Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_14719	LG3	51584354	51590083	hypothetical protein	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect
T/A	51584585	downstream_gene_variant
A/T	51585450	downstream_gene_variant
A/T	51585558	downstream_gene_variant
T/A	51586323	downstream_gene_variant
G/A	51586389	downstream_gene_variant
T/A	51586881	downstream_gene_variant
T/C	51586883	downstream_gene_variant
A/T	51586884	downstream_gene_variant
T/C	51586992	downstream_gene_variant
G/A	51587075	downstream_gene_variant
T/A	51587082	downstream_gene_variant
T/C	51587532	downstream_gene_variant
A/T	51587543	downstream_gene_variant
A/T	51587560	downstream_gene_variant
G/A	51587583	downstream_gene_variant
C/G	51587666	downstream_gene_variant
C/T	51587667	downstream_gene_variant
A/C	51587955	downstream_gene_variant
C/T	51589423	downstream_gene_variant
T/A	51589456	downstream_gene_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14719.1

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CDS Sequence:
>Vu_14719.1

Promoter Sequence:
>Vu_14719::LG3:51590083-51592083(-)

CTCTTCCTGAAAGTCTTAAACTCAATCTGCGAGCTCGTAAAAGGTCCCTTGAAGATCAAGATGATTTGATGTGAAATTCATATTCCCTTTTGATGAGAGCAAGCATCTGTGCTAATTGCTAATATTCTTAGCCCCCAAAGGAACAAAATATGTATATTCATAGAAATTCATTCATCATATAATTGAAAATAATATAGCATGTATATGATTGTTCAATGCTTATACTCAATGCATATGGTAACAAGAAAAATTACGGTTCTCCAATGCTTGTGCTTGCTTAAAAATTTAAAGTATTTTGAGAATTGATTTTTGTTAAATTATAAGTTATGAAAAGATGTTTTAAAATAATTAATTTTGTCCGAATGTAAGAAAAACATAAATATTTGGAATATGTATGAACCTGAAAGAAAAAAAGTTGTTAAAAAAAGCAACTATACATTATATAAACATTTTATTTTTCATAAAACCAACTAAAATTAAAGCAAATTTTCTTAAGCATGTTGTTAGACACCTCTTGTATGGAGATCATGTTAATAAGAAATCTCTTGGATGTTGCTTACTGTTGCAACATTAAATACTATTGATTAAACCCTAATCTGGTTCTTGAAGTATTAATTTTGAGCATAGCTTATTTAGTTCCAGAACTATTTAGAAAATAAAATGATTGCTTTTGACATAAAATCAATGGTTTGTTTTTATATATTCATTTATATATAAGCTACCTATCACTACCATGTGGCAATACATTGAGTGCTGGTCCTATTTTTTAGGTTTATGAAAGATGTGTGGATAAGTTTCTCAATAAAGGAGATAAAAGAAAAACGACAAAAATGAAATAATTTTTTCGTAAGCTAAAACTTACGTATAAGTTAAAAAAAGAAAGATGAGAATTGAGAGAAGTTATTAGAGAAAACTTCTACATTTTTTTATATAATTTTAGCATCTAAAAAAGTATAATTTTTTTTCTCAAAAATATTTATGATGAACTTTGTACAAAAAACACTAAACAAAATAAGGGTTCTCCAAAATACTTTTATTAGATAGTTTTGATTTGATTTGGCATAATATGATAAAATGAAAGAGAAAATATTTATTTCAAAAGTTTATTTAACTTTTTTTTTTCTTAAATTTATAGAATAGTATAGCAACAAACAATAATCTCAGACTAAATTAATTGTTTAGTCCAAAATGAAAGCATGATTTGATCCCCTTTGGTGGATCAGCACGACCCATTTCTTAATGCAGTGAGAACAAAAGTTCTCCACTTAAGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACAACATTTTTAACAACAATCTCTGTGATTATCTAAAATTATTTTACAATTAATAATAATAATTATAAACCCATCAATAAAAAAAACAAGAAAATAATATTAAAATATTATAGAAAATGTTTTCAAATATAATTATGTCAGTATATATATTTTGATATTAAACTTTGACTATCTCTAAATATTAAATTAGTAAAAGGAGCACGAAAGGTGACATAGCTATACCCCACACCTGATCCTAAAAAAAACAGAAAAAACAAAATGCTTCCAAGTGAAGATAATATTTAAAAATAGAATTCGAATACGGAATTTAATTTAATCACGATACAGTTGATTAACTAAAGTGTAATGCACTTGAATAAATAATATTTAAATTCCGAATACAATAATTAACTCATTCGAAAAAAAAATTGACAGTTGAATTAGTAAACGCAGGATAACTAATAAAACTGATAAGAGAGCCAAAAACTTCACAATCACATGACACCAACAAACTAGAAATGAGAAGAAACAAAGCCACAAATTAACACATTACACATTACAGCGAACCGTTTTCTGATCTTCAATTTCATTTGCATGTGAATTTTGCAGCATATGATTTCCGCGTTGCATTTCGCGAGTAGTAATCAAAACATAGCAATTGAAGAGGGCGGCAACCGGCA

Gene Sequence:

>Vu_14719(-)

ATGAGCACCGGCAGTAGCGGATCGTCCGCCACGGCGGCGATGGAGAAGGCTCGGGTGAGTCGAACGTCTCTCATTCTGTGGCATTCGCACCAAAACGACGCCGCGGCTGTGCGGAAGCTTCTTGAGGAGGATCCATCGCTGGTGAAGGCTAGGGATTACGACAGCCGCACGCCGCTGCATGTGGCTTCGCTCCACGGCTGGGTCGAGGTTGCTAACTGCTTGCTTGAATTCGGTGCTGACGTCAATGCTTTGGATCGTTGGAAAAACACTGTACTCTCTCTCTCTCCCTCTCTATTTATGTCGTGTTATGATAGATTCGTTAACTAGAGAAATTTTTTTTTACTTCTTCTGACGAATAAATTAGTGTTGTTTTGTTCTGGAAAGCCTTTGGCTGATGCAGAAGGAGCTAAAAAATTGCCGATAATTGAGCTTTTGCAGTTAAACGGAGGCTTGTCTTATGTAAGTATATTCAATGGAAGGGACATTATTTTGTAACAACGAAAATATAAATGTGAGCACGTCGATTAACTGACACTAACATAGATTGTTCGAGCTTAATGAAATCGTCTTTAGTTCTAGTCATGTTGCCTTACGGGGAGAATGATACCTGTTGTCTCAAACCAAAAGAAAATAAAAATGTATTTTCTATTGCAGTAAAACGAGGGAAGAATGAGTTTGTGATACTGATGTGTGTATGAGTTTGATGTTTGATTACGCAGGGCCAAACTGGAAGTCATTCTGAAAAGAGCCCTGTTCTTCCCCCATTGCCTAACAAATGTGACTGGGAAGTTGACCCATCCGAGCTGGACTTCTCTCATTCGGTTTGCATTGGAAAGGTGTTTTCTTTATTTTCTTGATCTCATTTGCATTGTACTGTATCAAAATCTTACTGTGAATTTTAGAAATTGCACTGTATTTATTGTGATATAGCTGTAAGTATGAAATTGTGTCTTCATCATATAGACTGGATGTGAGTATGAAATTGTTGTTTTCATCATAGACTGTATCGTATGTGAGTACAATTAGTTGTGAGTCTTCAATTGTCAATCTTCGTGATGATAATCTGGTCATTTATGTTTTTTAATTATTTGTCTTGGTTTTTTTAAGTTTTTTAATTTTTGTATCCACTCTGTTTCTTGCTGTCATTTCTACATGATTGCTTTACAGCTCATGTCATTTTACTTTTACTTTGCATTTATACTGTTAATGAACCAAATCTGCTCTTGAGGTTTGATCTTTGTGGGTGTGTTTTCTGAAGGGATCTTTTGGTGAGATCTTAAAAGCCCATTGGCGTGGAACGCCTGTTGCCGTCAAACGTATTCTTCCATCTCTGTCAGATGATAGATTGGTGATGTAAGATCCTTTATTTAATTTCTAGATTTTGTCTTGATTTGATTGCTATATAGTTAACAGGTTATCGCTGCAGTAAAATTCTTCTAATTGTCTGTGGTTGATTAATGTGTTAAAACAAACACCTTACTATTATCTGTCTTCTGTCAAGGCTTACTTGGGGCTACAGGTAAATTCATTTGGAGCCTGAGAAGGCAGATATGGTTCTCCACAAAATTTCTTAAATACGTGTTTTTGTAAATTTTACTTTCACATTTACTTTTTTTTTTATCTAAAAAATTAACTTGTCCTTCGTAAACTAAAACTGTCTACTTCTGAACCCTGGCTATGGGTAACCATTTCAATTTTTAGACTGTTCCTTGCGGTGATGTTTGTTCTGTTTGAACTAGCTACCTCTTTGGGAAATATGGTTCACATTAAAGCTCATGTATAATCAAACCCCTAAAATATGAAATAATGAATAATAAAAAGGAGAGGGGAGGCAATACACAGACAAACTAGTGATTAAGCTTGTGCATTCAGAAATCGACCATTTTTTCTATCTTGCACCTTTTTCAGTCACTTATCCCTTTATTTTTGTTGATCACTTTTTAATACAGTCAGGACTTCAGGCACGAGGTTAATTTACTTGTGAAACTTCGACATCCTAATGTTGTTCAATTTCTTGGAGCTGTTACAGACAAGAAGCCCCTTATGTTAATTACTGAGTATTTAAGAGGACGTGAATGCATATAAATAGACACCTAGGTTCAGATGCTCTGAACTCACGAAATCTTGTTCTTTAAGATTAAACTTATTAAATTACTATTTCGTTATTTATAGGGTGATCTTCATAAGTACCTCAAAGACAAAAGTTCTCTTAGTCCATCAGCAGCTATCAACTTTGGCTTGGATATTGCTAGGTATGGTGTGTCATTCTTTGATGTTTCTCTTGTTTTTCTTTTTAAATTTATTTATAGAAGAACAAACAGAAAACCTCAAAACAAGAGAGAAATTGACCCCCTTATCTTTTCAACCTCTCTGTAAATCTTTTATATAATTATAAATTATAAATCACTCCTTAAATGGATAATTCTCGTGGGACAGCGACTGAGAAGCCGAAACAACTGTTAAATTTGACCCCACCCAAGACCTGGGATTGCAAGGAGAGCACTCTTGCATAGGACCTTAATCTATTGCAAGGAGAGCACTCTTTCATAGGACCTTAATCTATTGCAAGGAGAGCACTTTTTCACAGGACCTTAATCTTTTGCCTTGTCCTACGCTACTGAAATGGATGGACGGAAGATGTTCCAATTTCAAAAGAAGTTTGCCAAACCTACTTCTAAAAAATTTCCAGAAGTAATTTCCTAAGCTTCCAAACAACATCAAAATCAATAAAAGATGATTGTTTGTAATGAACTCCCAAATCACAACTTGAGCATTGGTATAGAAAATAGTGCTTTACCGTCTTGCCTTACAATCTAATTGCTATGGGATATTGTGAATTACTGATGTCTGTGCCCTTGTAAAAGTCTTATATCTTTATGGGTGTCTCTTTGCTTCTCAACTTTGAATTTGTATTGGACTCTGCTTGTGGCTGGCTTTGGGGGTTCTTATGGATGCTTCAGGGTGATGGATTGGAAAGTTTACTGCTTTTTTCCATGTTCGAAGATATTCCCTCTCCTGCTTTAGACAATGTATTCTACCCATACTTTTCTTTGGCTTCTACAAATATAAAATAGAAAATCAAACATTGTCGATATTATAAAGGAATGCAAATAGTTCAAGTCAAATAACTTAATCACCTTTCTCTGAAATCTGACTTCCTCGTTGCTGATAAGTGAACTACACTTTTGATGGAATTGGTTATAGCTTAAAAGTATCGGCTCTCAGGCTTTTATTAATATAATGTATTTAAACAGCTTAAACATTGTTGGAGATAAGGTTGCAAATCCATAAAAGAAGATTTCCCCGTTCCAGTGCTTGTTTACTTGTCACTACCATTGCTGCGATCTAATGTTTGTCTTGACTTAGACTATGAACCAAAGTTTCTTCATAAGGTATAAGAATAGTGGTTTGTGCCTGTAATGAAGAAATTACATGCAGTAACACTTTTAAGCATATATATGTCCTTTGATATAATTTTCTACATGATTTTTTTTTTTCGATCATAGTCAGTTTTGCTGTGTATGAGAATGAGGATACAGGAAATGCTATCCTCACTTGCCATTTTTGTTTAAAACAAAAACTGTATTCACAAAACTCACTAGAAAAATTTAAGATTTTTTTTTATTTTTGTTAAAGAAACTGATTAATTCTTTTGAGGTGAGTAAGGGAGGAGCTTCAAGAATGTTGTCAAACGCATAACTAAGCCCATCTGAGCATCATGTATTCCTAACTGTGCTGATAAAACATTGTTAGGAAATCTAGAAACACTTGAAAGCATGCAGGTTCATTGAATCTAACTATTTTTATAATCTATATTTTGTAAATACTGTTTGTAGAGGGATGGCCTATCTTCACAATGAACCAAATGTCATCATCCATCGAGACCTAAAGCCAAGGTAAATATGTTATTCTTACAAATTGATTTCATTTTTTCTGTCCAAGGTTTAGAGTATTTAACTTGATCTAGAACATCATAGGAATTTATTTATATGTGATACAAGAATGCACTAGAAGTTGAAATCTTTTTCACCCCTAAAATTTCAGGAATGTTCTTTTAGTCAATTCTAGTGCGGACCATTTAAAAGTTGGTGATTTTGGACTTAGTAAGCTTATTAAGGTCCAAAGTTCTCATGATGTATACAAGATGACTGGTGAAACTGGAAGCTGTGAGTATGAGAAATTCTTTCAAATTAATAAGGGAAAATGCATAGACATGCCATGAACTTTACCTTGTTTTGAAATATCCATCTTGAACTTGAATAACGAGGTGAGTGCTTAACTTTCAAACTCTGCTGAGACCAATCTGCTCAGTATAAGTTAATATGACTTGCATGAGATAATATCTGTCTTTTTTCATAAATTTATTTTTAAGTTTCATAAATTAAAAAATGCAGAATAAAAGGAATATAAAGTAAAAGTATTTTAAAAAATAAAATAAAATCATGAGTTCCGAGATTATCAAATGAGTTAATCAATAGGCATGTCATATGATGAATGGTTGTTATTAGGCTTATGCATGGACGAGTCTATCTAACTGAGGTTTAGGAAAAATCTATCTAAAATGGAATTTTAATATGGCTATTTCAAAATGAGGTAAAGTTGAAGGAATGTATGAATTTTTTTTAATTAAAACTAGTAACAATTCTGCACAAAATTGAAATCTCCTTTATTTTGGTTTAAAAAAATAGACCGCTACATGGCTCCTGAAGTTTTCAAACACCGGAGATATGATAAGAAGGTTGACGTGTTCTCCTTTGCAATGATTCTGTATGAGGTATTCCACACTTTAAGACTTAGAATTTTGTTTGATAAAATGGTAAAAAGTTGAAGCTAGTTCTAAATTTCGAATTCACTATTCTTGAAATCTTCTTTGGGTCAGATGCTTGAAGGTGAACCTCCTTTTTCAAATTATGAGCCATATGATGGAGCCAAATATGTGGCAGAAGGACACAGGCCTTCATTTCGCTCAAAGAGTTATACCTCTGAGCTGCGAGAGTAAG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