Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14825 LG3 53006985 53013343 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 53007212 synonymous_variant p.Ala76Ala
C/T 53007214 missense_variant p.Pro77Leu
T/A 53007322 missense_variant p.Leu113His
T/C 53007327 missense_variant p.Phe115Leu
T/G 53007534 missense_variant p.Phe184Val
T/C 53007760 missense_variant p.Leu259Ser
T/C 53007876 missense_variant p.Phe298Leu
C/T,* 53007878 synonymous_variant p.Phe298Phe
G/A 53007916 stop_gained p.Trp311*
G/T 53007975 missense_variant p.Asp331Tyr
T/A 53008034 synonymous_variant p.Thr350Thr
C/T 53008091 synonymous_variant p.His369His
T/A 53008345 missense_variant p.Val454Asp
G/T 53008409 missense_variant p.Arg475Ser
G/T 53008881 missense_variant p.Gly633Cys
G/A 53009061 missense_variant p.Glu693Lys
G/T 53009065 missense_variant p.Cys694Phe
T/A 53009237 synonymous_variant p.Val751Val
G/C 53009258 missense_variant p.Lys758Asn
T/C 53009263 missense_variant p.Ile760Thr
A/T 53009269 missense_variant p.Glu762Val
C/T 53009548 intron_variant
G/A 53009563 intron_variant
T/C 53009973 intron_variant
G/T 53010575 intron_variant
T/A 53010636 intron_variant
C/T 53010735 intron_variant
A/T 53010736 intron_variant
A/T 53010810 intron_variant
G/C 53011288 missense_variant p.Asp982His
A/T 53011950 synonymous_variant p.Val1202Val
A/T 53012376 synonymous_variant p.Ser1344Ser
C/T 53012402 missense_variant p.Pro1353Leu
C/T 53013110 missense_variant p.Ala1589Val
A/T 53013242 missense_variant p.Asn1633Ile
T/A 53013335 stop_gained p.Leu1664*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14825.1
MNPIICSGYIFILYLSNLQLVAVADDGSYVPTENIVLSCGSNTSEYVQYDGRNWNGDIVSPYVPSDADTKSLAVRAPNTLESIPEVPYMTARIFHSKFTYTFNVTPGPKFIRLHFYPASYINLNISNAFLSVSAANFTLLHNFSASLNADYYNLTYFMKEFIVHVSGSVLQLTFSPSYNTSHAFAFVNGIEVVSMPLNLYTTGGDDAPLPLVGHNKVVNIYNDTAMENLYRLNVGGEQIPPKYDTGMFRSWDFDEVYSLGAIGIRPFDISMLVLYSDNAPPYSAPVDVYRTSRSMSPFDDGLINLNFNLTWFFPVDSGFLYLVRLHFCEIDQDITKVNQVVFTVFLNNQTAEEQVDIIALVGKPGVAVHRDYVVMVPHVNEGKQDLWLDLHPYKDSKPMYYNAYLNGVEIFKLSNFGDKSLAGLNPSKSFLSGSDEKASHVAHFNKSSKKLKFVLIGCGLLAVVLPVLLCLLLIRLKVIKLRRVVSLCGLTVHTPNRIEKAKKWSLCTQFSMRDIKLATNDFHEDLLIGTGGFGSVYKGSFTDGATYVAVKRANPMSEQGISEFEAEILLLSQLKHHNLVSLLGYCNEDGEMILVYDFMANGSLHDHLHLRQRDGSPLDWIQRLEICMGIARGLHYLHTGTKDRIIHRDIKTTNILLDHNWVPKISDFGLSKAGFPSFVTTNVKGSIGYLDPECYESHKLTEKSDIYSLGVVLLEVLSARPALSVGEDDEHINLAEWTVSCLENGNVEEIVDPNLKEKIIKECFELYLGVAMKCLAERGTERPSIGEVLESLVLAMHLQKNEGSVPNGNHNAALQGNSDLTPGVEFSEIMTPIGIKSTTRNHLYCATTAAILSFFLNFPVNNRPIASYKWLTASAKFVHFCIVYCKMPTLKLSAWTSKNNSNKEVAWSQLNYQSTRDGVSSFLPPQYGNSSSTLLLSNMKNSLVPKVPYSTARITHSPLTYSFPSSPGLKFIRLYFLSSLYLMMIPSDKAYFSVKAGPYTLVSDFNPSDFAEELNSKFFTKDFLLNVREDKLTITLTPSPLISKAFAFVNGIEIFPVPKSIYFPFSKVPVPYLGHQKILLTNDEYALETLYRVGICGGENAFGMWSDDSRYISRSHIGGVLNIKSVTVSLNYTTLSSKDYNYSAPEEIYWTARTMGSDGDANMKYNLTWSFPVDSGFKYLVRLHFCEISIGVTKPNQRVFKVYINNQTAEERMDVVASAGAPFTPLHKDYVVMVPTETGRRKDLWISLQPNLESKPKYADAILNGIEIMKISDSNHSLAAMFQLRSEQRNKKVQHVIIVVAATLGTIFGLFFTFFINIHRAGKKLKWRTSHILPSNSGSSHKDIQPTVTSGLCHQFTLEEISIATSNFSEDLVIGEGGFGKVYKGIMHHDGVTAVAVKRSNRRSGQGYKEFQTEINFFSFCHMNLVSLLGYCQEGNELILVYEYMAGGPLSDHLYKKRKQPLSWIQRIKICIGAARGLHYLHTSTRHPVIHRDVKSANILLDENWVAKIADFGLCRTVPSLYHSHVSTEVKGTLGYLDPEYYKRRKLTQKSDVYSFGVVLFEVLCGRAAVNPVAVEEENEKVGLATWAMHCYKCGSIDELVDPHLAGNVRPECLRAFVDLGIHCLADRTADRPTMGEVLNTLERILYLHDSLEEQEPHTISTIACD*


CDS Sequence:
>Vu_14825.1
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G


Promoter Sequence:
>Vu_14825::LG3:53004985-53006985(+)
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Gene Sequence:
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