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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14517 LG3 48943205 48945193 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 48943747 intron_variant
T/G 48943782 intron_variant
C/T 48943787 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14517.1
MRNFKAFGHVIIALFIVSLSAWCHGQVELDKAPMEKAEKDALFSTIQGFVGNWWNGSDLYPDPCGWTPIEGVSCDLFDGFWYVTVLNIGPIYENSLSCAKNLEFRPHLFELKHLKTLSLFKCFRSQRRHQVTIPNANWENLAGSLKSLEFRSNTGLIGKIPSSFGVLKKLQSLVLLENGLTGEIPPEIGNLKKLNRLVIAENYLSGHIPDIFTALGDLLILDLSRNSLSGSLPLTLGCLTSLLKLDVSNNHLEGNLLKEFAYLKNLTLLDLGNNRFSGGLTLSIQEMHSLEEMVLSNNAIGGDIRILKWENLHNLVSLDLSNMGLNGEIPESIIQLKRLRFLRLSDNNLTGNLSPKLSTLPSLNALYVSGNNLAGELKFSMEFYGKMGTRFGAWNNPNLCCPLGAIATSNVPFGVKPCQQQIKLVESNTNGSDVNKTFYSIASLCHAPNNFWWTFPFIMILFLNSYIIGL*


CDS Sequence:
>Vu_14517.1
ATGAGGAACTTCAAGGCTTTTGGTCATGTCATCATTGCTCTCTTCATCGTCTCTCTGAGTGCTTGGTGTCATGGACAAGTAGAACTTGACAAAGCTCCTATGGAGAAGGCTGAGAAAGATGCTCTATTCTCCACCATTCAAGGTTTTGTTGGTAACTGGTGGAATGGCTCAGATCTCTATCCAGATCCTTGTGGTTGGACTCCTATTGAGGGGGTTTCTTGTGATCTGTTTGACGGATTTTGGTATGTTACTGTCTTGAACATTGGACCAATCTACGAGAATTCTCTAAGTTGTGCCAAAAATTTGGAGTTCAGACCACATTTGTTTGAGCTGAAGCACCTCAAAACTCTATCCCTATTCAAATGCTTTAGATCACAACGCAGGCATCAGGTTACAATCCCCAATGCAAACTGGGAAAATCTGGCTGGCAGCTTAAAATCACTTGAGTTTAGATCAAACACAGGTCTCATTGGAAAAATCCCTTCAAGTTTTGGTGTCCTAAAGAAGCTTCAGTCCCTAGTACTGTTAGAAAATGGTTTAACAGGTGAAATTCCACCAGAGATTGGCAACCTGAAAAAGTTGAATCGGCTTGTCATTGCAGAAAACTATCTCAGTGGACACATTCCAGATATTTTTACTGCACTGGGTGACTTGTTGATACTTGATTTGAGTAGAAACTCACTATCCGGGTCTTTACCTTTAACACTTGGATGCTTAACCTCCCTTTTGAAGCTTGATGTTAGCAATAACCATTTGGAGGGGAATTTGTTGAAAGAATTTGCTTATCTGAAGAATCTGACCCTTTTGGACCTTGGGAATAACAGATTCTCTGGTGGGTTGACATTGAGCATTCAAGAGATGCATTCTTTGGAGGAAATGGTTTTGTCCAACAATGCAATAGGTGGAGATATCAGGATCCTGAAGTGGGAAAACCTTCATAACTTGGTCAGTTTGGATCTCTCTAACATGGGCTTAAATGGGGAAATTCCTGAGTCTATAATACAATTGAAGAGGTTGAGATTTCTACGCCTCAGTGACAACAACCTCACAGGCAACCTTTCACCAAAACTATCAACTCTTCCTTCTCTCAATGCACTCTATGTTAGTGGTAACAATCTTGCAGGAGAGCTTAAATTCTCTATGGAGTTTTATGGAAAAATGGGAACACGTTTTGGAGCCTGGAACAACCCCAACCTTTGTTGCCCTCTTGGAGCAATTGCAACAAGTAATGTTCCATTTGGGGTAAAACCATGCCAGCAGCAGATCAAATTGGTAGAATCTAACACAAATGGTAGTGATGTTAACAAGACTTTCTATTCAATAGCCTCTTTGTGCCATGCTCCTAATAACTTCTGGTGGACTTTTCCATTCATCATGATTCTCTTCCTAAATTCTTATATAATAGGTCTTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_14517::LG3:48941205-48943205(+)
TATTTTTAGAAAAATAAATCAAGATAATTATTTTTATCAGATGAGATATATTGACTTTTGTTCAGATATCTTATTATATTATATTATTTAAAAGTGGAAATGAAAATAATGTCTGAAAATAGTTATCAAGAAAACAGTAGTTATTACTCATTACCTAACATGCAGCTCAATATAATGCTGTATAACTTATTTTGTGTAAAACTACGAATTCAAAGGAATTCAAAAGTATACAATTAAGTCACTGCAAAATCATTTAGTTACAAAAGAACAAAAACCATATCCAATACTTGCAGCACTTCAAATTTATCTGAATACTTTGTACTTCAACCATACATGAAAAAACCACTTAGAAGGTTTGTTTTAGAACTATTATCAAGGTAATTGAACAAAGACATGAAAGTTTTCTATTTTTGTCAAAATATATAATAAAGCAAAAATTCTTCCTTAGCATAAACACACACAAAAGAAAAGGCACTCAATGATTATTCACGTTTGATAAACCGCACAACATTTTCCCAGTAAATAAATCATACAACAATGTTGCAGAAAGCTTGGGAAACAACGAACTTAATACTATTACTGTCATTTTTCTTCTCCTTTTGCTGAGACCAAAAACTTTTTAGCATAAGAAAACTCAGAAGTGGTTTTTTTGGTAGAAAATAATGTGGTCCTCATCATCCAACCGCAATGCAATGCAATGAAACAATATGGTTAGCTTCAGTTTTCAAAGCCACTCTGATATGTTGTCCTTTTTACCCTCTGCAGTTTCAGAGGGCTGTTAAAACCCCCCAGGCCACCACCACCAAACAAGACAACAAGGCAATAACAGATAAAAGCCTACTTTGTCTTGCATGCACTTACATGCACCTTTCATTTTTTGCATGCATGATATGGTCCCCTACTAATGCCACTTTTCTCACACTTTTATTTCTTCATAATACCCTTAACCAATCTAATCTAATCACACATCTTAAAGTATATCTATTTCTTGGAAGTTCCACCTTGAGATTCAGTTAGGTTCTTAATACTGTTTTTCATTAGTTTCAAATTTTTATAATGGTCAAAAGATATATACACTCTATTATCACTGGAATACAAGTGTAAGTCTAAGTCCCATTGGATATAAATAAGAGAATAAAACATCTTAAGATGAAAAAGATCCGTTAATTCATTGTGTTAAAGTTTTGGATACTCCGTCCTGTGAGCTCATATTTCATTTGTGTATCTATCTTTCCGATCAACCTTTTTCTTGATGGATCCAACGATTACTTCCTAACTCCAACGTATATGTTAAGTATTGAAGTGCATTGATAATAATGCTAATAATGTGACATTCAATAATTGAATCAGAAAGAGTGTGCCATTTTCAGACCAGATTTCGCTTTCATCTTATATAGACTTGATACAGCTCTGGCCATATTAGGCTCGTAGGCTCGTTAATATTATGACTTTGAGCTTCGAGAACTGTGCTAACAAGAACATCTTGTGTTGTTCCCTTATATCTGCTATATACTTCCTTAGCTTTTCCATAAACACAAAGAGGAAAAGAAGTCAGGTTTCTTGTTATGCATTTGTTTTTCCTCTACCATTATTCTTCTCCTTTTCCTCTTAAGTTTTGAACACAATTTTAGGATCCTGTTCTTCCTTTCCTGATGCAAGAATCTTCTCCATTTGTTTTATCAAATACCACTGGCTAAAATGTCCCTTGCTTCCCATAGGGTCCCATCTTGGTATTTCTTTTGTCTTGACATGCTTGCTTACTGTTGAGGGAGTAAGTCACCTGCTCTTCCTCCTCCTTTGTCTGTCCTTTTTCTTGTAATTTAGTTCGATGTTGTTTCTATGTCAAATAGTGAATTGTGTATGAAAATCACAATGCAAGTTGTGAAATAGAGTTCAGGCCAAAATAGCTCCTTTTGCTTGTGTTTGTTTTATCAATTTTGCTCCATCCACACCTTGAGTTTATCCTGTTCATGGTAGTGCTGCTTTCACTCTTTACCTCA


Gene Sequence:
>Vu_14517(+)
ATGAGGAACTTCAAGGCTTTTGGTCATGTCATCATTGCTCTCTTCATCGTCTCTCTGAGTGCTTGGTGTCATGGACAAGTAGAACTTGACAAAGCTCCTATGGAGAAGGCTGAGAAAGATGCTCTATTCTCCACCATTCAAGGTTTTGTTGGTAACTGGTGGAATGGCTCAGATCTCTATCCAGATCCTTGTGGTTGGACTCCTATTGAGGTGCTTTTCAGTTTTGACCCCTCTGAATGACTATACATCAAAGTGCAAAATTTCATAGCAACTACCTTTATATTGTGCTGTGGAAATGTGTAGCACCTTATTTAAACTATTTCTGGTTGAAGTTATAAGACCATCTTGCATTCAAGAATTTCAAATTCTTATTATCTTTTGCCTTACAGATTTCAGGGTAACAACTTATCATTACTATGTCAGTATACAAGGCCTTGAATTTTTTTTACATATAACTGTGAGGTGAACTTGGCATTCTGCAGCAAGCCTTCTGAAAAGAAAAGAAAATCACTTGGCTCAGTTTTTAGAATTATACAGAGTCCTGAATTGTTCTTCTTTAAAGATTTTTTTGTTTTTTTTTTTCAAAATGATGGCTTCAAAGTATGAACATCAGTTATTTTGTCTTTGTTTTCCAGTAACTAATTTGGTCCTTGCAAAATATTGCATGCATTGAGTCACTGTATCTGTTTCCTATTAGGCCATGTTCTCTTTACAAAAATGTTCCAAAACAGTACATGATATTCAAAACATTGTTTGACTGATATTTAGTATTGTTTTCTGCTGCAGGGGGTTTCTTGTGATCTGTTTGACGGATTTTGGTATGTTACTGTCTTGAACATTGGACCAATCTACGAGAATTCTCTAAGTTGTGCCAAAAATTTGGAGTTCAGACCACATTTGTTTGAGCTGAAGCACCTCAAAACTCTATCCCTATTCAAATGCTTTAGATCACAACGCAGGCATCAGGTTACAATCCCCAATGCAAACTGGGAAAATCTGGCTGGCAGCTTAAAATCACTTGAGTTTAGATCAAACACAGGTCTCATTGGAAAAATCCCTTCAAGTTTTGGTGTCCTAAAGAAGCTTCAGTCCCTAGTACTGTTAGAAAATGGTTTAACAGGTGAAATTCCACCAGAGATTGGCAACCTGAAAAAGTTGAATCGGCTTGTCATTGCAGAAAACTATCTCAGTGGACACATTCCAGATATTTTTACTGCACTGGGTGACTTGTTGATACTTGATTTGAGTAGAAACTCACTATCCGGGTCTTTACCTTTAACACTTGGATGCTTAACCTCCCTTTTGAAGCTTGATGTTAGCAATAACCATTTGGAGGGGAATTTGTTGAAAGAATTTGCTTATCTGAAGAATCTGACCCTTTTGGACCTTGGGAATAACAGATTCTCTGGTGGGTTGACATTGAGCATTCAAGAGATGCATTCTTTGGAGGAAATGGTTTTGTCCAACAATGCAATAGGTGGAGATATCAGGATCCTGAAGTGGGAAAACCTTCATAACTTGGTCAGTTTGGATCTCTCTAACATGGGCTTAAATGGGGAAATTCCTGAGTCTATAATACAATTGAAGAGGTTGAGATTTCTACGCCTCAGTGACAACAACCTCACAGGCAACCTTTCACCAAAACTATCAACTCTTCCTTCTCTCAATGCACTCTATGTTAGTGGTAACAATCTTGCAGGAGAGCTTAAATTCTCTATGGAGTTTTATGGAAAAATGGGAACACGTTTTGGAGCCTGGAACAACCCCAACCTTTGTTGCCCTCTTGGAGCAATTGCAACAAGTAATGTTCCATTTGGGGTAAAACCATGCCAGCAGCAGATCAAATTGGTAGAATCTAACACAAATGGTAGTGATGTTAACAAGACTTTCTATTCAATAGCCTCTTTGTGCCATGCTCCTAATAACTTCTGGTGGACTTTTCCATTCATCATGATTCTCTTCCTAAATTCTTATATAATAGGTCTTTAA

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