Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14483 LG3 48562676 48566809 transcription factor bHLH121
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 48562758 missense_variant p.Gly374Glu
A/T 48562876 upstream_gene_variant
A/G 48562892 upstream_gene_variant
G/T 48562998 upstream_gene_variant
C/G 48563009 upstream_gene_variant
T/C 48563412 upstream_gene_variant
G/A 48563452 upstream_gene_variant
C/T 48563615 upstream_gene_variant
T/C 48563619 upstream_gene_variant
C/A 48564439 upstream_gene_variant
T/A 48564948 intron_variant
G/A 48564951 intron_variant
A/T 48564966 intron_variant
T/A 48564978 intron_variant
A/T 48564990 intron_variant
T/C 48564994 intron_variant
T/A 48565009 intron_variant
C/A 48565010 intron_variant
A/G 48565011 intron_variant
G/T 48565013 intron_variant
T/A 48565017 intron_variant
T/C 48565028 intron_variant
G/T 48565029 intron_variant
T/C 48565039 intron_variant
G/C 48565042 intron_variant
A/T 48565077 intron_variant
T/A 48565099 intron_variant
T/A,C 48565122 intron_variant
T/A 48565127 intron_variant
G/T 48565134 intron_variant
T/A 48565168 intron_variant
A/G 48565181 intron_variant
T/A 48565195 intron_variant
A/T 48565200 intron_variant
T/C 48565460 intron_variant
A/T 48565461 intron_variant
T/C 48565487 intron_variant
C/A 48565501 intron_variant
C/T 48565764 intron_variant
T/A 48565801 intron_variant
A/G 48565805 downstream_gene_variant
G/A 48565845 downstream_gene_variant
T/C 48565881 downstream_gene_variant
C/T 48566009 downstream_gene_variant
T/C 48566060 downstream_gene_variant
A/G 48566062 downstream_gene_variant
A/G 48566076 downstream_gene_variant
A/*,T 48566202 downstream_gene_variant
A/C 48566254 downstream_gene_variant
T/A 48566540 synonymous_variant p.Thr90Thr
A/T 48566547 missense_variant p.Leu88His
A/G 48566612 synonymous_variant p.Ala66Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14483.1
MDSSLARGMHTLHAFLSLSKPVFGLDSDCGRGSTNHRPQPRTPKWINQIHHSPPNPNSLQSRRSTASLPPLTVSAAPSFSGLDAAYSLQTFFQSDFVSTLLRKRIEERESKGEGEKEDPSASRKVLKADREKLRRDRLNEHFQELGNTLDPDRPKNDKATILTETVQMLKDLTAEVNRLKTEHKALSEESHELMQEKNELREEKTSLKSDIENLNAQYQQRVRIMFPWTAIDHSVVISPPYSYPLPIPIPPAPISIHPSLQPFPFFGNQNPGPIPSPCSMYVPYSTPTNNPVDPPPVLYASTSHVSNQRESFSKSSGDRRPSSDAERCSESHDVATELELKMPGSSSTQQECTSGGRKGKHSVIRDRTIIGGSSGSASSRYSSSQGLQDSSNSVGDIPKTD*


CDS Sequence:
>Vu_14483.1
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Promoter Sequence:
>Vu_14483::LG3:48566809-48568809(-)
ATAAGAATATTTTTATTGAATATTAGAGAAAGTAGAAATATAAGTACGAGTACACATATTCTTTGATAAAGACAAGAATAAAATACAAATTTCATATTGGTTGAATATTAAAGATGTGTATATAAATTTTTACTTAAGAAATGGGAGTGTAGTCAACCTTTTATTGAATCATTATTATCATAACACTTATTATTGTTTATACTATTATTAGTGAACTATTATTATATTCAATTTCACCATTATGTTATAATAAGTGACACTTTCACATTTATAGGGATGACAATGGATTGGATTAGACACTGATAGTGTCTATCCACTACTTACTCGCTGGATACTTCCATAAAAAAAATTCATAGATTTTTTCAAAGAATAAGTACTCGTTGTTCTCGTTTATTAATAACATTTATTAATCCAACTACAAGAAAAAAAAAATTTACAGCTTGTATGTCTTTGGTTGGAAATCTTCACGACAAAAACTGATATTAGCTCTCAACAAAACAATAATATTTCAATATTTTTTTTTGTGTTGCTATTAATTTCTAGAGAAAATAATGGAATATGTATTCTTTTGAAGATAAAAGAATGAAAGAATTTTAATTTTCTAGGTTCAAATGAGTTTTTATTGTTTAATAAGAAGATTGAACCGTGTTTATATTCATAAAAAAAACCTCGAAGATTAATGATTGTAGTTTTGATTTATAATAGATCCTATGCAAAATTTGTGATTCTCTTTCCCATGGTGAGATGGAGAATATATAGGAATTGTTTTCTCATAAGAATGTGTTTAGTATTTACATTCTATGTGTTGTTATATGCTTAAGACCAAAAGGACTAGGAAGCTTGACATTAGAATCTCGGACACAAACTATCTATCGTATTCACATAGTGATTCAACAAATTTGAGATTTAGTTCGAAACTTTCTCACATGAAAGTGTTTGCAAGTGAGGATAAAGGCCAACAAAAACACCTAATTCTATAGAATCCATAGTCAAAAACAAAAAATAACCATTGAGTTCTTCCTAAAGAAATAAAACGAAAATACCAAAAAATGTTCTTTATCTCAAACTTAATTGATCAAATTTTCTCAACTCCCTTAAATCCATTACATCTTTATTTTTTCATCTAACAATTTCTTAACTTTCATAAATATCTAATAACACAATATTAACACATACACAACACGATGCACAACGACAATAACGAAAGAATAAAAATAACTTAAACCTAAAGAAGGATAAAAATGAAATTTCATTCTTTTAACGAATAATGGATATTTGTAGGTATAAATAATATAATACCCAAACTCAATCCATTAAATAGTAAGTACTAAATTTCTCGCTATTCATGAGTACCTATTATTCACATATATATCAACTATCCATAACCAATTTTATCCACAAATATATCGAATACCAATATTTTTGTTATTCGTACCCACATAGTCATCATTATTTTATTATTATTATCATCATTTATGTTATTAATATCTTTATCTCCACCACTATAATTATCAATCATTAAAATTGTTATCTTATTATATTATCATGACTATTAATATCTTATTAATATCCTACTTTTATAATTTCAAAAGTAATCTATAGCACTCATAATTAAACCTTGTGCCTTATCTTATTTAATTGTGATAAATTTTAAACGTTTTTATTAAAATTAAAGTACAATTTAAAATGAGAAAAGTATAACATAACATTTCAATTTCTAAAATTAGGAAAGTACTAAAGATTTTAAGTTATAATTTTAATTAATATGTTAGAAGACAATAAAAAATTTAAATTATTTATTTTCTACACATACTAAAATCATCGTGATTTTAAAAAAGAGAAGAGTAAAATTCAATATTAAATATAAAGCAAGCATGCACAAATATATGCCTCGAATGTCAACTCCCATGGGATCACACGTGTGAAGCACTGGGTCCTAATCCAGGGGCAGGTGTCCCGAAAACGACGTCCTTGAAAACAAACAACGAAATTCGACATAT


Gene Sequence:
>Vu_14483(-)
ATGGATTCCTCGCTGGCTCGTGGAATGCACACGCTTCATGCGTTTCTCTCTCTTTCAAAACCGGTTTTTGGATTAGATTCAGATTGTGGCCGTGGCAGCACAAACCACCGACCTCAACCACGCACACCAAAATGGATCAACCAAATCCACCACTCTCCTCCAAACCCAAACTCGCTTCAGAGTCGCCGCTCCACCGCTTCACTCCCACCTCTAACCGTTTCCGCAGCTCCCAGCTTCTCAGGTTTGGATGCTGCTTACTCACTTCAAACATTTTTCCAATCAGATTTTGTGTCAACACTTCTACGGAAGAGAATTGAGTAGATTAAAATTGTAGGCTGAAAGTCAAATTTTAGAACAAGGAAGAGTTTTCAGAAATAAATTTATGAACCATAGTGTTGTGCTCTGTGTAGGGAGAGAGAAAGCAAGGGTGAAGGGGAAAAGGAGGATCCGAGTGCCTCACGGAAGGTTCTGAAAGCTGACCGCGAGAAACTCCGTAGGGATCGACTCAACGAACACTTCCAAGAGTTGGGAAACACGTTAGGTTCGTTGGTTCATTCAACACTTTCTTTCTTTATTTTACAATTTCATTTTTTTAGTTTTACTTTTTTAAAAAAAAATAAAAATTGTTGTCGTTGTTGTATAAGTGTTGAGGTATCGGATGCCAAGTTTAGAACTAATTTTATTTCCGAAGAACCTTTCATCGATTGGTTTAGGATCCCTTTGAAAAGATTCTTAGTTCTTCTCAGTTTAGAAAATTTTTAAGTTAGTCTTAGTTTAAGGTGACTTCTAGTTTTAAAAATGTTATTTTAAATTTTAATTTAAAATAAATTGGTTTACAATTTTCTATTCTATTAAAATTAGTTTAAAGAAATGTTGATTGTGATGGTGTGGACAAGAGGATAGTGTTAGTCGTAGAAATGGTAACGGGAATAACGGTGTAGTGATAACGATAGTAATGGTAGTGCCTGAGTTGGCAGTGGTGGTACCAGTAGAGGTAATGGAAGTGTCAGTGGTTGGTGGTAATGACAACAACAATGAGTATAGTGCCAATGACAGTGACAGTACTGGTGACAAAAATGTGACGGTGAAGGTAGTAGCAGTGTGAATGATATTGGTTGTTGTAGCAGTGATGGTAGCAATGACCATGGTGGTGGAGACGTAGTGGTGGTTGTGGCTGTGTTGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGTAACGTGGACAACGTTGAGAAGTGTCATTGCCAAAGGTATCAAGAGTGTGCATTTTAATACTAAAAGACAAATTCAGGTAGTGATTTTTTCTTAATTTGAAAATAAAGGTAAAAGTGTTTCAAAATTGAGTTGAGAATCATTTCAACTAAATTTTTTGCCGAACACGTTTTGATTTGAAAACTAAATTTAAAGAACTATACAACCACCTTGAACAAATCATTAGTAATTTATTCTCTCTCTATTTATATTTTTTTGGATTTAATTTAATTCGTTCAACTTTTACAAGAAGGTTTGAAGTAATTTCTCTTATCATTTTCCTCACTTTTTCGTCTACCAAACCATGAAAAGAAAATTTATCCGTGAGTTTTTTCCTTCTTTATATTCTCTTTCCTCTCACTTCCATCTCTTCCAAACATAGCATTAAGGTAACTATTATTGAAGTCAATAAATACCTTGCATAGTGGTTTGTGCTCCGTTGACATGTTAAACGATTTTATAATTGGTGCATAGTCTATTTTAACTCAGTACCCTCTCCTCTTATTGGCTGGGGATGTACACAGCAGTCCAAACAACGTATACAAAGCGTCGATAGATCATGATATCACCTGGCTAGATTATTGTTGAATAAAAATGAATAAAAGTATTTTGCATTGTTTCCAACCATATACGGTAAGAATGTTAATTCTGTAATAACTATAAAAAATCATATCCACGGTGATTTTAATTATTTGACAGTGTAAACAAAAATTATCCTGACGGTGGGCAGAAATTAAATGACAAAAGTTGAGCGAATAATGAATAAAAGCATGTCAATTAGACTGGTGTTTGGTGGATAATGTACACAACTCTCCTTTACTCGTAATCTTTGCTATAAGAAACTACTGATATAGTTGATTCTGTGGTGATTTCTGAAACAAGAACCTTCTTTGAGTTTCGATCTCGTTCTGTAAATGGCTAGTGCAAGCAGGTAGTCCTTATATAACTTTTACCTGTTGTACCTGGGGTGTTACAATTTTTCTGGTTGTTATAGGGAAATCTTAGTATGTTAATATGACTTTGAGGCCTCTAAGATTCGGAGGTGCTTTTTCCAGAACTTTAATCTAGTCTTGTATAGATATCTTTAGTAAGGATATATATGTCATATCCAGTGCAAGTTTTTATGTCTATTGCAACATATATTACCAATTTGATGTAGCATTTATAACATTACATTACTGATATATTTATGCTTTTTGAACTCAACACAGATCCGGATAGACCCAAGAATGACAAGGCAACTATCCTTACTGAAACCGTCCAAATGCTAAAGGACTTAACTGCTGAAGTTAATAGGCTTAAAACTGAACATAAAGCACTTTCTGAAGAGTCACACGAAGTAAGGTTCTTGTTTAAATTTTTATCACAAGTTTACAGCTCCAATCTTCTGCTTATTTCTTCTGTCAATTTTGTGATTTGCAGCTAATGCAGGAAAAAAATGAACTCAGAGAAGAGAAGACCTCTCTTAAATCTGATATAGAAAATCTCAATGCCCAGTATCAGCAGAGAGTGAGAATCATGTTCCCATGGACTGCAATTGACCATTCGGTTGTCATTAGTCCACCTTACTCTTATCCACTTCCTATACCTATCCCTCCTGCTCCAATTTCCATCCACCCATCTCTTCAACCTTTTCCTTTCTTTGGAAATCAAAACCCTGGTCCCATTCCTAGTCCTTGTTCAATGTATGTCCCATATTCTACTCCAACTAACAACCCAGTTGATCCACCACCTGTGCTTTATGCTTCCACATCCCATGTGTCGAACCAAAGAGAATCTTTTAGCAAGTCATCGGGTGATAGAAGGCCTAGTAGTGATGCTGAACGATGTAGCGAGTCTCACGATGTGGCCACAGAACTTGAACTTAAGATGCCTGGATCATCATCTACACAACAAGTAGGTTACAAAATTTCTGGATTAATGTTTTTCGTTAAACCTATAATTTATGCTTCACATGTTGATAATTCTTAATTTTTGGTCCCCACACGTAAAGATTTGGTCCTTATAGGTGTAAAACTTAGGTGATTTGGTTCCTGTCACTGTTAATCCTCTTACGCATTCTTAATTTGATCCTTCTACCTCTACGTGTAGTACATTCTTAGTTCCGTTGTAAGGAACTCAAGTAGGAATGTGTTGTATGTAGTGAGATCAAATTAAAAATGTGTTGCACGTAGTGAGATCAAATTAAAAATGTCACACGAAGTGAGATCAAATTAAAAGTGCGTTGCACATATTGAGATCAAAGTAAAATTGTGTTGCGCTTGTAAAAGGACGAAGTGATAGATGTTAGAGCTAACAGTCAACATACTTCGGCAGAAACTGAATAGACAAGATCTGCAGGTATAAGAATTGATTTAAAAATATTTTGTGTATGAGGACCAAATTGTGGACCTGCTACACGTATAGGAACTAAAATTTATATTTAACGTATATTATCAGTATCACATTTGGTCCCAACAAAAGGTTCATCTCTATATGGTCTTTTTGTTTTTGAAAATCTGTTAGGTGTAGTTGCTATCCTTCACCAAAGTAATCTCCTTTTGGTTTCGTGTCTGGAAATACGAATCAACTTACACATTTTCATCAAACATGAGACTAAAAGGAGATTATATCTTTAGGGGTTATTGATTAAAAGTAAACACTGTCCTGTTTGCATTGATTAAAAACACTAAAACCTAGTCTTGAAAACTAAAAGTTGTCTCAATGCTCAAACTAACAGCACTATTTTCAATTTCTGAAGGAGTGCACTTCTGGAGGAAGGAAGGGCAAGCATTCAGTGATAAGAGATAGAACCATCATAGGTGGGAGTTCTGGGAGTGCTTCAAGCCGTTATTCTTCTTCTCAAGGACTTCAAGATAGCTCCAACAGTGTGGGTGACATTCCAAAGACTGATTGA