Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14489 LG3 48612171 48617097 PREDICTED: two-component response regulator ORR21-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 48612431 synonymous_variant p.Ser567Ser
G/T 48612432 stop_gained p.Ser567*
A/G 48612581 synonymous_variant p.Thr517Thr
A/G 48612727 missense_variant p.Ser469Pro
A/T 48612799 missense_variant p.Ser445Thr
G/T 48613224 missense_variant p.Pro303Gln
G/T 48613531 intron_variant
A/G 48613966 intron_variant
T/A 48614397 intron_variant
T/A 48614643 intron_variant
T/G 48614672 intron_variant
A/G 48614741 intron_variant
A/T 48614742 intron_variant
T/A 48614822 synonymous_variant p.Pro216Pro
A/T 48615706 intron_variant
C/T 48615791 intron_variant
C/T 48615811 intron_variant
A/C 48615833 intron_variant
G/A 48615870 upstream_gene_variant
A/T 48615956 upstream_gene_variant
A/T 48615963 upstream_gene_variant
G/C 48616412 upstream_gene_variant
G/T 48616541 upstream_gene_variant
A/G 48616586 upstream_gene_variant
G/A 48617017 synonymous_variant p.Val27Val
C/G 48617022 missense_variant p.Val26Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14489.1
MAQSRSAAGACKGATAEFPAGLRVLVVDDDATTLRIIEQMSIRCRYRVTTCTEATVALNLLRERKGCFDVVLSDVHMPDMDGYKLLEHVGLEMDLPVIMMSGDSTTSAVMKGIRHGACDYLIKPVREEELRNIWQHVVRKIWNENKEHDNSGSMEDSDWNKRGNDDTEYTSSVADAAEVVKAPKKRSSLKEEDIELESDDPATSKKPRVVWSVELHQQFVSAVNQLGLDKAVPKRILELMNVPGLTRENVASHLQKFRLYLKRLSGVAQQQNGMLNAVPGTIESKLSATGRFDIQALAAAGHIPPETLAALHAELLGRPATNILSTADQATLLQASIGLKHSHAEHAVAYGQPFVKCPSNIGKDFSPSFLTANDMSSGYGAWPSSNNTMGSVRPNNSDERVGTQYNNILMDILDHQQRQQPQQKQQQHQQQKQQQQQPLIHDQSCSINVQPSCLVVPSQSCDTLQAVNGSASVNQNCSFGMNAVIDYSLLSQKSNNSVSASQFSGGDTKARAVLYAHTMPSTCSMSSINGSIQQLQNSTLTFGGARPLPSPLPMSDRQDPYGLKPGDSFDQVCLRNIGFIGKGTCIPNRFVQNEIESSVSDFSQMKVNVDSTGNALKEEPNFISKLMTI*


CDS Sequence:
>Vu_14489.1
ATGGCTCAGTCGCGTTCCGCCGCCGGCGCATGCAAGGGTGCCACGGCGGAGTTCCCGGCGGGGCTAAGGGTTTTGGTCGTCGACGATGACGCCACCACGCTGAGGATTATAGAGCAAATGTCAATTCGATGCCGTTACCGCGTTACCACGTGCACTGAGGCTACTGTGGCTTTGAATCTTCTGCGGGAAAGGAAAGGTTGTTTTGATGTGGTACTGAGTGATGTTCATATGCCAGACATGGATGGCTATAAGCTCCTTGAACATGTTGGGCTGGAAATGGACCTTCCTGTAATTATGATGTCTGGTGATAGTACAACAAGTGCTGTTATGAAGGGAATTAGACATGGGGCTTGTGATTATTTGATTAAGCCTGTACGTGAGGAAGAACTGAGGAATATATGGCAACATGTTGTTAGGAAAATCTGGAATGAAAATAAAGAACATGATAATTCTGGCAGCATGGAAGATAGTGATTGGAATAAACGGGGAAATGATGATACTGAATATACTTCTTCTGTTGCTGATGCAGCAGAAGTAGTTAAAGCACCAAAAAAGAGGAGCAGTTTAAAAGAAGAAGATATTGAATTGGAGAGTGATGATCCAGCCACATCTAAGAAGCCTCGCGTAGTGTGGTCAGTAGAACTGCACCAACAATTTGTCAGTGCTGTGAATCAACTTGGGCTTGATAAGGCTGTGCCAAAGAGAATTCTTGAATTGATGAATGTCCCTGGTTTGACTAGAGAAAATGTTGCCAGTCATTTGCAGAAATTTAGACTTTACTTGAAGCGATTAAGTGGAGTGGCACAGCAACAGAATGGGATGCTAAATGCAGTTCCTGGGACTATAGAATCCAAGCTGAGCGCTACTGGAAGATTTGACATACAAGCTTTGGCTGCTGCTGGCCATATTCCGCCTGAAACACTTGCAGCCCTTCATGCTGAGCTCTTAGGTCGCCCTGCAACTAACATATTGTCTACAGCGGACCAGGCCACATTGCTGCAAGCATCCATTGGGCTAAAACATTCCCATGCTGAACATGCTGTGGCGTATGGTCAGCCTTTTGTAAAGTGTCCTTCCAACATTGGCAAGGATTTTTCTCCCTCTTTCTTAACTGCAAATGACATGTCGTCAGGATATGGTGCATGGCCATCATCTAATAATACAATGGGTTCAGTGAGACCCAATAATAGCGATGAAAGAGTGGGTACTCAGTATAATAACATACTGATGGATATATTAGATCACCAACAAAGGCAGCAACCCCAGCAAAAACAACAGCAGCACCAGCAGCAAAAGCAACAACAACAACAGCCTCTGATACATGATCAGAGTTGTTCAATCAATGTTCAACCATCTTGCTTGGTGGTTCCATCTCAATCCTGTGACACTCTACAGGCAGTAAACGGTTCTGCTTCTGTCAATCAGAATTGCAGTTTTGGCATGAATGCCGTTATTGATTATAGTTTATTGTCACAGAAATCAAATAATTCAGTTAGTGCATCTCAATTTTCCGGTGGGGACACAAAAGCTCGAGCTGTTCTCTATGCTCATACTATGCCCTCCACTTGTTCTATGAGCTCCATTAATGGCAGTATTCAGCAGCTTCAAAACTCTACTTTGACATTTGGTGGTGCAAGACCTTTGCCTAGCCCTTTGCCCATGTCTGATAGACAAGATCCCTATGGTTTGAAACCAGGTGATTCATTTGATCAAGTGTGCCTTAGGAATATTGGGTTTATTGGTAAAGGTACCTGTATTCCAAATAGGTTTGTTCAAAATGAAATTGAATCATCTGTCAGTGATTTTAGTCAAATGAAAGTCAATGTAGATAGCACTGGCAACGCACTGAAGGAGGAGCCAAATTTTATAAGTAAGTTGATGACTATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_14489::LG3:48617097-48619097(-)
TTAGGCTGAATAGATAAGTCCCTTAGTCTCGGGAGTTTGATTTGACATACATGATCGTGTTTAATCTCTTGCTCGGGCCTTGACTGACTTGTATAGTCTGTAGATTGATTGGTCATTCAAGCAAACTCATGTATATGGTTTGGCCATCCGACCGAGTTTGCAAGTGAAAAAGATGAGGTTTGAGTGTTGTCTTTTCTTCTTTTGAGGGGTAGAAAGGGATGAATGTCTTGTTTGTAGGATTTCACCGTTGAGTATAATGCCCGTTGTGAGTAGTAGAAAAGATTTTACTCATAAGTCATGAGGATTAAGGGAGACAGGTCTAAAGTTGCATTGGAGAACCACTCAAACATGTGTCTTTTTTTGTGAACAGATTTTGTACGACAGAGTATGGAAGGACAACACTTGTTTTGACATTGCTTGACTGCGATTATTGTAGGGTGACTTACCTTTGGGAAGACATAAGATCTTAGAGATTGTTTGAGGATAACATGATTTGTTTTGGAAGAAAGGATTAGATTGAAGATTGATTGAATAACATAATATGTTTTTGAATTGGCTTTGGTTGGGTGATAGAATTATAATATTGACTTGATAATTGATTTAATGATATATTGTATTAATGATTTGATGTTTATTCTGGTTGATTACTCGTGTTTATTTGTGTTTCTGTTTTGCACTCATGTTATATGGAAGTAGATAATCTTACAAATGTCGTCGTTGATGAGTAAGGTGGTGAGATTTGGAGAGTGGTTAAAGAATTTTTTATTTTAAACGATTTTTATTTAAATATTATGTAACAATTTTAATTTATTACTTGAAAATTTTAGATTTTTGTTTATATTTTTTATTTAATTGACCTTAAATAAATTAAGATTTTTATTATATTCGTTTTTAAGATGTTATTCTATTTTAAATTTGTGCAAATACCAATGTTTTGTACTTAAATGGTATCCTAGGTTGGAGGAAAGAAGATTTTTAGATAATAAATGTAAATTGATAGTTTATATGAGTGATATATTTTGAAATTTATATAAATAATGTATTTTAAATAAATTTATTGTAGAAATTGCATAAATAATATATTTATATAATTTTGTAGAAATGAATATATCTAAGCATTTAAAGATAAATTTTAAATAAATAGAAGATATAAAGTTTATAAACAAAGAATATACTTCATCGTTTATTTGGAGTCTATAAAGAGGAGGTAGTGTTTGATATTTGGTAAACTGTATGAAGTTTTCGATGATTTCTTTAAGTTTTAAAGAAAAACTTTTTCAGGAAGATATAAAAAAATTTAATATCAACGAGTCATAAACAAATAATATAAGAGATAAGACCAAACAAATCCTCAAATTTTAATGCATAATGAATTAAAATATTAAAAATTCCAAACTAACTTATTCCCACATCATCAAAGAATTTAAAAGTTTAAATTGATTAAAATAAAAAATAGTAGAAATTAGAAAATAACTTTCCTATAGTTATATGTAATTTTTCAATAATAAAATAAATCGAAAAATACATTTTCTCACTGTTCCCAGCAGAAGACAAGAGAGCTTAGAATTGAGGTAGACATGACTACACTTATTTGCAGTGTTGTGCAATAAAACTGGTAGGACATAAATAAAGTGATATGGAACATTTCTTAATTAAATATAATTATTTATTCATTTAATATAATCTTTGGCTATTTAATATCTTTGGCACCGTTATCATTTGCTTCTTCCCCCTTCAATTTTCCATTCCCACCTTTCCTTTTCCCTCCTCACGTTTCTCCAATTCACACGAATGTTCCTTTCTCCATTCACTCGCACCTTAAACTCTCTCTCTTCGTCTCCTTCTCCTTCATTCATCCATTTTTACCTTTAAACCTTTTCTCCTCACTTTCCTTTTCCGCTAGGGTTTCCATTCTTCTCCTATGCTCACTCTCCGCCATTCTGCTGCGCTTCTCCGCCTCTGAACTCTCGCCAAACCACGTCGTTGCTCTCCTCGCTCCC


Gene Sequence:
>Vu_14489(-)
ATGGCTCAGTCGCGTTCCGCCGCCGGCGCATGCAAGGGTGCCACGGCGGAGTTCCCGGCGGGGCTAAGGGTTTTGGTCGTCGACGATGACGCCACCACGCTGAGGATTATAGAGCAAATGTCAATTCGATGCCGTTACCGCGGTTAGTTAGTTAGTTAGTTATTTGCTTTCGACTGAACTTTCATTTTTCGGTTATATTCCTTGTTTTCTCACGAGATTAACTGGTAAGTAAATCACTGGTTCTGTGCTTGAGGCATTGCTTTATATCTTCACCACCGAGCTCGAGGATTGGCGCGAGATGTTCTTAGTTAATCACTGGTTTTGAATTCTGAGATTTTGAAATATATTCAATACTCGGCATATCGATAGCAGTGATCTTACCAGCTGGAAGCAGATATATATCTATGATTATTTATGTAAAAGAAACATTATTTTCTCTTCTAATTGTTCCCTCGAGTGAAATACCTTACTGGTAGGAGTTGGGAAGGCTACTTAATACGGAACTATAACATTGAGGTTCTCTTTCTAATTAACCAGTATTGAGTTGTTCTCTCCTCTTCTACTCAAGTCCTTACAACGTGTGCTTTCATTGAGAGTTGAGTTACGGTTCTCTATAGGCTATATATTATTAAGGTACAAACTGAATACTAAATAGGGTAGTAAAGCCGTCAAAGAGTATCACACTCAATAGAATAACTTACTCGGTGTAATACCTACGACTCGAGGTTCTCTTACCTAATGAATTAGTCTTTTGGGTTGGATTCGCCTCTTGTACTTAAGTCCCAACACCTACTTAGAAGTATTATGATTTATGGAAATTATGCAACGTGGTTTCTGATGTTAACTCACGGAGAAGCTTATTACTTCAAGTACGAAATTGGTGGTATGTTAGAAATTAAGGTTTGTTTTAGGGAACTGAGCTTAGTGCCACTTAAATGATGACAGTTTTTGTTATGTTAGGATCATGGATGACATTGTATCAGGTTTTCGAGACATGCCTAGCTTGGATTTGGTTCGTTTTATTGATTGTACCTATGGGGAGAAGGAACTCCTGGGAAGATTCTTCATATCCTCCACACGCCTCACATGCAAGATTGGATATTTCAAGGGGGGACTATATATTTATGAATGGTTTAATAGTTGCTTGTCAGTGGCGATAAGTTCAACAAATCTTGATACCATCTTAGTATTCTACAAAATTGACTTGTAAGAAAAGATTTGTATTTACTTCTATTTTATAATTTGACCATATCTCGAGTAGATGTGAAATATCCAACAGTTAAATTGAAAGACTGACTCAAATTTTGCCTTTCTGCAAATCCCTACGTTGTTCGACTATCCGATGAAGATTATTGTAAATAAATTGGCATATAGGTTTTGTACTTTATTTTTGGGTGTTATTATTTAGTGTGCTCAACTATGTGTAATGAGTGTGAAGAGGCTTGGTTTTTACCATGGGTTAAGGAGCTCAACAAAATTTTGTTTAAATATAATGGAGAATATTTATTATGCAGTCTACTTACTATGATCTAAATTTCAATTAAAACACAACGGCCTGAAAATCTGCAAATGATTTCAATAGATATTGTAGATCTAGTAAATGTCATGACATGGATTTCTTCTGATTTGCAACTTAGTCTTTATTTGAACTAAGCTTTTCTGTTTACTTGTGTTTTTATCTTCCAGTTACCACGTGCACTGAGGCTACTGTGGCTTTGAATCTTCTGCGGGAAAGGAAAGGTTGTTTTGATGTGGTACTGAGTGATGTTCATATGCCAGACATGGATGGCTATAAGCTCCTTGAACATGTTGGGCTGGAAATGGACCTTCCTGTAATTAGTAAGTGTTGTTCCCCTTGTCCTTAGAATAATAAGTGTCTTAGTAATGCTTAACATTTAGAAATATATTCTGCATTGTGCAGTGATGTCTGGTGATAGTACAACAAGTGCTGTTATGAAGGGAATTAGACATGGGGCTTGTGATTATTTGATTAAGCCTGTACGTGAGGAAGAACTGAGGAATATATGGCAACATGTTGTTAGGAAAATCTGGAATGAAAATAAAGAACATGATAATTCTGGCAGCATGGAAGATAGTGATTGGAATAAACGGGGAAATGATGATACTGAATATACTTCTTCTGTTGCTGATGCAGCAGAAGTAGTTAAAGCACCAAAAAAGAGGAGCAGTTTAAAAGAAGAAGATATTGAATTGGAGAGTGATGATCCAGCCACATCTAAGAAGCCTCGCGTAGTGTGGTCAGTAGAACTGCACCAACAATTTGTCAGTGCTGTGAATCAACTTGGGCTTGATAGTAAGATTCCCCTGCTATATTTTTCTTGCTATTGCTTCTATTTTTTCTTCTCAGTTACTAGACATAATTAGATTACAATAAGTATAATGCATAGATATTTTGCTTTTGTTTATTTAATCATTTATCACACTTTAACTTATAGATTGTTTCTTATCCTTGTTTTAGAGGCTGTGCCAAAGAGAATTCTTGAATTGATGAATGTCCCTGGTTTGACTAGAGAAAATGTTGCCAGTCATTTGCAGGTTAGTTTTTAGTTCAAAATGTGAAGCAATAATTTATCATTTTCCCCCAGAAATGCATAATTAATTTTGAGTAGTTGGATGTGCAGTCGATCTCGTCAGTTACACTGTTTATTTTCTTGGCTGTTTTAATTTTGTTAATTTTTTATTGTGTTATATCTTCTTTGTTAACACGGGGGTTACTTTTTATTTGGTTCAAATGCCAGCATATTATTTTCTTGTCTTGATGTCAATTTCATGTTGTTGCAATTATACCTTCTGAGCAGAAATTACCTTTGTGGTATCTCCTATAAACTTTAACTTCCACTGCTTGATACTCTTATGTGCATGATTAGTCTTTCTTACCACTGATGAGTATGCATCACTAGGGTTAGCTTCAACTAATGTGTACTATGCATTACACAACCGCAAGCTCAAATTTTTGTTATTAGAAAATCAATCGCTCCAAGCACTGATCAAATCAAGGTTTTAACTTATTTTTTTTGCTGTTCCAATTTTGATAGGGGTGGTTGACGAGGTTGCCTGTTGTGGATGAGGTCTTAGTTTTCTTGTTCCTTGAGACAACTTAAAGATGATGCTAAGAACTTTCAACAGTGTTGTCTGTCTTTGTTTTACTGTTGTGAATGAGAATGTGAAGTTACTTAGAAATGAAACATTGAAAATGATTTTAGCTGAGTTGAGAATCTTGATATGGATTATGCAGCACAACAGACTATTTGTTATAAAAAATATATGTTTTGACTTGAATCAATGGAATGAAAGAATGAGTGTATTGATGAATGAGAAAGGGGAGGGAGACCAGGATTGACATGGGTAGGATTGATAGCAATAATTTTGCAACTATGCAGCTTTTTTAGTTTCTCTTTTTTAAAATGACATGTGGTTAGTTGATATCATCGAAAGGTCAAGTATATGTAGAAATGAATCGTAACCATTTTTAAGTGATAAATGCCATTTATTGTAAGTTTACTGGTGTCAGAATTACGAGTTTATGCCCGTCATTTTTTACTAATCTGAAAATATTGCAATAATTGTGCGAGGAATATTGTCTGTTAATATGCAAATATTTGATCTATTTTACTAAGTAAGGAAATATATGTAGAGAGATGCGCTTGGGTGTTGTTGCTCTTAAGTGTAATTAACATTGTCGTTTGAACTACAATATTCATTTACAGAAATTTAGACTTTACTTGAAGCGATTAAGTGGAGTGGCACAGCAACAGAATGGGATGCTAAATGCAGTTCCTGGGACTATAGAATCCAAGCTGAGCGCTACTGGAAGATTTGACATACAAGCTTTGGCTGCTGCTGGCCATATTCCGCCTGAAACACTTGCAGCCCTTCATGCTGAGCTCTTAGGTCGCCCTGCAACTAACATATTGTCTACAGCGGACCAGGCCACATTGCTGCAAGCATCCATTGGGCTAAAACATTCCCATGCTGAACATGCTGTGGCGTATGGTCAGCCTTTTGTAAAGTGTCCTTCCAACATTGGCAAGGATTTTTCTCCCTCTTTCTTAACTGCAAATGACATGTCGTCAGGATATGGTGCATGGCCATCATCTAATAATACAATGGGTTCAGTGAGACCCAATAATAGCGATGAAAGAGTGGGTACTCAGTATAATAACATACTGATGGATATATTAGATCACCAACAAAGGCAGCAACCCCAGCAAAAACAACAGCAGCACCAGCAGCAAAAGCAACAACAACAACAGCCTCTGATACATGATCAGAGTTGTTCAATCAATGTTCAACCATCTTGCTTGGTGGTTCCATCTCAATCCTGTGACACTCTACAGGCAGTAAACGGTTCTGCTTCTGTCAATCAGAATTGCAGTTTTGGCATGAATGCCGTTATTGATTATAGTTTATTGTCACAGAAATCAAATAATTCAGTTAGTGCATCTCAATTTTCCGGTGGGGACACAAAAGCTCGAGCTGTTCTCTATGCTCATACTATGCCCTCCACTTGTTCTATGAGCTCCATTAATGGCAGTATTCAGCAGCTTCAAAACTCTACTTTGACATTTGGTGGTGCAAGACCTTTGCCTAGCCCTTTGCCCATGTCTGATAGACAAGATCCCTATGGTTTGAAACCAGGTGATTCATTTGATCAAGTGTGCCTTAGGAATATTGGGTTTATTGGTAAAGGTACCTGTATTCCAAATAGGTTTGTTCAAAATGAAATTGAATCATCTGTCAGTGATTTTAGTCAAATGAAAGTCAATGTAGATAGCACTGGCAACGCACTGAAGGAGGAGCCAAATTTTATAAGTATGCAAAAAGTGAGTCGCCCAATCGTTGAAAGATATCAATCTTGTGATCATTCAAGTGTGTTTACTGAATAGGTAAGTTGATGACTATTTGA