAACAGTTTGAGTAACAGATTTCTTTTATCTCTGATGGGCCTTCCACATCTCCAGTTTCTTGATTTAAGCTACAATCAATTACAAGGAGTGCTAGATATAAGCGAGAATGAGACATTTAAATGGCCAACCAATTTACAATATCTACACTTGAGTTCAAACAGTTTGAGCAACGAATTTCTTTCATCTTTGAAGAACCTTCCACATCTCCAATATCTTGATTTAAACCACAATCAATTACAAGGAGCGCTAGATACAAGCGAGAATGAGACATTTAAATGGCCAACCAATTTACAATATCTATACTTGAGTTCAAACCGTTTGAGCAACAAATCTCTTTCATCTCTGAATGACCTTCCACATCTTCAATATCTTGATTTAAGTCAAAATCAATTAGAAGGAGCACTAGATATAAGAGGATTATCAACTTCATCCAATTTGACGAATCTTTATCTACGCCATAATAATATCCATAATTTTGTTAACCATCAAGGCTTAAAAGGTCTCAGTGGATTGGATGTCCTTGATTTAGATTGGAATATGATAGATGGAAACAAACTAAGAGAGTCATTACGAGCTTTATCATTATCCATTAGAAAGCTTTCTATATCTTACAATAACTTCAAAGGAACAATTTTAGCTGAAGATTTTCATGATTTAAGTAACCTAGAACGTTTGACATTGGATGGAAATAATAACATGGAGAATGAAATTTTTGAAAGTATTGGAAACTTGACATCCTTGAAAGCTTTGTCTCTTTCATACTGTGATATGAATGACACGCTTCCTGAAGCTGATTGGTCTAGGATGAAGAAGTTAGAAGAATTATATCTAATAGGCAATGGATTTGAAGGATCTCTTCCCAATTCTTTTGTTAACATGACATCTCTTCAGATATTGAAACTTTCTCAAAATAACTTCATTGGAAGGTTTGATTCTAACATTGCAACACTTACATCACTTGAAGAATTTGGTTTTGAAGAAAACCAATTTGAAGTTTCTATTTCTTTTTCGTCATTTGCCAATCATTCAAACCTTAAAGTCATTCGGGGTAAAGGCAATAAAATCATAGTGGACTCACAGCATAATTTGCGC


Promoter Sequence:
>Vu_15232::LG4:4917177-4919177(+)
TAGAGATATTGATCAGTCAGAAGTGTAGTCATCTCTATCATAAATCTATTGGTGGTTTCTGATTGTCAAACACAAGATAAAAAATCAAAAAGTTTGAGAGAATGACAAAAAATGTTTATAAAAGATTTTAAAGAGACAGTAACTCTTGTAAGATGAAACTCGTTCAATAAAAACTTTCATTTATAATATAAATATTATTAATAAAATAGTTGAGTGTCAAATATTGCTACTATTCTTTGTTATTTTCTAGATCCTTACATAATTAAATAAATAAATAAATTATCTTACAATTAAATTTTATGATAAAATAAATATTGTTAAATATATAAACTATATTTTAAATTTAATAATTTATATTAATGTAATTTCTTATAGTTATATTATAATTATTGAGACATGTCCATGTCTATCTTGGATTGAAGTTGGTGGTGGATGAAGTCAAGTCATCGTTTTTTTTTTCTTCGTCTTTGTATGTTTTAACTATTAATATTTATTTTAATTAAATACAATCGGTAATCAACAAACATTTAAATTGTTTGCTTTATATTACGATTAAAAGCAATGATAAACCTATTTTTTTTTTTAAATATGAGTTGTATTTTAGATTTCTAAACAAGATTTCATATTATGAAAATTTATTTTATTAATTATAACACAATTATTGAGTTATGTTTATCTTGAATTCTATTTGAAGATGATTGTGACTTTTGGTTGGATAAGTCACCCTTTGGGTGGACTAAATAATAAACGATACTTTAGTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATACATATTTGTCTTATATAATTAAAATTAAAATTAAATAAATAATACTTAATTGAATAATATAAATTATACTATGTTTAAATTTATGATAACCTAATAGTTTTAAGTGTATAAATTATATTTTCAATTTATAATAAATAATCTATATTGATATGACTTTACTTTTAATTGTAGAATAATTGTAGACGTATGTGTATTTTGGGTTTCACTTGGTGTTGGTTTTGGCTTATTAGTTGACGTGAAATCAATTTTGTTTTAATGTTTTTAAGTCTTTATATGTTTAATTAATAATTATTTATCATAATTAAAATTAATAATAAATAATTACCTTTTGTTTACAAAAACGTATTATAAATTTATGAAGGATAATTATTAAATATATAAATTATATTTATTTTAACATTTATAAGTAATTTAAATAGTGTAAATTTATTTTTAATTATAACATAATTATTGAGAAATGTATGTTTTAAATTCATCTCCACCTTTGGATTGAGCTCAAGTGATCATCTATAAAAAAAGTGTTTCTCTTTCTATTGTGTAATTATTTTTATTTTATTTTAATCTTTTAGTAATGTTTTTTAAAATTCATATAATTAATAATAATAAAATAATTACTTATATTTATATTTTTATCCTAACAACCTTTTTAAAATTTAAATAATTATTCATAATGATAAAATTATTTACGCAATAAAATAGTTATCTATAAATAAATTATAAAAATTAATCACTTTTATAATTATCTTTTATAAATATTATTTTATAATTTATTGATGCTTTTATTTTAATAAATAAAAATTATTTTATAATTTAATAAATTGGAAAACTATAAAATTAAAAAGTATCAAAGTAAATCTGGTGGAATAAACAATCCTTAAAATTTTCTCGTTCAAATAAGCATTATAATTCATATATTAAAAAAACAGAATGAATGTATTTTCATTAGTTTTTTTTAAGCCGTCTCTTGTTTTTTTATTTTTATAAAAATGAATTAAATCGGTTTCGTGCTCTAAAAATTAAAAAGTCACTTAGCAAAACTTACACATGGACTTTCTAATTAAAATTGAAAGTATAGATGCATTGGAACATAAAGTATGTATAGGTGATGCTTTCCTATTTAAGAGACAGAGAAGTTGTTGATTCAATGA


Gene Sequence:
>Vu_15232(+)
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