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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14391 LG3 47745963 47751889 PREDICTED: squamosa promoter-binding-like protein 14
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, positive regulation of transcription, DNA-templated, positive regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, positive regulation of transcription, DNA-templated, positive regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, DNA-binding transcription factor activity, DNA binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14391.1
MEKVAAPPILMQRKRDLSYGVVAGSPSESWKWEWDSVRFAGKPPSDDVVFEEESVAAVAPLQLNLAGRVSGGGNKRVRSGSPGTATYPMCQVDNCREDLSKAKDYHRRHKVCEAHSKASKALLSNQMQRFCQQCSRFHPLSEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTQPEDVTSATQAPAAAVAAAANLEIFNLLTAIAGASQGKFEERSQVPDREQLVQILNRIPLPADLATKLRDAGNVNGKKDHVQSETPSSYHHHDQLNHTPAAPLTMDLLGVLSTSLSGSGPDANASPSQNRSCSSDGGSVKSRSSADQTRQQHFFSVGGERSSSSSQSPVEDSDCQEDVRVNLPLQLFSSSPEEDSLPKLASSRKYFSSDSSNPAEERSPSSSPPSPPVVEMQFDLQGGATGLKPESISSGRGVNSNKETSQSHSCNISLDLFKGSNKRIQQPSWLQSVPFQAGYTSSGSDHSPPSLNSDAQDRTGRIMFKLFDKHPSHFPETLRAQIYSWLSNRPSDMESYIRPGCVVLSLYASMSCAAWEKLEENFLQHVHSLIQNSDSDFWRSGRFLVHSGSQLASHKDGKVRICKPWRTWKSPELISVSPLAIVSGQETSISLKGRNLSTPGTKIHCTGTGSYSSAEVIRSSYPGVVYDNIKLSGFKVQDVSPGVVGRLFIEIENGFKGNSFPVIIANETICEELRPLESEFNEEEKICDAISEEHEHHFGRPRSREEALHFLNELGWLFQRERFSYMHEVPCYSLDRFKFVLTFAVERNCCMVVKTLLDVLVDKHLQGESLSTGSVEMLNAIQLLNRAVKRKNIGMVDLLIHYSLPNKNSTSRKYVFPPNLEGPAGITPLHLAACTSGSEGVVDFLTSDPQEIGLKCWESLVDANGQTPHAYAMMRNNNSYNVLVARKLADRRRAEISVTIENEIEQASLRVELNQKQSNLLKRGQSSCAKCVSAEIRYNRRFSGSHGLIHRPFIYSMLAVAAVCVCVCVFFRGRPFVGSVAPFSWETLDFGTM*


CDS Sequence:
>Vu_14391.1
ATGGAAAAGGTGGCGGCGCCTCCGATTCTGATGCAGCGAAAGCGCGATCTGTCGTACGGCGTCGTTGCGGGGAGTCCGAGCGAGAGCTGGAAGTGGGAGTGGGACAGCGTGCGGTTCGCGGGGAAGCCTCCGAGCGACGACGTCGTGTTCGAGGAGGAGAGCGTCGCGGCGGTGGCTCCTCTGCAGCTCAACCTCGCGGGGAGGGTGAGCGGCGGTGGTAACAAGAGAGTGCGCTCGGGGTCTCCCGGAACGGCGACGTATCCGATGTGTCAGGTGGATAACTGCAGGGAGGATCTGTCGAAGGCGAAGGACTATCACAGGAGGCACAAGGTGTGCGAGGCGCATAGCAAAGCCTCCAAGGCGCTTCTTAGCAACCAAATGCAAAGGTTTTGTCAGCAGTGTAGTAGGTTTCACCCGCTGTCCGAGTTTGATGAGGGGAAACGGAGTTGCCGCCGTAGACTCGCTGGACACAACCGCCGCCGGAGGAAAACGCAGCCGGAGGATGTTACTTCCGCCACGCAGGCCCCCGCCGCCGCCGTCGCAGCAGCAGCAAATTTGGAAATCTTCAACTTGTTGACTGCAATAGCGGGAGCTTCGCAGGGAAAATTTGAAGAAAGATCACAAGTTCCGGATAGAGAGCAGCTTGTGCAGATTCTCAACAGGATACCTTTGCCTGCGGATCTTGCAACCAAGTTGCGGGATGCTGGTAATGTCAACGGGAAAAAGGATCATGTACAATCGGAGACACCATCCTCCTATCACCATCATGATCAACTGAACCACACCCCAGCTGCCCCATTAACTATGGACTTACTTGGTGTTCTTTCCACGAGTCTGTCTGGGTCTGGCCCTGATGCCAATGCGTCCCCCTCTCAAAATCGTAGCTGCAGCAGTGATGGCGGTAGTGTTAAATCTAGGAGTAGTGCTGATCAGACGAGACAACAGCACTTCTTTTCAGTTGGCGGAGAAAGAAGCAGTAGCAGTTCCCAGTCTCCAGTTGAAGATTCAGACTGCCAGGAGGATGTTAGAGTTAATTTGCCGCTGCAACTCTTTAGCTCCTCCCCAGAAGAGGACAGCTTGCCTAAACTTGCATCTTCAAGAAAGTATTTCTCGTCTGACAGTAGTAACCCTGCAGAAGAGAGGTCACCATCGTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTGTTGTGGAGATGCAGTTTGATTTGCAGGGTGGTGCTACAGGTCTAAAGCCGGAGAGCATCTCTTCTGGAAGAGGAGTTAATTCAAACAAGGAAACTAGCCAAAGTCATAGTTGTAATATCTCTCTCGATCTATTTAAAGGGTCAAATAAAAGGATCCAACAACCTAGTTGGCTTCAAAGTGTTCCATTTCAAGCTGGGTATACATCTTCGGGCTCTGATCATTCACCTCCCAGTTTGAATTCAGATGCTCAGGATCGCACTGGTAGAATAATGTTTAAACTATTTGACAAGCATCCAAGCCATTTCCCAGAAACATTGCGAGCACAGATTTACAGTTGGCTTTCTAATAGGCCATCCGACATGGAGAGCTACATACGGCCTGGTTGTGTGGTCCTATCACTTTATGCTTCAATGTCTTGTGCTGCCTGGGAGAAACTAGAGGAAAACTTCCTCCAACATGTTCATTCTTTAATTCAAAATTCAGATTCTGACTTTTGGAGAAGTGGAAGGTTTCTAGTACATTCTGGCAGTCAATTGGCTTCACACAAAGATGGGAAGGTACGCATATGCAAACCATGGAGAACGTGGAAGTCGCCAGAGTTGATATCTGTGTCCCCTTTGGCAATTGTTAGTGGACAGGAAACCTCTATTTCATTGAAGGGCAGAAACCTGTCAACTCCTGGCACAAAGATCCACTGTACGGGTACTGGCTCTTACTCATCAGCGGAAGTCATCAGATCTTCATATCCTGGTGTGGTGTATGATAATATAAAGTTAAGTGGTTTTAAAGTTCAGGATGTTTCACCCGGTGTTGTGGGTCGCCTTTTTATTGAGATTGAAAATGGTTTCAAGGGTAACAGTTTTCCAGTGATAATAGCCAATGAGACCATTTGTGAGGAATTGAGACCACTTGAGTCTGAATTTAACGAGGAGGAAAAAATATGCGATGCCATTTCAGAAGAGCATGAACATCATTTTGGAAGGCCAAGATCAAGGGAGGAGGCTTTGCATTTTTTGAATGAGCTTGGCTGGCTGTTCCAAAGAGAAAGGTTCTCATATATGCATGAGGTTCCCTGTTATTCGCTTGACAGGTTCAAATTTGTACTCACATTTGCTGTGGAAAGAAACTGTTGTATGGTAGTCAAAACCCTTCTCGATGTACTGGTTGATAAACACTTGCAAGGGGAGTCGTTGTCAACAGGGTCAGTGGAAATGTTGAATGCAATCCAACTCTTAAATAGAGCAGTGAAAAGAAAGAACATAGGCATGGTTGATTTGCTCATTCACTATTCTTTACCAAACAAAAATAGTACATCCAGGAAATATGTATTTCCTCCTAATCTTGAGGGTCCTGCTGGTATTACACCCTTGCACTTGGCAGCATGCACGTCTGGTTCTGAGGGTGTAGTTGACTTTTTAACAAGTGACCCACAGGAGATTGGCTTGAAGTGCTGGGAATCCCTTGTGGATGCTAACGGGCAGACTCCACATGCGTATGCTATGATGAGGAATAATAACTCTTATAATGTGCTGGTTGCCCGTAAACTTGCTGATAGACGAAGGGCTGAAATTTCAGTAACAATTGAGAATGAGATAGAGCAAGCCTCTCTGAGGGTAGAGCTTAACCAAAAGCAAAGTAACCTACTCAAACGAGGTCAGAGTTCTTGTGCCAAGTGTGTGAGTGCAGAAATTCGCTACAACAGAAGATTTTCAGGTTCACACGGTTTGATTCACCGCCCCTTTATTTATTCAATGCTAGCCGTTGCTGCAGTTTGTGTATGTGTTTGTGTGTTCTTCCGTGGACGCCCTTTCGTAGGCTCAGTTGCTCCCTTCAGTTGGGAAACCCTGGATTTTGGCACAATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_14391::LG3:47751889-47753889(-)
TTCAAAACCTATAAATATGAGTTTAAGATAAAAAGTAATATGATCGAATTTATTACACTATTGATAATTGAATGACCACCAAAAGGTCACCTACCGACTTAACTTAAGTATCAAATTAACTTTTATAAATAACCATACATTGTATAAAAAATAGTAAAAACTTCATTGGAACAATTTGAGGTTTGTTTGGAGTTTGATGTTGAAAACAATTAACATCGAACCGAACAATAATTGTTTAAAATAATTGATATTCTTATAATTAAAAGATTAATTACATTTTGATAATTTAAAAAAAGACCATTTTATTATTTAAACACAGTATATATCCCATTAAGCTACATAGATTATGATAACATATCATTCTCTAGTTTATTATTTTAAAATTACAACTATAATTTGATTAGTCATTATGTAGCTGCTTAATGAAAATTAATCAGTATTAAGGTAGCTCTGACTTTGGCTCCTGAAAGCAATGTGATGAATGTGAAAGGAAATAAAAAAGGTGTTTCCAATAGTATATAGGTGGGGACTGTTTCAAATAGTTGTCACATACTTTTTGTTTGTTGCTGTGATGGAAGATAGATCGTGCGGTGCAAGATGAATCATGTGGCCATCCATGCTGTTACATTCAATTCTCTCAACAAATTTCATTTTAACCCATGTCATATTATTTCTTTGCAAGATGACACCATAATAATAATAATAATTAGTGTGGTTAAAACTGATTATCTGTCTCAGTTTAACTCACCATTGTTAAGTTAATTCAACTCAGCTTTCTTGTCAGTAAATTGAAAAAATTTAAAACCGATCTAACTCACCACAGATATATGAGTTAAAAGAATTAACTAATTCACTCATTTAATTATAATTTTATTTTTAATTAAAAAAATTATCATTTTTTAACTCAAACCTAAATAAAAAGAACTCAAATCTAAATAAATGGAAGGTACTTAGATTATATTTATAATTAAATATAATACAAAAAATATCACAAAATTTTCTTAATAAAATTTTCGATATGGTTCATGTTAAAATTTTAAATATTTTTTTTATTCAAATTGAGCCTGTGGTAGGTCGAAGTAACTCACGGTTCTGATCATTTTAACAATAATAATAATAACATGAATTTAATTTGTATTGTGATTAATATTATTTTAATAAAAATTTTAACAAGTCTTTTATAAAATATTTAACTTTATCATTTAAATTAGACTTAAATTTTCAATAATTTCCTTTTAAGTTTGAATTTCTTCGTATTAATCACGAGTATCTTTTATTTGTTTTGTACTTATCAATGTAACACGTTTGTTTTAATTTTTTTTTATAAAAAAAAGCTTTCAATACAAAAGTCATACATTACTAGCTTTGCAGTTTATCATCGAGATAAACAATTAATTTTTAATACTATAAATAATCTTTTGAAAAATAGAATAAGAATAAAATATTAATAAAGTAATTCTAATCCAAAAACTTTGAAATAACGAATAAAAACACTCAACTTTCTTATTTATATATATATATATATATATATATATATGTATAAAAGTTAAACTCTTACTATAAATAATACTAATAAATTGTTATATAATTTTAGTTTCATCAGTAAATTATATGATAAAGTTTGTACCTTATTATATATTAATAATGATTGTGGGAATGGGTGAATATTTAGGTAATAATAGTTGAATATTATTACGTAAGAATAAGAAGGACGATATAGAGGATAGAGATAGGGCAAAGAAAGAGCAGTGGAATTCCGATAATATCCCTACTTCATAAAAGTGGTGCCACTGTTACCTTACAGACCCCTTTACCCAAAAAAAAAAAAGTATAACCAAACCACTCCCATCGTACGGAACACAAGTGGCCACTGCGAAACGAAACCTCTTGGATTCTTCCATACCTCTTTCAACGCCCAAACCACCCTCCAAATTCATTCTATTTACAATTCCTGCCACTCCCACACCCAACAAACACTTTAACAACCCAACACAACCTTC


Gene Sequence:
>Vu_14391(-)
ACACACAACCTTACAATGCAATACAACCCTTGCAAGAAAGAAACCTAAAACCAAAAAATTCAATTAAAAAAATAACAATAGAGTTTCTTTTTCTTTCTCAGATCTGAGTTTCACAAATTTCACAATTCATCTGCTGATGGATATTTTTGGTTTTTGTTTTCGTTTTCGTTAATTCCTTCCGAGGAAAGAGGCTTTGATTTTGTGGAATTCCAATTTGGAGATCCTTTTCCTATTTTTGGTTCTGATTTTGGTGGAAAATGGAAAAGGTGGCGGCGCCTCCGATTCTGATGCAGCGAAAGCGCGATCTGTCGTACGGCGTCGTTGCGGGGAGTCCGAGCGAGAGCTGGAAGTGGGAGTGGGACAGCGTGCGGTTCGCGGGGAAGCCTCCGAGCGACGACGTCGTGTTCGAGGAGGAGAGCGTCGCGGCGGTGGCTCCTCTGCAGCTCAACCTCGCGGGGAGGGTGAGCGGCGGTGGTAACAAGAGAGTGCGCTCGGGGTCTCCCGGAACGGCGACGTATCCGATGTGTCAGGTGGATAACTGCAGGGAGGATCTGTCGAAGGCGAAGGACTATCACAGGAGGCACAAGGTGTGCGAGGCGCATAGCAAAGCCTCCAAGGCGCTTCTTAGCAACCAAATGCAAAGGTTTTGTCAGCAGTGTAGTAGGTTTCACCCGCTGTCCGAGTTTGATGAGGGGAAACGGAGTTGCCGCCGTAGACTCGCTGGACACAACCGCCGCCGGAGGAAAACGCAGCCGGAGGATGTTACTTCCGCCACGCAGGCCCCCGCCGCCGCCGTCGCAGCAGCAGCAAATTTGGAAATCTTCAACTTGTTGACTGCAATAGCGGGAGCTTCGCAGGGTGAGAATTATTTGTTCAATTGAATTTTAGTTTAATTGATTGATTGGTTTATACTTTTTTGTTGTTTTAAATAATTTAATTCTAGCTCAACTCAATTCGAACAATAATAAGTACATGTTAAAGAGTATTTATTTATTTCATAAGTATTTAGATTTATCTGGAATCTATGAAAAATCATTAATCATTAGGGTGTAATTGCTTCGTATTCGGTCAAAGTTAATCCTACAAAGCATTAAAAACAATGATTTAGGTTTCTTTTTCTGTAATTAGTGGATTTCGATCCTCACCCTAGGATCTAAGTTTCATAAAGAGGGTCTAATTCATTAATTTTTCGGATTACGAAAACTAAATTTATTTGCTTTGGTCTAAGGTCATCAGGCATGTGGACTAAGGTCGATATTGATTGGAAATTGAGGGATCTAACAAAATTTATTTTACCTAAATAAATAACTATATTTTCAAAATAAAAGTTGATAATCTAAAAAGTGATCAATAATTTCTTTATTTGGGTTTTGCAAAGACAATTACGATTTACTTTTATTTTCTTTTTAAAACGGCACGCACGGCTCTATCAGTTAAGAAAACAACTATTTTCTTTTCACAATAAACTGATGCGAAAATAATCTTAAGATAATAATTTAAATTTTTTGGAAGAAGTTATGCAAAAATAAAAGCAACTAATTATAGAAAATAATGGCTTGTTTATCCTGAAAATAACATAAAACCAGCATACTCTTGTTCATTAGGGCCTTTTCTTTCTAGTGTAAAACAAGCTTGCACTAATTTTGTTTGGGTTGTGATGATTATTATTTTCACGTGTAGGAAAATTTGAAGAAAGATCACAAGTTCCGGATAGAGAGCAGCTTGTGCAGATTCTCAACAGGATACCTTTGCCTGCGGATCTTGCAACCAAGTTGCGGGATGCTGGTAATGTCAACGGGAAAAAGGATCATGTACAATCGGAGACACCATCCTCCTATCACCATCATGATCAACTGAACCACACCCCAGCTGCCCCATTAACTATGGACTTACTTGGTGTTCTTTCCACGAGTCTGTCTGGGTCTGGCCCTGATGCCAATGCGTCCCCCTCTCAAAATCGTAGCTGCAGCAGTGATGGCGGTAGTGTTAAATCTAGGAGTAGTGCTGATCAGACGAGACAACAGCACTTCTTTTCAGTTGGCGGAGAAAGAAGCAGTAGCAGTTCCCAGTCTCCAGTTGAAGATTCAGACTGCCAGGAGGATGTTAGAGTTAATTTGCCGCTGCAACTCTTTAGCTCCTCCCCAGAAGAGGACAGCTTGCCTAAACTTGCATCTTCAAGAAAGTATTTCTCGTCTGACAGTAGTAACCCTGCAGAAGAGAGGTCACCATCGTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTGTTGTGGAGATGCAGTTTGATTTGCAGGGTGGTGCTACAGGTCTAAAGCCGGAGAGCATCTCTTCTGGAAGAGGAGTTAATTCAAACAAGGAAACTAGCCAAAGTCATAGTTGTAATATCTCTCTCGATCTATTTAAAGGGTCAAATAAAAGGATCCAACAACCTAGTTGGCTTCAAAGTGTTCCATTTCAAGCTGGGTATACATCTTCGGGCTCTGATCATTCACCTCCCAGTTTGAATTCAGATGCTCAGGTAGTTAGTTTGGAATTTTACTACCCTGTCTTCTTTTGTTTACGTAAGCTTTGCATTATCTGTACTGTCTTTAAGCTTACTTAGGTGAATAGTATTCTTGAATTGAATCTATTTTGTGGTTTTCCAACAGGATCGCACTGGTAGAATAATGTTTAAACTATTTGACAAGCATCCAAGCCATTTCCCAGAAACATTGCGAGCACAGGTGTTTACACTTTCCTTTGAAATTTGACATGGGGAAGTTATTTTTGTTATATCCTGTCAAATGTGCATATATGAATAACTTTTTTTTTTCTTTCTAGATTTACAGTTGGCTTTCTAATAGGCCATCCGACATGGAGAGCTACATACGGCCTGGTTGTGTGGTCCTATCACTTTATGCTTCAATGTCTTGTGCTGCCTGGGAGAAAGTTAGTGAACTGCTGTGATGTACATTTGCTGCTTTTATAATTCTATCTTGCTGATTGCTTTCATGTTGTGTTTATTTCAGCTAGAGGAAAACTTCCTCCAACATGTTCATTCTTTAATTCAAAATTCAGATTCTGACTTTTGGAGAAGTGGAAGGTTTCTAGTACATTCTGGCAGTCAATTGGCTTCACACAAAGATGGTGAGCATCATAACTATTTCTAATTTTTGACTGGGTTTAGCTCTTTAATTTTTTTTTAGATTGAATATTAATATGATCAGAGCTTTGCTATCGGGACTGTCGTTTTCTACATAGCTGGAATTTTGAATTAGATCCTTTTTGGTCTTGAAATTCCAGGGAAGGTACGCATATGCAAACCATGGAGAACGTGGAAGTCGCCAGAGTTGATATCTGTGTCCCCTTTGGCAATTGTTAGTGGACAGGAAACCTCTATTTCATTGAAGGGCAGAAACCTGTCAACTCCTGGCACAAAGTCAGTAAAGAATTTCCCCTATTTTTGGTTGTTGTAGTATGCTTCTTTCTGGTCTGTTTGCCTAATATTTGTCCTGAATTTTTGCAGGATCCACTGTACGGGTACTGGCTCTTACTCATCAGCGGAAGTCATCAGATCTTCATATCCTGGTGTGGTGTATGATAATATAAAGTTAAGTGGTTTTAAAGTTCAGGATGTTTCACCCGGTGTTGTGGGTCGCCTTTTTATTGAGGTATTTTTCTACATTCTCTAATCTTTGCACTTTATTACCCTAGCAAACTCTGCACTTGACGACACATGCATGTCTATAGCATTTTTTATGTTTGAATGTGGTGTATACTGATAAAAGTGTGACCTATTTTTATGATCAGATTGAAAATGGTTTCAAGGGTAACAGTTTTCCAGTGATAATAGCCAATGAGACCATTTGTGAGGAATTGAGACCACTTGAGTCTGAATTTAACGAGGAGGAAAAAATATGCGATGCCATTTCAGAAGAGCATGAACATCATTTTGGAAGGCCAAGATCAAGGGAGGAGGCTTTGCATTTTTTGAATGAGCTTGGCTGGCTGTTCCAAAGAGAAAGGTTCTCATATATGCATGAGGTTCCCTGTTATTCGCTTGACAGGTTCAAATTTGTACTCACATTTGCTGTGGAAAGAAACTGTTGTATGGTAGTCAAAACCCTTCTCGATGTACTGGTTGATAAACACTTGCAAGGGGAGTCGTTGTCAACAGGGTCAGTGGAAATGTTGAATGCAATCCAACTCTTAAATAGAGCAGTGAAAAGAAAGAACATAGGCATGGTTGATTTGCTCATTCACTATTCTTTACCAAACAAAAATAGTACATCCAGGAAATATGTATTTCCTCCTAATCTTGAGGGTCCTGCTGGTATTACACCCTTGCACTTGGCAGCATGCACGTCTGGTTCTGAGGGTGTAGTTGACTTTTTAACAAGTGACCCACAGGAGGTAAATGTTTTCTCTGTACTCCGTTGCTATGCCATTGGTTTCACCGAAGTAAGGGAAAAAAATTAATTGGTAACACATACCCAGGTTCCTGCAGTAGTTATTTTGGGTAAATATCATCTGCTCTCTATCTGGACGGCAGGTGGTACTGGGGATTTTTTGAACCTTGAGTTAATGCAGATCTCTCTGGCTTTGATGCGTCATTTGTTTGTTTTCTTTCTTTTGGGAAAGGGGGCAGGGGGAAATGGCAGATTGAAAATTAAAAAAGTAAAATAGTTGAATTACCATGCTACTTGTACGTTAGCATTATTTTCACCCTTAAATCAACTGTCTGATTGTATTTCTTGCGCTCCATTCCTTGTATTTTATTTTTAACTTGTGCTCTTGTGCTGCTACAGATTGGCTTGAAGTGCTGGGAATCCCTTGTGGATGCTAACGGGCAGACTCCACATGCGTATGCTATGATGAGGAATAATAACTCTTATAATGTGCTGGTTGCCCGTAAACTTGCTGATAGACGAAGGGCTGAAATTTCAGTAACAATTGAGAATGAGATAGAGCAAGCCTCTCTGAGGGTAGAGCTTAACCAAAAGCAAAGTAACCTACTCAAACGAGGTCAGAGTTC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