Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14695 LG3 51343344 51351815 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 51343367 stop_gained p.Cys352*
T/C 51346724 intron_variant
C/T 51346738 intron_variant
C/T 51346749 intron_variant
G/C 51346750 intron_variant
C/T 51346752 intron_variant
T/C 51346757 intron_variant
C/T,* 51346811 intron_variant
T/*,G 51346830 intron_variant
A/G,* 51346833 intron_variant
A/T 51346836 intron_variant
T/A 51346848 intron_variant
G/A 51347574 intron_variant
G/A 51348531 intron_variant
A/G 51348533 intron_variant
C/T 51348583 intron_variant
G/T 51349129 intron_variant
C/T 51350267 intron_variant
G/A 51350278 intron_variant
T/A 51350286 intron_variant
T/A 51350962 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14695.1
MARRGRNDSDMVAVANGVSVKTKLSKALSHNFHGGTMASRDEDEFLRWLLQLVSRMEEIATSSHAWSVPLKMGRVPCCEKVGLKKGPWTPDEDKKLLDYVRKHGHGNWRSVPAKAGLQRCGKSCRLRWINYLKPDIKRGNFSAEEDHSIIQLHALLGNRWSIIAAHLPQRTDNEIKNYWNTKIKKRLIRMGLDPITDKTIKQNTFEPFGGGHDQSKDTTNISHVAQWEGARLEAEARGSMLQLGSSQLSGLILRKIPTENNTAYNMYALVLATNNDFRSSVSTLSIPMLPGVSNTPHIRNKESSLSYKSDNSIMGASGQSQKEIEGWVSNLQDDIMVAVEAFRTARSESIDELFNEYTSN*


CDS Sequence:
>Vu_14695.1
ATGGCACGACGAGGACGCAACGACAGCGACATGGTGGCGGTCGCGAATGGAGTTTCTGTGAAGACGAAGCTTTCAAAGGCGTTGTCTCACAATTTCCATGGTGGCACGATGGCTTCGCGTGATGAAGATGAGTTCTTGCGGTGGTTGTTGCAATTAGTTTCGCGTATGGAGGAGATCGCGACGAGCTCGCATGCTTGGAGTGTGCCATTAAAAATGGGAAGAGTGCCATGCTGTGAGAAGGTAGGGTTGAAGAAAGGACCATGGACTCCAGATGAAGACAAGAAGCTCCTGGACTACGTTCGGAAGCATGGCCATGGAAACTGGCGTTCAGTGCCTGCCAAAGCCGGTCTTCAAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGAGGTGGATTAACTATCTCAAACCTGATATCAAAAGAGGAAACTTCAGCGCCGAGGAAGACCACTCAATCATTCAACTTCATGCTCTTCTTGGAAACAGATGGTCCATCATAGCAGCTCACCTTCCCCAAAGAACCGACAATGAGATCAAGAACTATTGGAATACCAAGATCAAGAAAAGACTCATCAGAATGGGCTTAGATCCCATTACCGACAAAACAATTAAGCAGAACACGTTTGAACCCTTTGGTGGTGGCCATGACCAGTCCAAGGACACCACCAATATCAGCCACGTGGCTCAATGGGAGGGTGCTCGACTTGAAGCTGAAGCCAGAGGATCTATGTTGCAACTTGGATCCTCGCAGCTGTCTGGGCTCATTTTGAGAAAAATTCCAACCGAAAACAACACAGCGTATAACATGTATGCCCTCGTGCTTGCCACAAATAATGATTTTCGGTCGTCTGTATCCACTTTGAGCATTCCAATGCTTCCTGGAGTTTCTAATACTCCACATATCAGGAATAAGGAAAGTTCACTTTCATATAAGAGTGATAATAGTATCATGGGAGCTAGTGGCCAAAGTCAAAAGGAAATAGAAGGTTGGGTATCAAACTTACAAGATGATATTATGGTGGCTGTGGAAGCATTCAGAACAGCAAGGTCTGAGAGTATCGACGAGCTGTTTAATGAATACACTTCCAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_14695::LG3:51351815-51353815(-)
ATAAAGAAATTCTAATATTACATATTTACTTATCTTGTTTTCACCTTTTTCTTGTAGAATGGATTCCATTGATGTAAGAAGAAACAAGGTCGAAAAAAGAAACAGGGTCAAAAATTCGAAACTATACACCCAACAATAAACCAAACCAATAAACCAAATCCCTAAAATTGAATTTTCCAGATCATTTTGTTTTGGTTAATAATTCAAGCAATGTGAATCAATCATTTGTTGACCTGTGTCGGAGTTAAAAAATTGTCAAAAAAAAAAGATGTCAATATATCATTACCTATATATTATACAGGTTTTAACCACTATCTTATCTCTACTAACCCACTCACCTTAATTGTCCTTCCATTGGTATTTCAGTTTCCCACTTTTCCTTAATTCCCTGCACTAATATGTTTTCTGCACTAGGTCCAAGCCACATCTCGGTTTACTCCTTGACTAAGCAGAATTATTAGTGTCCAATATTAGATGGATTATCAATGTTAATCTGACACTACTATAAATAATTAAAAATATTTATAATTATTTTTTTAAATAACTTTTTCATTGTATTAAATTCAGTTTAACAACATAGTAATTTTGCTGACTCTTTGAAACATGTTTTGTTTTGTAGTAACACTATAATTAAACGAAGAAATGTTACTTTAGACAAATAAGGTGAAACTCTGGACTTGACATTTTGTTTGGTAATTTGATCTAACCATAAAATTTGTTTTACTAAATAGAACTGCGAAACCCACATGCAGACAAAGGACAACACTTGTTGGATAATCTCATTTTGTATAACCATCTTTACCACCTGTTTTCTTGTTTTCCTTAGAGTAGGCTGTGTTGGAGGAGAAAGTTAAATTATTTTTTTATAGGCAAAAATATATTAATAATAGAGCATTTGAGATGCTAGAATCCTTAAAAAGAAATATTTACAAGGATACTTTCTCGTACATATCCATTTGATTTTTCCTGAAATATCAAATATATCACCATTTTAAATCATTCCAATTCGGGTCTGCTGCACGGTGTATATATGTGATAATCGCATAAGAGTGGGTAGCCCCAAGTGATATACTAGTAAAACTACTGTGCTCCCATATGTCTGTCATTGTTAAATTGGTACTCTATATAAGTATCCGCAAATTTAATGCTCGGAAGTGTAATATTTTTGCTTTATTCTAGGATACGAATATATCCAAAATATACTGGTCATCATTGAATTGACGAGGATGCTTTTAAAGCAATAAATGCTGCCTCGTAGCTAACAAGTTAGTTAAAAGCTACCTACTTAAAAACATATTTTTTATGTGGATGTATTTGTTGCCTGATCACCTTGTTAACGTTTTAAATATAAAATATTGCAATAACCACTAATAAAAAAACAGCATTTAAACTCGTACAATAAGTCTCGGTTTAGGAGAAACCGAAGCCTATCAGAATGCGGTGATATTTTTGTAATTCTGTCGAACTTATATGTCTCGGTTCAAAGGAAATCGAGGCATATAAGCTGTATTACCTCGGTTGCAATTTTAACCGATGTCTAAAATCCTGAAAAATTCAACGATTTTTCAGATCCTGCTTACTGCTTCGGTTCTGTGGCGAACCAAGGCGTATAAGTTGAATGTAATTTCAAAAATGCCATTTTATATTTTTCTTTTATTTATTTTTGAGGTGTATAGGCATCGGTTGCTTTGTTAACCGAGGCATATAGACATTTATTGCCTCGGGTAAGTAAAGAACTGAGGTAGTATAACTTTTTATACTTCAAAACTCGTTAAAAATTTTAACCTACTGTTTAATCTTCTTCTTCCTCCCGCAAGAGCTCTTCTTCCTCGCACACCCAAGAAGTCTTCTTCTTCCTCGTGCAAGCCTCCATTGCTCTGGCGCCATCCTCGTTGCTCGCTTTCTTCACACTTTGGTGCCTCTGGTTCTCTCGCTGTTGCTCCAAAGTGTCTCGTTGGGCTTGGCTGAGTTTTGCGAGATCGGAAGGAAACTCTTTTCTC


Gene Sequence:
>Vu_14695(-)
ATGGCACGACGAGGACGCAACGACAGCGACATGGTGGCGGTTAGGCGCTGGATCTTGCGATTTGGGGCTTGATTTCTAGTTTTGGTGATTTTTGTTTGTAGGTCGCGAATGGAGTTTCTGTGAAGACGAAGCTTTCAAAGGCGTTGTCTCACAATTTCCATGGTGGCACGATGGCTTCGCGTGATGAAGATGAGTTCTTGCGGTGGTTGTTGCAATTAGTTTCGCGTATGGAGGAGATCGCGACGAGCTCGCATGCTTGGAGGTTCGGAGATGATTTGGTGGAGGCGCGAAGAAGGAAGAAAACGCGGCTAGGGTTTCTAGAAAAATGGATATCCGATTTGGATCTAAAAAAATTAAAAAAAAATTAAAAAGACTCTACTGCCTCGGTTGTCTGTGAACCGAGGCAGAATCCGAAACCTTTTGCCTCGGTTCTGAACCGAGGCAAAAAGTCTACTCCTTTCTACCTCGCCTGTATATACCTCGGTTGCGGAACCGGTGTCTATAAACGAAAATAACCGCTGTCGTTTCTCTTAACTGCACTAGTGAACATTTTGAGAAATAGGGTCAAGAAATTGAAATTCTAAAGTGGCGTTCATAGACCTCAAGCCCTATATATTTATCCACCACAATTTCATTATAATATAATTCATTCATCAATGTTATAACTTTATTGATTGTCATTAGGGCAAAGCCACTTCCTAACCCTATCTTCTTAAAAATGACAGATAAATATTTAAACTAAAGGTTTTCAAAGATGGTACCGTATTTATACGTATAATGGTAACATTCACCTACTTATGTACACTTCCAATATTTCCTTCTTTGTATATGTTAACTCCTGGCTTGCACTCACAGCCTAAGAACAGCAAGGACTGATTCGGGTTACCTTACAACAGTGTGCCATTAAAAATGGGAAGAGTGCCATGCTGTGAGAAGGTAGGGTTGAAGAAAGGACCATGGACTCCAGATGAAGACAAGAAGCTCCTGGACTACGTTCGGAAGCATGGCCATGGAAACTGGCGTTCAGTGCCTGCCAAAGCCGGTAACAATACAACTTCTGTATACCCTTTTTTCTCAATCATCGACTGTGCATGTTCTTGATATTCAGCAATCACGCTCCATATCCCCAATTTATTTGTTACGTACATGTATGATTTATATCTAGGTCTTGAAAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGAGGTGGATTAACTATCTCAAACCTGGTATCAAACGAGGAAACTTCAGCGAGGAGGAAGACCGTACCATTCTTCAACTTCATGCTCTTCTTGGAAACAGGTGACCTTCTTTTGGTTTTCATACTTTCGTATTAGTAAATCAAAAGGTTAATCATATATTTCTCCGAAGCTAATCGTGTTTCTCTATTGCACACACAGATGGTCAATCATAGCAGCTCACCTTCCCCAAAGAACCGACAATGAGATCAAGAACTATTGGAATACCAACATCAAAAAAAGACTCATCAGAATGGGCTTAGATCCCATTACCCACAAAACAATTAAGCAGAACACGATTGAACCCTTTGGTGGTGGCCATGACCAGTCCAAGGACACCACCAATATCAGCCACGTGGCTCAATGGGAGGGTGCTAGACTTGAAGCTGAAGCCAGAGGGTCTCAGTTGCAAGTTATTGGATCCGGATCTTCGCAACTCTCTGGGTTAATTTTAAGCAAAATTCCAACTCAACCTTGTCTTTCATCACATTCGGTGTCAACCGAGCACAACACAGCGTATAACATGTATGCCCTCGTGCTTGCCACAACTCATGATTTTCGTTCATCTATGTCCACTCTGAGCATTCCCACGCTTCCCGCAGTTTCTAATATTCCACAAATGAAGAACACAGAAAGTTTACTTTCATATAAGGGTGATAATAATGTCATGGGAGCTAGTAGCCAAATCAAAAAGGTAATGGAAGGTTGTGTATCAAACTTACAAGATGATGACATTATGGTGGCTGTGGAAGCGTTTAGAACAGCAAGGTCTGAGAGTATCGAAGAGCTGTTTAATGAACCCACTTCCCTTTAGAAGGCCTAATATGACGGCTTCTTTTAAAATATGCGTTGTTTTAACAAAATGCGTGATAACTTCTTCTCTGTGTAGGGATTTTCAGCTTCATATCAGTTTGGATGTCTCGGTATGTGTCTCACTCAATTTATGCGTTCTTATATGATAGGCGGCGAGATGGTTCTGTTATCAGGAAACAGATAATTATAATTTTTTTTCCTCATGTTCTGATGCTGTATTCTTGAGTATTCATCGTGGTTCAGATCCTGTTTCCTTTAGTTTTGGCAAAATATTTCTTATAAAAAAACTTCCGGTGAGTGCCAAGGTCGTGATGTTGCATGTTACTATGATCTCTATAAGGAATTTAGCAACTTTCAAGGAAAACCGCATGATGAAAAGAGATGTATGTATCGATTGTTTTCGGGAAAGTGTTTGTATGGTTGTTAAAATATCATTTTCCATAATTAAAATAGTTAACCTAGTCTTCTCATTTTGTCAATGTTTCTTTAGTTTCAGTCTTATTGGGCATACATTCAATACTATATTGCGTTAGTCATGGAAGACGTCATTTGCTTTGCATTATTGTAGTAGTAATTTATGTATTTTTCTTGTTTTTTATTTGATACCACAGAAAAATGTAATTTCTTATTTTCAATTCATCTCTAATATTCTGTTTCACAATTTGCAAAATATAGCATTCATTTTCTATTGGCTCAAACTTAGAAATAATTGATCTATAATGTCATCCACAACTGATCTATAATTGATGCGAAAAGAAACAAATTGATCTTGATATTTTGATATTCGTAACTTTTACACTTAATTTATCTCTTTCTCTTTCTAATCATTAAATATAATATATTTAATATAGATGTCAGCGTGTAGGAAGAGGGGTTTGAAGGGTAATATTTATCTCATGCAGGGAAGAGCCTCAATATACCTGACAAAATCTGCAAAGTGTAGTGTTGGTGGGAGGGAATGGCTTATACATCATGAGAAAAAGGATCAACCAAAGCATCTAATTGAAGGACTATAGTTATGTGGCAGAAATAGAAACAGAAAGTAGAGATAATAGCAATCAGTATGTTTTTGTATGCATGTTATATAATACTCGGATGTAAGGAATCACCAAGGGTAACTTCCAGACGAAGCAAAGAAAACCTTAGAAGAATGAAATATCTACATGCTATGTATATATATAGGTTTATGACGATAAATTTAGTACGTCAAATTTTAATAAAAAAAAAATCCATGATATTTCATACTATTAACTCTATACATTAAAAAAAAAAGGTAAATTACTCATCATTTCAACCATTTTTGTTTTACTGGGATTTTTGGCTTATAAACAAACGTTAATTAAAGGAGAGGGTTCTTGACAACAAGTGTATCACTTCAAAAGCTGCAGGCCTATTAATGCCATGGCCTTAGGAACAACCCTATTCAAACCCCAGAATTGCCTTAAATTAGGTGATGGATAAATAAATTATGTGTAAGCTTTTTCATATCTGATTTATAGTTTATGTTTCCCGTTGTTACAGTTTTGTTACATTAACAAGAGTATAAGACCTAGACAATATATAAATATTATTAATTATTTGGTTAGCATTAAAACTGATAATGAAAACAAGCTAAAAAATAAAAATGGTTGATTAGTAAATTAAGAAATAACTTTACAATTTTTATATGCTACTGTTGTAGAGACAAAAACAATTAACCAACCTATTCATTCACTTTCCAGCCCTTTCGAACATTAAACTTGAAATCAGTAATTTTTTGTACTACTTATTTGAAAAATATGGTGAACACTTACTTTTCTAACTCTTCTATTCACACACTAGTGCAAAATTGACCTTTAACGTCAGTCCATAGACGTCCGTCCACCAAAATTTCAACGTAAATAATTGACCGGTGGCATAAATGTAAATAATTGAGTGTGGAGACATCCGTCCTGGAGGGGGCCGGACGTCTATAAATCTTCAACTCTCCCGTCAGCCTTTTGAACGTCCAGGGGCCGGACGTCTACTATATTATAGACGTCCGGCCCGACGTCCGGCCCCCTCCAGGACGGACGTTCAAAAGGCTGAAGCAATCAACTCTTCAACTCTCCCGTCAGCCTCATGAACGTCCGTTAGAGGGGTCGGACATCTACTATATTATAGACGTCCGGCTCCCTCCAGAACGGGGACGTTCAAGAGGCTGACAAGGTAGTTGAACCCGTCAGCCTTTTGAACGTCTACTATATTATAGACGTCCGACCCCGTCTAACGGACGTTCAAAAGGCTGACGAGAGAGTTGAAGAGTTGATTGCTTTAGCCTTTTGAACGTCCGTTATGGAGGGGGTCGGACGTCTATAATATTGAGACGTCCGGCCCCCTCCAGGACGGACGTTCAAAAGGCTGACGGGTTCAACTACCCTGTCAGCCTCTTGAACGTCCGTTCTGGAGGGGGTCGGACATCTACTACATTATAGACGTTCGGCTCCCTCCACAACGGACGTTCAAAAGACGTTTAAAATAAGGACATACACACCAAAACGCGAACCCGCGAGGAGTTACGCGAACCCGTGAGAGTTCGCTCTGCGCCTTGCATTTCCAGGTTGGTTTTTATCTGTTTTGGACCATTTAATCTTACTTTTATTTCGTTTAAATTGTTCAGTGATGAAATATCTTTCATTTGGACAGATTAAAAGTCGTTTTCGGTGCGTTTTGGTACAGTTGGTTGCGTGTTCTTGGGTGGCGTTTTTTGGCCTACGTTTTAGGTCGTGCACTCCTCCATTTCCCTCCATTTTCATTTCGAATATGCTCTTCAGACGTGTGGCAGTGCACAAACAAACGTCCAAACCCCGTAATCCTAAATAACTCGTTCAGCCATATAGACGTCCGTTTCGACACAAACAGACGTCTATATAGACGTTTGTTGTGTCGGAACGGACGTCTACATAGACGTCCGTCCTTATACAACGGACGTCTACAT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