Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14730 LG3 51741235 51746057 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 4 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 51741302 3_prime_UTR_variant
G/T 51741556 3_prime_UTR_variant
G/T 51741584 3_prime_UTR_variant
C/T 51741607 stop_retained_variant p.Ter457Ter
C/A 51741649 missense_variant p.Gln443His
G/A 51741651 stop_gained p.Gln443*
T/A 51741652 missense_variant p.Gln442His
C/A 51741822 missense_variant p.Asp386Tyr
C/T 51741860 missense_variant p.Gly373Asp
G/A 51742118 stop_gained p.Arg350*
G/A 51742285 intron_variant
G/A 51742964 synonymous_variant p.Tyr206Tyr
T/A 51743471 intron_variant
C/G 51743477 intron_variant
T/C 51743613 intron_variant
G/T,* 51743621 intron_variant
T/A 51743648 intron_variant
A/T 51743713 intron_variant
A/G 51743717 intron_variant
G/T,A 51743726 intron_variant
T/A 51743731 intron_variant
T/A 51743733 intron_variant
T/A 51743735 intron_variant
A/T 51743771 intron_variant
A/T 51743785 intron_variant
G/A 51743976 intron_variant
T/C 51744477 intron_variant
T/C 51744481 intron_variant
T/C 51745377 intron_variant
C/T 51745639 synonymous_variant p.Leu51Leu
A/T 51745700 missense_variant p.Met31Lys
G/A 51745912 5_prime_UTR_variant
T/C 51745998 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14730.1
MAGGGSGDRPPWKESAPPRPTISLPPRAASMETLFSGGFSPGPMTLLSGFLTDGDDSSKSFSQLLAGAMASPVASTAVHDSHGLFSPSQMSFGMTHQQALAQVSVQASQANSNMHIQAEHSLPVSVSSPTSFTQVPAATSNATQPLIPPLTANSWATMTESTDHSHSEQKLQSSSLNVDKPADDGYNWRKYGQKQVKGSEFPRSYYKCTHPHCPVKKKVERSLEGHVTAIIYKGEHNHQRPHPNKRSKDSVPSNEHSNMQGNASAYQGMTKMDPESSQATTDHLSGSDSEEVGDHEAEDDEKNVEPDPKRSKTEATNLDPASSHRTVTEPRIIVQTTSEVDLLDDGYRWRKYGQKVVKGNPYPRSYYKCTTPGCKVRKHVERASTDPKAVITTYEGKHNHDVPAAKTSSHVMASNNTAQIKSQNSNHGKQSIGSRDIGGNEQQPVARLRLKEEQIT*


CDS Sequence:
>Vu_14730.1
ATGGCGGGCGGCGGAAGTGGGGACCGACCACCGTGGAAAGAGTCGGCGCCACCTCGACCCACCATCAGTCTCCCTCCAAGAGCTGCTTCCATGGAGACCCTTTTCAGTGGCGGCTTCAGTCCTGGTCCCATGACTCTTCTCTCTGGCTTTTTGACTGATGGGGATGACAGCAGCAAGTCCTTCTCTCAGCTCCTCGCCGGAGCCATGGCTTCTCCGGTGGCCTCCACCGCCGTGCACGACTCGCATGGCCTCTTTTCACCTTCCCAGATGTCATTTGGAATGACACACCAGCAGGCACTAGCCCAAGTTTCAGTGCAGGCTTCACAAGCTAACTCAAACATGCATATTCAGGCTGAACATTCATTGCCTGTATCAGTATCATCACCTACCTCATTCACACAGGTTCCTGCAGCTACTTCCAATGCTACACAACCGCTGATTCCACCCTTAACTGCAAATTCTTGGGCCACAATGACAGAATCCACTGATCATTCTCACTCTGAACAAAAGTTGCAATCTTCATCACTCAATGTTGATAAGCCTGCAGATGATGGATACAACTGGAGGAAGTATGGACAGAAACAGGTGAAGGGTAGTGAATTTCCTCGAAGTTATTACAAATGCACACATCCACATTGTCCTGTCAAGAAAAAAGTTGAGCGTTCACTTGAGGGTCATGTTACTGCAATTATTTATAAAGGAGAACACAATCATCAACGTCCTCATCCTAACAAACGCTCAAAAGATTCTGTGCCTTCAAATGAACATTCAAATATGCAAGGGAATGCTTCTGCTTATCAAGGGATGACTAAAATGGATCCAGAGTCAAGTCAGGCAACAACTGATCATCTATCAGGAAGTGACAGTGAGGAAGTAGGTGATCATGAAGCTGAAGATGATGAGAAAAATGTTGAGCCTGACCCAAAGAGGAGTAAAACAGAAGCCACAAATTTGGATCCTGCATCTTCACATAGGACAGTCACTGAGCCTAGAATCATTGTGCAAACAACCAGTGAAGTTGATCTTTTAGATGATGGTTACAGATGGCGAAAATATGGGCAGAAAGTTGTCAAAGGAAACCCTTATCCGAGGAGCTATTACAAATGTACAACACCAGGTTGTAAAGTCCGAAAGCATGTTGAGAGGGCTTCAACAGATCCTAAAGCTGTCATAACAACATATGAAGGAAAACACAATCATGATGTTCCAGCTGCTAAGACCAGCAGCCATGTTATGGCAAGTAACAACACTGCACAGATAAAATCACAGAATTCCAATCATGGAAAACAAAGTATTGGCAGCAGAGATATTGGAGGCAATGAGCAACAGCCGGTTGCACGGCTAAGGTTGAAGGAAGAGCAGATAACCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_14730::LG3:51746057-51748057(-)
TATTTATGTACGAATGTCTCAATTGGGTCCTCGTTTTTTAAAGTGTATCAAAATGGTCTTTAATTTTGAAAATTCATATCAATTGAGTCCTTTCCGTTAAGTTGGCTGGATGGCGTTAAAAAAATTCATGAGTGGATGCTGAGATGACGAACGAACGCTCGTCCACCAGCGAACGAACGCAACGAGCGCTCGTCCACCAGAAAACGAACGCTCGTCGACCTCTTACTGCTGGACGACCGTTCGTTCCACACTGGACGACCGTTCGTTCGGTGGTCGACGAGCGTTCGTTCGCTGATGGACGAGCGTTCGTCCGCTGGTGGACGAGCGTCCGTTTGTCATCTCAGCATCCACTCATGAATTTTTTTAACGCCGTCCAGCCAACTTAACGGAAAGGACTCAATTGATATGAATTTTCAAAATTAAGGACCATTTTGATATACTTTAAAAAACGAGGACCCAATTGAGACATTCGTACATAAATAGGGATGTACTAAAGGATTAAACCTACATTTAAACTCTAATACTACAACTACAATTTTTTTTTTCTTTTTTTCCAATATGTATCATTGTATCACCGTTGTTTTCATTCAAATTACAAATTACACATTAAATAGAACAAATAATGATATAATATTATATTTAAGTAAATTTATCAAAGTTTACGAGTTAATATAAATATTAAAATGACATTATAATAAAAAAGTAGGGTATGGAAAGAAAGTAGATTTTACTTTTAAAATTTTAAGTAAAGTTTCAAAATAACTTTTTGTAGTATTAATATATTTAAAATATAGTTTTTTTTAGAGATATTAGTAGTTCTTATAAAAAAAAGACTTATTTTACATTAGAAAGATTTTCTCCCTTCTTGTAAATATAAAATTGAAGATAAGCTACTAAAAATATTTGAAAATAGGTATTTTTCATAATAATAATAAAAAAAGTGTGGTTCTAAGTTTTAAAAAAAAATATTTTTTATTTAAGTTTAGATAAGTTTTAATTTTTATGTTTTAATCCAACTAAACATTATCCCTCAAATACCATAAAGACGAACACAATTATTTTATGGATAGTGAATTTATAACTAAAAGTACTTCAACTCTATAACATAATTATAACTTCTGAGCATATGAAAGATATTAAAAACTTTAGAAAAAAAAATATTAGCCATTTATAATTCTACATATACTAACTTATAAGAAAATAAAAAAAATAAAAAATATTTAAAAATATGCAATAATAAGTTGGTGGTGGACATGCCATCATTTTCTTCTCATCCTTTTTCATTGACTTACTTACTCTGCCAAATGGCTTATTTTTATAAAGTCTTTTGGTCAATTTCAACAATACTTCATTTAATAAGCCAATTATTTTAGGCCACTTGCCTCCCTACACACCACAGATTTCATTCCTACTTATTCACGGCTCCACGACTAATTCAAAATTAATTAATTAATTAATCTTTATTTCCCAAAATGTTGAATGCTTCAATTTTCTTTAAATATTTAAATATTCTTTATATTGAATCTTTCAATAAAGTAAGACGAAAATTTAATAACTTTTTCTTAATTTTCTTACAAATTATAGTAATAAAAATATTAGGTAGGATTTTGTTGGTTGATTATAATACGATGAAGATGTTTATAAACGTTAAAAAAATGAAAATGTTGATAGGGTTATGTATTATATCAGTGTTCACGTTATTTTAAAACATGCATGAGGAGATATCAAAATCCTCTTAAATTAAATTTATATTTTCAGGTATTATTCTTATTTTTTTAAGAAGATATTTCATAAAATTGTTCTAAAATAAATTTTGCACACCATCTTAGTAGTGTAATAATTATATTTGAGAAGTTTATATCTTGATAATAATTGTGATAGTAAATTTGGATAAAACATTTATAGTTTTCTGAACAAAAAGTACACCTTAGTTATAAAAAAGGCAGAGTTTTTAATAAGATGAAAGCTAAAATTTATAGAAGAAAAGATATTATTTTTTT


Gene Sequence:
>Vu_14730(-)
GTATTACAGAGCATTTGGTTGGGCAAAGAAGGCGTGGACTTTTTTGATACATTTTCTTCATTCAGATCCACCAAACCAAACCAAACCCATCACACAAAATCACGTAAAACACCCAACTCAAAAGCTTCAAACTTTTTCAGTTTTTCCAAATTAAGATACAGTGAAAGAAAAGAAAAAGACTTGCAAAGTTTTCTTCTTTTTTGTTTCTTGAAAGTCAGAGAAAAGTTTGAAGCTTTCTTCCTCCTCCGTTGAATTATTTAACTGGGATGGCGGGCGGCGGAAGTGGGGACCGACCACCGTGGAAAGAGTCGGCGCCACCTCGACCCACCATCAGTCTCCCTCCAAGAGCTGCTTCCATGGAGACCCTTTTCAGTGGCGGCTTCAGTCCTGGTCCCATGACTCTTCTCTCTGGCTTTTTGACTGATGGGGATGACAGCAGCAAGTCCTTCTCTCAGCTCCTCGCCGGAGCCATGGCTTCTCCGGTGGCCTCCACCGCCGTGCACGACTCGCATGGCCTCTTTTCACCTTCCCAGGTACTACAGTTCTTTCTTTCACTCATCACGTGCAAGTTCTTCTAGTGTTGCATTTTCATTTATCAAACATAGTAAGCTTTGGAAAATTTGTTTTTCATTTTTGGTTTAGACAAAATTCTGATGCAAAACTTTACTGCTTTTAGCATGATTAAAATTGAAGTTTGACCCCTAAGTAATTGACTTTTGATGTTGACTTTTTATATGCGGATTACTGAAGTGTTAAGTAAAAATGATTTTGATTCTGGAATGGCTTAAAATCCACCTTGATAGAGAGGAGTTGTAGACAAGTGTTTTTAGTTGGTTTCTGGCAATTGGCTAGGAACCCCCTCATTATAGGAAGATTGTTTTTGTCATGTTTTGTGTTTGTTATGTCTGTACAAACACATTTAAGATTTTACTCAACTATGAGAAATTTGTGTTAAGGCCATGTTTGATAAATCTCTTTATAAGCATTCACGAGGGAATAAAATAAGAAGCAAAAATTAAGTTTCTCTCTTAAGCTAAAATTAGCTTTTGCATTGTTTAAAATAAACTTCTGGAGAAGTTAAATGGGAAACTTTTACAAATTAGTTTAGAGGAAAAGCTTTTTTTCCTTATTCTCCTGTAAAAGGGTCTTAAATAGAAGTTTTTCTTTAAGGTGGTAATTGTAACTACAACCCTTTGATTAGATTCATGGAATTTAATGTATTACTATGAATGTAGTCATTGAATGTGAATACATACATACATACATACATATATATATACATACATACATATATATATACATACATACATACATATATATATATATATACATACATATATATATATATATACATACATATATATATATATACATACATATATATATATACATACATACATATATATATATACATACATATATATATATATATATACATACATATATATATATATATACATACATATATATATATATATATACATACATATATATATATATACATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATACATATATATATATATATATATATATATATATAATTTCATAGAAGGGTATTTTTTTCTATTATTAGAATGGGATCTTTGTAATGGTAATGGACAAGTTATGATGCACAAATAAAAGCTTGGAAGCAGGAGCTGTATTCAAGTTACAGATCAATATAAGTTGGAAATATAATCATTTGCAATGCTTGATATTGTTATTTCTAGTACTTCATTAAAAGGAAACTAAAATAAATTAGTGGATATGTCTGAAATATTTTCTGGACATATTTGAACATGTCTACGTTTGCTAAGGATCGTTTAAGTTTACAACATGTGTTGTCCACATTTTGTAGCATGTTGCTCCTTCAATCTTTCAACTTTTCACATTTATTGCTGGCCAAGTTTTTAACTTTTACGTTGAAATTGACAGGCTTCTTAAATGGGTGGGTCCATCAGCAACCCCAGTTGCTTATTATAAGCAAAGAGTGGTATTGCAAAATAATTGGATTTCAATTTTTAAAGTTTTAAAATAGTTATATTAAGGTACTTGTTCTCAAGTAAAGATTCATTTTGGGTTACTTGATGAAGAGACCTCATGCACATGTTTGTGTTGGCGTCTGTTAACTTTTCTATTTTGGAGATGAAGTTTCTTTATACTTCTTTGTAAACTTCATTATTCATAAGCATATATACTACATTTAGGGCTGAAACATGTTGACTACAAATTAACTTTGTCAATAAATTGATTCACCTGTATTGTTCTTCTGTTATCATACAATCAACTATACAATTTATAGACTCGCATATTCATTATGTTGTACTCAAAACAAACAAAAGACAGCTAAAAACGACTAACACATTAACTATCCATAAGACTCCGACTACTACATTACTATCTATAAGATTCCAACGGCTAATACATTAACTACCCATAAGACTCCAATGTTAATACATTTAAGTTTATTCCAAACCCAACAAAACACTTATATAGTATGAAACTTGATCTTATTGAATGAAAACTATCTTTTCTGATTAAGGAATTAACCATGCTGTTTTGAAATCTTAGTTTTACTCAGTGTGAGTATTAGTCTAAAGAAATTTACCCTTTTAAAGTGGAAAACAGCTTTTAAGCGAGTATTAGTGATATGATATTTTTAAGTGATTATACTTAAAATCACTTATTCTTCTGACAAACTGATTTCTCATATATGTAGATGTCATTTGGAATGACACACCAGCAGGCACTAGCCCAAGTTTCAGTGCAGGCTTCACAAGCTAACTCAAACATGCATATTCAGGCTGAACATTCATTGCCTGTATCAGTATCATCACCTACCTCATTCACACAGGTTCCTGCAGCTACTTCCAATGCTACACAACCGCTGATTCCACCCTTAACTGCAAATTCTTGGGCCACAATGACAGAATCCACTGATCATTCTCACTCTGAACAAAAGTTGCAATCTTCATCACTCAATGTTGATAAGCCTGCAGATGATGGATACAACTGGAGGAAGTATGGACAGAAACAGGTGAAGGGTAGTGAATTTCCTCGAAGTTATTACAAATGCACACATCCACATTGTCCTGTCAAGAAAAAAGTTGAGCGTTCACTTGAGGGTCATGTTACTGCAATTATTTATAAAGGAGAACACAATCATCAACGTCCTCATCCTAACAAACGCTCAAAAGATTCTGTGCCTTCAAATGAACATTCAAATATGCAAGGGAATGCTTCTGCTTATCAAGGGATGACTAAAATGGATCCAGAGTCAAGTCAGGCAACAACTGATCATCTATCAGGAAGTGACAGTGAGGAAGTAGGTGATCATGAAGCTGAAGATGATGAGAAAAATGTTGAGCCTGACCCAAAGAGGAGGTAAGCTTTTATTTATGAAATCCTTTTCTTGTAGGTAAATTGCTTATTGTGAGTTAGAAAAGAAGGAAAATGGGTGCAAACTTCACCTTATAAGTTGGTTTTGTAGAATTAAGTTAAATTTAAAGTCCACTTCTTAACAGAAAACTTAGTTACAATTTACAAACAAGTAGAGTAATTAACTTGTTAGCTGTAGAAATTAATTAGATATAAATATGGTGAATTAAAGGAAAAATGTTTATTCTATTTGATTATAATTTGTGGATTGAGATTTTGCTCTTTGGTAGAGGAAAAATCCTTTGTGTTGGTGAAAGGTCTCTATCCTAATATTCTCAGCAAAATTTCTCTTTTCTTTTTGACATTTATCCTTGGTAACATCAGTTGTCTTTTCTGATCTTGAAAGTGTTGTAATTATGCAGTAAAACAGAAGCCACAAATTTGGATCCTGCATCTTCACATAGGACAGTCACTGAGCCTAGAATCATTGTGCAAACAACCAGTGAAGTTGATCTTTTAGATGATGGTTACAGATGGCGAAAATATGGGCAGAAAGTTGTCAAAGGAAACCCTTATCCGAGGTGCTATTGCATCTCCTCCATACTTTGTTGCATTCATCGAACTATTCATGACTGTTAAACAAGTTAAAAAATTATCCATCAAAGGAAAATGCTCAATTTTTCCAATTATATTCACTGCATCACATCATATTGACCTCATCATTAAGCTTGTCTAGTCTAATGCTGAATCTAGCATATATCATGTGTAGGAGCTATTACAAATGTACAACACCAGGTTGTAAAGTCCGAAAGCATGTTGAGAGGGCTTCAACAGATCCTAAAGCTGTCATAACAACATATGAAGGAAAACACAATCATGATGTTCCAGCTGCTAAGACCAGCAGCCATGTTATGGCAAGTAACAACACTGCACAGATAAAATCACAGAATTCCAATCATGGAAAACAAAGTATTGGCAGCAGAGATATTGGAGGCAATGAGCAACAGCCGGTTGCACGGCTAAGGTTGAAGGAAGAGCAGATAACCTAGTGTGTGCTGTAAGAACTTGCTTCTATTTAGGAAAAGTGTGTATCACTCAACAAATCATCTTTGTTTTCATGCTCATTGCATTCTTTTTAAGTCTTAGGCCTAAGTTTTGATCATGGCCTATCAGTGCAATCCCTAATAAACAAATGGTTCAACACTTTTCTCTTCCAGTCTTCTCCCACAACCACATCATGATGAAAGAGGTAAGGACAAAAAACAAAGGGTTTATTTGCACAGTGAAAACAGGTTTTGGATGATTATGTACTATTTGTATCATTTGTGTACATTGAAAATTTATGTTATGTTGTTTAATATAGCTGGTCATCATTTCATAGTGTAATCCTTGTTATTTAATATTTGTTTTTTCAAGAATGT