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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14758 LG3 52111490 52116264 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 52111556 3_prime_UTR_variant
A/T 52111588 3_prime_UTR_variant
G/T 52112242 downstream_gene_variant
C/G 52112679 downstream_gene_variant
C/A 52112740 downstream_gene_variant
A/G 52112745 downstream_gene_variant
A/T 52113841 downstream_gene_variant
G/C 52114984 downstream_gene_variant
C/T 52116202 5_prime_UTR_variant
C/T 52116241 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14758.1
MAPSPFTSLPFVFFTLLSILHLSHCKTLKRDVKALNEIKASLGWRVVYAWVGDDPCGDGDLPPWSGVTCSTVGDYRVVTELEVYAVSIVGPFPTAVTSLLDLTRLDLHNNKLTGPIPPQIGRLRRLKILNLRWNKLQDAIPPEIGQLKSLTHLYLSFNNFKGEIPKELANLPDLRYLHLHENRLTGRIPPELGTLQNLRHLDAGNNHLVGTLRELIRIEGCFPALRNLYLNNNYFTGGVPAQLANLTSLEILYLSYNKMSGVIPSSIAHIPKLTYLYLDHNQFSGRIPDPFYKHLFLKEMYLEGNAFRPGVNPIGFHKVLEVSDSDFLA*


CDS Sequence:
>Vu_14758.1
ATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGTACCTAAGCTTCAACAATTTTAAGGGAGAAATTCCCAAGGAGCTAGCAAATCTGCCTGACCTTCGCTATCTTCATCTCCATGAAAACCGTTTAACCGGAAGAATACCACCAGAATTGGGCACTCTACAAAATCTTCGGCACTTGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCTAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATACTTGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTACCTAGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_14758::LG3:52116264-52118264(-)
CAACTTTACAATGGACTCGTTCTCTTTTGGGGCAAGCTTTGATTGGATTTGCTCAACCTTTTCCATATCATCCTCTGCATCAATTTTCACACTACATATTTAGGAGTTCACAGGGGTTACCAAACTCTCCATTAACTAAAAGTTAAGATATTTCAGGATGTTCAAACGTTTGTTGCCCAATGTCTCAATAGCAAGTAATTGAAATATCAGCCTAAGCATCCCACAGGACTGCATCTACCTCTTCTTTCCACCAAATGGGAGAATTTGTTACTTTATTTCATTACTGGAGCTCCCCAATTCTCAAAGCATTCACACTGATTCATGTTTTGGTTCTACATCACTTTTACTAATTTTTCATTCAATAATTTACAATCAGAAAGCAAAACCCAGAGAGCAGATTTTTCTTACTGCACCAAGTCTCTACCAATATACTAGTATCAACCAATATACCAACTCAAATATCAAACACAAGATAAAGAGGGTTTGAACAACTTACCGTGATGGGCAGCACCAACGACGACGACAACAGAGTGGGCGACGACGACGACAACTGCAGGGACGAAGGCGGTAGAGTGGGAGAACGACGGTGCACTAATTCTCGCAGCAAATGGATGCACAATGTAGGAAAAACGGAGAAACTTCAGACGTACAAGGTTGAAGAAGAGAGGTCGCGAGAAAGGAGGAAAACGCAGGGTAACTTATTACGCGAAAGAAGATGCAGGTTCAGGCGAGGAAGAAAATGGAGGTTCAGGCGAGGAAGAAGACACAGGTTCGACCAGAGAGAAAATGATCGAGGAAAGAAGATGCACAGGGTAAGTTCTTACGCGAAAAAATTTTAAATGAGGATATGCTTCGGTTATTCAACAAACCGATGCCTCAGCTCAAATAGACCTCAATTCCTTAGAACCCGAGACATAATCTCTAAACATATGCCTCGGTTCCACAACCTACCTGATGTAATAGCAAAGTCCTATCATAAAGCTGGGTTGCAGAGGGGTTTGCAGTGGCACTGCAGGTTGTGCTAGGTATATAGGCATCGGGTCTGCTACCAACCGATGTAATAACACTTTTTCTAAAAAGTTGTCAGCCAAAAGTCTGATTTGCAGAGAGGTATAGGCCTCGATTCCATAACTAACCGATGCAATATGGCCTTTCCATTTCGGATTTCTCTAAATCGAGATATATACTTCGGTTTTTTCTTAACCAAAGCCCGTGCTATATAATTTGAATCTTTATATATAATTTTTCACCCTTAATATCCAAATACTGTTATTTATTATCTTTGTCAAAAGTTATTTCCGCAACATCTATTTCACTGCTTCGACAATTGTCTCTTTACTCTTCGAGCAAGGAAACATGTTAATTTTATAGTTTTTTCAATTACTTTTTCAACTTATAGCTTGATTTATCTTCTGAAAACTTTGTTTCGATTTACCTTCCTAGGAAGTGACTCTTTTTTTTTTTTCATTTTCAATTCATCTTTTTTCACACACACACGCACAAATTGTCTTGATTGATTATCTCTTCTTAACTCTTATTCTTATGAATGATAAAGCACGATGTGACTCATTTATCTTTCTATTTAAATGCTAAAATAAAAAATATTTTAAGATATTACTACACAATAATATTATAATTTGAATTATTAATACTTACACATAAAATTTTAATTCTTAATTATAATAACTTTTAAATTATCTAATTAAATATATTAATTAATTAAAATTTTGAAAAATATTTATATTTCTGTTTAACCACACATTTATTGTCCATACAAGTCATGGAATCTTGTTCAAAGAGATTAAATTTTCTAATTTATTAAATATAACTGTTATTAAGGTTAAGACACTAAATTGACAAATGGCAACCCACTCCTATTTTGCTATTTTAACTGTCAAAAGCCGATACAAGGCCATAGTCAATACCAATCAAACCAAACAGGCTAAATCCAATAACATAAAAAGTAATATAATAATATATAATATAATAAAAGATTGTAC


Gene Sequence:
>Vu_14758(-)
AATAAAAAACAAAAGAAAGAAAAGAAAACCATCAAAACCTCAGTGCCGACGCCAAGGAGTGTGTTGTTGGATGTTCAGATTCCAACATGATACCGCGTTCGCTCACTCTCAACTTCAATTGATCAATCACCAAAATCAAATTCCTACACCACACCTTCTCTCTCCTTTGCAAAATCTGAATCAACAACACGCAGCAAAACATCTCACTCAACCACACCAACAACACTTCAGATCTACGATTCCAATCCCACAACACAAAAAATAAACAAAAACCGATTTCTCCAAGCGGCCTCAAAATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGGTAACGTTAGCTACTTAACTCAGTCCCTTTACCCATGTCGTTTTCTCTCAACTTTTCTCCAATTCGGTTAATTGGGTTGTCGAGTTTTGCTTTTTCCCGTCATGGGTCGGAGTCGTTTATGTCTTCCTCGAATTTTTTGCAGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTGTGAGCATCATTTATCAATTTTCAATTGATTTAGAAAAATGCAAAAAATGTCCCTTTTTTTTGGAATTGTTAAGATAAAGGTTTTTTATTTTTAAGTTCAGTTGTTGCTGACGAGATTTGAGGTTGTAAAGTTGGTGTAATTGGGATTTGGTATTTTTCAGTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTGTAAGTTTTTATTTTTTTCATTAATCTATGTTTCCTTTAATTTTGATCCTTTAACGGGTTGAGAAACATGTGGTGTTGATTAACGCCTATGGTTGTGTTGGAGTTGAATGTTTGAAAGCCAAATATTGTGTTCTGTTTGTATGTTTTTCATATTTGTTTGCAGGATAGCGAGGAGTTTATTTGGTTGGTGTTTATTAATTTGATGCAAAATAATAAAGAAATTAATTATAAATGGTTGATTGAAATTTATGGGTTGAGATAATGCATTTGCAGTTCATCTGCGTTTTGTTTTGCTTTGTTGCTTTTAATTACAATTACTATATGTGTATCATTGAAATGCTTCCATTTTGATTCTCCCTTTGAAATTCTTATGAGTTGATGCACTGTGTACTTATGGCAGTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTGTATGAATTTTCTGATCCCTGTTCACTTTTTCTTTCTCTCTGCATTTTTTGTTCTGATACTTATGTTTGACGCAGTACAATTATTTATACTAGATTTTTATGTTAACAACTAATGTTTATTTAGGAAGATTTTTCTTTTTATTGGGTTTTTATTTAAGCAGTGGTTGATCATCTATAACCATTATTCTAAGATGTTATATTGATTCATTTTTTACCTCTCTTTCCTTCCAGAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGTGAGTAACTCTTACCTTCCTAATGTCTTTGGGCTTGCTTGTCCCTTTTTCATCGTTGCTTTTATTTTATTTAGAATTGTAACTGTAATGTCATATCTTTTTGCAGGTACCTAAGCTTCAACAATTTTAAGGGAGAAATTCCCAAGGAGCTAGCAAATCTGCCTGACCTTCGCTATCTTCATCTCCATGAAAACCGTTTAACCGGAAGAATACCACCAGAATTGGGCACTCTACAAAATCTTCGGCACTTGTAATAATCAAAGCATTTTAATTTAATAATATTCTAGTGCAGAGTACACGATTTATCGTACTTAATGTTTCCTAATACTGTTATACTTTATAGGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTGTAAGTTAATGCTGGTGAATTAGTTTCCTCAATATATTATCATTTGGTTTTAAATAATATTGTCTAAATTTTAACGTTTTTTTTGTGGAACCAGATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTGAGTGCTGCTTTTCCTTTTATCCTTTAATACCACTTTTCATTCTTCCTCCTCCTTTGAGCATGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGACAGTATTGCTTTACAATAATTCTACCCTTTTTGCAAGATCTGTCTCTTATTTATGGAATTTCCATAACATGATTATTGTATGTTGGAGGCAGGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCTAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATACTTGTAAGTTTGTCTTTCTCTTGTTGATTGGAATCTTCATTAGAAGTGTTGTGCATTGAATAAGGTCTAAGTTGTTTTTGATTTTTCATGAAACTCTTGATTTCGTATTTTGTTGCTACTTATATATCTTTTAATTTTATTTTATAATATACTTATTCTTTAATGAGGAAGATTCCTCACCTTTTTTGGACAGATGTTAATGGAGAAGCTAGTCTTGGAATACCTTATTAGATTTAGTAGTTGAAATATTGTTATTTTGATTGGTGACTTTTAGGAGGTAGTGGATGATATGATTCAGAGAAAGATTAACACTATGCGTATTCAAGAAACTAAATGGGTTGGAGAAAAAGGTATAGATCCAGACACTGCACGAGTTAAACTTTGGTGTACACTAGAAAGTTGGAGGTGATGACAAAATTGCTACTACTGGTGGAAAGTGGTGGAAGTAAAAAGAATCGGGACTAAATTTTACCTTAAAATTTACATTGGAGACTGATAATATTATTAATTTTTGCTTATGCGCCACAAGTAGGATCATAACCACTTTTAAAAGAGAAATTTTGTAAATGTTTTGGATCAAAGTTTTCCTCAAGAGGAAAAGATTCTCGTAGGCAGGGATTTAAATAGATATGTTGTTAATTGGGCAAGATATGTTGATGAATTAAAAGGTTTTGGACCAAGTGATAAGAAATCTTGGTGGTGGAACATAAGTGTTCGAGGAAAGAAATAAAAGAGTGTTTTAAGGATTTACACGAGTCCAATAATACTAAAAATTGGGCAAGATTTTGGAAACATAGAAATGAGGTAGTTAAAGTTGTGAATGAGGCACTATTCAAAGCGGTTGCAGAGTTTTAGCTTGATATTGGGACAAAGAATAAATAAAGAGCATATATATAATAAGCTTGCCAGAAGTAGGTAAAAGAAATCAAGAATTTTGGACCAAGATTTATTAAAGATCAAGAGAATTTCTAAGTTACTGCTACAGATCACGATATCAAAGAAATATGGGATAGCTATGTCCAAAGTTTTTCAATGCCAGATAAGGATTTATATTTAGCATGGAAGAATTAGAAAATTAACTGTTCGAACAAATTTGACTTATTGTGTAGAATTTTAGTTATTGAAGTAAAAGAAGCCTGTAAGAAGATGGATAATAGTAAAGTTTATTAGTTTATATAATTTGGTTGTTCACTGAGTTCAAGAGCATCATGTGATCTACATAGCTAACTTCACCTGCTGGGATAAAGTTATTGTTGCTGTTCTATTGGTTTACCGACAAAAAGAGTTTTTTGTATTGTAACCGGATATATCACAAAATTCAATGGCTGGGCTATTTTTAAACATACGAGTATATAAGTCATATAGAAATTGATGTGAGTGTATGTTTACCCTTTTTGATTTTGAGACTTATAAACCTTGTCCTTTAGGCATTGAGTTCTCTAAATGCAATTTAAGAACTAGAAACACATGCTTTACTTGCTTTCATTTATTTATTCTCGCTGGAAAACTATGGTCTTTAATATGCTGCTGTGAGCTTCAATACTACAAACACTTGGCTCAGAATTCTAATTTTCTGTAGAAAATGGAAATTTGAACTTTCCTTTCCATTTTGTTAGTAAGATTGATAAATATGTTCTCAGATACTTCCATGAAACTCAATTGTCATCTTTGTGAAGTTTTTAACAATTTCAAGATTTTTTTCTCTATTTCAGGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTGAGTTTCCAATAAAGTTGTGCAGATCACATTATATTGTTCTAAGAACTGAGAAATTTTATATGCTCTTGGCAGGTACCTAGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAATAAAAGCTCTAAATATTTATAATTTTTCAGGAACTGTACTTGTATAATTATTGAAAAAATCTTGTTCCTCTAATTACCTCAATGAAATACCCACATAGGTAATTCAATTTTGTCTAATATGTCTTGTGGTAATAAACAGTCTTTTTTAGTTTTAAGAGCTTTCCACGTTTCCAACAAGTTGTAATATATAGTCATGAACTCTTGTTATCAGCTTCAAAATTGAAGAATGATATTGCATATTTTTTTCAGTAAAAGAATATTACTGAATCCCTGTTGGACTCTAATGAGAGCATTTGCTTC

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