Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14854 LG3 53415774 53416754 PREDICTED: LOB domain-containing protein 41-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of gene expression
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 53416089 missense_variant p.Thr107Pro
G/A 53416238 intron_variant
T/A 53416239 intron_variant
T/G 53416254 intron_variant
A/G 53416261 intron_variant
T/A 53416273 intron_variant
C/A 53416289 intron_variant
G/T 53416395 intron_variant
A/G 53416398 intron_variant
C/T 53416404 intron_variant
A/T 53416484 intron_variant
G/T 53416556 intron_variant
T/A 53416575 missense_variant p.Gln60His
T/A 53416576 missense_variant p.Gln60Leu
A/G 53416632 synonymous_variant p.Leu41Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14854.1
MKISCNGCRILRKGCTEDCVIRPCLEWINSSEAQANATLFLSKFYGRAGLLNLINAAPQQHRTDVFKSLMYEACGRIINPTFGSVGLFWSGEWAQCQAAVDAVLAGSQINVMPTSHSQSDHGSKLLDIRHVSKDANMDKVRGKSKKHKDVMMPMSHVGLVNSATLWNPILSHHEPRRLEGGNGEIMKAVLVSQDKPRINGGANIDLELTLG*


CDS Sequence:
>Vu_14854.1
ATGAAGATTAGTTGTAATGGTTGTCGCATTCTTCGCAAAGGTTGTACCGAGGACTGTGTCATTAGGCCATGTCTTGAATGGATAAACTCCTCCGAGGCACAAGCTAATGCCACCCTTTTCCTTTCTAAGTTCTATGGTCGTGCCGGCTTGCTCAACCTCATCAATGCTGCCCCACAACAACATCGGACTGATGTTTTCAAGTCACTAATGTATGAGGCCTGTGGGAGAATCATAAACCCAACATTTGGATCAGTTGGGTTATTTTGGAGTGGTGAGTGGGCCCAATGTCAAGCTGCTGTTGATGCTGTGCTAGCTGGGTCACAGATCAATGTCATGCCAACATCTCATTCGCAAAGCGACCATGGTTCGAAACTCCTTGACATACGACATGTGTCTAAAGATGCCAACATGGACAAGGTGAGAGGAAAATCTAAGAAGCACAAGGATGTTATGATGCCAATGTCACATGTGGGTTTAGTCAACTCAGCTACATTATGGAATCCAATTTTAAGTCATCATGAGCCAAGACGGTTAGAGGGTGGTAATGGGGAAATAATGAAGGCTGTGTTGGTGAGCCAAGACAAGCCAAGAATAAATGGTGGAGCCAATATTGATTTGGAGCTAACTCTTGGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_14854::LG3:53416754-53418754(-)
AAATATGAGAGACATAATGAGAATTGAGATGCAGTCATTTTTATAAGCTAAGTGAGGAAATGAATGTATTTATTGTGATTTAACATTTTAAATATTTATTTAGATTTTTATGAATATCCCTGTCACTAATGCTATTTTTCCTCTTGTTACTCTATAGGTAGGTATTTAGTAAGTATATACTTCGAATATATTTCTAAGATTAAATTATATACGTGAAATATATTCTCAACAGTTACAAAAGTTAATGTGTGGACTAAATTAAAACACTTTTAAACGTAAAGTATTAAAAACACTAACAAAAATTTGGAGCACCAATTTTGATGGTAGTACAGACCAATTTTTGAATGTAAAAAGAAATTTATGTACCTTTTTGCACTATTTTATATTTGTATTAAACATTAAATTGAAAATAAGGTTGTAAATTTTATGATTTATTTAGCTACAGTCCTAAAATTATCAAACTTTATAATGAATTAGATATCAGAACTTTGAACATAATAGCATGAATTAAAATTTGATACATTTAGAGAAACAATAATATATGGGAAAATAATTATTATAAAATTAAAATTAAAGATGTTACACTTCACACATGTTAGTGATATATATATTCTTATTATTTGAATTAATCTTAATATCCTTGTCAGTACCTTTTTTCTTAAGTTTATAATCTTCCTATTTTTTTCTTAATTCGCATATTGTCATTTGAGTTTACACGTTTTTGGTTTGTTCTTCTCAATAGTATTTTCACTCATTACTTAAAAATAATAAATTTTTTCATATTTTTTTTACATATATTTATTCTTCATCACTTGTTTATCAACCTTTATTTATTTCACTTTACATTATTTCTAATAAAAAGAAGAGATCATGAATAATATATTAATTATAAAAAAACAAATAATTTTTCTTCCAAAAAGTATTTTGACCATTTTCCTTAATGCAAGTTAATAAATAAAATTCATGAATGAAAGTATTTATGAAAATATAAAGAATTTATCGTTTATCTTAATATAGTTGAAAACACTTATTAAATAGTATTGAATACACTTTGACCAGTATTTTAAAGAGAGCTTGTTGGGAAGACTTTTTTAGAGAGAAAAACAAACTTTAACCTTGCATGATCACATTGTTCATACACCATGAAATAAGTAAAAATAGAACTATAATCATAAAATACGATTTCAAAGCATGTATGATAAAAAAAATGTCAAAGAAAAACTAGCATGGTACCAAAATATCCGAACTTATAGCAAATATGTCTAAAACATAATTCTTATATTGAAAAGATGTCCAAAATATTTTTCACAAAACTTTGATTTTATGGAAAAGGAAAGAGAAAATACATTAACTAGTTAGAAAGAAAAGGACAATAGATGATATAATCAAATAATTAATGTACAAGTTATCCAACTAAGCAGGATACTATCTAATCAATGATGTTGTGTTAGACAATTACTTTCACAAAAAACACTTGGCTTCCACAACAGGAAAAAGAACAACATTGCATATTAATGAAGTCGTTGATGAAAGAAAACCATGGGCGAATATATATATTCCGCCCTCGCCCATGGCCCCACAGAATTTTTCTCCCTATTTAAGGGAGCTCCAATATACTTTATGAAAAATTGTCAACATAAGCTTGTGTCCTTATCCGTCAATTTACCCACGCTTTTCCTCCTCCAATACCTCGTGTTACAAATTGAAATGTCTCATGATTTAAATTACCTTGTAGGATTACCTCTATACCCTTTGCTTTCACAATCAATTACAAATTTCTCTTCATGCAGTGCTCTCGTAAAGCCTCATATACTGCCAAGGTAATAAGTCCCCACATGAAATTATTAAAAGGAAAAAGAATACCACGAGAAAAAAAAAAACCACAATACCAGGAAAATTTCATTAGGGACCTGACCAGTTTCACTTGGTGGCTTGGTTGGTGTTAATATATATATATACACTCCTTTACACTGTTATTCTAAGTACTCGGAAAAACCACC


Gene Sequence:
>Vu_14854(-)
ATGAAGATTAGTTGTAATGGTTGTCGCATTCTTCGCAAAGGTTGTACCGAGGACTGTGTCATTAGGCCATGTCTTGAATGGATAAACTCCTCCGAGGCACAAGCTAATGCCACCCTTTTCCTTTCTAAGTTCTATGGTCGTGCCGGCTTGCTCAACCTCATCAATGCTGCCCCACAACAACATCGGACTGGTGATTTTCCCTCACAATTATACCCTTACCTTAAATTAAACTTACGTATTTCAACATATTTACTTTTTTGTAAATCTATCTGTGATTAAAAATAAATAAATTCAGTACCCTCTAAGAGAATAATAATCACCATTTTGTTGTCATTTGTTTCTAGTTAACAGAACAATGACAGTATATCCTTTTTTACAATGGATAATAGGATGGGAAAGAATGTTGTCTATATAGTTTGATGAAAAAAGTTATTCTCTATCAATTTTTCGGTGTGATTTTGGAAAGATTTTGAGATAAAAAATATATATTAATTATTTACATCTTGAAGAAAATGACAATATTTGTAAATTTCAGATGTTTTCAAGTCACTAATGTATGAGGCCTGTGGGAGAATCATAAACCCAACATTTGGATCAGTTGGGTTATTTTGGAGTGGTGAGTGGGCCCAATGTCAAGCTGCTGTTGATGCTGTGCTAGCTGGGTCACAGATCAATGTCATGCCAACATCTCATTCGCAAAGCGACCATGGTTCGAAACTCCTTGACATACGACATGTGTCTAAAGATGCCAACATGGACAAGGTGAGAGGAAAATCTAAGAAGCACAAGGATGTTATGATGCCAATGTCACATGTGGGTTTAGTCAACTCAGCTACATTATGGAATCCAATTTTAAGTCATCATGAGCCAAGACGGTTAGAGGGTGGTAATGGGGAAATAATGAAGGCTGTGTTGGTGAGCCAAGACAAGCCAAGAATAAATGGTGGAGCCAATATTGATTTGGAGCTAACTCTTGGCTAG