Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15143 LG4 1633302 1637942 PREDICTED: U-box domain-containing protein 52-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 1635388 downstream_gene_variant
G/A 1635422 downstream_gene_variant
G/C 1635441 downstream_gene_variant
G/T 1636626 downstream_gene_variant
T/A 1636724 downstream_gene_variant
C/T 1637318 stop_gained p.Gln637*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15143.1
MWLPKHRSDKKDGVSGLVAVAIDKKKESQSALKWAVDNLLTRSATVILIHVKLLAPTLSPSPSLFAPRISSFLGDDTSVVSKEHEGQNRSVFLPYRVFCTRKDIQCKDVLLEDSEVPRAIIEYASQTGVEHLVLGSSAKTSFLKRFKVSDIPGEIAKGAPDFCTVYVIAKGKIQTMRSATRPAPAIFSNQVCQINNGRSNLSEPNVYSSRSIREQETYSFDAGSQYDETFRSPFTRKRYNGRQYGDTPNLDTDISFVSSGRRSTERLIPSLNLDTGISNSRLSYSSDIDANFSFESASYRRKSTEMGSPLELSSFSFESDKQSSCSSQTADDMEAEMRRLKLELKQTMKMYNTACKEALTAQQKAVELQRWKMEEERRLEEARLAEEAALAIAEKEKAKSKAAIEAAEAQKRIAELEAQKRLSAEMKALKESEEKRKVLESLVNVDVRYRKYTIEEIEEATNFFSESLKIGEGGYGPVFKCLLDHTPVAVKVLRPDAQQGRSQFQREVEVLSCIRHPHMVLLLGACPEYGCLVYEYMANGSLEDRLFRQGNTPPLPWQLRFKIAAEIGTGLLFLHQTKPEPLVHRDLKPANILLDRNFVSKISDVGLARLVPPSVADSVTQYHMTSAAGTFCYIDPEYQQTGMLGVKSDIYSLGIIFLQILTAKSPMGLTHHVARAIEKGTLSEMLDPSLSDWPQEEALTFAKLGVQCAELRRRDRPDLGKVVLPELDRLRNLAEDTDLISALGNPTNMPRDRHVSAVLEGDCPPFPNPVSGEIRANNSVTF*


CDS Sequence:
>Vu_15143.1
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Promoter Sequence:
>Vu_15143::LG4:1631302-1633302(+)
GGATGTCAAGCATGAACATGTGCTGAAATTGGATATGGCCAAAGCATATGTATGTGATTCCTGTAGAAAGCAAGGGAAGTTCTGGACATTTTCTTGTGATGTTTGTGACTATGACCTGCATCCAAGTTGTCTAGAAAAGGCCAACTAGAACTACAGCTTATAGAGCATAGAAAAACGTAAGTTTGGAACAATTATGGTTGTTTCTGTCGTGATGGAAAGAATGTTGTAATACCTAAGAAATTTGAACACTGAATATATTTTCATTCTTATCAGTACGTTGACAAAACCTGCCATTTGAAATTAAGAGTGATTTAAATCAGATTAGTTTTGTAAGTAAGATAAAGTTCTGAATAGAATTACTAAGTTTAAGAAAGTGTGGGCAACTGTTTACAGAATGTACTGCTTTTACTTGCAGGTTGTCTGTATCATGATTTTGATACAACTTTATACATACCCTGTTGGTGAAAAACAAATGTAAAAATAATCAAATATTCTGTTCAATACTCCGACTCTTAATTTTTATTTATGACTTTTAATATGATAATAATGACTGTAATTATTCATCAATATAATATATATTAACATAATTATAAGTTATAGGTTATTTTTATATGTATTTTTTTTACGTCCCTTTTGTATTTAAATATATAATCAATGTAAAACACATAATTCAATACTTTTTTTTTATCTTCTTGGAAGTGAAAATGTGTGCAGGTATTCAAGTTAATTAGAATGTATTCAAAGTGTTGATGACTCATACAGTTAGTTATTCATACAAAGATGTCAATATGCTTTTTGTGTAATCCACTCCAAGGAAAAAAAATCAGGTTAAACAACCATATTATCAATATAATTTAAACTTTTTTCTTATTTTTAATTATATCAAATAGGATTTAATTCATTTTCATTTTTTTTCTAATTTTTCTCATGTTTTGGTTCTTATTAAAATCTATTTTATTTTAGTCACTGATATTATGTTTCAGTTCTTACTAAAGCACAACTTTTTTTATATAGATCTCTTTTCCATCAGAAAGTTTTCATCTTAGTCTGATATTTAAGAAATATCAGGATCTATTGTCAATCAAAAAGGCATGGCATGTCATCATTTAGAGGGACAAGGATTAAAATAAAAATATAAAAACTAAAAATTATTAAAGTTTGAATAAAATAATAGACATGAATTGAGAACATTAAGCAATGTAGAGTTATATTTTACTTTATAAAAGTAATAGTAAGAGGACAAAACTAACAAATAAAAATATATAAACATAGTGAATCTAGATCAAATAACTTTATATTTGTAATTTCTTTACTGATTTAAATAAACTAAATCCACCATAGTGAAACATTAATGATAAAATTTAGATGTCAGTTTACGTTTTTTATAACCATTTAATTCCCTTCTGTGTTTGTACGATGACATTAAAATATGATTAATGGGAGCTGTTACTGACTATATATGATTTAGTAAGCAGATTTCATTCCCAAAAGGACGAAGTCAAAGTTAACCCGCAAATTTTGGTCATTCTTTGATGGGATAAACAACATCACAGAATAGAACAATGTGTGTGGTTCTTACATCTTAGAAAAAGAAGCCTAAAATAGTTAAATAAATCCCAGATTGGCTGCTACAGACATACAAGGGATCGGTTAGTTATTACTATTCTTTTTGTCGTTTAAGGTTTTGAACATCAAAAGAGAATCAGGAACAACAATCTAACAAAGTAAACGAATTAAACAAATGCCTCAAGTCCTATGTTATTCAAGAGTATCATGTGATCCTATATATTTTTCATCAAAGCAAGTTGAGGAATTTCTGGGTGCAACTTAACCAAACCAACCACAGATTAGGAAACATCATCAAAAGGCTTAAAAGGAAGGATCTTTAGATGATGCCTTTGAAAGGAAGAGAAGAAAAGACATTTTGGCCTTGAGGGTCCCTTTAGTTTGGTATTTGGCTGATTGAAGGAGCAGAATAAGATTGCAGTGAAAGAAAGTAA


Gene Sequence:
>Vu_15143(+)
ATGTGGTTGCCAAAGCATCGATCAGATAAAAAGGATGGTGTGAGTGGATTAGTAGCAGTGGCAATTGATAAAAAGAAAGAGAGCCAATCTGCACTCAAATGGGCAGTTGACAATCTCCTCACCAGAAGTGCAACAGTAATTCTCATCCATGTCAAGCTTCTCGCACCAACCCTCTCTCCATCACCTTCTCTTTTCGCCCCTAGTAAGTACCCTACAATGGAATTGCCATTGCTATTAACCATAGCTTCAAACATCATTGTCTCTGCACAACATTTCTGCATGTTCAGTGATTGGTTTTTGTTGAGTAAATTTTGGAAAAACAGATTTTCTTCTTCACTGGTAAATAATCTAGTACATAGCACAATTTATTTCAATTTGAATGAGTTTTATGACAGTTAATGTCACTTTTTTTTCATAAAAGTAAAATTAAACAGATCTCAATTTCTATTATGAATTTATGAAAGTTTAGAGTAACGTGTGAAATACACACACATATATGTGTGTGTGCAAAGGAAAGTTTTTCAGCAGCAATGGGAACAATGGCGACATGATTGATTCCTCGTTTGGTTTATTACCTTGGCAGGGATAAGTTCTTTCCTGGGTGATGATACTTCAGTGGTAAGCAAAGAACACGAAGGCCAAAACAGAAGTGTTTTCCTCCCATATCGTGTCTTCTGTACAAGAAAAGATGTGAGTTGTTTTTCCTTTCAAGATGAATGTTTCTGGAAATGAAAGCAGCTATCTTGCTGATGGTGTTCATCTTAGAATTCTTATAATCTCTTTTGTTTTGTTTCTTGGTGTGGTGTGGTGGATGGGCCATAGATTCAATGCAAGGATGTCCTACTAGAAGATTCAGAAGTACCCAGAGCTATAATTGAATATGCTTCTCAGACAGGAGTTGAGCATCTGGTTCTTGGCTCTTCAGCAAAAACTAGTTTTCTCAAGTATGCTACTTTCTAACTCACGTTGTCATCTTGCAAATTTTACATCAAGTTTCTGGTCATCTTCCTTTCATTCAGATAAAACACGATATAGTCAAAATGCAGAGTTTGGAAATGTGATTACAATTGCTTAAGACTTATCCTGTCTAGCGTAGAGTCACTTGCCCTTGTGAATACGTATTGTTAAAATAGAAACCTGAAGCTCTCGCTTGGATGTGTCAGTATGTATTCGATTTCTTAAAGAATGTTTTTTTCTCATCAGAAGATTCAAGGTGTCAGATATTCCAGGAGAAATTGCAAAAGGGGCGCCAGATTTCTGTACTGTCTATGTTATTGCGAAAGGAAAGATTCAAACTATGCGATCTGCTACTCGTCCTGCACCTGCCATTTTCTCTAACCAGGTCTGTCAAATTAACAATGGCAGGTCAAACCTTTCAGAGCCAAATGTGTACTCATCTCGAAGCATAAGAGGTTAGATTCATCCTTTCAAGAACCACACATCTATGTCCCTAAACATATTGTGAAATGTGCTGCTCACTGAAAAAGTTGGTTTCTATCAGAGCAAGAAACGTATTCCTTTGATGCTGGATCACAGTATGATGAAACATTCAGGTCAGTGACATTACATAATACATACTACTTAGCATTTGTTTTAGCATATGAAGACTAAATCTATTGGAAACAGGTCACCATTTACTAGGAAACGTTACAATGGCAGACAATATGGGGACACTCCCAATTTAGATACGGACATATCCTTTGTAAGCTCTGGAAGGAGAAGCACAGAACGTTTGATCCCTTCATTGAACTTAGATACAGGAATATCCAACAGTCGGCTATCATATAGCTCAGACATAGATGCAAACTTCAGCTTTGAGTCAGCGTCTTATCGAAGGAAGTCTACGGAAATGGGCTCTCCTCTTGAATTATCATCATTCTCATTTGAGAGTGATAAGCAATCATCTTGTTCGTCACAAACAGCGGTAAGGAAAGTTCGCAGTGCTGTAGAGATCTGTTTGGTCTGAGAAAACAGTTTTCTTATGTTTTATTACTTACTAAAAAGAATCTCATCTTGTTTTCACTTTGTTTAGTTAAAACTGGATTTTTGTTTTTATTGTGTAAGTCTTTGAAAATGGAAAAACAGGTAAAGTAAGTAGTATCTTTGTAGTTATTTACAAAGCCAGATTCTCATAGCAAAGGTATCCTGCATTTGTATTTTTTGGCTTGCTTGAACATGTTATAACAGTTCCTGCACTGATAAGGAGTTGAAGAGAATTCCATAGTTTAGGCCCATTTTTGTAAAAAAGAATAAGATTTTTTAAATTGTTGAAGTTGTGGCAATTGTAGGATGACATGGAAGCTGAAATGAGAAGATTGAAGTTGGAGCTGAAGCAGACCATGAAAATGTATAACACGGCTTGTAAAGAAGCACTCACAGCACAACAGAAGGTGTGAATATATATTGTGTATATATATATATATATATATGGTTTGTGTTTAGAATTTATTTTTCATGCACTGGTTATCATAACATTAACCAATTAGAAATCACTTGATGTATACAGTCTTACTAGAACATGAGAATCTATGGATGAATGACAGTGTAAAAAATCTTTACATGAGTACTTTTGAATTATATAATTGTGTTTTTCCCTGGAAAAGTTCAATAATGTGTGATTAATGGCATGCATGGTTGACAGGCAGTGGAACTTCAGCGGTGGAAAATGGAGGAAGAGAGGAGATTGGAAGAAGCGAGGCTGGCTGAGGAAGCAGCACTGGCAATTGCAGAAAAGGAGAAAGCCAAGTCTAAAGCAGCCATTGAGGCTGCCGAAGCACAAAAAAGGATTGCAGAACTGGAGGCACAGAAGAGACTCAGTGCAGAAATGAAAGCACTTAAAGAATCAGAAGAGAAAAGAAAAGTGCTTGAATCTTTGGTAAATGTAGATGTCAGGTATAGAAAATACACTATTGAGGAGATTGAAGAAGCAACAAATTTTTTTTCTGAATCCCTTAAAATTGGAGAAGGAGGATATGGTCCTGTTTTCAAGTGCCTTTTGGATCACACCCCTGTTGCAGTCAAGGTTCTACGCCCTGATGCACAACAAGGAAGATCACAGTTTCAGCGAGAGGTAAGCAAGCATAGAAACAAAACACTACATTTGAACACAACAAATTCAACTCAATGATCAGAGATTTTGCTTTCTTTAGGTTTTACTTGGTTTCAGAAAATGTTCTATATTTTCATTTTTGTTTTTGCAAGACATCTTTGTTTTCAACTTTTAAAGATTTGCATACAGTGTAAAACTTTTAAGCTAACAAACAATCAAAATCATCCTCTATTTGACTTGTAACTCATTCCTTACAAAATTCAATCATCAAACAAGGCAATTTATGAGTGGATGAGAGTTTTGTTTTATCGATAATGTTACTTGTTAGTATTTGTTAGTAGGGAGAGTTAACCGACAACCTTTTCCACTTCTCTTCCAAACCTGTCAAACCAGTCTTATATTTTCCAAGTATTAGTAGCAAGAGTTGAAACCACAACCTCTCTCACTTTCCTTTCCAATTTTACCACTAAGTCAATCTTATATCTCCTGGATTACAGGTTAAACTATACATATTTTTGTTATTATATGTGAAAACAAAGCTATTTCTTAAACCATGTAATGCACATTACAGGTTGAGGTATTGAGCTGCATACGGCATCCACACATGGTTCTACTCCTAGGAGCATGTCCAGAATATGGATGTCTAGTGTATGAGTATATGGCAAATGGTAGCTTGGAAGATCGCCTCTTTCGACAAGGCAACACTCCCCCACTGCCTTGGCAGCTAAGATTCAAGATAGCAGCTGAGATTGGCACAGGCTTGCTGTTCCTGCACCAGACAAAACCAGAACCTCTGGTGCACAGGGACTTGAAACCAGCCAACATCTTGCTTGACAGAAACTTTGTGTCCAAAATCAGTGATGTAGGTTTGGCCAGGCTAGTTCCACCATCTGTGGCAGACTCTGTCACGCAGTATCACATGACATCCGCAGCCGGAACCTTCTGCTACATAGATCCTGAGTACCAGCAGACAGGAATGTTAGGAGTGAAATCAGACATATACTCCCTTGGGATAATCTTTTTACAAATTTTAACAGCAAAATCACCTATGGGTTTGACCCATCATGTTGCAAGGGCCATTGAGAAAGGAACTTTATCTGAGATGTTGGATCCATCACTCTCTGATTGGCCACAAGAGGAGGCCTTGACGTTTGCTAAGTTGGGAGTGCAGTGTGCTGAATTAAGGCGCAGAGACAGACCCGATCTTGGCAAGGTTGTCCTACCAGAACTCGACAGACTCAGAAACCTTGCTGAAGATACTGACCTTATTTCAGCTTTGGGTAACCCTACGAATATGCCCCGAGACAGACATGTTTCAGCTGTACTGGTAAGTTTCTCTGTTTTTATCATACAAGTAAGTTAATACTAAAACAAAGCACACATAAAAACTAAGTTGTTGAACTCATAATTAACCAAGAATCAAGAATGTGAAATGGGAAAGTTACCTCTTCTTGTGAAGAGGATGTTACATATGCATCATGCTAACATGAAAAGTTGTGCCTGCTTTTTTATTTTGCCAGGAAGGAGATTGTCCTCCATTTCCTAACCCTGTCTCAGGGGAAATTAGAGCTAACAATTCAGTGACTTTCTGA