Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13962 LG3 41104327 41118634 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 isoform X1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 41104570 synonymous_variant p.Ser838Ser
C/T 41104576 synonymous_variant p.Arg836Arg
T/C 41104588 synonymous_variant p.Ser832Ser
T/C 41104648 synonymous_variant p.Glu812Glu
T/G 41104744 intron_variant
G/A 41104749 intron_variant
A/G 41104768 intron_variant
T/G 41104781 intron_variant
T/C 41104830 intron_variant
T/A,* 41104877 intron_variant
G/A 41104935 intron_variant
T/G 41104940 intron_variant
G/T 41104947 intron_variant
T/G 41104949 intron_variant
C/T 41104988 intron_variant
A/G 41105011 intron_variant
A/C 41105023 intron_variant
C/G 41105058 intron_variant
G/A 41105059 intron_variant
A/G 41105076 intron_variant
C/T 41105085 intron_variant
T/C 41105109 intron_variant
A/T 41105111 intron_variant
C/T 41105128 intron_variant
T/C 41105130 intron_variant
G/A 41105132 intron_variant
T/G 41105134 intron_variant
T/C 41105137 intron_variant
C/T 41105143 intron_variant
T/C 41105166 intron_variant
A/G 41105210 intron_variant
C/T 41105333 intron_variant
T/A 41105346 intron_variant
C/A 41105381 intron_variant
C/A 41105430 intron_variant
G/A 41105458 intron_variant
G/T 41105512 intron_variant
G/T 41105534 missense_variant p.Phe790Leu
T/A 41105746 intron_variant
A/T 41105981 intron_variant
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C/T 41106012 intron_variant
T/A 41106046 stop_gained p.Lys736*
A/T 41106047 missense_variant p.His735Gln
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C/T 41106469 intron_variant
A/G 41106473 intron_variant
T/A 41106501 intron_variant
T/A 41106793 intron_variant
A/C 41106834 intron_variant
C/A 41106954 intron_variant
C/T 41106967 intron_variant
T/A 41106969 intron_variant
C/T 41106974 intron_variant
T/C 41106995 intron_variant
G/A 41107001 intron_variant
C/T 41107025 intron_variant
A/G 41107031 intron_variant
T/C 41107061 intron_variant
C/G 41107120 intron_variant
C/A 41107123 intron_variant
T/A 41107159 intron_variant
C/T 41107165 intron_variant
C/A,T 41107200 intron_variant
A/G 41107219 intron_variant
C/A 41107245 intron_variant
C/T 41107257 intron_variant
G/C 41107260 intron_variant
A/G 41107290 intron_variant
A/T 41107305 intron_variant
C/T 41107318 intron_variant
C/T 41107336 intron_variant
G/A 41107351 intron_variant
A/T 41107365 intron_variant
C/T 41107368 intron_variant
C/T 41107380 intron_variant
G/T 41107411 intron_variant
C/A 41107505 intron_variant
G/C 41107523 intron_variant
T/G 41107529 intron_variant
G/C 41107545 intron_variant
G/C 41107548 intron_variant
G/C 41107551 intron_variant
A/C 41107767 intron_variant
T/C 41107830 intron_variant
T/C 41108127 intron_variant
G/A 41108394 intron_variant
A/T 41108398 intron_variant
A/T 41108405 intron_variant
C/A 41108693 intron_variant
T/A 41108709 intron_variant
T/C 41108733 intron_variant
G/T 41108800 intron_variant
C/T 41109033 intron_variant
G/A 41109048 intron_variant
G/A 41109265 missense_variant p.Ser529Phe
G/T 41109618 intron_variant
T/C 41109931 intron_variant
G/C 41109936 intron_variant
G/T 41109960 intron_variant
A/T 41110605 intron_variant
A/G 41110610 intron_variant
C/T 41110613 intron_variant
A/T 41110618 intron_variant
T/A 41110650 intron_variant
T/A 41110710 intron_variant
T/A 41110713 intron_variant
G/A 41110881 intron_variant
G/A 41111012 intron_variant
A/T 41111128 intron_variant
T/C 41111157 intron_variant
T/A 41111254 intron_variant
C/A 41111291 intron_variant
A/G 41111374 intron_variant
G/T,A 41111523 intron_variant
T/G 41111526 intron_variant
A/T 41111676 intron_variant
A/C 41111730 intron_variant
T/A 41111916 intron_variant
A/T 41112051 intron_variant
C/T 41112129 intron_variant
T/C 41112362 intron_variant
G/A 41112427 intron_variant
C/A 41112497 intron_variant
A/C 41112992 intron_variant
A/T 41113408 missense_variant p.Val273Asp
A/T 41113431 intron_variant
G/A 41113491 splice_region_variant&intron_variant
G/A 41113566 synonymous_variant p.Gly246Gly
G/A 41114264 intron_variant
A/G 41114477 intron_variant
A/T 41114504 intron_variant
G/A 41114637 intron_variant
T/A 41114665 intron_variant
T/C 41114670 intron_variant
T/G 41114744 intron_variant
A/T 41114774 intron_variant
T/G 41114907 stop_lost p.Ter194Serext*?
G/A 41115037 intron_variant
A/C 41115178 intron_variant
C/T 41115329 intron_variant
C/G 41115358 intron_variant
A/C 41115581 intron_variant
G/A 41115788 missense_variant p.Leu144Phe
T/A 41115840 synonymous_variant p.Ile126Ile
A/G 41116101 intron_variant
G/T 41116252 intron_variant
G/T 41116255 intron_variant
T/G 41116367 intron_variant
T/C 41116649 intron_variant
G/A 41116689 intron_variant
C/A 41116720 intron_variant
G/A 41116795 intron_variant
G/T 41116808 intron_variant
G/T,A 41116830 intron_variant
A/T 41116843 intron_variant
A/T 41116844 intron_variant
A/C 41116850 intron_variant
G/T 41116881 intron_variant
G/A 41116883 intron_variant
C/A 41116885 intron_variant
T/A 41116908 intron_variant
T/A 41116920 intron_variant
C/A 41116924 intron_variant
G/A 41116937 intron_variant
T/A 41116984 intron_variant
T/A 41116991 intron_variant
T/C 41117017 intron_variant
A/G 41117100 intron_variant
A/C 41117115 intron_variant
A/C 41117188 intron_variant
G/T 41117491 intron_variant
T/C 41117597 intron_variant
G/A 41117615 intron_variant
C/T 41117897 intron_variant
A/T 41117899 intron_variant
A/T 41117946 intron_variant
G/A 41118085 intron_variant
G/A 41118113 intron_variant
G/C 41118197 intron_variant
A/T 41118199 intron_variant
T/C 41118213 intron_variant
A/G 41118356 intron_variant
A/T 41118429 intron_variant
C/G 41118435 intron_variant
G/C 41118446 intron_variant
T/A 41118551 missense_variant p.Gln28His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13962.1
MGWMSHGLAFALVAVFFCHFSCFVSFSQAQSANATTDPSEARVLNSIFSTWGISALTNVWNISGELCSGNAIDSTSTPESYNPFIRCDCSFDNRTTCHITALRVYALNVFGEIPEELWTLTYLTNLNIGQNYLTGSLPPAIGNLTRMQYLSLGINNLSGELPKELGNLTELIILSISSNNFSGSLPSELGKLTKLEQLYIDSSGNSGPIPSSFADLTSLATVWASDVELTGNIPNFIGNWTRLQVLRLQGNSFNGSIPSSLSNLTSLTELRISGLSNGSSSLEFLQNMKSLTTLELRNNNISGSIPSFIGEFHNLTQLDLSFNSIEGQIPGSIFNLSSLNTLFLGNNKLNGTLPTQKRSSLQNIDLSYNDLSGSLPSWVNEANLQLNLVANNLSIDDGSDSSGLPFGLNCLQKNFPCNRGVGRYSDFAIKCGGPQITSTEGITYERENETLGSATYFVTDTSRWAVSNVGLFTGNSNPEYTKFVSNQFTNTMNTELFQTARVSPSSLRYYGLGLENGFYNITLQFAETAILDSAGRWESLGRRVFDIYIQGNLVLKDFDIKKEAGGISFRAVQRQFRFEVTENYIDIHLFWAGKGTCCIPAQGTYGPLIQAIHAIPDFIPTVSNEPPSNSNNRTGLIVGIVVGIGVVSFLSVFVIFCIIRRRKRQHEDEGNSLTLNWSTRYDICTGIARGLAYLHEESRLRIVHRDVKASNILLDYELVPKISDFGLAKLYDDKKTHISTRVAGTIGYLAPEYAMRGHLTEKADIFSFGVVALELVSGRPNADSSLEGDKVYLLEWAWQLHESNLIMDLVDPRLSEFNEEEVKRIVGIALLCTQTSPSLRPSMSRVVAMLSGDIEVNTVTSKPGYLSDWKFDDVSSFMTENAVKGFNTSYQSSGSTSMVGGADYSPVSVSKPILKDALNEGR*


CDS Sequence:
>Vu_13962.1
ATGGGATGGATGTCACATGGTTTGGCTTTTGCTCTCGTTGCCGTGTTCTTCTGTCACTTCAGTTGCTTCGTTAGCTTTTCTCAAGCTCAATCTGCAAACGCCACCACTGACCCTTCTGAAGCAAGAGTTTTAAATTCAATCTTCAGTACATGGGGTATCTCTGCACTCACAAATGTGTGGAATATAAGCGGTGAACTGTGCAGTGGAAATGCCATTGATAGTACTTCCACCCCTGAAAGTTACAATCCATTCATCAGATGTGACTGTTCATTTGACAATCGAACTACTTGCCACATCACAGCATTGAGGGTCTATGCACTGAACGTGTTTGGTGAAATTCCGGAAGAACTATGGACTCTCACCTATCTCACCAATTTAAATATTGGGCAAAATTACTTGACGGGTTCTCTGCCTCCAGCTATTGGAAATCTAACTCGTATGCAGTACTTGAGCCTTGGAATCAATAATTTATCAGGGGAGCTTCCAAAGGAATTGGGAAATCTTACAGAGTTAATAATACTGAGTATTTCGTCAAACAATTTCTCAGGATCTCTCCCATCCGAACTTGGGAAACTCACAAAGTTAGAACAACTCTACATTGATAGTTCTGGAAATAGTGGTCCAATTCCATCCTCATTTGCAGACCTTACGAGTTTGGCAACAGTATGGGCTTCAGACGTGGAACTCACAGGCAATATACCAAACTTCATAGGGAATTGGACTAGGCTTCAAGTCTTGAGGCTTCAAGGCAATTCTTTTAATGGCTCAATACCCTCGTCACTTTCCAACTTGACTTCTTTAACAGAATTGAGAATAAGTGGTTTATCTAATGGGAGCTCCTCACTGGAATTTCTACAGAATATGAAATCTTTGACTACCTTAGAATTGAGGAATAACAATATTTCTGGTTCAATTCCGTCCTTCATTGGAGAGTTTCACAATTTGACCCAACTGGATTTAAGTTTCAATAGCATCGAAGGACAAATTCCGGGTTCAATTTTCAATTTGAGCTCGCTCAATACCTTGTTTCTTGGAAATAATAAACTAAATGGCACCCTTCCAACACAGAAACGTTCATCACTTCAGAATATAGACTTGTCATACAATGATCTATCAGGAAGCCTCCCCTCTTGGGTAAACGAAGCAAATTTACAACTGAATTTAGTTGCTAACAACTTGTCGATAGATGATGGTTCAGATTCCAGTGGCTTGCCATTTGGGCTCAACTGTCTCCAGAAAAACTTTCCTTGCAATCGAGGTGTTGGAAGATATTCTGACTTTGCTATCAAGTGTGGCGGACCCCAAATTACGTCCACAGAAGGAATCACATATGAAAGGGAGAATGAGACACTTGGTTCTGCTACATACTTTGTTACTGATACAAGTAGATGGGCTGTTAGTAATGTTGGATTGTTTACGGGCAATAGTAATCCAGAATACACAAAATTTGTGTCTAATCAATTCACTAACACTATGAATACGGAGCTCTTCCAAACAGCACGGGTCTCTCCTTCATCATTAAGATATTATGGCTTGGGGCTGGAAAATGGCTTTTACAACATCACCCTTCAATTTGCAGAAACAGCTATTCTGGATTCTGCTGGAAGATGGGAAAGTCTTGGGAGACGAGTCTTTGATATATATATCCAGGGGAATCTTGTTTTGAAAGATTTCGACATAAAAAAGGAAGCTGGGGGCATCTCATTCAGAGCTGTCCAAAGGCAATTTAGGTTTGAAGTGACTGAAAACTATATTGACATCCATCTCTTTTGGGCTGGAAAGGGGACTTGTTGCATACCAGCTCAAGGTACTTATGGGCCCTTGATTCAAGCCATCCATGCTATCCCAGATTTTATACCTACTGTCAGTAACGAACCTCCAAGCAATTCAAATAATAGAACCGGCCTTATTGTTGGAATTGTTGTTGGAATTGGAGTTGTAAGCTTCCTATCAGTTTTTGTGATTTTCTGTATCATTCGGAGAAGAAAACGTCAGCATGAAGATGAAGGAAATTCTTTAACCCTCAATTGGTCCACACGCTATGATATTTGCACGGGTATTGCCAGAGGTTTAGCATATTTACACGAAGAGTCTCGTCTCCGTATTGTACACCGTGATGTGAAGGCTAGTAATATTTTGCTTGACTACGAGCTTGTACCCAAAATATCTGATTTTGGATTGGCCAAATTGTACGATGATAAAAAGACCCACATAAGCACCCGTGTGGCTGGAACAATTGGATATCTTGCACCGGAGTATGCCATGCGTGGACACCTTACAGAGAAAGCAGATATATTTTCATTTGGTGTTGTTGCTCTTGAGTTAGTAAGTGGGAGACCAAATGCTGATTCAAGTTTGGAAGGAGACAAGGTCTATCTTCTTGAATGGGCTTGGCAGCTTCATGAAAGCAACCTCATAATGGATCTGGTGGACCCTAGACTTTCAGAATTCAATGAGGAAGAAGTAAAACGTATTGTGGGAATAGCACTTCTGTGCACTCAGACATCACCATCATTAAGGCCATCGATGTCACGAGTGGTGGCAATGCTTTCAGGAGATATTGAAGTGAACACTGTTACTTCAAAGCCTGGATACCTTAGTGACTGGAAATTTGATGATGTTAGCAGCTTCATGACTGAAAACGCGGTCAAAGGATTCAATACAAGTTACCAGTCGTCGGGAAGTACCAGCATGGTGGGTGGTGCAGACTATTCACCCGTAAGTGTTTCTAAACCGATCCTTAAGGATGCTCTTAATGAGGGTAGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_13962::LG3:41118634-41120634(-)
GAGATGATAGGCTAAAAATTATTGTGCCTTTAGCATAGTGTCAGTGATGAGAGAAGGCCAATCAATGTGGACATGATTCAAAATACCATAGATAAGGAGAAGATCTTGCTTAGAGTATTGAGCATGATTGGTGGCACGAGAGCATATGATCCAAACTTTCAGGTAATGGATCATCCTCTCCTCCACTTTGAAACCGCCCACCAGTAGTTGTTGTCGATTTAATTGTTGTTGAGGGTTTCTCAAAAACGACTGGAAGGCAAGAAGACGATTGAACTTTGGAACTCCAAGATGAATTTTCACTGCATCATCCCAGATGGTGAGCATAGCTACATTGGTTCAGATGTCGTCATCAAGAATGATGCGTAACCCTTTTACTTTAGTAGTAACAACACCATCACGATAACAGAGTTTGTGGTAGAATACCCGAATGAGGTCGGAATAAATACATTCCTTTTGTTCAACGAGATTGGTTAAGCCTTGGTTTGAAAATAAATTAGGAAATTGGAACCCATAAGATTTGTAGTACTCTAAGCGAACATACTTCACACCCATGATCTGTCTCTCCTGCCAAAAACGACCGAACTCAGCTTGTTTCTCCGGATCACAGAGCCATCCTTCAAGAGTGGCAGGTCTTGGAGCTTGAGGACGTGAAGAGGATGCACCACCAGTACGTCTGTGTGTAGGCATCTTGCACCTTGAATCAACAATGAAGATCAAAGAAGGTGTAGAAGAAAAGTATGAGAAAGAGAGTAAAAGCTTGATTAATCTTGATTCTGGTAGAGTTTGGATGCAATGGGAGGTTATTAATCGATTATGAATGAGTATTTATAGAGAGAATTGAAAAACTAGCCGTTTTTTATCGTTGTAACGACTATATTTTTGAATTTGCGTTGATTGAATCGATTATCATTAATGAAAACCATGCCTAAAAGGACGTATTACCTACTTCAAGCAAAGTATTGAAAAAACATGTATGCTCTGATAAATTGACTTATCCAACGGCTGATGCACATGAAGAAAGAGAAAACACAAGAATCAAGGCGAACGCTTAGTCTAGCGAACATTTATTCAAAAATCCTTTAAATTGAAGAGCTTTTGAAAGAAAAATCAAGAGGATAGCAAGAGAAAAGCTTACAACAAAATATATATTCTTAGAAGCATCAAAAAGAGAAGAAAAAAAGAGAAAAGAGAAGAGAAGAAGAGAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAATACTTCCAACCTTCATTGTAATATTGTTTACTGATTAAAAAACAGAGAGAAAGAGAAAAAAGAGAATATTATACTACTTTGTATTATAATCATATCTTCTCTGCAAGAGTAATAATCTAAACGACTTGTAAATCATCGTTGATTACATTTCTTACGAGAATTAAAACACTTACAACTAAACTGAGCTCGAATTAAAAAAAATCTAGACAAGATTGTCTAGTACTAGATATGGTACGAATAGTCAAAAGAAAAGTTGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTAATGCATAACCAACGTGAAAAATTGTCCAAGAGATTTTTTTTTAGGATTAAAGTAAAAAAGGTAGGGGAACATTCCATGGTTGGTGTGTCCACAATTTGCATGTTAGCTAACCACATAAAAATGGCCACTAAAATTATTTATTGGTATATAACCTAGTTGATCATGTTGACCTTTGAGCTACACGCGGGCCATCTGGTGTGCTATGGTGGAACATGACGTAAGCTTTGACAGAGCTCAGGCGATTCATAATAGTTACACACGTTGAACATTGTGGTCAGAGACGCCATTTTTGCCTCTCTTTTGCAAGTAGAGTCTTATAAAAGCAAACCAACGTTCCAATCTTTCTCCCTAACACTGCGATTGCTCACCAAATACTAAATTTCTCATTAACCTGAAAGTCGATCGGCCAAGTTTGAAAGCACTCGACAAATTTTTTCAAAGATTGTTATTGTGGGGTGGTCGTGTTCTTCATATC


Gene Sequence:
>Vu_13962(-)
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