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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15130 LG4 1533340 1537021 PREDICTED: basic leucine zipper 9-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 1535991 intron_variant
T/A 1536025 intron_variant
C/A 1536072 intron_variant
G/A 1536146 intron_variant
T/A 1536260 intron_variant
C/T 1536264 intron_variant
A/T 1536269 intron_variant
A/T 1536273 intron_variant
T/A 1536409 intron_variant
G/C 1536434 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15130.1
MEWVPSHGVLSICNCAVCVHSFASQSCVFATVGSPVSANKPEGWKNHTKGATSGSSEPSDEDGPCEQSTNSVELKRLRRKVSNRNSARRSRRRKQAQLADLELQVEKLKVENATLYKQFNDASQHFHEADTDNRVLKSDVEALRAKVKLAEDMVTRGSFTTLNNQLLPTQCQVNTPPPLNTTNLRRMAHVSPTITVHGNDGSYNDATVCVQNSDLGNLDMNFNDMNNVNGVMSDGMSCGSIWPPF*


CDS Sequence:
>Vu_15130.1
ATGGAATGGGTCCCATCCCATGGTGTTCTTTCTATTTGCAACTGCGCTGTGTGCGTCCACAGTTTCGCAAGCCAATCGTGTGTCTTTGCCACTGTTGGTAGTCCAGTGTCAGCTAATAAACCAGAGGGCTGGAAGAATCATACGAAAGGAGCCACAAGTGGTTCTTCTGAGCCATCTGATGAAGATGGTCCTTGTGAACAGAGCACAAATTCAGTTGAATTGAAACGTCTTAGAAGGAAGGTTTCTAATCGCAATTCTGCCAGAAGGTCAAGAAGAAGAAAACAGGCGCAGTTGGCTGACCTAGAGTTGCAGGTTGAAAAACTGAAAGTGGAAAACGCAACCCTATACAAGCAGTTCAATGATGCCAGTCAACATTTTCATGAGGCTGACACGGATAACCGGGTGCTGAAATCAGACGTAGAAGCTTTGAGAGCTAAGGTGAAGTTAGCAGAGGACATGGTGACTAGAGGCTCTTTCACTACGTTAAACAATCAGCTTCTTCCCACACAGTGTCAAGTGAACACACCCCCGCCACTGAATACGACCAATCTCCGCCGCATGGCGCATGTTTCGCCAACCATCACTGTGCATGGAAATGATGGCTCATACAACGATGCCACAGTTTGTGTACAGAATTCAGACCTTGGAAACTTGGACATGAATTTCAACGACATGAACAATGTGAACGGAGTTATGAGCGATGGCATGAGTTGTGGGAGTATTTGGCCACCTTTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_15130::LG4:1537021-1539021(-)
AGAAAAGTTGGTTTACCACATATTTAACTTTTCATACTTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAATATTGGGTGTGTGTGCATTTCCCTTTCTACTCTCTGTTTTGGACAAGAGTAGGTGCAAATAACATAACATTTCTCCTTTCGCCATTTTCACAGAATGAAATTCCCTCGCCACTTGTTGCTCATCAAAGTCAAACCGCCCTCAACAAGTTATCCATAATTCTACAAAACTACAAACTTTTCATTATTACTTAATCAAACATCCAAAATAAATTATTCTTATTTTATATTATTTATTTTTAAAATAAAATAAAAAACTACACTTATTTCTATATATTATTATGAAAATACTTTATCAAAAGATATGACGTAACCATTAATTTATTTAAGAATTTCTTACTTATATATAATGTGAAACAGAACAACATCCAAAGCGTGCCATTATTATTCTTTACAAAACTATTCCTCCCCTACCCTACTCTACCCTATGCCCTTTATTCCACCTCTGTTCAAAACTATTTTCAGCATGTATTTTAATTAATTTTATAAAAATGGAATATATAATAGTTTTATAAATACCATGATTTCTTTAAACAGTTGAAAATAATATTTATAATATTAATATTGCAAGAGAAAAGTATACGACGACAAAATTAATGAATTTATCAATCATATTTTAATTGTTTTATAACATAATATTATAATCCTGAAGGGGGACCCAATTCTAAATGCATTGTACAAAGGAGAAATAGAAGTTAGTCCCACGTGTAATTTTCACTTTGCCACGTGTCAATATGAGGGCTTCTTGATTCAAGATAGTCGGTTCAGATTTGATTCTAGAAAAATCCCAGTCACGGTCGGAACACGTAATTATACGTGACGGATCAGGTCACTTTCGTGATTTCAATGACCAAAAAAACTTTCTGGTTTGTTTCAATGTCAAGTGCCGCCCGATCTTTCTTTCTTTCTTATTTTTTTAATAAAAGTTTATTTGTTTATGCGCATTGGTTTTCTATTTATACCCCTGAAGCTGCTACTCTCATTCCCTTTTCCCTCCTAATTCTCTCTCCTACTGTTAACGCTCTCTCTCCGGCCACGTTCTGGCTGCGTCTCAACAATCTCTCACGCCGTCGTCGGTTTTCTCCGGCCACGGCTGCTTCAAGCGGATGACGACCACGGAGTCCGATCTCGATAACGACTTTTCTAATCTCGACGAGCTCCGGTATCTGAACCTCGCCGGAACCGATGTCTTCGCCGCTTTCCAAAATCTATTACCGGTCAGTCTTCTCTTTCTCTTTCACACTCAATTCTGAAACTGAAAACGCCTTCGAGCCATCTTTTGCCGTGGCAAACTGAAAACCTATTACGGTTCTCCCTAGAACGTAATCCGCGTGCGCCTAACGCTTCCTTAACAGTAATAACAGAAAGAGTAAACGATTCCATAAAAACAAAATAATAATAATTATGCGTTTCTGTTTTAGGCAAGACTTGTATTGTGATCGAGATTTGTTTAATTAAATTTGTCTTGTAGTTCAATTCATTATAGTTTGTCAGCGTAGAAATCTTGAGGAGAAGAGTGATTTAGTATGAACAAAATGCTATACTTATAGAAAGAAGATATATAATAAGAGAAATATTTCTAAAGATGTTTAGAGAAATACTGTTGTGGCTGGCACTAATTATTGTGAAGTGATTTTTGAAGGTGAAAGGAAAGTTACTTTCTCCAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAACCGTGAGAGGTATGAGTGCGTGAGTGAAGGTGGAGGAGTGAAGGTGTTCGTGGAGAAGACATGGTGATGTGGACTGCTTCGTTCTTGGGTTTTGTTGAGAACTTGTGTGAACGCAGGACTTTGAGAAATCTACGATAGTGCGCTTCCTTTTTTAATATTGTTTTTTGTCTTTCTTCCT


Gene Sequence:
>Vu_15130(-)
ATGGAATGGGTCCCATCCCATGGTGTTCTTTCTATTTGCAACTGCGCTGTGTGCGTCCACAGTTTCGCAAGCCAATCGTGTGTCTTTGCCACTGGTCATTATAAATTTATTTTGTACAATAATTTCACCTGTCTAATCGTGTATCATATGAGGCAAATTTTAATTGAGTAATTAGAATTTTGAAAAATAATTATGTATCTTCTTTTGCTTGTCAATTATATTTTCATGAACATTTTAAAAAAATAGCAGAAATGATTGAAAAGTTGTATGTTGTAACCTATTATATAGAGTTGTAGCTCACTTCAATGATTAGTGTTACAATAGCGGCCACGACTTTCCTCAATGCATCAATAAAAAAATTCTATTATTATTGGGTAATATTGTTTCGTGCGTGATTGTATTTGTATAATAGTTTTTACTTAAGAGAGTGTAACTAAGAATAAACAATTACTGTATGAAAATTATTGAAAGTATTATTTATTATAAGATAATGTAGTTCTGTTGTTTTTTCTAGTAGTTTTACCTCCGCCAGCAGATTAACAAAAAACACTGTGGAAAAGCTTTCTATAAAGTGACGAGGCAATTACCAAAAACAAATGTACCATAAAAGTGAGAAAGCAAACAACAGCAATAACACGAAACTGTTTTTAATCCAAATGCGGTAGGTAGTTTTCATGGTTTAAAATTAATATATGCCTAGTTTTTTAAATATTTGTTGTCTATTCAAGTGGACTGTCAGGAAAATTGTTCGGTTGATGAATAATGTTTTACAATTACGTAAAGAAAAACCCTTGCTTTTCTTTCTTAACTTTTTGTTTCTTCATTATGCGTTGCGTATATATGTACAAATATTACATTAAAATTATATGCTAAACCTTTTAGATGTTTGCAATAGCTTCTCAACTCTCTTTTTTTCTGGAAACTTTTTTTCATTATTTAATATCAATACGATGATATCAACTTATTCTATGATTAAAAGCTTCTACCATTGGCCTAAATTTGCGCATCGCGCCATGAAGTATTTCACAATCACTAAATTCTAAAGAATTTAAATCCTCGGGTTACGAGTCAGTGGTAAATAGTTATTTTTTGTGAAAGTAGCAAATAGGAATAACACGATCAATTACTCTATGTTTGGTTGGTGTATAAGCCTTCATATGTTTCTATTTTGATGGATATATACTTGCAAAAAAAAAAATTCTACATTTCAATATATGTACTTAAAGAAATATGTTAAGTAAAAATGTTTGACCCTGGTATGAATACATTATTTTATTATGTAATGATTTTAAATTGATAACATAAATAGAACCATTAAACAAGAAATTAATATATACAAAAATATGCTATACATAAAAATAAACAGTTACCGTAACTTTGCATAAAAATTAATTAAAAAATGTTTAGGAAGTTGGGTTTAGTCAACGACCCATTAACCTAATTCAGCTAAATTTAATTATTTTAAGTTTTAACAAAATTTTCAGATTTGTCGGAGTAAAACTCAATTAAGTCTATAATGATCCTTGGTTCATGGAGCAATTGGAGGAATTCGTCAAGTTTTGTTCGATTAAAACCCAACTAAGTTGAGTAGCAAGTACAAAAGTTAAAGTGTTGTGTCGACCTAATTTGAAAAACTAACCCTATATTTTAGAGTCTATATTAGATCTAAAGGTTAGGAACAGAATTTCAAGGTTGAATATTTAATTGCTGTTCTTATATAGTGGAAATTGTCAATTTTAAATAAATGCATTGAAAAAATTATGTTTGAATTATTTTTTTCAATTCTTATGAAATTTATCCTGAGGAAAGAAAATTAATTTAAATTTAATCAATTAAACCTGTTTACAAATTCCAAAAGCATTAAACTAAAAAAATCACTAATAATTAAATGAAACACTTTCTCCTTTTTATTAATAGAATGGCGTCACTATTTTCTTCAAAAACACGAGTACAATGATTTTTTTTATAAAGCTTTGATATTATTGCCTCTATCTCAGTGGACCCGGTTTGAAGCTTGTGAATTATTGGAATATTGCTTTGTTATTTCCCTGTGGCTTATTTTTGGTGCATGTGCTCCATTGCTGTTTTGCATGTAAAGAAGAAAAAGAATAAAAAAAAAAGAGTCTGCAAGGACATTGTGATAAAAAAGGGAAAAAGATAGTTTTAGTGGCTAAAATGATGTACGAAAATTCAGCTAGCTTAACCATACTCGTCTGTAATATTGCAGGATGCCATGACTTCATTTTCAACTTGTGGACTGACAGATCCTTTTTCTTCCCAAAACCTCACTCCCAAGCATTCCACCATCACTGCTACAATCGATTCTCGGTCTTCCATTTGTGGCACTGCTAATGGTATGAGCACTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGTTAATCCTTAACTCAATATTATAGTAATATTATGTTTACAACATTTTGTTGTTTATCTCTATTGTATATCATTCATCAGATATCATAATTATAGGCAGAACTGCACACAAAAAAAATGTTGTATAAATTATTGCATTCATTATTCTATGTCTCTTATTCCTCACCAAATTATCATTTAATTATGGAATTTAACATTTTGGATTGAATTAAAAACTGGGCAGTTGGTAGTCCAGTGTCAGCTAATAAACCAGAGGGCTGGAAGAATCATACGAAAGGAGCCACAAGTGGTTCTTCTGAGCCATCTGATGAAGATGGTCCTTGTGAACAGAGCACAAATTCAGTTGAATTGAAACGTCTTAGAAGGTAAGTCAAATTATGAAAACTACACTTTATTTAGATGAAAGTCCTCACCAGAGAAGAAAATAAATAAATGGAATTTTATTTAAAAAGTATAACCGATCATACTTTTTCCCCTCCATTCTAAGTGTCAATGGAAAAAATCATCTTAAATAGTATCTTCGATGATTTTAAGCCTCACTGAGATTCTAAATTTCGTTGTAATTTTAGGAAGGTTTCTAATCGCAATTCTGCCAGAAGGTCAAGAAGAAGAAAACAGGCGCAGTTGGCTGACCTAGAGTTGCAGGTATTTGATAAGTCTTTAACAAGGGAAAAGTAGTAATGATGTGAAAATTCCCATATCAATATTAATTTTGTTTTGACAGGTTGAAAAACTGAAAGTGGAAAACGCAACCCTATACAAGCAGTTCAATGATGCCAGTCAACATTTTCATGAGGCTGACACGGATAACCGGGTGCTGAAATCAGACGTAGAAGCTTTGAGAGCTAAGGTATTATTAGGTTGACGAAAGCTTAATAATAACCTATAGTTTTTTCATTCAAGGTTGAAGGAAAATATGCTAATAGAATCTGACATCTTTGTACACTTGTAGGTGAAGTTAGCAGAGGACATGGTGACTAGAGGCTCTTTCACTACGTTAAACAATCAGCTTCTTCCCACACAGTGTCAAGTGAACACACCCCCGCCACTGAATACGACCAATCTCCGCCGCATGGCGCATGTTTCGCCAACCATCACTGTGCATGGAAATGATGGCTCATACAACGATGCCACAGTTTGTGTACAGAATTCAGACCTTGGAAACTTGGACATGAATTTCAACGACATGAACAATGTGAACGGAGTTATGAGCGATGGCATGAGTTGTGGGAGTATTTGGCCACCTTTTTAG

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