Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14973 LG3 55396706 55397057 receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g45590
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 55396721 missense_variant p.Lys6Glu
A/G 55396747 synonymous_variant p.Ala14Ala
G/A 55396772 missense_variant&splice_region_variant p.Ala23Thr
G/A 55396810 intron_variant
G/C 55396912 missense_variant p.Gly39Arg
G/A 55396926 synonymous_variant p.Leu43Leu
A/G 55396956 synonymous_variant p.Arg53Arg
G/C 55396983 missense_variant p.Leu62Phe
T/C 55396985 missense_variant p.Ile63Thr
C/T 55396987 missense_variant p.His64Tyr
A/G 55397028 synonymous_variant p.Arg77Arg
C/A 55397038 missense_variant p.Gln81Lys
C/G 55397046 synonymous_variant p.Gly83Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14973.1
MCWGKKFDIAVSVAMGLEYLHHAVKAVEDLGMMEGKKEGVVEIAVEEFGVMEERQNVSVMDVDTSLESCPMRVVDYSNMSPVGLIS*


CDS Sequence:
>Vu_14973.1
ATGTGTTGGGGGAAGAAGTTTGACATCGCCGTTTCGGTGGCAATGGGGTTGGAGTATTTGCACCACGCGGTTAAGGCGGTGGAGGATTTGGGAATGATGGAGGGGAAGAAGGAAGGGGTTGTGGAAATTGCGGTCGAGGAGTTTGGGGTGATGGAGGAGAGGCAGAATGTGAGTGTGATGGATGTTGATACATCGCTGGAGAGTTGTCCTATGAGGGTTGTCGATTACTCGAACATGTCGCCAGTGGGGCTGATAAGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_14973::LG3:55394706-55396706(+)
ACATTGAAGTATGATAGATGAGTTGTGAGTTTTAGATTAATTGGTTGAAACTTGATTCGTGATCAAATCATTAAATTGGTATCTAATTTGAGTTATAAAATTGTTCTTCAATCATTCCTCTTGTCTAGAATTCCATTTTGATAATTTGAATAGGTATTGGGGTCAATTAAAGCTAGTTTTAGAGTTATTGATTTTCTGGTATAGGGCTGAGTGTCAGGATTGTAGGGCTGAGCACAACTCTTCTAGTAGTGTTGGTGTTGAGCGGTAGTTTTCTAGTGAGGATAGCGTTGAGCGCCAGAAAGTTGGCGTTGAGCGTGATATGTTTGCAGTATTGGTTTATGTTCTCTATTCTCTTGTTCTTGTTGAGTTTTGAGTTGTATTTGGTACTTTGATGCTTGTTTGGTAGTATCTATTGAATTGTGTGATGATGTTTACATGAGACTATGTATATTATTAAGTATGGTGAAACGTATGGGAGACATGTATAATAATATTCAAATGAAATGAAAAGTGTGGATTTAAATATGATGGAGAAAGGAATTCCACAGAGGAATATTCTAGTGTAGTTATGTTGTGTAATATATTGAAATAGGAGCTCCTGGATTGAGGAATGATCATGACACTCTCAGTAACCCCATCACAAGTAGAGATGGGTGATTATGTCATGGAGAGTAGCAGGAGGTCCTAGTCTATGGTCACTGGTTTTGACCATAGATGTTTCACGAATTAACCTTGGTGTATGACATTATGGTTGTTGTTATTATTCGAAGCAAGTTACTCCACCATACATGTGTACAGGTTCTCCATGAGTCTAACATCAATACATCTATCCAAATAGTTGGAGTTCAAGGTTGATGGGAATTATTTCTATGTTGCTTGATTTATAATATGGATGTGTTGTTATGGTTTCAAAAATGTATGTATATTCTTTTGGTACTTTAGTTTATTCTTGCTTTTGTGTTGTCTGTCTGTGTGTTGTTTTCTCTTTTGCAATGATCACCTTAATGGTGTGAGCTTAGGAAAATATTTTTTCAATTTCTCTAGCGAGAGGTGAGGGTAAAATATATGTATAATTAGATGGTTCAATAGGTGTAAATATCTTATTTGCAGTAGGTTTGTTTTACCTAATTGTTCTATTATCATCTTTTGTAACGTTTTATTTTAATAGTTTTATACTATTAAAATGAGATGTTACAATTGGAACCCACCATAGAATAAACAAATTGAAACATAATTATCTAAAAAAAAATAAAAAGAATAGTCATAAGCAATACAAATAACTATGTATTATATTAAGTTTAATCATTTTGGCATCCCTATTTGTGCATAATCTTCTCAAATAGGTTCTCGTATTTTGAATGTTCTCAATTAGGTCCTTTTTTGTGAAAAATAGAATCAATTTGAACCTCACCGTTAATTAGGATGGACGACGTTAAAAAGTGTGCTTCGTGGCTTGGTGACTGAGCAAATTTTATTGACGTGGCAGACTTTGGTGGCCTGAGGTGGATTATTTTTATTAACAGTTTTAAAAAACTTTAATTTAATCAAAACACAACGTTTTAATTACGGGAATCTAATTAAAAGTTAGGGATTTGTGGTTTGCTTCTTCAGTCCGTGCAAAATTGGGGAAACTTTCTTACAATCGACGCCGTTTGAGCACAACCAACAACGTTTCTCTTATTTTGTTCTACGCTGCGCGATGAACTCGTTCTCGTCGTCGACAAAGCTTGGGCACGACGGGTTCGGTTCGGTTCACAAAGCAAGTCTACCTTCTGGCTAGACCGTGGCGTTGAAGGTTATGGACTCGCCCGGGTCAATCCCAAGGGAGAGAGAGTTCCACAACGAGTTGACGCTGTGTTCGTATCTAAAGTCGCCGTTTGTTATTTCGTTACTCAATTTTTTTTCGGACCGGCGCAGTCGGAAGCTGGTTCTGGTTTATGAGTTGATGTCGAACCGGAGTTTGCAGGACACGTTACTAGACTGACGGTGTCTGAAGCTGA


Gene Sequence:
>Vu_14973(+)
ATGTGTTGGGGGAAGAAGTTTGACATCGCCGTTTCGGTGGCAATGGGGTTGGAGTATTTGCACCACGCGTGTGAGCCTTCGGTGATTCATGGGGATATAAAGTCGAGTAATGTGTTACTGGATGAGGATTTTAGAGCGAAGGGATTTTGGGCTTGCTAGGGTTAAGGCGGTGGAGGATTTGGGAATGATGGAGGGGAAGAAGGAAGGGGTTGTGGAAATTGCGGTCGAGGAGTTTGGGGTGATGGAGGAGAGGCAGAATGTGAGTGTGATGGATGTTGATACATCGCTGGAGAGTTGTCCTATGAGGGTTGTCGATTACTCGAACATGTCGCCAGTGGGGCTGATAAGTTGA