Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14617 LG3 50237314 50241495 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 50237682 synonymous_variant p.Ser75Ser
G/T 50237818 downstream_gene_variant
G/A 50238194 downstream_gene_variant
A/G 50238213 downstream_gene_variant
G/T 50238223 downstream_gene_variant
G/T 50238254 downstream_gene_variant
A/G 50238261 downstream_gene_variant
G/A 50239298 splice_region_variant&intron_variant
A/G 50239299 splice_region_variant&intron_variant
G/A 50239370 downstream_gene_variant
G/T 50240264 downstream_gene_variant
T/C 50240892 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14617.1
MAPSPFTSLPFVFFTLLSILHLSHCKTLKRDVKALNEIKASLGWRVVYAWVGDDPCGDGDLPPWSGVTCSTVGDYRVVTELEVYAVSIVGPFPTAVTSLLDLTRLDLHNNKLTGPIPPQIGRLRRLKILNLRWNKLQDAIPPEIGQLKSLTHLDAGNNHLVGTLRELIRIEGCFPALRNLYLNNNYFTGGVPAQLANLTSLEILYLSYNKMSGVIPSSIAHIPKLTYLYLDHNQFSGRIPDPFYKHLFLKEMYLEGNAFRPGVNPIGFHKVLEVSDSDFLA*


CDS Sequence:
>Vu_14617.1
ATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCTAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATACTTGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTACCTCGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_14617::LG3:50235314-50237314(+)
AAAGCTGAGTTTGAGATGACAGATCTCGGGAGGCTTAGCTACTTCTTAGGGATGGAGTTTTTGCATACATCCACCGGTTTAATAATGCATCAAAAGAAATATGTGAAGGACTTGTTGGAGAAATTCAACATGAACTACTGTAATGAAGCCAGAAGTCCACTTGAGGTAAATGTGAGACTAAACATAGATGACGATGAAGAAGGCATAAATGAAACTGACTATAGAGAACTTGTTGGATCTCTTCGATTCTTATGCAACAGCAGGCCAGATTTAATGTTCGGAGTTGGTTTGATTAGTAGGTTCATGTGTAAGCCAAAGAAAAGTCACATGACAGCAGCCAAGCGCATACTCAGATATATCAAAAAGACTTCAGATTATGGAATACTATTTCCTTATGGTATGAAGCATGAAGAATTGAATTTAGTTGGATACACTGATTCTGATTTTGGTGGAGATCAGGTTGAAAGAAAAAGTACATCTGGGAATATATTTTTTGTGAACAAGGCTCCCATATCATGGAGTTCTAAGAAGCAAACTGTCATCGCCCTATCCAGTTGTGAAGCAGAATACATAGTCGGTTGTGCTGCTGCTTGTCAAGGGGTGTGGTTGAATGAGTTGCTGATGGAATTGCAAATTCAGAAAGGAAGATCTGTAGAATTGAAGATGGACAACACTTCAGCTATCAGTTTGGCAAAGAATCCGGTTAGTCATGGGAGAAGTAAACACATTGAAGTTAAATACCACTTCTTACGTGATATGGTTAACCGAGGCAAGATTGAACTGGTGCATTGCAAAACTGATATTCAGCTGGCAGATTTGTTTACAAAAGCTCTAGATTTTGCCAGGTTTGAGTATCTCAGAAAGGAGATTGGAGTTGTGACACCAAAAGGCTTGAATTAAGGAGGTTATTAGTTTTATAATTCAAGCTTTAATGTTTGTCAGAGTTGTTAGTTAATACCGTTATTTCTGTTATAGTTGTATGTTACATATATAAACTTTCTGTAACTCTTTGAATATACAGTTTTCGTTATTCTCTATTACATTTCTTTTTCTCAATTCTTGTTACATCTTTTCTGCCTATCTCACTTTCTGCTATCAGTTTCTCTGCATCACTTTCTGCTATCAGTTTCGATTTACCTTCCTAGGAAGTGACTCTCTTTTTTTTTTTCATTTTCAATTCATCTTTTTTTACACACACACGCACAAATTGTCTTGATTGATTATCTCTTCTTAACTCTTATTCTTATGAATGATAAAGCACGATGTGACTCATTTATCTTTCTATTTAAATGCTAAAATAAAAAATATTTTAAGATATTACTACACAATAATATTATAATTTGAATTATTAATACTTACACATAAAATTTTAATTCTTAATTATAATAACTTTTAAATTATCTAATTAAATATATTAATTAATTAAAATTTTGAAAAATATTTATATTTCTGTTTAACCACACATTTATTGTCCATACAAGTCATGGAATCTTGTTCAAAGAGATTAAATTTTCTAATTTATTAAATATAACTGTTATTAAGGTTAAGACACTAAATTGACAAATGGCAACCCACTCCTATTTTGCTATTTTAACTGTCAAAAGCCGATACAAGGCCATAGTCAATACCAATCAAACCAAACAGGCTAAATCCAATAACATAAAAAGTAATATAATAATATATAATATAATAAAAGATTGTACAATGAAAAACAAAAGAAAGAAAAGAAAACCATCAAAACCTCAGTGCCGACGCCAAGGAGTGTGTTGTTGGATGTTCAGATTCCAACATGATACCGCGTTCGCTCACTCTCAACTTCAATTGATCAATCACCAAAATCAAATTCCTACACCACACCTTCTCTCTCCTTTGCAAAATCTGAATCAACAACACACAGCAAAACATCTCATTCAACCACACCAACAACACTTCAGATCTACGATTCCAATCCCACAACACAAAAAATAAACAAAAACCGATTTCTCCAAGCGGCCTCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_14617(+)
ATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGGTAACGTTAGCTACTTAACTCAGTCCCTTTACCCATGTCGTTTTCTCTCAACTTTTCTCCAATTCGGTTAATTGGGTTGTCGAGTTTTGCTTTTTCCCGTCATGGGTCGGAGTCGTTTATGTCTTCCTCGAATTTTTTGCAGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTGTGAGCATCATTTATCAATTTTCAATTGATTTAGAAAAATGCAAAAAAATGTCCCATTTTTTTGGAATTGTTAAGATAAAGGTTTTTTATTTTTAAGTTCAGTTGTTGCTGACGAGATTTGAGGTTGTAAAGTTGGTGTAATTGGGATTTGGTATTTTTCAGTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTGTAAGTTTTTATTTTTTCATTAATCTATGTTTCCTTTAATTTTGATCCTTTAACGGGTTGAGAAACATGTGGTGTTGATTAACGCCTATGGTTGTGTTGGAGTTGAATGTTTGAAAGCCAAATATTGTGTTCTGTTTGTATGTTTTTCATATTTGTTTGCAGGATAGCGAGGAGTTTATTTGGTTGGTGTTTTTTAATTTGATGCAAAATAATAAAGAAATTAATTATAAATGGTTGATTGAGATTTATGGGTTGAGATAATGCATTTGCAGTTCATCTGCATTTTGTTTTGCTTTGTTGCTTTTAATTACAATTACTATATGTGTATCATTGAAATGCTTCCATTTTGATTCTCCCTTTGAAATTCTTATGAGTTGATGCACTGTGTACTTATGGCAGTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTGTATGAATTTTCTGATCCCTGTTCACTTTTTCTTTCTCTCTGCATTTTTTGTTCTGATACTTATGTTTGACGCAGTACAATTATTTATACTAGATTTTTATGTTAACAACTAATGTTTATTTAGGAAGATTTTTCTTTTTACTGGGTTTTTATTTAAGCAGTGGTTGATCATCTATAACCATTATTCTAAGATGTTATATTGATTCATTTTTTACCTCTCTTTCCTTCCAGAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGTGAGTAACTCTTACCTTCCTAATGTCTTTGGGCTTGCTTGTCCCTTTTTCATCGTTGCTTTCATTTTATTTAGAATTGTAACTGTAATGTCATATCTTTTTGCAGGTACCTAAGCTTCAACAATTTTAAGGGAGAAATTCCCTAGGAGCTAGCAAATCTGCCTGACCTTCGCTATCTTCATCTCCATGAAAACCGTTTAACCGGAAGAATACCACCAGAATTGGGCACTCTACAAAATCTTCGGCACTTGTAATAATCAAAGCATTTTAATTTAATAATATTCTAGTGCAGAGTACACTATTTATCGTACTTAATGTTTCCTAATACTGTTATACTTTATAGGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTGTAAGTTAATGCTGGTGAATTAGTTTCCTCAATATATTATCATTTGGTTTTAAATAATATTGTCTAAATTTTAACGTTTTTTTTGTGGAACCAGATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTGAGTGCTGCTTTTCCTTTTATCCTTTAATACCACTTTTCATTCTTCCTCCTCCTTTGAGCATGTGTGTGAGAGAGAGAGAGACAGTATTGCTTTACAATAATTCTACCCTTTTTGCAAGATCTGTCTCTTATTTATGGAATTTCCATAACATGATTATTGTATGTTGGAGGCAGGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCTAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATACTTGTAAGTTTGTCTTTCTCTTGTTGATTGGAATCTTCATTAGAAGTGTTGTGCATTGAATAAGGTCTAAGTTGTTTTTGATTTTTCATGAAACTCTTGATTTCGTATTTTGTTGCTACTTATATATCTTTTAATTTTATTTTATAATATACTTATTCTTTAATGAGGAAGATTCCTCACCTTTTTTGGACAGATGTTAATGGAGAAGCTAGTCTTGGAATACCTTATTAGATTTAGTAGTTGAAATTTTGTTATTTTGATTGGTGACTTTTAGGAGGTAGTGGATGATATGATTCAGAGAAAGATTAACACTATGCGTATTCAAGAAACTAAATGGGTTGGAGAAAAAGGTATAGATCCAGACACTGCACGAGTTAAACTTTGGTGTACACTAGAAAGTTGGAGGTGATGACAAAATTGCTACTACTGGTGGAAAGTGGTGGAAGTAAAAAGAATCGGGACTAAATTTTACCTTAAAATTTACATTGGAGACTGATAATATTATTAATTTTTGCTTATGCGCCACAAGTAGGATCATAACCACTTTTAAAAGAGAAATTTTGTAAATGTTTTGGATCAAAGTTTTCCTCAAGAGGAAAAGATTCTCGTAGGCAGGGATTTAAATAGATATGTTGTTAATTGGGCAAGATATGTTGATGAATTAAAAGGTTTTGGTCCAAGTGATAAGAAATCTTGGTGGTGGAACATAAGTGTTCGAGGAAAGAAATAAAAGAGTGTTTTAAGGATTTACACGAGTCCAATAATACTAAAAATTGGGCAAGATTTTGGAAACATAGAAATGAGGTAGTGAAAGTTGTGAATGAGGCACTATTCAAAGCGGTTGCAGAGTTTTAGCTTGATATTGGGACAAAGAATAAATAAAGAGCATATATATAATAAGCTTGCCAGAAGTAGGTAAAAGAAATCAAGAATTTTGGACCAAGATTTATTAAAGATCAAGAGAATTTCTAAGTTACTGCTACAGATCACGATATCAAAGAAATATGGGATAGCTATGTCCAAAGTTTTTCAGTGCTAGATAAGGATTTATATTTAGCATGGAAGAATTAGAAAATTAACTGTTCGAACAAATTTGACTTATTGTGTAGAATTTTAGTTATTGAAGTAAAAGAAGCCTGTAAGAAGATGGATAATAGTAAAGTTTATTAGTTTATATAATTTGGTTGTTCACTGAATTCAAGAGCATCATGTGATCTACATAGCTAACTTCACCTGCTGGGATAAAGTTATTGTTGCTGTTCTATTGGTTTACCGACAAAAAGAGTTTTTTGTATTGTAACCGGATATATCACAAAATTCAATGGCTGGGCTATTTTTAAACATACGAGTATATAAGTCATATAGAAATTGATGTGAGTGTATGTTTACCCTTTTTGATTTTGAAACTTATAAACCTTGTCCTTTAGGCATTGAGTTCTCTAAATGCAATTTAAGAACTAGAAACACATGCTTTACTTGCTTTCATTTATTTATTCTCGCTGGAAAACTATGGTCTTTAATATGCTGCTGTGCGCTTCAATACTACAAACACTTGGCTCAGAATTCTAATTTTCTGTAGAAAATGGAAATTTGAACTTTCCTTTCCTTTCCATTTTGTTAGTAAGATTGATAAATATGTTCTCAGATACTTCCATGAAACTCAATTGTCATCTCTGTGAAGTTTTTAACAATTTCAAGATTTTTTTCTCTATTTCAGGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTGAGTTTCCAATGAAGTTGTGCAGATCACATTATATTGTTCTAAGAACTGAGAAATTTTATATGCTCTTGGCAGGTACCTCGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAA