Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14387 LG3 47720232 47724605 PREDICTED: putative Myb family transcription factor At1g14600
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 47721010 intron_variant
T/C 47721059 intron_variant
T/G 47721062 intron_variant
G/A 47721413 intron_variant
A/G 47721455 intron_variant
C/T 47721460 intron_variant
A/G 47721494 intron_variant
G/A 47721497 intron_variant
T/A 47721712 intron_variant
C/T 47721747 intron_variant
G/T 47721750 intron_variant
A/T 47721970 intron_variant
T/G 47721988 intron_variant
T/C 47722120 intron_variant
A/G 47722163 intron_variant
T/C 47722208 intron_variant
G/A 47722249 intron_variant
T/C 47722288 intron_variant
A/T 47724098 upstream_gene_variant
A/G 47724217 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14387.1
MGSCGREGVVRQYIRSKVPRLRWTPELHRCFVYAIETLGGHHKATPKLVLQLMDVKGLTISHVKSHLQMYRSMKGDSCRQDKTSTQHRKQDDDEVGDVGFYSCFKSIGKESDSQPSCSNFSLKRARIEKTSFLSGFPQCSQRNPYTTFYDYLQSMAEQKRIKKICAGSILQTKPLSTTFLPMLPSQASDFLQVAYLNDEQGLNEVEKSCGVEAEDEDDMGGCELSLSISLPQPHPSSQRSNASSVSDISEAFSLCPKFNNNNNNYMGCSTSSNVSNKVNVDLSLAI*


CDS Sequence:
>Vu_14387.1
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Promoter Sequence:
>Vu_14387::LG3:47718232-47720232(+)
CATTCACAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGTTAAATATATTTGTATTTTCTAAATTTGAATGTAAAAGCAGAATTCGGTTCCATGAGTTAAAACGTGTCAAACAATATAAATATTTCAAACATCAACTCGAAACCCGGTTTGACATATTTATAAAATTTAATTCATTTAGATTAAAATAATTATATTTATTCATTTATAAAGTTTAAACAAATTATATCAAAATTTAAAACAAAACCAAATTTCAATTTTACATCTAAATTTAAAAATTAAAAATATATTTATTTCTATAAACAAATATTAATTTATAGATGAATATATCGAACTTAGAAAAAGAGAATACTCAAAACTCATAAATAAAGAAGATAATGAACTAGAAAAAAGAGAGAAGAAAGTTGATAGATAAATAAGTTAAACAAAAATTAAATTATACATTTTATATTAGTGAAATATTTATTTTTAATTTGTGAAAGAAAATTATAAAATAATCTTATCTTGCTATTTTCTTCCCTTATTTAATAAATATTAGTAAAAAAGAGTTGTATTTTGAATCAGTACCAAAACAATTTAAACATAATTTTTGAAATAATTATTATAAAAATCTGTAAATCTTATATCTACTTATAAGGTTGATTTGTTTGTTTGAAAAAAATTCTGATTATGAATTCAACTCTCACACCAATAAAATACTAATAACTAATATTTGTCCAAAAAAAAAATTATATCTATTCATAATTATTTCTCACTAACATGAGACATACGGCAAGTCATTCTATTTTTTAAAGAAGATAGAAGACAAAAGATAAATAAATTAGACTCCTTCTAAACTTAAATTTAAGAGAGAAAAATGTGTTATACATATTTTAATTTGCATGCATCGTCATAATGTAAATATTTGCGATGTTAATCAGTAAAATAATATTTTGATAGATTGATAATAATAATAATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATGAAGACATTAATATTGATAATAATTCGTAATTGAAGAATATGATTAACCATTTTTCTGATAGAGTCTCTTTTTTCAATTATATTTTCAGTCATGACTTTCAAAATCGAAATTTTTCTTAAAGGTACCAAATCTAGTTTTAGTTTCACTTGTTAGTACTATAATTTGTAACTAAACAATGAAGAAATTTGTTTATAGTAATATTAGTCTTATATCTGATAAGTCTATATAAAAATAAAAATAATATACAAGAACATTATCGTGTTTACGCGTCAATGAAACAGTTCTCATGAGAAGAGAACAAAACAAAAACCTGAAAAGTAATTTCATGGCATCCATGTATTCCCCCCAAGTGATTATGACGATGTTGTCGCATATATTACTATTACTGGTCTATCTAGAGAGAGAGAGTGCGTAAAAAGGAAACTAGAAAGAGAGACAAAGGTCAAAGATTGGCAACACACGAGACACTATATATATATTGGCATAACTAGGCATAATCATTTCGTATGAGCAAGCAAAACAACATATATCAGAGTTCAGAAGCCTCCTCGTGATTATTTTTTGGTTTCGTTTCTTTCATTTTTTTACTCTTTCGTTTTTCCTTTTTGTCATTTGGCTAGCTGCGTACACGCTGGAAGCAGCAACAGCACCTACCATAAGGTATTATCAGTGACATGTTCGGGAATTTGCAGGACTTCTTCCCCTGTCATGTCCTTTTCTCTCGATATTTTCCCCTTTCACTATGATGATTCTGTGTTCTCTTCCTCATTTTTTTTTTCTGTTTTCCTAAAGAGAAAAGCTGCATGCATGCCATGCTTTTTTCTTAGTCCTGTGTTGTTCTTGTTATATAAGGAGGTCCAAGTTTTGGAGCACGAATGGTAATTATAGGGGTTTTTCAGAACACCCTTTTGGTTTCAGAAGTGGAAAGTGAAGGTCTTTGAAGAGAAGGAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_14387(+)
ATGGGTAGTTGTGGAAGGGAAGGTGTAGTGAGACAGTACATAAGATCAAAAGTCCCTCGTTTAAGATGGACCCCTGAACTCCATCGTTGCTTTGTTTATGCCATTGAAACTCTTGGAGGTCATCACAGTGAGTACATTGTTTTCACCCAACTAAAAATTTTCTATGCTTTTCTTCATGTTTCTTTCTTCTTCTTTTTGTTGCTTTTCTTAGATCCCATAAACACAAGGACAAAGCTTATTAGATGCATTATTGTTAATGTTAACTTTTCATCAGAATTGAAGCTTCACTTTATGTAGAAGGAAATGGGGGTGTATGGAGCTGAGGGAATTGAAAGACAGACAAAAATAATAAATGTTGTAGATGACATGAGAAAATGAGGTAGAAAAATAAATTAAATGTGAGAAAAAAGTAAATGTATGTTGGCTATTTTCTTCATTCTTCTTTATCTGTTTTTCATTACTATATACTATGATGAATTTCTAATACGTTTCTACCTCTTTTTTTATTCATATATTGTGCAGAGGCTACTCCTAAGCTTGTTCTTCAGTTGATGGATGTTAAAGGGCTGACAATTTCACATGTCAAGAGCCATCTGCAGGTTCATTTTAATCTGCTTAATTAGTATAAAATTGGCAATTTCATACATTAATTTGGTGTTCCTGATTAAGCTTTTCTTCCTCTTTTTCAAAAATAACCAGATGTACAGAAGCATGAAAGGTGATTCCTGCAGACAAGGTACCAAACGTTGTTCATTTGACCTTCTTTACTGCAAAACACTATGTCTCTTCAATACTCTTTCCTACCCTCATCTGCCTATGCTTTGTGTTCATAAAGTAGGTTATTTATCTACAGATTTGGATACATAATAATGAAAATGTGTGCATTAAGAAAAGTTAAGGTTTTATATATGGTAATTATGTTAATATGAGCATCAATCATTCTTTCATTACTCTAAAATATTACCTTTTATGTTGCATATTTTATGTGTTATCAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTTGTTTTGGTGATCCAAATTTATGAGGTCATACCAGCTTGAAAATAGGACTTGCCAATTGAAAAATAACACCTGCATATTTAACTAAACTAACATAAAATTTTGCATTCTCGAACAGAGAAGACATTTTGATGATGATAGAAAGTGTCTCCACAGCATCCCTTTTTATGGTTTACATAAAAAAAATGGACTCACCGAATCAATGGAAAATAGAGAAGTTACCCGCTTTTGGTAAAAAATAAAAATACTTTTTTACTATAAAATAGTGGAGAAACATGGTATATATATAAATATAAAGTGTGGAAATTTTTTAGGGTCATAGTATGGTAGACACCCTATTTCTTTTTATACTTGCTTTTGACACTCGTAAAAATTATTATTTTATATTTATTAGTTAAGTATAGTATGTTTTTTCAAAAGGGGTTGTAAAATAAGAGTAAAAGAAACGAGGAGTTTCAAAGAATATTTTTCAACTTTTTAAGTTAAGTGTTCTTATTTATTTATAAAGTAGCTAGGATGAGTTCTTCATCTCATCTCCTGGTTTATAAAGTGATTCATTATTTAAAAATGGTTTTTGACATCTTACAATTTTACACTGTGCCCCTTACGTTTCCCTTTTATGGTTAACTGTACAAAAGAAAGAGAAAAGGAAACTGGGTCAGACAGACGAGATATAAAATTATTACGTGTTAATTTTTTTTTCTAGTTGTTAAAAAAACATTTTTCGAGAAGATTATAGTTAAAGTGAAATAAATAGCTTGGTTGAAGCATTGATTGGTCAACAGATTAATATCGATGATCTGCATGTCGTACATTGAATAATGTAGATGATGCTTTCTGCATTGAAAGCATGCAGATAGATATGGAGTCACTCTATCGATGGTTGTTTCTCTTATTGGTTAATAGTTTGTGGTTGAAAAGCAGAGGAAAAAGCTATCCTCCATGCATGAGTTTAGCAAATTCTCAACAGCAATGTTGCTCATTAAGTAGTCCCTTTCGTGTCTATAGTTGATGCCAGAATAGACAAAGGAGAATCATAAACCATTCTGCTTTTACCATCTTATAATGGTATTTTTATGAAACCCACAACTTTTCTGCTTTCAACATTTAATATATAAATTCCATTGCTCCTTTAATTTCACCCATGTAAGTTTTCATTCTTCCTCCAATCCTATTATCATACTGTAACTATTCATCAACTTTCTCGATCACTATTTTTGTATAAAGAAATCTATTTCTCTGAAAATCTTTAATGGAAAAAAAAATTAAAGAAAAACAGATAAAAATTAGTTATTTACTGGAATATAAACATAATAAAAGTATTTTTTTAATTTTTAATAATATAATACTCTTTATTTCTTTTATCTTTATTATATTAAGTATTCAAATATATAAGTTAAAAAAATTGTATTGAATAGAAATAAAGTGACATATGAGTAAAATAAAAATCACAAACATTAAATCTTAAACTTTTGTGTTGAAAATAATGTTATATCTTTTCTATGTTTGTCAGTTCATGTCATGTGGTAAAAAGATATTATAATATTTTATGCGAACAAAAACTCATAATTATACAAAATTTTTAAAATATTTTACAAAAAATTTACTTTTTTAAATTTTTTTACCAATATATTTCAATCCTACACCAATCAAAGTGTAGCGGTACATCTTTTACAAACATATTTGTTTTTGCTTTTCATGCACAGAATTTAAATCCCAGAAAAATCTTAAAAGAAGAAAAAGGCTACATGCAGTTTCACTCTAACTAAACGTTAATTTGTTTTAAAATGTTGAATGTTTTCGCTAAATGTTGTTCTACTTTGAATTCCTTGTCTGATGGTTATCTGTGACAGACAAGACTTCCACCCAACATAGAAAACAAGACGATGATGAAGTGGGTGATGTTGGTTTCTACTCTTGTTTCAAATCCATTGGAAAAGAATCTGATTCCCAACCCAGCTGCAGTAATTTCTCCCTTAAAAGGTCAGCTTAACTTCATGTTTCAAATAAACAATACAACGAGTTTTCAATCACAAATCAACATGTATACAACAAATCTCATTATTTTATACTTATTATTTAGAAAGTACACTAAGAAAAGAAGCACGATCAGTCAAGAATATGTAACTTTTTTTACCCTGCATATAAAAAAACTCTGGCTTCTTTGCTTGTTGAAATAATTTGAAACTTTTCAAAGGACTAAAAAGTGGTACAACATATGTAAAGTAAGAAAACAAAAGTGATTGGTCTTTGCTTGATCTCTGACTTTTCTGAGGCAACTTTTACTTTTAAGCAAGAAAAGAAAGAAAAAATCTGAATTAATTAACGTTTGGATTCTCCACAGAGCTAGAATCGAGAAGACAAGTTTTCTCTCAGGATTCCCACAATGCAGCCAAAGAAATCCATACACTACTTTTTATGATTACCTGCAGAGCATGGCTGAGCAGAAGCGAATAAAGAAGATTTGTGCTGGTTCAATATTGCAGACTAAACCCCTTTCCACAACTTTTCTTCCCATGCTACCAAGCCAAGCATCAGATTTTCTCCAGGTACTCTTCTTATAGAGACAATCTATCTATCTTTTTGTACTTCATTTCTCCTCCTTCAACATAAATTATTGAGCTTCAAGTGGAGTGTCTCATTGGTTATGTCTTTATTTCACTGTCATGTGAAAATTTCTCAGCAATAGGACCCCCCCTTTACGAACAAAACACGAAAATGACAGCCTCCTTGTCAAAAACATCAATTCAAATAATCAAAGTTAACTCTTTTTATTTTCTACAGATAATCATGTTCAACTGTTAATGCTATGAAGAATTAATCAGTCTCCTTTCTGCTTCATATATCCAACCTTGTCAGTGGCCTTAGCAAAATCTATTAGCTTTGTTCCCTTAATATTGCCCCCTTTGTGCATATAAGAAAAAAATGATAGACCCTTTTTGTGAGAAAGTCCACGTGAATAACTTTCTGCAATGGCCTTGTCACTTTCTGATGTGTTCCTTTTTCACTATGTTGAACAGGTTGCCTACTTAAATGACGAACAGGGTTTGAATGAAGTTGAAAAGAGTTGTGGGGTAGAAGCAGAGGATGAAGACGACATGGGAGGTTGTGAGTTGTCGCTGTCCATCTCATTGCCACAACCACATCCTTCTTCTCAGAGAAGTAATGCTTCTTCAGTCAGCGATATCAGTGAGGCCTTTTCATTGTGCCCTAAGTTTAACAACAACAACAACAACTACATGGGATGTTCTACTTCTTCTAATGTTTCAAACAAAGTTAATGTCGACCTATCTTTGGCCATTTGA