Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14704 LG3 51432865 51438857 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase STY46-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 51432975 synonymous_variant p.Ala384Ala
A/G 51435186 downstream_gene_variant
T/A 51435265 downstream_gene_variant
A/C 51435346 downstream_gene_variant
C/G 51435521 downstream_gene_variant
C/T 51435656 downstream_gene_variant
A/T 51435691 downstream_gene_variant
C/A 51435886 downstream_gene_variant
A/T 51435973 downstream_gene_variant
A/T 51436115 downstream_gene_variant
G/A 51436119 downstream_gene_variant
T/C 51436142 downstream_gene_variant
T/A 51436444 downstream_gene_variant
A/C 51436450 downstream_gene_variant
A/T 51436495 downstream_gene_variant
T/C 51436539 downstream_gene_variant
A/T 51436636 missense_variant p.Ser239Arg
T/C 51436649 missense_variant p.Lys235Arg
T/C 51436654 synonymous_variant p.Lys233Lys
C/T 51436663 synonymous_variant p.Lys230Lys
G/A 51436689 downstream_gene_variant
A/T 51436708 downstream_gene_variant
A/C 51436724 downstream_gene_variant
C/T 51436779 splice_region_variant&intron_variant
G/T 51436782 splice_region_variant&intron_variant
A/G 51436794 synonymous_variant p.Ile223Ile
G/T 51436815 synonymous_variant p.Pro216Pro
T/G 51436949 downstream_gene_variant
T/C 51437021 downstream_gene_variant
C/T 51438191 downstream_gene_variant
C/T 51438195 downstream_gene_variant
T/C 51438321 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14704.1
MSTGSSGSSATAAMEKARVSRTSLILWHSHQNDAAAVRKLLEEDPSLVKARDYDSRTPLHVASLHGWVEVANCLLEFGADVNALDRWKNTPLADAEGAKKLPIIELLQLNGGLSYGQTGSHSEKSPVLPPLPNKCDWEVDPSELDFSHSVCIGKGSFGEILKAHWRGTPVAVKRILPSLSDDRLVIQDFRHEVNLLVKLRHPNVVQFLGAVTDKKPLMLITEYLRGGDLHKYLKDKSSLSPSAAINFGLDIARGMAYLHNEPNVIIHRDLKPRNVLLVNSSADHLKVGDFGLSKLIKVQSSHDVYKMTGETGSYRYMAPEVFKHRRYDKKVDVFSFAMILYEMLEGEPPFSNYEPYDGAKYVAEGHRPSFRSKSYTSELRDLTEECWSSDITKRPSFIEILKRLEKIKENLPSDHHWRVFAS*


CDS Sequence:
>Vu_14704.1
ATGAGCACCGGCAGTAGCGGATCGTCCGCCACGGCGGCGATGGAGAAGGCTCGGGTGAGTCGAACGTCTCTCATTCTGTGGCATTCGCACCAAAACGACGCCGCGGCTGTGCGGAAGCTTCTTGAGGAGGATCCATCGCTGGTGAAGGCTAGGGATTACGACAGCCGCACGCCGCTGCATGTGGCTTCGCTCCACGGCTGGGTCGAGGTTGCTAACTGCTTGCTTGAATTCGGTGCTGACGTCAATGCTTTGGATCGTTGGAAAAACACTCCTTTGGCTGATGCAGAAGGAGCTAAAAAATTGCCGATAATTGAGCTTTTGCAGTTAAACGGAGGCTTGTCTTATGGCCAAACTGGAAGTCATTCTGAAAAGAGCCCTGTTCTTCCCCCATTGCCTAACAAATGTGACTGGGAAGTTGACCCATCCGAGCTGGACTTCTCTCATTCGGTTTGCATTGGAAAGGGATCTTTTGGTGAGATCTTAAAAGCCCATTGGCGTGGAACGCCTGTTGCCGTCAAACGTATTCTTCCATCTCTGTCAGATGATAGATTGGTGATTCAGGACTTCAGGCACGAGGTTAATTTACTTGTGAAACTTCGACATCCTAATGTTGTTCAATTTCTTGGAGCTGTTACAGACAAGAAGCCCCTTATGTTAATTACTGAGTATTTAAGAGGAGGTGATCTTCATAAGTACCTCAAAGACAAAAGTTCTCTTAGTCCATCAGCAGCTATCAACTTTGGCTTGGATATTGCTAGAGGGATGGCCTATCTTCACAATGAACCAAATGTCATCATCCATCGAGACCTAAAGCCAAGGAATGTTCTTTTAGTCAATTCTAGTGCCGACCATTTAAAAGTTGGTGATTTTGGACTTAGTAAGCTTATTAAGGTCCAAAGTTCTCATGATGTATACAAGATGACTGGTGAAACTGGAAGCTACCGCTACATGGCTCCTGAAGTTTTCAAACACCGGAGATATGATAAGAAGGTTGACGTGTTCTCCTTTGCAATGATTCTGTATGAGATGCTTGAAGGTGAACCTCCTTTTTCAAATTATGAGCCATATGATGGAGCCAAATATGTGGCAGAAGGACACAGGCCTTCATTTCGCTCAAAGAGTTATACCTCTGAGCTGCGAGATTTAACAGAGGAGTGCTGGTCTTCTGACATAACTAAAAGACCTTCGTTCATAGAGATCCTTAAACGGCTTGAAAAGATCAAGGAAAATTTGCCTTCAGATCATCACTGGAGAGTGTTTGCTTCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_14704::LG3:51438857-51440857(-)
GGGAGGACACCTCCTCTTCCTGAAAGTCTTAAACTCAATCTGCGAGCTCGTAAAAGGTCCCTTGAAGATCAAGATGATTTGATGTGAAATTCATATTCCCTTTTGATGAGAGCAAGCATCTGTGCTAATTGCTAATATTCTTAGCCCCCAAAGGAACAAAATATGTATATTCATAGAAATTCATTCATCATATAATTGAAAATAATATAGCATGTATATGATTGTTCAATGCTTATACTCAATGCATATGGTAACAAGAAAAATTACGGTTCTCCAATGCTTGTGCTTGCTTAAAAATTTAAAGTATTTTGAGAATTGATTTTTGTTAAATTATAAGTTATGAAAAGATGTTTTAAAATAATTAATTTTGTCCGAATGTAAGAAAAACATAAATATTTGGAATATGTATGAACCTGAAAGAAAAAAAGTTGTTAAAAAAAGCAACTATACATTATATAAACATTTTATTTTTCATAAAACCAACTAAAATTAAAGCAAATTTTCTTAAGCATGTTGTTAGACACCTCTTGTATGGAGATCATGTTAATAAGAAATCTCTTGGATGTTGCTTACTGTTGCAACATTAAATACTATTGATTAAACCCTAATCTGGTTCTTGAAGTATTAATTTTGAGCATAGCTTATTTAGTTCCAGAACTATTTAGAAAATAAAATGATTGCTTTTGACATAAAATCAATGGTTTGTTTTTATATATTCATTTATATATAAGCTACCTATCACTACCATGTGGCAATACATTGAGTGCTGGTCCTATTTTTTAGGTTTATGAAAGATGTGTGGATAAGTTTCTCAATAAAGGAGATAAAAGAAAAACGACAAAAATGAAATAATTTTTTCGTAAGCTAAAACTTACGTATAAGTTAAAAAAAGAAAGATGAGAATTGAGAGAAGTTATTAGAGAAAACTTCTACATTTTTTTATATAATTTTAGCATCTAAAAAAGTATAATTTTTTTTCTCAAAAATATTTATGATGAACTTTGTACAAAAAACACTAAACAAAATAAGGGTTCTCCAAAATACTTTTATTAGATAGTTTTGATTTGATTTGGCATAATATGATAAAATGAAAGAGAAAATATTTATTTCAAAAGTTTATTTAACTTTTTTTTTTCTTAAATTTATAGAATAGTATAGCAACAAACAATAATCTCAGACTAAATTAATTGTTTAGTCCAAAATGAAAGCATGATTTGATCCCCTTTGGTGGATCAGCACGACCCATTTCTTAATGCAGTGAGAACAAAAGTTCTCCACTTAAGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACAATATTTTTTAACAACAATCTCTGTGATTATCTAAAATTATTTTACAATTAATAATAATAATTATAAACCCTAAATCAATAAAAAAAACAAGAAAATAATATTAAAATATTATAGAAAATGTTTTCAAATATAATTATGTCAGTATATATATATTTTGATATTAAACTTTGACTATCTCTAAATATTAAATTAGTAAAAGGAGCACGAAAGGTGACATAGCTATACCCCACACCTGATCCTAAAAAAAAACAGAAAAAACAAAATGCTTCCAAGTGAAGATAATATTTAAAAATAGAATTCGAATACGGAATTTAATTTAATCACGATACAGTTGATTAACTAAAGTGTAATGCACTTGAATAAATAATATTTAAATTCCGAATACAATAATTAACTCATTCGAAAAAAAAATTGACAGTTGAATTAGTAAACGCAGGATAACTAATAAAACTGATAAGAGAGCCAAAAACTTCACAATCACATGACACCAACAAACTAGAAATGAGAAGAAACAAAGCCACAAATTAACACATTACACATTACAGCGAACCGTTTTCTGATCTTCAATTTCATTTGCATGTGAATTTTGCAGCATATGATTTCCGCGTTGCATTTCGCGAGTAGTAATCAAAACATAGCAATTGAAGAGGGCGGCAACCGGCA


Gene Sequence:
>Vu_14704(-)
ATGAGCACCGGCAGTAGCGGATCGTCCGCCACGGCGGCGATGGAGAAGGCTCGGGTGAGTCGAACGTCTCTCATTCTGTGGCATTCGCACCAAAACGACGCCGCGGCTGTGCGGAAGCTTCTTGAGGAGGATCCATCGCTGGTGAAGGCTAGGGATTACGACAGCCGCACGCCGCTGCATGTGGCTTCGCTCCACGGCTGGGTCGAGGTTGCTAACTGCTTGCTTGAATTCGGTGCTGACGTCAATGCTTTGGATCGTTGGAAAAACACTGTACTCTCTCTCTCTCCCTCTCTATTTATGTCGTGTTATGATAGATTCGTTAACTAGAGAAATTTTTTTTTACTTCTTCTGACGAATAAATTAGTGTTGTTTTGTTCTGGAAAGCCTTTGGCTGATGCAGAAGGAGCTAAAAAATTGCCGATAATTGAGCTTTTGCAGTTAAACGGAGGCTTGTCTTATGTAAGTATATTCAATGGAAGGGACATTATTTTGTAACAACGAAAATATAAATGTGAGCACGTCGATTAACTGACACTAACATAGATTGTTCGAGCTTAATGAAATCGTCTTTAGTTCTAGTCATGTTGCCTTACGGGGAGAATGATACCTGTTGTCTCAAACCAAAAGATAAAATAAAAATGTATTTTCTATTGCAGTAAAACGAGGGAAGAATGAGTTTGTGATACTGATGTGTGTATGAGTTTGATGTTTGATTACGCAGGGCCAAACTGGAAGTCATTCTGAAAAGAGCCCTGTTCTTCCCCCATTGCCTAACAAATGTGACTGGGAAGTTGACCCATCCGAGCTGGACTTCTCTCATTCGGTTTGCATTGGAAAGGTGTTTTCTTTATTTTCTTGATCTCATTTGCATTGTACTGTATCAAAATCTTACTGTGAATTTTAGAAATTGCACTGTATTTATTGTGATATAGCTGTAAGTATGAAATTGTGTCTTCATCATATAGACTGGATGTGAGTATGAAATTGTTGTTTTCATCATAGACTGTATCGTATGTGAGTACAATTAGTTGTGAGTCTTCAATTGTCAATCTTCGTGATGATAATCTGGTCATTTATGTTTTTTAATTATTTGTCTTGGTTTTTTTAAGTTTTTTAATTTTTGTATCCACTCTGTTTCTTGCTGTCATTTCTACATGATTGCTTTACAGCTCATGTCATTTTACTTTTACTTTGCATTTATACTGTTAATGAACCAAATCTGCTCTTGAGGTTTGATCTTTGTGGGTGTGTTTTCTGAAGGGATCTTTTGGTGAGATCTTAAAAGCCCATTGGCGTGGAACGCCTGTTGCCGTCAAACGTATTCTTCCATCTCTGTCAGATGATAGATTGGTGATGTAAGATCCTTTATTTAATTTCTAGATTTTGTCTTGATTTGATTGCTATATAGTTAACAGGTTATCGCTGCAGTAAAATTCTTCTAATTGTCTGTGGTTGATTAATGTGTTAAAACAAACACCTTACTATTATCTGTCTTCTGTCAAGGCTTACTTGGGGCTACAGGTAAATTCATTTGGAGCCTGAGAAGGCAGATATGGTTCTCCACAAAATTTCTTAAATACGTGTTTTTGTAAATTTTACTTTCACATTTACTTTTTTTTTTATCTAAAAAATTAACTTGTCCTTCGTAAACTAAAACTGTCTACTTCTGAACCCTGGCTATGGGTAACCATTTCAATTTTTAGACTGTTCCTTGCGGTGATGTTTGTTCTGTTTGAACTAGCTACCTCTTTGGGAAATATGGTTCACATTAAAGCTCATGTATAATCAAACCCCTAAAATATGAAATAATGAATAATAAAAAGGAGAGGGGAGGCAATACACAGACAAACTAGTGATTAAGCTTGTGCATTCAGAAATCGACCATTTTTTCTATCTTGCACCTTTTTCAGTCACTTATCCCTTTATTTTTGTTGATCACTTTTTAATACAGTCAGGACTTCAGGCACGAGGTTAATTTACTTGTGAAACTTCGACATCCTAATGTTGTTCAATTTCTTGGAGCTGTTACAGACAAGAAGCCCCTTATGTTAATTACTGAGTATTTAAGAGGAGTACGTGAATGCATATAAATAGACACCTAGGTTCAGATGCTCTGAACTCACGAAATCTTGTTCTTTAAGATTAAACTTTATTAAATTACTATTTCGCGTTATTTATAGGGTGATCTTCATAAGTACCTCAAAGACAAAAGTTCTCTTAGTCCATCAGCAGCTATCAACTTTGGCTTGGATATTGCTAGGTATGGTGTGTCATTCTTTGATGTTTCTCTTGTTTTTCTTTTTAAATTTATTTATAGAAAGAACAAACAGAAAACCTCAAAACAAGAGAGAAATTGACCCATTGATCTTTTACTTAAAGATTGAAAAGAAATAATTCTTGAGGGCTTTATTGAACCCTCTCATAATCTTCTATTTATAAAAATAAATTGATAGAAGAATACATGATAAATAGGATAACTCTGGACACAATATAATCATGATAAATAGGGTAACTCTAGACACAATATAATCATGATAAATAGGGTAACTCTAGACACAATATAATCATGATAATTAGGGTAAATATTCTAACACTTTTCAACCTCTCTGTAAATCTTTTATGTAATTATAACTTATAAATCACTCCTTAAATGGATAATTCTCGTGGGACAGCGACTGAGAAGCCGAAACAACTGTTAAATTTGACCCCACCCAAAACCTGGGATTGCAAGGAGAGCACTCTTGCATAGGACCTTAATCTATTGCAAGGAGAGCACTCTTTCATAGGGCCTTAATCTATTGCAAGGAGAGCACTCTTTCACAGGACCTTAATCTTTTGCCTTGTCCTACGCTACTGAAATGGATGGACGGAAGATGTTCCAATTTCAAAAGAAGTTTGCCAAACCTACTTCTAAAAAATTTCCAGAAGTAATTTCCTAAGGTTCCAAACAACATCAAAATCAATAAAAGATGATTGTTTGTAATGAACTCCCAAATCACAACTTGAGCATCAGTATAGAAAATAGTGCTTTACCGTCTTGCCTTACAATCTAATTGTTATGGGATATTGTGAATTACTGATGTCTGTGACCTTGTAAAAGTCTTATATCTTTATGGGTGTCTCTTTGCTTCTCAACTTTGAATTTGTATTGGACTCTGCTTATGGCTGGCTTTGGGGGTTCTTATGATGCTTCAGGGTGATGGATTGGAAAGTTTACTGCTTTTTTCCATGTTCGAAGATATTCCCTCTCCTGCTTTAGACAATGTATTCTACCCATGTTATAGATGTACTTTTCTTTGGCTTGTACAAATATAAAATAGAAAATCAAACATTGTCGGTGTTATAAAAGAATGCAAATAGTTAAAGTCAAATAACTTAATCACCTTTCTCTGAAATCTGACTTACTCGTTTTGCTGATAAGTGAACTACACTTTTGATGGAATTGGTTATAGCTTAAAAGTATCGGCTCTCAGGCTTTTATTAATATAATGTATTTAAACAGCTTAAACATTGTTGGAGATAAGGTTGCAAAGATTTGGAACCCCATAAAAGAAGATTTCCCCGTTCCAGTGCTTGTTTACTTGTCACTACCATTGCTGCGATCTAATGTTTGTCTTGACTTAGACTATGAACCAAAGTTTCTTCATAAGGTATAAGAATAGTGGTTTGTGTCTGTAATGAAGAAATTACATGCAGTAACACTTTTAAGCATATATATGTCCTTTGATATAATTTTCTACATGATTTTTTTTTTCGATCATAGTCAGTTTTGCTGTGTATGAGAATGAGGATACAGGAAATGCTATCCTTACTTGCCATTTTTGTTTAAAACAAAAACTGTATTCACATAACTCACTAGAAAAATTTAAGATTTTTTTTATTTTTGTTAAAGAAACTGATTAATTCTTTTTGAGGTGAGTAAGGGAGGAGCTTCAAGAATGTTGTCAAGCGCATAACTAAGCCCATCTGAGCATCATGTATTCCTAACGGTGCTGATAAAACATTGTTAGGAAATCTAGAAACACTTGAAAGCATGCAGGTTCATTGAATCTAACTATTTTTCTAATCTATATTTTGTAAATACTGTTTGTAGAGGGATGGCCTATCTTCACAATGAACCAAATGTCATCATCCATCGAGACCTAAAGCCAAGGTAAATATGTTATTCTTACAAATTGATTTCATTTTTTCTGTCCAAGGTTTAGAGTATTTAACATGATCTAGAACATCATAGGAATTTATTTATATGTGGATACAAGAATGCACTAGAAGTTGAAATCTTTTTCACCCCTAAAATTTCAGGAATGTTCTTTTAGTCAATTCTAGTGCCGACCATTTAAAAGTTGGTGATTTTGGACTTAGTAAGCTTATTAAGGTCCAAAGTTCTCATGATGTATACAAGATGACTGGTGAAACTGGAAGCTGTGAGTATGAGAAATTCTTTCAAATTAATAAGGGAAAATGCATAGACATTCCATGAACTTTACCTTGTTTTGAAATATCCATCTTGAACTTGAATAACGAGGTGAGTGCTTAACTTTCAAACTCTGCTGAGACCAATCTGCTCAGTAATTAAGTTAATATGACTTTCATGAGATAATATCTGTCTTTTTTCTTAAATTTATTTTTAAGTTTCATAAATTAAAAAATGCAGAATAAAAGGAATATAAAGTAAGAGTATTTTAAAAAATAAAATAAAATCATGAGTTCCGAGATTATCAAATGAATTAATCAATAGGCATGTCATATGATGAATGGTTGTTATTAGGCTTATGCATGGACGAGTCTATCTAATTGAGGTTTAGGAAAAATCTATCTGAAATGGAATTTTAATATGGCTATTTCAAAATGAGGTAAAGTTGAAGGAATGTATGAATTTTTTTTAATTAAAACTAGTAACAATTCTGCACAAAATTGAAATCTCCTTTATTTTGGTTTAAAAAAATAGACCGCTACATGGCTCCTGAAGTTTTCAAACACCGGAGATATGATAAGAAGGT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