Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15100 LG4 1221022 1224168 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 32
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 1221607 intron_variant
G/T 1221659 intron_variant
T/C 1221699 intron_variant
G/A 1221872 intron_variant
G/T 1222080 intron_variant
T/G 1222084 intron_variant
C/T 1222235 missense_variant p.Gly327Asp
A/G 1222759 synonymous_variant p.His191His
G/A 1222953 stop_gained p.Gln127*
G/T 1223102 missense_variant p.Pro77His
G/T 1223105 missense_variant p.Ala76Glu
T/A 1223122 synonymous_variant p.Val70Val
C/G 1223227 intron_variant
C/T 1223362 intron_variant
T/A 1223375 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15100.1
MEKEEPMQQPLTDSSLTTHSSTSTASDEEQLHSETLSLHSSAHMQRSSTASKLGQDESKQSAQHSDEETIVKKAVEAPQKQTENQLQMSVCSTSSSKLSPTSVSMYLSSAPNSSVPQQRPSPKAVKVQKMDKGTPSGDTTLSSVSVSRTSASDGYNWRKYGQKQVKSPTGSRSYYRCTHSNCCAKKIKFCDHSGYVIEIVYKGQHSHDPPHIVDSTKESKFLPYSEPKIKCSIPKQSSRVQIDSDPSSPRKPLYESPCSANKNQENSSHDENDKVLLKKEHVNDPEPKRRLNKGDLTCLDSAIKPGKKPKFVVHAAEDMGISSDGYRWRKYGQKLVKGNPHFRNYYRCTSAGCPVRKHIETAVDNAKTVIITYKGVHDHDMPVAKKRQGPPRASLVAAAAPASMKNLHFKKGGLVQNQETSSAQCSEDTEDEALDLGGEKAIESARTLLSIGFEI*


CDS Sequence:
>Vu_15100.1
ATGGAAAAGGAAGAACCGATGCAGCAACCGCTCACAGACTCGTCGCTAACCACCCATTCATCAACTTCCACTGCTTCCGATGAAGAGCAACTCCACTCAGAAACCCTATCTCTGCATTCTTCTGCTCATATGCAAAGAAGCTCTACCGCAAGTAAGCTTGGTCAAGATGAGAGTAAGCAGTCAGCACAGCATTCTGATGAGGAAACTATTGTAAAGAAGGCAGTAGAGGCACCTCAAAAACAGACAGAAAATCAACTTCAGATGTCTGTTTGTTCAACTTCATCGTCTAAACTATCACCAACTTCTGTATCAATGTATTTATCATCTGCCCCTAATTCAAGTGTACCACAACAGAGACCATCTCCCAAAGCTGTAAAAGTGCAAAAAATGGACAAAGGAACTCCTTCTGGTGATACAACCTTGTCTTCAGTTTCTGTTTCAAGGACATCTGCATCTGATGGATACAACTGGCGGAAGTATGGTCAGAAGCAAGTGAAGAGTCCCACAGGTTCTCGAAGTTATTACAGGTGTACCCATTCAAATTGTTGTGCAAAGAAGATTAAATTTTGTGACCATTCAGGATATGTGATAGAGATTGTTTACAAAGGTCAACATAGTCATGATCCCCCACACATAGTTGATTCTACTAAGGAAAGTAAATTCCTGCCTTACAGTGAACCTAAAATAAAATGCAGTATTCCAAAGCAGTCTAGCAGAGTTCAAATTGATTCTGATCCATCTTCTCCAAGAAAACCTTTATATGAATCACCTTGCAGTGCCAATAAAAATCAAGAAAACTCATCCCATGATGAGAATGACAAAGTTTTGTTGAAAAAAGAGCATGTTAATGACCCTGAGCCAAAAAGAAGACTGAACAAAGGTGATTTAACATGCTTGGATTCAGCAATAAAACCTGGAAAGAAACCAAAGTTTGTTGTACATGCAGCAGAGGATATGGGGATATCAAGTGATGGATACCGATGGCGCAAATATGGACAAAAATTGGTGAAGGGAAACCCACATTTCAGAAACTACTACAGATGCACTTCTGCTGGATGTCCTGTTCGAAAGCACATTGAGACTGCTGTGGATAACGCAAAAACTGTGATTATAACATACAAGGGAGTGCATGATCATGACATGCCTGTGGCCAAGAAACGACAGGGTCCACCAAGGGCTTCCCTTGTGGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCAATGAAAAATTTGCACTTCAAAAAAGGTGGTTTGGTACAAAACCAGGAAACTTCTTCTGCTCAATGCTCAGAGGACACAGAAGATGAAGCATTGGACCTTGGTGGTGAGAAAGCAATCGAATCAGCTCGAACTCTTTTAAGTATTGGCTTTGAAATTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_15100::LG4:1224168-1226168(-)
GCGAACATCATCAAATGCTTGCATTACGCTGGTAACAACTGTATGATATGCCAATATATTAAGTGTATCCATCACTGTTGTAATGTAGACAGAAAAGTGAAAAGGGATGGTCGGATGGAGAGGTCTGGGTGTAAGAAAAGATGGGAAAAAGAATATCTCAAATATTCTGTTCCATTGTTGTAGAGGGAAATGCCAATTTATTGATTCAAGATTTTGACAGCGTTGTCACTCAAATTTTCATCCCAGGAATTAAAACATGTAAATTGATATTTCTGAGATAGCACACATCAGTGTTGAATAATGACCAGTATCAAATTTGTGTTTGATTAAAATTTGAAGTATTCTTATTTCTTAATCGTGAAGGATGGTGAAATCAATTTTACCAATTAATCGAAATGTATTGTTAGGCTGGAAACTGAAGTACTTCCTAAAAATGGATGAAGAAGATCAACAATGTTACATAAGATCTGCTTTAACTGATCGGAGTAGTAGATACTACAACTTTTTGGTTTACTAACAAATTCCTAACCTAATATATTTTTTAAAAGCACATAACAATTTGATTTTTTTCAAATAGTCTTTTAATCTTGTAAGATTATACATTTAGGATACTTAAGTTCTTTACATGGTTCTAGCCATTGATTGGTAGGGAATATAAAACAATAATCTTTATCAATACTGTTATGTGCATGTATGTTTAATTCTTTTAACTATAATAAAAAATAAAAGGGTCATTATTATAATTATGAAAATGAATTTAAATAATTCTAATAATTTTGTCGTAGATAGTTTTTATTTATTTTTTAGATGTTTTTTTAATCACAGATGGTTATTTTAATTTTAAAAAATAACCAAATTAAGAAAAACAGTTAAATTTTAAAAAAATGGTCAGAATAAAATTAGTAAGAAAATTATTTTAGTTTAGAAAATAGTTACTTAAAAGAATAAACTTGGAAAAAATATGTACTTAATAGTTACAAAAACAATTGTTTATTAATATTTAAGTTATGACTACTGTTTACAGCACAATTTCTTATATAGTAAGGATTAAAATATGGATTTTTTTACATGTTTATTGTCTCTTAAGATGAAATTCTATAAATTGTTTTTTAGTTCTTTCAACCTGATTTTAATAAAATCATCTACTTGCATAAAAATATTTGCAAGTAAAAATTTGTTATTACATCTAAGAATTTTATTGCAATTTGTAGTTCTTAAGTGGCGAATGATAGTTCATTCAATGAAAAAGGAGGGTCAAAACGTACAAGTTTCACTGTAGTATTGGCTTTTTTTGTTCAGTTCTAGTCACTTTTTCTTCCATTTTTTACACAACAATTAGAGTTATATCTTGTTCAAGAACACTTTTTTTTTGCAATTATTTTTTAGGTTGAATATACGCTTTTCCAATTAGTCAAACAAGACTTTCATGAGGGTGTCTAAAATGATGAAGTATATGACGCTGATTATAATATAATAGTATTATGACAATTAATTTATTGTTTAAATATTGGAAGACATATTAGTTTTTTAAATGATTTCTATGTATAGTTTAATTTTATGCATGTTGAACAAATCTATTATCTTTCAATTAAACTAAACTAATTAACTTTTTATTCATTTTCTTACTTTTAAATAAATCATTCATTCAGCTCACAGGTTCCTTACTCAAATGCTGTTTGAAGAAGGTGCGATAAAATAAAACAAACGGCGTTAACAAATACCGTGAAATGGAATAGAAGATGAGCAGGTCCAAAAGACAAACATCGAACGCGGGCAAACGGTTAATAACAGTGCAGACAACCTCCGTTTCCAAGTCGCAGCAAAACCCGACAACCCACCTGAAAGAGAGAGAAAGAGAGTGGTCAATAGCAGTCAACACATCTTGTTTTCTTTCACTCGGCTGTTCGCTAATCAACAAAACAAGATCAAATCAAAACCAGAAAATGAAAATTCGTGATCGAATCGTAAACTGAACAAACCAAAAATTGTCGTGCACTGTC


Gene Sequence:
>Vu_15100(-)
ATGGAAAAGGAAGAACCGATGCAGCAACCGCTCACAGACTCGTCGCTAACCACCCATTCATCAACTTCCACTGCTTCCGATGAAGAGCAACTCCACTCAGAAACCCTATCTCTGCATTCTTCTGCTCGTAAGTTGCGTTTCAATAACACTTTTCTCTTCTCTGTTATATTGTATTGATAGTAGTAAATACTGAATAATGGTGTGTTCATGCGGCAGATATGCAAAGAAGCTCTACCGCAAGTAAGCTTGGTCAAGATGAGAGTAAGGTTAGAGCATCTGTGTTAAATTATTAATTTAAAAAAAATTAAAACATTGAGATTGTGAATTTCAAAGGTGTGATTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTGAAATGTTATGCTTGGTCTCAGTCACCTTATAAAGGGATTCTGGACGTGGTTTATGAGCCGTTGTTGTTGCTTCTTGTTCTTATGAGTGCTGAAGATATAGGTTTAGAATGACTATGGCTATGGCTACCCAGCTTTATTAAGTGCTTTTTAAATCAGTGTTTGTGTATAAGATATTTCTAGAATCCAAGACGAAATGAGGTTTAGTATTATTGAAATAAGCTTAAATGTATCATAAGCTATGTTGTAATCTCTTCCGAATGAGTGTTCATGTCATTAGATAACCCCAATTAAGCTATGATTAAGCTCTTTAAACACACCCTCAGTGTATTTTTCTGTCGCTGTTTGAAAGTTTCGTGACTTCTTGGCCTTTAAAGGTATTTGTGAGGCTTAGAAACCTGAGGTTACATGAAGCTTATAAAAGAAAACAAGAAGCAAATAGTCTCGAATTATAGAATTATTCCTTGACAGTAAAACTTAATTTGACCAAAACTGCCATGAATCCAGCTGCAAAATCCAGTTTTTGATGTTTGGTATTAGATCTTCCATGAATAAATGGATCGGAGTTTGATACTTTGATTGATGCTCTCCCTTCTCTGCTTCCCATTTATTTGATTTCTTCAGCACTGAAATGCACCATTTTATGTACAGCAGTCAGCACAGCATTCTGATGAGGAAACTATTGTAAAGAAGGCAGTAGAGGCACCTCAAAAACAGACAGAAAATCAACTTCAGATGTCTGTTTGTTCAACTTCATCGTCTAAACTATCACCAACTTCTGTATCAATGTATTTATCATCTGCCCCTAATTCAAGTGTACCACAACAGAGACCATCTCCCAAAGCTGTAAAAGTGCAAAAAATGGACAAAGGAACTCCTTCTGGTGATACAACCTTGTCTTCAGTTTCTGTTTCAAGGACATCTGCATCTGATGGATACAACTGGCGGAAGTATGGTCAGAAGCAAGTGAAGAGTCCCACAGGTTCTCGAAGTTATTACAGGTGTACCCATTCAAATTGTTGTGCAAAGAAGATTAAATTTTGTGACCATTCAGGATATGTGATAGAGATTGTTTACAAAGGTCAACATAGTCATGATCCCCCACACATAGTTGATTCTACTAAGGAAAGTAAATTCCTGCCTTACAGTGAACCTAAAATAAAATGCAGTATTCCAAAGCAGTCTAGCAGAGTTCAAATTGATTCTGATCCATCTTCTCCAAGAAAACCTTTATATGAATCACCTTGCAGTGCCAATAAAAATCAAGAAAACTCATCCCATGATGAGAATGACAAAGTTTTGTTGAAAAAAGAGCATGTTAATGACCCTGAGCCAAAAAGAAGGCAAGTTCCATATGAATTAATTTTTTTCATAGGAAATTTTTGAGGAATTTACTCTTTTTCTTGTACATGTGGCTGGATGTAATGTCTAATGCTCTTGTCCTTAATATGATAACTAGACTGAACAAAGGTGATTTAACATGCTTGGATTCAGCAATAAAACCTGGAAAGAAACCAAAGTTTGTTGTACATGCAGCAGAGGATATGGGGATATCAAGTGATGGATACCGATGGCGCAAATATGGACAAAAATTGGTGAAGGGAAACCCACATTTCAGGTTCATAGTTATATCTTGCTTTCTTTTTGTATTTTAAATAATACCCCTACTCGTAGTTCTGTTCTTCTATGGAAGTCGTAGCTGCAGTGTGGAATTTTATAAATAAATTTCCTGTTTGATTTGTTGGGTCAAATCAATTGAAGATATTGGTTTCACCAAAAATCTCTCGTGCTTATGTTCATAGATGCCATTGTTTTGGTTAATCAATAAATGGAATGCTAAGAAGTGTTTGAGTGTTTTGTTTTAAATCAAGGGTTGCATGTCTCCTTTTAATATTCCAAGATATAGCTAGTCTGATATGCTTGGTATGCACAGGTCCATTAAAATTGTACTTTTTTTTATAATTGTATTTTATATTTATTTAAAAATAAAAACAAGTTTTAAAACATATATATTAAAATTGAAGATGATTAATTATATTTTTAATTGAACACATGTTACCCTAAAAAATATTAGTAATTGTTAAATTTATTATTATCTGATCTTTCTTCAAGTAATAATAGTACTATATGTATACAATAAATTAAAAATCAATTGTAATAGATATAAACTTATAATTAATTAAATTTTAGTATTCATTCTCTTTTACTTCAAATACTGTGTTTACATGTTGAATTTAATTTTTGTGACATAAAGGATTACATAAGTGACATAAGTTCAATCAGGATTGACATCACTTTTAACCCAAAAAATTTGTCTTTTTTCTTTTACAGTGTTAACTTAAAAACACTTAAAAACCCACTTTTCTGTGAGATGTTAACTTCCCTTTTGTTTTATTTAATACGACTGTTGAAATCTTACTTCTGTGCTTATCAATGTGAATTTCCAGAAACTACTACAGATGCACTTCTGCTGGATGTCCTGTTCGAAAGCACATTGAGACTGCTGTGGATAACGCAAAAACTGTGATTATAACATACAAGGGAGTGCATGATCATGACATGCCTGTGGCCAAGAAACGACAGGGTCCACCAAGGGCTTCCCTTGTGGCTGCTGCAGCTCCTGCTTCAATGAAAAATTTGCACTTCAAAAAAGGTGGTTTGGTACAAAACCAGGAAACTTCTTCTGCTCAATGCTCAGAGGACACAGAAGATGAAGCATTGGACCTTGGTGGTGAGAAAGCAATCGAATCAGCTCGAACTCTTTTAAGTATTGGCTTTGAAATTTAA