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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14815 LG3 52862904 52867186 PREDICTED: squamosa promoter-binding-like protein 6
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14815.1
MESWSYVPEEKGYLFSDEMDFSLDAFMRSRRTLVEWDNKSNFERDGFNSDREAVKSMEFVDLGFPDLLQKSFHGSQPLETSSYELNSNSSRRGNSSTQVIALDSTMGEEESDSKHLSSLVEAKTHDSSLIDLKLGRLADCKGASSDKVAKEGFTLTSINPTTLSKRARTSSLSAQAPVCQVYGCNMDLSSSKDYHKRHKVCDAHSKTAKVIVNGLEQRFCQQCSRFHLLAEFDDGKRSCRRRLAGHNERRRKPQFDYMTGKQHKILHSYQGTKYLGSSLQNKPQFPFQNIFQSGILFHGKHAQNSQSGRIKLEEDSLYSSQLAAPVTLGQELSSCALSLLSDQSQYPSRHAAGNPLAGSRILHGIHIQDRDDLVSQTSLRITSSADKYAANESFPCNTASKDVIKNQTAPLSNAVHALQDHHGDDICQPSDLFDIKHRLSSEHGATVDLFQLSSHLQRVEQQRNSVLVKWENEDYCFPTV*


CDS Sequence:
>Vu_14815.1
ATGGAATCTTGGAGTTATGTCCCTGAAGAGAAAGGCTATTTGTTTTCTGATGAAATGGATTTTTCACTTGATGCGTTTATGAGAAGTCGAAGAACATTGGTTGAATGGGACAACAAATCCAACTTTGAGAGAGATGGATTTAATTCAGACAGAGAGGCGGTTAAAAGCATGGAATTTGTGGACTTGGGTTTCCCTGACTTGTTGCAGAAGTCTTTTCATGGTAGCCAACCTCTAGAGACATCAAGCTATGAACTAAATAGTAATTCTAGTAGAAGAGGGAATTCCTCTACACAAGTCATTGCTTTGGATTCTACTATGGGGGAAGAAGAATCTGATTCAAAGCATTTAAGTTCTCTAGTTGAAGCGAAGACTCATGATTCTTCCCTGATTGATCTGAAGCTTGGGAGATTAGCAGATTGTAAAGGTGCAAGCAGTGATAAAGTTGCAAAAGAAGGGTTTACTTTGACATCCATAAATCCAACTACGCTTTCAAAGAGAGCTCGCACTTCCAGCTTATCTGCACAGGCTCCTGTATGTCAAGTTTATGGTTGTAACATGGATCTTAGTTCCTCAAAAGATTACCACAAAAGGCATAAAGTTTGTGATGCTCACTCCAAAACGGCCAAAGTTATTGTAAATGGCCTTGAACAAAGGTTTTGTCAGCAGTGCAGCAGGTTCCATTTGCTGGCCGAGTTCGACGATGGCAAGCGCAGTTGCCGCAGGCGCCTAGCTGGACACAATGAACGCCGGAGGAAACCTCAATTTGATTACATGACTGGTAAACAGCACAAGATTCTTCACTCATATCAAGGTACCAAGTATCTTGGGTCCTCATTACAGAACAAACCCCAGTTTCCCTTTCAAAACATATTTCAAAGTGGCATCCTTTTCCATGGAAAACATGCTCAGAACTCTCAGAGTGGACGCATCAAACTGGAAGAAGATTCCTTGTACAGTTCCCAACTTGCTGCACCCGTCACACTTGGTCAGGAATTATCAAGCTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAGATCAGTCACAGTATCCATCACGCCATGCAGCAGGAAATCCATTAGCCGGTTCCCGAATCCTTCACGGCATTCACATTCAAGATAGAGATGACCTAGTTTCCCAAACATCTTTGAGGATAACAAGTTCTGCAGATAAATATGCAGCAAACGAGTCCTTTCCATGCAACACCGCCTCTAAGGATGTTATCAAGAATCAAACCGCACCATTATCTAATGCAGTTCATGCTCTTCAAGACCATCATGGAGATGATATTTGCCAACCATCAGACCTGTTTGACATCAAACACCGTCTTTCCTCGGAACATGGAGCTACGGTTGATCTGTTCCAGTTGTCCTCACATCTTCAGAGGGTGGAGCAGCAAAGAAATTCTGTTTTGGTGAAGTGGGAAAATGAAGACTACTGTTTCCCAACTGTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_14815::LG3:52867186-52869186(-)
GTCGTTCCATTTTTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACTTTTGCTTATTGTTGAGGATAAATTATAAAATTATTCCATAAACAGTATTATGTCGGACATATTAGTTTCTAAATGTGTATTATATCAATCAAAGAAATCCTTAAGTTTCATTTCATTATATGTTTTGTTCTTTTGTTTAACTTTTTGTAATTTTTATCCCTATTATGTGTTTTGAATTAATCTTTTATTGGTTTTTTCTTGTTAAAAAGAATTAAATCATTTTAAATATTCTTCCATTCAATTCTTCCTGTAAATTTCAAACACATTTCTAACTTTGGATTATTTACAATTGATTTGCATCCCAAATCCATTATGAAACCCTAAAAACTAGATAAAAAACATAACAGTATTAAAATTTCATGAATGAAAAATTTGTTAGAGTATTAAATTTGTTTATTTGTAAAAATTAAAAGAGAACAAAATTACATATAATTTGTATTAAGGAAATGGAAAGAATGATTAAACTCAGTTTTTAATATTTATAACCTAAGAATTAATTTGACAGAAAAATACCCATTAAAAAACCATACACATAATTTTCATCACCCAAAAACTAACCAAGTGACTTTCAATAAACTTAGTAGCTTCTGAGGTAAGAGACCCACCAAACTAAATCTGTTAAATGGAAATTTTCTACTTTGGCATAAGAGTGTCTTGAGAAACGAAATTGTTCCCTCTAGGGTGAAAAAAAATCATAATCATGATCAACCATGTTGTTTAGAGTTTTACTTCTAACTACTAATTTAACTTTTACTCAAAGTTTTAGTCATCATAGATACAAAACAACAACTAAATTCAAAAACACACATTTTCTTCATTATTATAATGTTCAACTTCTTTGGTATGTTTATGTAAATAGAACCAAATCAAATGTACTAGAATGGAATTCCCATGCTGTCTCAAAAGCTACAAAAGACCTCAACATGCTTTTGGTTTGGTAGTAGAGGAAGAAATCATGTTGACTCATGCTCTATCTGCTTCAACGATGCCACTGCTCTGAAAAAAGAAAAAATCTCTAAAAAAAAGTTCTTTTTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCACTGTTCACTCTGCTGTGTGCCAAAACTAAAACCACTCACAAGGTGCCACTAATCTGTCAGGTTATTTCAAGATACCATTTTTCTGGTGTTTGGTTCCCAAGAAACTGTTTAGAATAGAACCACGGAACAGTGAGAAGGCCAATTCATTTTCTTCAACCTGTGTCAGCACCAAGCTTGTTTTGCATTTTTTTCTTCCAGCGGTTTGTTTCCCTTTTCCTCTCAAGAAAAGAGTCCTTTCAGCTTCTTCTTTCATGGGCATATTCTTTTTCACCTTTATTCTGCTCCAACACTGTTTGAACTACCAACATTTTTACTTTGTCCATTGGGGATTTGAGCTTAAAAGGAGTTGGAACTTGGGAGATATCTAATCATGCAATCTGGGTTTGGTTTGATTTGATTTACCCTTTTCAATTTTTGTTTCTGGGTGCTGGGTTTACCTCAGCGTCAATGTCCCTGTCATAAAAAGTTGAGATTTTTGGATGCTATTTTTGGCTGGTAGCAGGTCAAGGATTAAGAGTTTCCTGACTATAAAACAAAGTGGGATCTGATTTTCTTTTTCTTTAGCCTTTTCTTCTTTTGGTGAAAAATTTGCTTTCACATGTCTGTGGGAATTTGTTATATTTTGACACGGTTGTCATACCTGTTTGTTTTATTTTGTTTCCCTAGTGTTCATTAGTACATGTACTTTATTTGTCTACAGCTATTAGTTATGTCTTGAGCAGTGTGTATTCATATATGTATATAGATATGCCTGAATTTGGTAAAACTTTTGATTTGGCATGGGAGTAATGTATTTCTTTTGATTGTGGTAGGATTCTCCATTATTTCACAGCATCTGTGACTTCGATTTGATTGTACTA


Gene Sequence:
>Vu_14815(-)
ATGGAATCTTGGAGTTATGTCCCTGAAGAGAAAGGCTATTTGTTTTCTGATGAAATGGATTTTTCACTTGATGCGTTTATGAGAAGTCGAAGAACATTGGTTGAATGGGACAACAAATCCAACTTTGAGAGAGATGGATTTAATTCAGACAGAGAGGCGGTTAAAAGCATGGAATTTGTGGACTTGGGTTTCCCTGACTTGTTGCAGAAGTCTTTTCATGGTAGCCAACCTCTAGAGACATCAAGCTATGAACTAAATAGTAATTCTAGTAGAAGAGGGAATTCCTCTACACAAGTCATTGCTTTGGATTCTACTATGGGGGAAGAAGAATCTGATTCAAAGCATTTAAGTTCTCTAGTTGAAGCGAAGACTCATGATTCTTCCCTGATTGATCTGAAGCTTGGGAGATTAGCAGATTGTAAAGGTGCAAGCAGTGATAAAGTTGCAAAAGAAGGGTTTACTTTGACATCCATAAATCCAACTACGCTTTCAAAGAGAGCTCGCACTTCCAGCTTATCTGCACAGGCTCCTGTATGTCAAGTTTATGGTTGTAACATGGATCTTAGTTCCTCAAAAGATTACCACAAAAGGCATAAAGTTTGTGATGCTCACTCCAAAACGGCCAAAGTTATTGTAAATGGCCTTGAACAAAGGTTTTGTCAGCAGTGCAGCAGGTATTTTTGGGTTCCTTTGATGGATAGTTAGTTATATTGAAGTTTAATACTTCTCTTACATTATGATGGTCAAACTCTTGCCATTTGTAAGCTCCTTATATTTGTTTAGCTGGTGAGGTACCTCAATCCTTTTGATTGGAAACACATAAAATTTGAGCAAATTATTTGCTAGAAAAAACTCAACAAAAGGTATCAGGATTTGTTTGGTTTAAAGAGAACAATCTTTTGTTTTGCTCATAATTACAAGTATTATATTGTTTCTTATTTTAAAAAAATTTCACACAATCTTCTCAGTGAAAACATAAAACAAGGTCAAACAAGTTAACATTTTGTAATTACTAGTAAAAGGGACATAAAAACTGAAATCTTTTTCTCAAATCTAATAATCTTAGTGCTTCCCTTATTTTTACTTTCATTTGTGTCCAAGTGGGTTCTATTAATGCAATTATTTAAAAGTTTTCTTTTCATTCAACAAATGTAGTTCAAATTGGTTTGACAAATGAGAATGCATTATTATTAAACTCCAATCAATCATTTTGTATAACCACAGATTGACTGTCTTTAATTTGTGGTGGTAAATTTAACCTGATGGTTACCTATGGATTAAATTACACCATTTGTTTTGTTTTAAAATTAGGTTCCATTTGCTGGCCGAGTTCGACGATGGCAAGCGCAGTTGCCGCAGGCGCCTAGCTGGACACAATGAACGCCGGAGGAAACCTCAATTTGATTACATGACTGGTAAACAGCACAAGATTCTTCACTCATATCAAGGTATGAAAATTTATCTGTTAGTAAGTACCTTCATTGGCATTAGATAAGACAGAATTATCATTTAAATTTTCAACTTTTAAATCTTCTACTTTATTGTCCAAGTGAAATTTTTTATATTGTTAATTTAATGACGTGTTGTATTATTTAGCAGCTTTAGTGGGTGCTTTTCGTGTCCAGTTTGTTAAAGCGCATTCTGTTTTAGAAAACTTCTGTGGTTTTAACTTCTTTAGCAGAAATACAATTTAAACGAACTAGCAGGTATGCAATAGATTGATGACGAAGGGATAACAGATTTCGGAAACAAGGTAGTGATAGTTTTGTTTGATTAAAGATAAAGAGAAATCATTCAATAAAGTTTAGACATTGTAGAATCATAATGTTCAGACAAACACTGATGCTCTAGTAGGAAAAACTAGAGGTTTCAAAGAGGCTTGTTATTAAAGGAATCAAGAAAACTTATAGCACTCTGTAATAAAGATTAGGAAGAACAATTCATATTGAAAATCCTTGTTTATCGTTTCTTATTAGGATTTATGTAGCTGATAACTGCTCATGCGTAGCTCAATGTAACTTAACTATGCAGAAATGATATTGATAGGAAGCACTCAATACAGTAACCTGAAAACTAGAATCATATTTGAAAATTAACATCATGATGTTTATGATGATTTCTGTATGATATCATCTTCTCCGTACTAAAATACCTACTAAGCAAACATGCCATAGCCATGATGAGAAAAATAAAAAAAGAAATTAAATTCATACCCATTTCTTAAATTTGGGTAGCATACTTCAAATTAAATCTGATAGGATCTATGCAGTAGTACAAAAAGTTGAGTTTTTAACAAATCAATAAATGCCGAAATTGAGAGCAAATGTTGTTGAGTGGCTGCATTTTGTAGCATTTCTATGTCAGGAGACTTTCACATTCATTTTACTTGGGGTTTTGGGTGAAGATCCCTCTGCATATATAACCATGTATTGGAGGGCTTAGAATAAAATTGTAATCTGATTGGTGTAATTTTGAAGATTGGTGTAAATATTTTACTTTGATAAGCTGAGGCAGCAATATATGACATTGATAGGTATTATCTTTCCCTTATGTTTTTTGTATTTCTCTTTTAATGTATGCTCTATTCTTTGTGATCATATTCCTGAGTTTATGATGCACAAGTTGTATAGTAGAAATCTCTTATTCAATTGTCAAGGGACCTCATATAAATAAGTTTTGGAATTTGTTGTTTGTTGCCTCTAGACATAAACTATATATTTCACGCTTTTTTGGTCACTATTAGTGCAGATATGTCACGAACTTTGTCTGATAGTGTATAACTAAATAATGTTTGTTTGATTCTTTATAATTTATTCTTCAATTGTTCTGTTCGATCAAATATCAATCAATTATGGTAATGAAGTCATTTAAAGAAGAAAGCCAAATGTTTCTTCTTTTAACAGTAAGATGCCAATACCATAGGATATTTGGGTCAACTCAAGCTAAGTTGGCTATATTAGCTGCACTGAAAGCTTCTTTTATGCTCCCTGTCCAATGACTTTTTGCCAACATCAGAGGAGCTTTCAAAAGATGATGATACAACTCCTTCCATGAACTAAAATTAAAACCATTAAATCCTGAAAAGACAAGCCTGAATTTTTTAAACATTTTAGACAAAGGAAGCACTTACAGGTTCTTTAAATTATGTTATCTCCTTATATCATGGTCCCGGGGAGAGATGTGGACCATTTAACTAATGTTGGTATGCATTTGTTAGAATTTTTTATGCACGAAGTTCAAGCAAAGCATACCAGTATTGAAGTATCTTTTCTTTATCATTGTAGGACTTTTACATTGCTATTCCTCAGATACCTATAAAATTTTATTTGATTCATAATTAAAAACAGAAAATCATGGTGGAATGTTCTTACAAAGTGTATTCTATAGTCACTGAGAAATATAAGATGCATTGTAAACAAGACAAAAATAATTGTTACTGTTCTAATGAAGTTGAACAAGATCCTTTCCTAATTTCATCTGATCTCCACAAGTGTTCAAGAAAAGTTTCCTTGTTTTTTTCCCTGTTGGATGTTTGTTATTCCTGTCATAATCTTACTTGTTCGAACAAACCTTTTCAATGGGAAGGGTATATGCACTTACACTACATGCACCAAGAGCCAAGAACTTCTCTTACACTGATTGTGTTATCAGGTACCAAGTATCTTGGGTCCTCATTACAGAACAAACCCCAGTTTCCCTTTCAAAACATATTTCAAAGTGGCATCCTTTTCCATGGAAAACATGCTCAGAACTCTCAGAGTGGACGCATCAAACTGGAAGAAGATTCCTTGTACAGTTCCCAACTTGCTGCACCCGTCACACTTGGTCAGGAATTATCAAGCTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAGATCAGTCACAGTATCCATCACGCCATGCAGCAGGAAATCCATTAGCCGGTTCCCGAATCCTTCACGGCATTCACATTCAAGATAGAGATGACCTAGTTTCCCAAACATCTTTGAGGATAACAAGTTCTGCAGATAAATATGCAGCAAACGAGTCCTTTCCATGCAACACCGCCTCTAAGGATGTTATCAAGAATCAAACCGCACCATTATCTAATGCAGTTCATGCTCTTCAAGACCATCATGGAGATGATATTTGCCAACCATCAGACCTGTTTGACATCAAACACCGTCTTTCCTCGGAACATGGAGCTACGGTTGATCTGTTCCAGTTGTCCTCACATCTTCAGAGGGTGGAGCAGCAAAGAAATTCTGTTTTGGTGAAGTGGGAAAATGAAGACTACTGTTTCCCAACTGTATGA

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