Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14809 LG3 52751429 52754237 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 52751601 missense_variant p.Leu16Ser
T/C 52752296 missense_variant p.Tyr248His
G/C 52752338 intron_variant
C/G 52752392 intron_variant
A/C 52752633 missense_variant p.Glu324Asp
A/G 52752635 missense_variant p.Lys325Arg
G/T 52752685 missense_variant p.Gly342Cys
A/G 52752692 missense_variant&splice_region_variant p.Lys344Arg
A/T 52752822 intron_variant
C/A 52753013 synonymous_variant p.Ala397Ala
C/T 52753031 synonymous_variant p.Asn403Asn
T/C 52753041 synonymous_variant p.Leu407Leu
A/T 52753133 missense_variant p.Leu437Phe
A/G 52753199 synonymous_variant p.Arg459Arg
C/A 52753214 missense_variant p.Phe464Leu
T/A 52753268 missense_variant p.Ser482Arg
A/T 52753269 missense_variant p.Ser483Cys
C/T 52753271 synonymous_variant p.Ser483Ser
G/C 52753283 synonymous_variant p.Pro487Pro
T/A 52753704 intron_variant
T/A 52753868 missense_variant p.Asn651Lys
T/C 52753873 missense_variant p.Phe653Ser
C/T 52754071 missense_variant p.Pro719Leu
C/T 52754140 missense_variant p.Ser742Leu
T/G 52754149 missense_variant p.Ile745Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14809.1
MIFIVLLTMLHNARALIVLDNVDQVEQLRMFTGNRDTLLRECLGEGSKIIIISRDEHILRTHGVDDVYQVQPLSWENAVQLFCRNALKVNYILSDYEKLARDVLSHAQGHPLAIEVIGSSLFGRSVSQWKSALARLKENKSKSIMDVLRISFDELDEEDKETFLDIACFYNGYEEIYVKEILSFRGFHPEYGMQVLVDKSLITNNYGRIYMHSLLMDLGRSIVREKSPKEPRKWSRLWDYQDFHNVMLHNQEIDNLEAIVVKNEEWMFGKTTMKADGLSNIRQLKLLKLENVNFSGSLNHLSNELGYLTWNKYPFKCLPPSFRPEKLVELKLRWSSIQRLWEGTKLLHNLKRLDLSYSKDLIEMPDVGEALNLERVDLEGCIKLQKINPSIGLLRRLAILNLKNCKELVSLPRSIFGLNCLEYLSISGCSKLYNNQLLDEPRNTEYLKKLYLVEAPIHLRSTPSFIKEMLSWPSDLLYLRSQSSCLLPSSPSHPCLRELDLSFCNLVQIPDAIGKLHCLEKLNLKGNNFTTLPNLKDLFKLYYLNLQHCKRLKYLPDLPSRTHLPSKVYMLPFPYSPSILGRLVEDDEDKAGLIIFNCPELVDRERCSSMSISWMIQIVQANHQYGSLTSTTIGPDVESIIPGSEIPEWFNNQFQSRLNLIEINSSPVENDNDWIGVVCCVIFGRGNEMEMRYPRPYYPRPDNPIKKPPLDLRRDPTMEPSDHMWLFYFSRKQFIEQRDWLGSRFIIPEMKKFRYAVYVKKYGYRWVYEQDLIL*


CDS Sequence:
>Vu_14809.1
ATGATTTTCATTGTTTTATTGACGATGCTACACAATGCCAGGGCACTTATAGTTCTTGACAATGTTGATCAAGTTGAACAACTGAGGATGTTTACAGGGAATAGAGACACTTTGTTACGTGAATGCTTAGGTGAAGGGAGCAAAATCATCATAATTTCTAGGGATGAACATATATTAAGAACGCATGGAGTGGATGATGTTTATCAAGTGCAGCCGTTGAGTTGGGAAAATGCTGTCCAGTTATTCTGTAGAAATGCTTTGAAAGTTAATTATATTTTGAGCGATTACGAAAAGTTGGCCCGTGATGTACTATCACATGCTCAAGGACATCCTTTGGCTATTGAAGTAATTGGTTCATCTTTGTTTGGCCGAAGTGTGTCTCAATGGAAAAGTGCATTGGCTAGACTAAAAGAAAATAAAAGTAAAAGTATTATGGATGTTTTACGTATAAGTTTTGATGAGCTGGATGAAGAAGACAAAGAAACATTTTTGGATATTGCTTGCTTCTACAATGGGTATGAAGAAATATACGTGAAGGAAATTCTAAGTTTCCGAGGATTTCATCCTGAATATGGCATGCAAGTTCTTGTTGATAAATCACTGATAACCAATAACTATGGGAGGATATATATGCATAGCTTGCTAATGGATTTGGGAAGGAGTATTGTTCGAGAAAAATCACCTAAGGAGCCCAGGAAGTGGAGCAGGTTGTGGGACTACCAAGATTTCCACAATGTTATGTTACACAATCAGGAAATTGACAATCTTGAAGCCATAGTTGTAAAAAATGAAGAATGGATGTTTGGTAAAACAACAATGAAGGCAGATGGTCTGTCGAACATTAGACAGCTTAAGTTGCTTAAACTTGAGAACGTGAACTTTTCAGGAAGTCTCAATCATCTTTCGAATGAACTAGGATATCTTACTTGGAACAAATATCCTTTTAAATGTTTGCCTCCAAGTTTTCGGCCCGAAAAACTAGTTGAGTTAAAACTGAGATGGAGCAGTATTCAACGACTGTGGGAAGGCACAAAGCTACTGCACAATTTGAAACGTTTGGATCTGTCTTACTCCAAAGATTTAATTGAGATGCCAGATGTTGGAGAGGCCCTAAATCTTGAAAGGGTAGATCTTGAAGGATGCATAAAGCTCCAAAAAATCAATCCATCGATCGGTCTTTTGAGAAGGCTTGCCATTTTGAATTTGAAAAACTGCAAAGAGTTAGTGAGCTTACCAAGGAGCATATTTGGCCTGAACTGTCTTGAATATCTAAGTATCTCTGGGTGTTCAAAACTTTATAACAATCAGTTATTAGATGAACCAAGGAATACAGAGTATTTGAAGAAGCTTTATTTAGTTGAAGCTCCTATTCATCTCCGATCAACACCCTCTTTCATAAAAGAAATGCTTTCGTGGCCTTCAGATTTGTTGTATTTGAGATCACAAAGTAGCTGTTTGTTGCCGTCCTCTCCCAGTCACCCTTGTTTGCGTGAACTCGATCTAAGCTTCTGTAACTTGGTTCAAATTCCTGATGCCATTGGAAAGCTACATTGCTTAGAGAAGCTAAATTTGAAGGGAAACAATTTTACTACACTTCCCAACCTCAAGGACCTTTTCAAACTGTATTATTTAAACTTACAGCATTGCAAGCGATTGAAATACTTGCCTGATCTCCCTTCACGAACACACTTGCCCTCAAAAGTGTACATGCTACCATTCCCATATTCACCTTCTATCCTTGGACGTTTAGTAGAGGACGATGAAGACAAGGCAGGATTAATCATCTTCAACTGCCCAGAATTAGTTGACAGGGAACGCTGCTCAAGCATGAGTATTTCATGGATGATACAAATTGTTCAGGCGAACCATCAATACGGGAGTCTTACATCCACCACAATTGGTCCAGATGTTGAAAGTATTATCCCTGGAAGTGAAATACCCGAGTGGTTCAACAATCAGTTTCAGAGCCGGTTAAATTTAATAGAGATTAATTCCTCTCCCGTCGAAAATGACAATGATTGGATTGGTGTTGTGTGCTGTGTAATATTCGGTAGAGGCAACGAAATGGAAATGAGATATCCAAGACCATATTATCCAAGACCAGATAATCCCATTAAAAAACCTCCACTCGATTTGAGAAGAGATCCAACCATGGAGCCGTCAGATCACATGTGGCTATTTTATTTCTCCCGGAAGCAGTTCATTGAACAACGTGATTGGCTTGGCTCGAGATTTATCATACCGGAGATGAAAAAATTCCGTTATGCTGTGTATGTCAAGAAATATGGGTATCGCTGGGTATATGAGCAAGATCTAATTCTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_14809::LG3:52749429-52751429(+)
GAGAACAATCTGTTCAATACAACGAGAACAATCTCCCTGAAACTCATAAGTCCTATAGTTAACAGTTCGACTAAAGCCGAACGATTAACTCGGACTTGGAGGGCTTATGTTACTATGCACTTGCATGCAACCGATCGGTATTGGTCTATCAGCTCCTCAGCCGGTCGGTCTCGGCAAACCTCTTGTCGTTCGGTCTCGACAGTTGTTGAGCAGATTTAATACGCAAATAAATGTGATAACGACTACCGTTAAACAATTAAGGTTTGCATTAATGACCATTAAGAGGTAAATTAATTTAGATTCCTTTAAACTCTATAAATAAGGGTTAGGTTTGAGGTAAAGTCAAATTCAACTCAGACTACAATACGTCCTATTTGGACTTCAATATCTAACTGTAACAAACAGTTCATAAAACCACTCTTAACTTGAGCGTCAGAGTGTTTTTTGCAGGTACCTCCCCTCTTTTACAACCGAGCGGCCAATATTGAAGGTGATCGATCGGTCTAAACTGGAAGAGGACAAGCGAAGCGCACCAGTCGAAGGTTAGTGTCTCGATCTTACAATTCACACCAAAACAAACAATAATAAAAATGAATCCACATCTTGACCAAGAGGAAGCAAATAAGATGTCATGAATGTGACTTGATAATTATTATAAGCACAATTATATGAAAACACGCAAAACTGGCAGACAGGATCAATTATACAATAAATATGACCTTCTTAGAAGAGGCTGGAAAAATGAAACGCGGTTCACATCATGGGTGGATCTATATTTCTTCAATGTTTGCTTTCCACTTTCACAGCAATTCCATAATAGTCTTCACTCTCAACAAATGCCTTCTAACGCCATCGTCCAATACAGCTCTTCTTCATCTCATGCAATTAACACATACGACGTATTTGTGAGCTTCCGTGGTGAAGACACGCGCAACAACTTTACTGGTTTTCTCTTTCAAGCTCTCCGCAGAAAAGGCATCCATGCCTTCAAAGATGATCAAGATTTAAAAAAAGGTGAATCCATTGCACCCGAGCTGCTGCAAGCCATTCAAGCCTCTCGACTTTTCATTATTGTCTTCTCAAACAACTATGCTTCCTCCATTTGGTGCTTGCGTGAACTGGCAGAGATTCGTAACTGCGCTCAAACTTCGGCAAGACGTGTTATACCTATATTTTATGATGTTGATCCTTCGGTGGTTCGCAAACAGAGTGGATGTTATGACATATCAGAACACGAATACAGATTCAGAGAAAATAAAGCCAAGATGGAGGAAGCTAAGAGATGGAGAGAAGCTCTCACGGAAGTGGCCAATCTCTCTGGTTGGGATATTCGAAATAAGTGAGTGATCCTCTCTCGTTTCAAGATCGATCACAAATATATATAATTATACAGTGAGTTATATAGCTTTGAATTTATTTAATACTTTCTAGTTCCTGCTGTTTTCTGAAATTCACTATCCCTTTCTAAACTAGAGTTGAGAGATGTTAAGAATTTAGGAAAATTTTAACAGAGTGGTTGATGTGTTGTTATTGGTATGACTTTCGAAGAGAGGTTTAGCAATGTAAGTATGACTTATAGAAGGTAATGTATGTTTGAGAAATATTAGTAAGCTAGAGAAGTTTTGGATGATAGAAAATAAGTCCAAATGTATAATTGTTTGATGAAATGAAAGTTAAAAAAGTCTTACGTTTACTTTGTCCTGTATATACTCTATTTTGTTGTGTTGTGTGATGTTTTGCCTTAATTTCATTTAAATTTTCAGGCCACAATATGCGCAGATAGAAGAAATTGTTGAAAGCATAACAAATATTTTGGGTCCCAAAATTTCAAGTCTTCCAAAGGACGAACTAGTTGGGATAGAGTCTCGGGTTCAAGAATTAAAAGATCTTCTGTGTTGTGGATCACTTAATGATGTTCGAGTCGTTGGAATTAGTGGGATGGGTGGCATAGGAAAGACAAGTCTTGCTTGGACTTTATACGAAAGAATTTGTCATCAATA


Gene Sequence:
>Vu_14809(+)
ATGATTTTCATTGTTTTATTGACGATGTAAGCAAAATTTATCGAGATTCTAGTTCGTTAGGTCTACAAAAACAGTTAATTTCACAGTCTCTAAACGAAAAAAATCTAGAGATTTGCAATGGTTTTGAAGGAACATGTTTGGTGTGGTCTAGGCTACACAATGCCAGGGCACTTATAGTTCTTGACAATGTTGATCAAGTTGAACAACTGAGGATGTTTACAGGGAATAGAGACACTTTGTTACGTGAATGCTTAGGTGAAGGGAGCAAAATCATCATAATTTCTAGGGATGAACATATATTAAGAACGCATGGAGTGGATGATGTTTATCAAGTGCAGCCGTTGAGTTGGGAAAATGCTGTCCAGTTATTCTGTAGAAATGCTTTGAAAGTTAATTATATTTTGAGCGATTACGAAAAGTTGGCCCGTGATGTACTATCACATGCTCAAGGACATCCTTTGGCTATTGAAGTAATTGGTTCATCTTTGTTTGGCCGAAGTGTGTCTCAATGGAAAAGTGCATTGGCTAGACTAAAAGAAAATAAAAGTAAAAGTATTATGGATGTTTTACGTATAAGTTTTGATGAGCTGGATGAAGAAGACAAAGAAACATTTTTGGATATTGCTTGCTTCTACAATGGGTATGAAGAAATATACGTGAAGGAAATTCTAAGTTTCCGAGGATTTCATCCTGAATATGGCATGCAAGTTCTTGTTGATAAATCACTGATAACCAATAACTATGGGAGGATATATATGCATAGCTTGCTAATGGATTTGGGAAGGAGTATTGTTCGAGAAAAATCACCTAAGGAGCCCAGGAAGTGGAGCAGGTTGTGGGACTACCAAGATTTCCACAATGTTATGTTACACAATCAGGTTAAATTGATAGTTTGATTATAAAATCTTAGGATGCAACTTTTAGTATATGTATATACTTGAAAAAAAAATCTAGAAATTTGATCCTTTTGTGCAATGGTGTAGGAAATTGACAATCTTGAAGCCATAGTTGTAAAAAATGAAGAATGGATGTTTGGTAAAACAACAATGAAGGCAGATGGTCTGTCGAACATTAGACAGCTTAAGTTGCTTAAACTTGAGAACGTGAACTTTTCAGGAAGTCTCAATCATCTTTCGAATGAACTAGGATATCTTACTTGGAACAAATATCCTTTTAAATGTTTGCCTCCAAGTTTTCGGCCCGAAAAACTAGTTGAGTTAAAACTGAGATGGAGCAGTATTCAACGACTGTGGGAAGGCACAAAGGTAGTATACATTAACTAATTTTCCATTTCTATTTTTTAAAAACAACTTCTCTCTCTTTATATTTCCTTTTTCCTTTAACTAATTTCTGAAAAAGGAAATTAAAGAAAACTCAATTGTGTCATTACTGAATTTGTTTGCTTCTGTTCTGCAAATTGTTGTAGCTACTGCACAATTTGAAACGTTTGGATCTGTCTTACTCCAAAGATTTAATTGAGATGCCAGATGTTGGAGAGGCCCTAAATCTTGAAAGGGTAGATCTTGAAGGATGCATAAAGCTCCAAAAAATCAATCCATCGATCGGTCTTTTGAGAAGGCTTGCCATTTTGAATTTGAAAAACTGCAAAGAGTTAGTGAGCTTACCAAGGAGCATATTTGGCCTGAACTGTCTTGAATATCTAAGTATCTCTGGGTGTTCAAAACTTTATAACAATCAGTTATTAGATGAACCAAGGAATACAGAGTATTTGAAGAAGCTTTATTTAGTTGAAGCTCCTATTCATCTCCGATCAACACCCTCTTTCATAAAAGAAATGCTTTCGTGGCCTTCAGATTTGTTGTATTTGAGATCACAAAGTAGCTGTTTGTTGCCGTCCTCTCCCAGTCACCCTTGTTTGCGTGAACTCGATCTAAGCTTCTGTAACTTGGTTCAAATTCCTGATGCCATTGGAAAGCTACATTGCTTAGAGAAGCTAAATTTGAAGGGAAACAATTTTACTACACTTCCCAACCTCAAGGACCTTTTCAAACTGTATTATTTAAACTTACAGCATTGCAAGCGATTGAAATACTTGCCTGATCTCCCTTCACGAACACACTTGCCCTCAAAAGTGTACATGCTACCATTCCCATATTCACCTTCTATCCTTGGACGTTTAGTAGAGGACGATGAAGACAAGGCAGGATTAATCATCTTCAACTGCCCAGAATTAGTTGACAGGGAACGCTGCTCAAGCATGAGTATTTCATGGATGATACAAATTGTTCAGGTGTGCATACTCCTCCCTCCCTCTTCCCCTTCTTTTAATCTATTTATTATGAAAGAAAACAGCTACTAACGCATAACTCTGTGGTTGTAAAAGGCGAACCATCAATACGGGAGTCTTACATCCACCACAATTGGTCCAGATGTTGAAAGTATTATCCCTGGAAGTGAAATACCCGAGTGGTTCAACAATCAGTTTCAGAGCCGGTTAAATTTAATAGAGATTAATTCCTCTCCCGTCGAAAATGACAATGATTGGATTGGTGTTGTGTGCTGTGTAATATTCGGTAGAGGCAACGAAATGGAAATGAGATATCCAAGACCATATTATCCAAGACCAGATAATCCCATTAAAAAACCTCCACTCGATTTGAGAAGAGATCCAACCATGGAGCCGTCAGATCACATGTGGCTATTTTATTTCTCCCGGAAGCAGTTCATTGAACAACGTGATTGGCTTGGCTCGAGATTTATCATACCGGAGATGAAAAAATTCCGTTATGCTGTGTATGTCAAGAAATATGGGTATCGCTGGGTATATGAGCAAGATCTAATTCTGTGA