Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14939 LG3 54953908 54956726 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G,* 54954045 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 54954209 5_prime_UTR_variant
G/A 54954364 intron_variant
A/G 54954366 intron_variant
T/A 54954387 intron_variant
T/A 54954393 intron_variant
T/A 54954457 intron_variant
T/A 54954459 intron_variant
G/A 54954536 intron_variant
A/C 54954843 intron_variant
C/A 54954919 intron_variant
C/T 54955187 missense_variant p.Pro77Leu
C/A 54955239 synonymous_variant p.Ile94Ile
G/T 54955243 stop_gained p.Glu96*
T/C 54955418 splice_region_variant&synonymous_variant p.Thr128Thr
A/T 54955532 missense_variant p.Leu166Phe
A/T 54955537 missense_variant p.Asn168Ile
G/A 54955580 intron_variant
T/A 54955591 intron_variant
G/A 54955597 intron_variant
C/A 54955742 synonymous_variant p.Leu194Leu
A/T 54955934 synonymous_variant p.Pro234Pro
C/T 54956022 intron_variant
G/T 54956030 intron_variant
T/A 54956031 intron_variant
A/C 54956235 missense_variant p.Lys307Asn
A/G,T 54956414 missense_variant p.Asn367Ser
T/A 54956625 3_prime_UTR_variant
A/G 54956725 splice_region_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14939.1
MGNCLDSSAKVDAAQSSRSTSGISKTTPSILSIPSYSEKSNALSLPTPRSEGEILSSPNLKSFTFNELKNATRNFRPDSLLGEGGFGCVYKGWIDEHTFTASKPGSGMVVAVKKLKPEGFQGHKEWLTEVNYLGQLYHPNLVKLIGYCLEGENRLLVYEFMPKGSLENHLFRRGPQPLSWSVRMKVAIGAARGLCFLHNAKSQVIYRDFKASNILLDAEFNAKLSDFGLAKAGPTGDRTHVSTQVMGTQGYAAPEYVATGRLTAKSDVYSFGVVLLELLSGRRAVDKTIAGMEQNLVDWAKPYLSDKRRLFRIMDTKLEGQYPQKGAFMAATLALQCLNSEAKTRPPMTEVLATLEQIEAPKASSRNSHSEHHRVHTPVRKSPARNRSPLNLTPTASPLHAHRLSPRVH*


CDS Sequence:
>Vu_14939.1
ATGGGTAACTGCCTAGATTCTTCTGCCAAAGTTGATGCAGCTCAGAGCTCCAGATCCACTTCTGGAATCTCAAAAACTACACCTTCTATCTTATCTATTCCATCATACAGTGAAAAAAGCAACGCCTTAAGTCTGCCCACACCAAGGTCTGAGGGTGAAATCTTGTCTTCTCCAAATCTCAAGTCCTTCACATTCAATGAGCTGAAGAATGCCACCAGAAATTTTCGGCCCGATAGTCTTCTCGGTGAAGGGGGATTTGGATGCGTCTACAAAGGATGGATCGACGAACACACATTTACAGCTTCAAAGCCTGGATCAGGAATGGTCGTTGCTGTAAAGAAGCTCAAACCTGAAGGTTTTCAAGGTCATAAAGAATGGTTGACTGAGGTTAACTACCTTGGACAACTGTACCATCCTAATCTGGTTAAATTAATCGGTTACTGCTTGGAGGGAGAGAATCGGCTATTGGTCTATGAGTTCATGCCGAAAGGCAGCTTAGAGAACCATCTGTTTAGAAGAGGACCGCAACCACTGTCTTGGTCAGTGAGGATGAAAGTGGCTATTGGTGCTGCTAGAGGACTCTGTTTTCTTCATAACGCCAAATCACAAGTCATATACCGTGATTTTAAAGCCTCTAACATCCTACTTGATGCGGAGTTCAATGCTAAACTCTCTGACTTTGGTTTAGCCAAGGCGGGTCCAACTGGTGATAGAACTCACGTGTCTACTCAGGTGATGGGCACTCAAGGATATGCAGCACCTGAATATGTTGCAACTGGAAGGTTGACGGCGAAAAGTGATGTGTACAGCTTTGGAGTTGTGTTGCTTGAACTTCTATCTGGAAGAAGAGCTGTTGATAAAACAATAGCTGGTATGGAGCAGAATCTGGTGGACTGGGCAAAACCATATTTGAGCGACAAAAGAAGACTGTTCCGGATCATGGATACGAAGTTGGAGGGGCAGTATCCGCAAAAGGGTGCCTTCATGGCTGCCACACTTGCCCTACAATGCCTCAACAGTGAGGCCAAAACAAGGCCTCCAATGACAGAGGTTTTAGCCACTCTGGAACAGATAGAAGCCCCCAAAGCTTCATCCAGAAACTCTCATTCCGAACACCACCGTGTTCACACCCCTGTCAGAAAGTCTCCGGCACGCAACCGCTCACCGCTAAATCTAACTCCCACTGCATCCCCTCTTCATGCTCACCGGCTATCGCCTCGTGTGCACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_14939::LG3:54951908-54953908(+)
ACATGAGAAGGAGAAGAAATTAAAACAATATTTTAAAAAGAATTATATATGAATAGGCTTCGATTAAGAATAAGAATCGAAGCATGTAAAAAATATAGGCTTCAAGTATGAACTGAAGCCTAAAGTTATGTATTTTTTATGTTGTATGAATATACCTTAGTTAAAAAAGTAAAGCATAATTTCCAAAACAGCCGGTGTAGAAGTCTTGACCTGCACTAATAAGGGTCGTGAGACTAGGGAGACTATGTTGTAAATGTAAATATTATATGTTTAGATGTTGTTGGATTTGTATTGCAACACTTTATTTCATAGGTAGTTGATTTCTTTGTTGTGATATGAATGGAGCAGTAACCTTGTTATACTTTCTTTTCATTTATACACTTTATGTCTTAGATTTTATGTTTTCCTTTGATTTGGTTTATGCTTAATGTTTGTCTTGGGGTATGTCTTAGAACATGATGTAGTTGTTGGAAGGTCCTAAGAATAGGATTTCAGCAAAAGAACTAACTAAATCAAAATCAGATTAAAGTCGTTACCAAAGATGGAACTATGTATTTGGTCCACTATTTTGACTCTTAATCCAAGTATTGGGCAAATCTTGTGTTAAGAAATTGAACAAATTGTTTAAGACTTAGATAGGCATAACCAAAGGAATATGAATGTTCTTAGCCTTAGAGATTATCTTCATATGTGAAGATATATCTGGTTAAGTTGAACAAAGATCTCCAACCTTAGAGAAAGTCTCTACAATTTAACCTTCATAATATATAACTAATGACATATATGTTATGAAAGGTTAATTATGCGGAGAACATAGATAATATTTTAATTTGATAAAGGTTCAAATTAGAAATATTAATACTTAAGAAAAGTAATAGTAAGAAGTTAAAGTGATTATGATCTCATATGTAAGTACATAATTCATGTTTCTTTTATTTTCTGAAAAGAAAAATAAAAAAGAACCTAAGGTCTTCCACAGTTGATAGATGAGATAGCTTTGATTTATACTGACTGCTCTCAATGGTCAATCTAAATACGTTTTCGCATACTTCTTTACAGGTCTTTTTTAATTAATTGTGAAAATGTGAGTTATGCTAATACAAGAATTTTAATTTTATTTGAAAAAATAAATAACAAGTGACATGTTATTTTTCAGTAAAATAAACGTTAACGTGGTTGAAAAAAATAGAGATAAAAATAAATATTTTTAAAAATTTAGAGACTAAATATATTAAAGTTTAGAGACTATTTTCAATTTTACATAATACTTTTTGGGCAAAAACCTATATTTATAAATAGAAATATTGTTACAACTATTGAATTATTTAAAATTGAATTATCATTCGATTAAGTTATATTTAAATTTTTTTACAGATAAGATAATAACATATATATTTTTTGTTTTCAATATATTATGAAAAAAGTTATATTACTTTTTAAAATGATAATTAATTGTTATAGAATCATCCAAAACTTCCCTTTTCTTATTGATGACTTTTGTCTAAAACATAACAGCACCATGTTTGAAAAAACACAAGTTTTGAAATAAAATTAAATTTTAAGTCAAACTTGATTAATTATGCATCTTAAACCTGAAATTAATATCTATATGTTTTTTACCAGTATATTATATGAGCTTTTAAGACCTTATTATAATAACTACTAAAACAGGCACTAGTATTGAAGAAAAAGTGTATTCCTAAACCAAGTACTTAATTCTCTGATAAATGTAGCAGCAGGTTTAGTAAATTCAATTCAACACAACACTCTCAGTGTTTAACCTCCTACTGTTTAAGCAAATTGATAAAAGAAAGTAATTCTATGCGACATAAAAGTCAAGTAGTTTGTCAATGACTACGCAACTGTTTTGTGTCCTTTTATGTTAAAAAACAGAAAGAGTGGATGAAGAAGAGAAAAAGAACAAGAAGGAGGGTATTTTGGGAAATTTGAAGACGATATACCAAATTTGACGAGCTCGTATTTCCGAGGGTAGAGATAGA


Gene Sequence:
>Vu_14939(+)
AGAGTTCATGACACGTGGCCGCGTATGACGCGGTTCAAATGGCAGTGTTGAGAGTCTTCACAGCATACGCGAAGCCAAAAACACAACTGATTCTTTTCATCCCATGTTCTGTTCCCCACGCATATTAATAATACCTTACCACCTTCTTCTTCGTCTTTCTTTCTTTCTATGTTGTCATAATTTTCTTCCTCTCTTTCTCTCTCTTTCAACCACCCAACCAAACATCTTCCACTCTCAACTTCCTTAGAAATTGCAAACTTCAAATCCTTTCTTTTTTTTCTCCTTCACTCATTCTCTAAAAAGTGTTGCGTAGAACTGACAATTGTGGCAGGGCCTAATGGGTAACTGCCTAGATTCTTCTGCCAAAGTTGATGCAGCTCAGAGCTCCAGATCCACTTCTGGTTCGTCACGTTAGATCATTACCCTCTTTCTGTTTTTTCTTGTTTTCGGTTTTCTGGAGGCTTGTGATCGTGATGCTCTCTTTTTCATGATGTTTTGGGAACTGGGTTTTCGTGGTATGGGTTGAGGAGGTTCTAAAGTTTAGTTCTTTCTCTCTCTTGGTAACCGGGGTTGGATAAAGTTTGATTATTTTCTCCTAGTATAGCACAGGAATATATGATTTTTTTTTGGACGGTTGTGTTCTGGTTTTTTTGTTAGTGTTTACTGTTTGAAAAATTCAGCTTGAGATATTACTACAAGGGTTCAGATTCTTCGAAATAAGATAATTTTTCTACTTTTATGATTATGCTTTTAGGATATTTCTCCTTCTTTAATTCTTTTGAGGATGTAAACGTTTCCTTATGGTCTAATTTTAGGCATGGATTGTTTTGAGGATTAAAGTTTGGTTGAATTGTAAGCAGTTCATAACGTTATAAAGGAGAAGATTTGGCGTTGTTTTTCTGAGATTATTATTAGGATTGTGGGTTGAAATGACGAAATTGAATAATAAATAAAGAAAATTGTTTTTTTCTTGCAGTGTATGAAATTGTTCAGAAAAGGATTCTAGTATTGCTGATGGTTAAAATTGAAAGCTCAATTATTTCGCTACTTGCTTTTGTTTGTGTGGTGGTACCATATATGGATTAACCAATTTTCTCCTTTATTTCTGCCTCAGGAATCTCAAAAACTACACCTTCTATCTTATCTATTCCATCATACAGTGAAAAAAGCAACGCCTTAAGTCTGCCCACACCAAGGTCTGAGGGTGAAATCTTGTCTTCTCCAAATCTCAAGTCCTTCACATTCAATGAGCTGAAGAATGCCACCAGAAATTTTCGGCCCGATAGTCTTCTCGGTGAAGGGGGATTTGGATGCGTCTACAAAGGATGGATCGACGAACACACATTTACAGCTTCAAAGCCTGGATCAGGAATGGTCGTTGCTGTAAAGAAGCTCAAACCTGAAGGTTTTCAAGGTCATAAAGAATGGTTGGTAAGTGTTTGCATAAAAAGAAAGTACTTTTGTTTTCTGAATACACATGGTAATGAAAGTTTTAATCAATATTTCAGACTGAGGTTAACTACCTTGGACAACTGTACCATCCTAATCTGGTTAAATTAATCGGTTACTGCTTGGAGGGAGAGAATCGGCTATTGGTCTATGAGTTCATGCCGAAAGGCAGCTTAGAGAACCATCTGTTTAGAAGTAAGTTACATAAACCATTATTGAGAATGATCTTTTTCTTTTGACGAAGATGTTTTTGAAAAGTATAATGGTCAAAGTAATGGATACTTGAGTTTCCTTGATTTATATGTTGATTTTACTTGACAGGAGGACCGCAACCACTGTCTTGGTCAGTGAGGATGAAAGTGGCTATTGGTGCTGCTAGAGGACTCTGTTTTCTTCATAACGCCAAATCACAAGTCATATACCGTGATTTTAAAGCCTCTAACATCCTACTTGATGCGGTAAGATCAACAGCGAGTTCTTCGTTTTTCTTTCTGTAAACTGCTTATACTGATCATGCAAAGGGATCGCAGGAGTTCAATGCTAAACTCTCTGACTTTGGTTTAGCCAAGGCGGGTCCAACTGGTGATAGAACTCACGTGTCTACTCAGGTGATGGGCACTCAAGGATATGCAGCACCTGAATATGTTGCAACTGGTATACAATGCCTTATCTGGTTATTAATCTTCAATCATATAGTCTCTTCTGTCGCCATTTTAAAATCGTAATTGATTTACAGGAAGGTTGACGGCGAAAAGTGATGTGTACAGCTTTGGAGTTGTGTTGCTTGAACTTCTATCTGGAAGAAGAGCTGTTGATAAAACAATAGCTGGTATGGAGCAGAATCTGGTGGACTGGGCAAAACCATATTTGAGCGACAAAAGAAGACTGTTCCGGATCATGGATACGAAGTTGGAGGGGCAGTATCCGCAAAAGGGTGCCTTCATGGCTGCCACACTTGCCCTACAATGCCTCAACAGTGAGGCCAAAACAAGGCCTCCAATGACAGAGGTTTTAGCCACTCTGGAACAGATAGAAGCCCCCAAAGCTTCATCCAGAAACTCTCATTCCGAACACCACCGTGTTCACACCCCTGTCAGAAAGTCTCCGGCACGCAACCGCTCACCGCTAAATCTAACTCCCACTGCATCCCCTCTTCATGCTCACCGGCTATCGCCTCGTGTGCACTGAGATTTCATCGTAAAACATATCCGTATGTATATTCCTTGTTTCTATCAGCTTGTCTTTTCGACAGTAAATGCAATTTTGCCTTGTTAAGTAGAATCAATACTTAACACCATTTATTCCAAAGTAATGTTAAGTTTATATTCATTTTACATATATTATAAAAATAAAGTGACTTTTTATATTAG