Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14448 LG3 48222957 48232955 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 48226568 intron_variant
G/T 48226580 intron_variant
G/C 48228816 intron_variant
C/T 48228853 intron_variant
A/G 48228924 intron_variant
G/T 48228933 intron_variant
A/T 48228946 intron_variant
A/G 48228947 intron_variant
T/C 48229106 intron_variant
A/G 48229124 intron_variant
C/T 48229145 intron_variant
C/A 48229243 intron_variant
G/A 48229355 intron_variant
C/T 48229406 intron_variant
A/G 48229477 intron_variant
T/C 48229603 intron_variant
T/C 48229622 intron_variant
G/A 48229650 intron_variant
T/C 48229651 intron_variant
C/T 48229670 intron_variant
C/G 48229672 intron_variant
C/T 48229674 intron_variant
A/G 48229853 intron_variant
T/A 48229995 intron_variant
A/G 48230030 intron_variant
T/A 48230111 intron_variant
T/A 48230191 intron_variant
T/A 48230240 intron_variant
T/A 48230246 intron_variant
T/A 48230561 missense_variant p.Lys119Met
T/A 48230810 missense_variant p.Glu36Val
A/C 48230930 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 48231184 5_prime_UTR_variant
A/T 48231432 upstream_gene_variant
T/C 48231536 upstream_gene_variant
C/A 48231651 upstream_gene_variant
T/C 48231693 upstream_gene_variant
A/T 48231695 upstream_gene_variant
G/C 48231714 upstream_gene_variant
C/A 48232217 upstream_gene_variant
A/G 48232340 upstream_gene_variant
G/A 48232356 upstream_gene_variant
A/G 48232357 upstream_gene_variant
A/C 48232724 upstream_gene_variant
A/T 48232729 upstream_gene_variant
C/T 48232953 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14448.1
MTVDEVDSSSEWSREQDKAFENALATHPENASDRWEKIAADVPGKTIEEIKQHYELLVEDVSQIESGCVPLPSYNSSSEGSTSHASDEGAGKKGSGLGNFNSESNHGTKASRSDQERRKGIAWTEDEHRLFLLGLDKYGKGDWRSISRNFVVTRTPTQVASHAQKYFIRLNSMNKDRRRSSIHDITSVNNGDVLAPQGPITGQTNGAATNSTAKATKQATPASTGVPGVGIYAAPTIGQPVGGPLVSAVGTPVNLPSPAHMAYGVRAPVTGAVVPGAPVTVSPVTYPMPHTSAPHR*


CDS Sequence:
>Vu_14448.1
ATGACTGTGGATGAAGTGGATAGTAGCTCTGAGTGGAGCAGAGAGCAGGATAAGGCATTTGAAAATGCGTTGGCAACTCATCCGGAGAATGCTTCAGATCGATGGGAGAAGATCGCAGCTGACGTGCCGGGGAAGACTATAGAGGAAATCAAACAGCATTATGAACTCTTGGTTGAAGATGTTAGCCAGATTGAATCTGGTTGTGTGCCTTTACCATCTTATAATTCTTCTTCAGAAGGCTCAACAAGCCATGCTAGTGATGAAGGAGCTGGCAAAAAGGGCAGCGGTCTTGGGAATTTTAACAGTGAGTCCAATCATGGAACTAAGGCTTCAAGATCAGATCAAGAAAGACGGAAGGGGATTGCTTGGACGGAGGATGAACACAGGTTGTTTCTTCTGGGCTTGGACAAGTATGGGAAAGGTGATTGGCGAAGCATATCAAGAAACTTTGTGGTGACAAGAACACCTACACAAGTTGCCAGCCATGCCCAAAAGTACTTTATTCGATTAAACTCCATGAACAAAGATAGAAGGCGATCCAGCATACACGATATCACCAGCGTTAACAACGGTGACGTTTTAGCTCCACAAGGACCAATCACCGGTCAGACGAATGGTGCTGCCACCAATTCTACTGCCAAAGCAACCAAACAAGCCACCCCGGCCTCAACCGGAGTGCCAGGAGTTGGAATATATGCTGCTCCTACCATTGGACAACCTGTAGGAGGACCCTTAGTATCTGCAGTTGGCACTCCAGTGAACCTTCCTTCACCTGCACACATGGCATACGGTGTCAGGGCTCCGGTTACCGGTGCAGTTGTACCTGGTGCACCGGTAACTGTGAGTCCTGTCACGTACCCTATGCCACATACATCTGCTCCTCACAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_14448::LG3:48232955-48234955(-)
ACATAATTTACTTAAAATATAATTATAATTAAAATATAATTACTTAACTTTAAAAGTATCTAAAAATTAATTTACAAATCAATAAATTAATAAACTAAAAAGTAAAAAATAAATAAAAGAATACATTCAGCTTTCCATGATTTCTTTTATTTTTATTTTTTACAAACACTTCATTTATAAATAAATAATTCTACAGAAAATATTAAATTAAAATAAATGTACAAAAATTAACAACCTAAATAAAATTAAATTAATAACCTAAAAAAAATGAATCGCTAAGGCCTCAACCAATATGGGAGATCAATTGGACTTTCAACGGAGGAAAACACCTAAAACATTGAAGGACTTCAACGGATATGAGACATCCTTTGAGTCTTCAACATTGATCTCGAGATCCATATCAAGATTCGTTGAAGGCTCAACTGATGTTTCATATCCGTTGTAGCCTTTTTCTCTTCTTTGCTTAACATAGAAGAGAGACACGTATAGAATCACTAACCTAGATCGAAGACAACAACAAAGGAAGCACCAAACTCTACAACACCGTGAACCCATCATGAATTAAGCAACAACACAAACCTACCACCAACCAAGCACTAACATAAACCAAGCAAAGGAGAAGAGAACCTTGGCAGAAATGATAGAAATGATAAACTGGGGAAAGAGGAAGATAAGAAATGGGGGAAAGAGAGAGAGGAGAATAAGAGAGAAAATAAGAGTGTGAGGTTGGAGAAGTGGTCTCCGGATGAGTGAATAAGAAAGTAAAAAATTAGAGTTTTAAAAAAAAGTTAAAAAAGATAAAAGACAAAAATAAATAAAGGTATTTTTAAAATTAAAAATATTTAAAAAGTGTAGAGAAAAGTTTTTATAGGTGAATCTCTCTTTTCTAAATAATAAAGAGGTTTTTTCTAGACACAAAAACCATCAAAACCCCTGTTACAAGATCTTGCTTCTTATCCAAGTCCACCCTGAAAATCTCATATAAAAAGATATGATATTTCTAATTTTTATAATAGTTTTTTTGAAATCAATAATTACCATAATTTTAGTTAGTTGATAATTTAAAAAAACTTTTGTCGAATACAATAATTTTATTTGTTCTAAAAGTAAATAATACTTTAAGGAAACTAAAGTAAAACATTTGAAAATTGAAAATAAATATAAAAATATTTTAGTTTTTGAAAATGTTGTCAAATTTTTCGTTTGATCTTGAACTTCTTTTTATATATTTCTATCATTATTTTGTTTCCGTCACATTTCACCATGAAACTTACATGATAAAGCAATTTTAAGAACTAAAAACCAAATAAAAAATTAGTAAAGACTAATAAAAACCCAACACTATTTGAAGAACTAATACCATTTAAGGATGAAATGTTATAAGAGAAAAGCTTAAGTCTAGAATATAGTTTTAGCTATTGGAATTTTATTTTTTTTCCAATAAATTTTGGAAAATAATACTTTAATACTCTTGAAAAAAAAAAATCTCCTACTTTACAACCTACTTTAATAATATAATAATGTATATTAAAATTTTAAATTAATAAATAAAACAAATATAATTAAAATATTATTATTTAGGGTTGTGAAGTGGATTTTTTGGTTTGAAGGTGTCAAAATAACACCATTCTAGATTCATTCTTTACTTTTGAAAGTTATTGAAATATTTATAAATTTAATTTCTTAAAATAATATTTTCCTTAATTTTTGAGTTTTTTATTAATAGATATGTTTTTAGATATATTACGTGAATATATATAATGTAATGGTAGAGAACAGATAAAAACAAATAAATATTTAAGATGAAACTTGAAGAAAAATATTATTAAAGATAAAGAAAATTTGTAAAAGCTTTAGGAACCTAAATTAAAAATGTATTGATTCAAATTATTTGAAAATATTGAATGTAATTTTGAAGCAGGGAACAAAATAAGAGGCGGAGAGGGACATGTCAGTTGTACAGTGCAGTATATATGCCGCGACAACATTATTTGACTCAT


Gene Sequence:
>Vu_14448(-)
GTGGCTGTGTGTTACAGTCCCTCAGAACTGAAAGAGCCAGCAGCTGAAAAGATTGAAGCATTGCACAACGAAGAAAAAGGTGATGACTTCATTATTTCACGATTGCGCACAAATCATCACATCCCTCATCACAACTTTGAACCATTCCTGCTGTTACCTCTCCATTTCATCTGGGCACACCCGTATCATCATTTTTAATTTTATTTTTCATTTGGGTCGGATCAATTTATGTAAAAGTTGAATCTTTATTCACTTTTTTCTTATTTTTGTATTTTGCCCCTCTTTCTCTCTCCAGAACTTTGGCTTTTGAGTTTCTCTCTCTTGACGTTGTATTATTTGTCAGATATTAATGGGCACTGCAGATTCCTGTGGTTTGCAACTTGGGTTGTGGCTTTTTCAACCCCAGCTGTCCTATTTGTAGCAAAGCAGTTGTTGGGATGGGGCCAAATTGACCCATCCTGCACCTGTGTGTGGGTTTTCAAGACAACCATCAATGTCATTTATGATTTGGGTGTGAGTTCTACCCTTGAAATTTTCACCACATGCTAGGGTTTTTACTTAAACCTGAATTTATCATCTGTTAGTGTGTGTTCCCCCTTCTTTTTACTGTTTAGGTTGTTTTTATCTGTCTTTTATCACATTGATTGTGAGTTTTATTTTAATCAGGCTGAAATTAAGTTAGTTTCAAGTGCAGTTTTATGAAACGTTTTCTATGTTTTTTGGAGAAAGAATTGGTGGGGGAATTTCTCTTTTACCATCACACTCAGAATTAGGTTTTACTTGGCAGTGAATGTAATATGTTAGGTGGCGTTAAAGAAATCTTTTTATTATTGGTTGGTTAACGTGTCAGAAGCTTGACAGTGCGTGTGACTTTGTGCATCCATCTTTTTGTTTTGTTTTTTCTTCTCTTGTGTTTTTTTATGACACTGCATCCATTGTTTTAAAGTGGAGATTAGTTGTTAGTTCATTGAACTCTTATAATACCCTTTTCATACACCTACTGAATGGATTCTACAGTGGAGAGTAATTCATTGGATGTTAATGGGATTGGTTTTCTTGCTCTTGTTAAGTTGTTGGATCAAAACTGTTGAGATTAAGAAAATTTATTGGATTTTGTATTTGAGTGCAAGGTGGTTTTATTAACTTCCAATCTAGGAAAAAGACTTCGAACCAAATTGATGATCAGTGTGTATATCCTTTCACCCTTTTTAACTTTTTTTTGAGATTTTAACCCTACATGTCTCACTTATTCTGAGACCTTGATGCCTAGTTAGTTACTACGAATTACTATCTGCAACATAGCCGGGTTCAGAAAACAAAATATGATGCTGAGTGTGTTCAGTGAAAATGAGCTTTACAGTAAAACTATACTTATGGGTGAAAGTTTTGTGGACCTGTGCTGTTAAAACAGTTGTTATCAGTAGGGCTGTGGTAAATTGAAGTTTGGTTTTTTATTGAATGTCCTTTACTTTCCCTTGTAGTCTTATCTATTCTTCCTTCTTTGTTTGTTTCTGAAAGGTCTTTTTCTCAATCTGAAATCCTAGCTGGTAATTACCTTGGTTTCATTGACTAGCCTTCACATTAATTTTGTAAATTTCACTTCTCTTAATATGTCATGTATTGCACCTATGATTTTATTGTTGTCAGACTGAGATATTTTTCATGTCCTAACTGAACCTTTTTTGCCCTTTCATTCATCAACAGGGTCAGAAATACACAAGTGTCCGGTTCTCCGAATTTTGAAGCAATTCACCTTTGAAATTTCACACACCTCATATGATTTTTTGGATTCCGCTGGTATTGGGCTTATTTCAGCTTCCTGCCATTTTCTGCACATCAGGCTGCTTCTTGTAGTCCAACATATCTGCTCCCTACGTTTATAACATGCCGTCAAGGTTAATATTTGTGGTACTGACCGTAGAACAGAGCAGAGTTTGTGGTTAATAAGAAGGCCTTAACCAAGATTTAGAGCAATTAGGTAGGTAGAAACCTTTCTTCTCCTTCGAATCAAACTCAGTATTTGCTTCAAACAAGACTAGATGACTGTGGATGAAGTGGATAGTAGCTCTGAGTGGAGCAGAGAGCAGGATAAGGCATTTGAAAATGCGTTGGCAACTCATCCGGAGAATGCTTCAGATCGATGGGAGAAGATCGCAGCTGACGTGCCGGGGAAGACTATAGAGGAAATCAAACAGCATTATGAACTCTTGGTTGAAGATGTTAGCCAGATTGAATCTGGTTGTGTGCCTTTACCATCTTATAATTCTTCTTCAGAAGGCTCAACAAGCCATGCTAGTGATGAAGGAGCTGGCAAAAAGGGCAGCGGTCTTGGGAATTTTAACAGTGAGTCCAATCATGGAACTAAGGCTTCAAGATCAGATCAAGAAAGACGGAAGGGGATTGCTTGGACGGAGGATGAACACAGGCAAGTTCATTATTGCTTATGTATTTTTTGGAAAATCCTACATGCTGCTAATGCTAGTATAGGTTACATTTAAATGTTTATTGTTTTCATCTTAAGTTTATGATCTTTATACACATGCTTTTGTTGTTAGTTCAAGTTTTATCTTGTTGTGGGCACTGTATAGAATCGAATTCAATCTGAACATTAAGATATATTTTGGTCAGTGTGTTTATGCTCCTAAATGATTTTGTTTGCAGCCGTTTGCAAATCTCATTTTTTTCTTTTAAATTTTTAGGTACCGACTAACTAATAATTTCTTACAAAATTTCAAGAAGTACTTCGTAAAATGATTGTTTTAGGAGAGGGTGATAGGAAGCAGAGGGGAATCTCTCTGTTGAACTGAGTTTCAAGATCTTAAAACATAGGACTGTAAGATCTCAACGAAAATGTAAAATTATACTAATATATACACAGATAAAATAGAACAAAAAATGGGAAGCGTACCAGATTTTTACCCAGTATACTCAAACACTAAACCAACCCCAAAGACGGGGGGAAGATGTGCCAAGATGTGCAGGGAATCATCCAGATAGCAATATAGAGGGTCCAAGAGATGGGGCAGGATGGCAAGCAAAACAGATGGTGTGGATCAAGATGTCATCTTCTGTCACCTGCAAAATGCTCCGATGAAATGTGGGTCTGTTTTGGGAAGAAAAACTTAGGGCCCAAAATTGGGGTTTAAAAACCCTGGTTTATATGGACGAGTTGTGCAACCTACAACACAAAATTCTTCAACTTCAGGATTGACACTAGCACAATCTTGCAATTTCACTATGATTTTGCCCATTGGTGATTTCAGGTGCAATTCAGACTGGGAGAGGGCTGCAGGATCTTAAGATCACGGGGATACAGTTAATGATCTAGTTTGCAATGTTACCAGCATTGGTTACTTCCATCTATTGGTCTCTTGTTGTTAATATCTATAATTATAAAATACACTAGTTTGCTGGAATACTTTCATGACATCTCATTTTCCATAGGATGCTGGACATAGTTTTGAATGACAATTTAGAGTAAATATGCCTCATAAATGCATTTGCTCTGTTGTGTTCATTGTGTTATCAAAGCCGCTAGTTGGCCTTTCAGTTTCCAATTTTCTTTTCCAAATCTACACTTTCCTTTACCAGGATAGAGAACCTAAACTGTATTTCAAATGAGCGTTTAGTTATTGTAATCTTCAGTGCCACATTTTAGATGGCTTAAATCTATAGAAGTACAAACTTATTATTTGATTTAAGAGTGTTTTATGTAAGTAGATCTTTTCTGACATAATGATTTATGTCATTTGGTTCTTATTTCTTGCTTGAGATACTGTGCTTCAATTCTGCGGTTATCTTCATTGGATGGCATAAATCATCTTTGTGTCATGTCAATTTGTTGTGTTCATAACAGTTTGTTTGTCGTTTTCCTTGATCAAGGCTTCAAGGAATTTCAGTTTCATCTAACTCTAGCAAATACAATTCTAGGAAGAAGATTACACATTAGACCTTTTGTGGAGATGCTTCTACAATCTTCTCTTTAATAGTTGTGATCTAGATTGAAGGTTAATCTTTTGTTCCCATTAGCATTCTTTCCTCCTGCCTTTTTCTAGCAACGTCTTCTTGCCGCATTCTGTCTCTGTTTGCAGCCGACATTATGGCCATCTTGGTTCTTTTTCCAACCCTTTTCTATAGCACTCATTATTTATTTATATGTTTTCCTAAGACAACCTTTCCTTGTTAATTATGAATATATAATGAATTTTGAGTATTTTTTTTCCTCTGGCATTTATATTTATGTAGTATAAATTATATAAACATTAGAATATATCACTTTAATTGCCATCGTGCTGTGTTGCTATTTGATATTGATAACTATGCTATATGGTAAGTACGTAACTTGGTTTTGAAATCATCTGAAAACTTCGATGCAGTTCCTTGTAATAAAAGCCTCAATGAGAAAAGGAAAATCCATGGCCATGTACTGTGTCTTCATGCACTTATTTTTTACCTAATTTTAGTCACGTGTATTGAGTCACTAAGTTAAAGATGTTTTCAGGGTTTTAGTTTGGTTTAAGGTGCTGATTCTTTAGGAATTGACTTCCTATCAGGAGAGTCTGAGAGGGTGTATTACACAGCTGTACGGCATTGTAACCCTTAAGGGATACTTCTTTGTAGAAAGTGGTAGAAATTTGTCAGTTCTGGAGACAAAATAGAGGATGATAGGCACTGTTGAAGGAAAAAAAATTGTAATTTCGGAACATGGGAGTGGATTAGGTCACCTTGACCTGTTAAGTATGATGCACATTGGGTGAGATTTGGTGATTAGGGTTAAGATCTATCTGGATGTGGATTAATGCCTAAGTTAGCTGTACAGCACTATCTTGTTAGGTGAAGTTTGCATTCACTTGTATACCATGATTCACATCTAATATATGATCTTCATGCTACCCCCTTTAATGTGGGACTAAATGCTTGTAAACGGTGGAACACCAGTCCAATAGCATGTGACAGGATAAGCTCAATAAATCTTTTATGATAGACTCTAATACTAACTT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