Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13888 LG3 39962993 39965959 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 39963113 missense_variant p.Gly41Arg
T/A 39963322 synonymous_variant p.Ile110Ile
A/T 39963323 missense_variant p.Thr111Ser
A/C 39963712 missense_variant p.Glu240Asp
G/A 39963922 stop_gained p.Trp310*
A/T 39963923 missense_variant p.Asn311Tyr
A/T 39964284 intron_variant
G/T 39964375 missense_variant p.Trp431Cys
T/A 39964376 missense_variant p.Cys432Ser
T/C 39964378 synonymous_variant p.Cys432Cys
T/A 39964407 missense_variant p.Met442Lys
A/C 39964444 intron_variant
C/T 39964455 intron_variant
G/A 39964505 intron_variant
G/A 39964516 intron_variant
T/A 39964625 intron_variant
G/A 39964673 intron_variant
G/A 39964679 intron_variant
C/T 39964741 intron_variant
C/G 39964822 intron_variant
G/T 39965131 synonymous_variant p.Ala460Ala
T/A 39965171 missense_variant p.Ser474Thr
G/T 39965212 missense_variant p.Gln487His
A/C 39965393 intron_variant
G/A 39965416 missense_variant&splice_region_variant p.Gly530Asp
T/A 39965462 missense_variant p.Asn545Lys
C/T 39965463 stop_gained p.Gln546*
G/A 39965470 missense_variant p.Cys548Tyr
T/G 39965472 missense_variant p.Leu549Val
G/A 39965669 missense_variant p.Glu585Lys
A/G 39965710 synonymous_variant p.Glu598Glu
T/A 39965781 missense_variant p.Val622Asp
G/C 39965804 missense_variant p.Val630Leu
G/A 39965815 synonymous_variant p.Leu633Leu
A/G 39965843 missense_variant p.Lys643Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13888.1
MSTISYCSLDSLAVSESIQDIKNETLVSAGGITELGFFSPGNSARRYLGIWYPNVSPFTVVWVANRNTPLENNSGVLKLNQKGVLELFNGTNNIIWSSPNRSSNTVNDPITRLLDSGNFVVRNGGETKEDSILWQSFDYPGDTQMPEMKFGWNLETGVERYIASWKSDEDPAEGEYVIKVDLRGYPQIIKFKGTDIKARAGPWNGLSLVGNPIPARGTSAKFVFNEKEVYFWYSLSDELEFFVYTLTPSGTGQSWFWTTETRTRQVVSSGEEDQCENYAFCGANSVCIYDGNFPICECLRGYVPKFPDEWNISIWHNGCVPRNKSNCTNIYTDGFLKYKHMKLPDTSSSWFDATMNLDECMKLCIRNCSCTACANLDVRDEGSGCLLWFNDLVDMRNFSQWGQDFYIRVPASELDHAGHGKITIKIAAITVGVIIFGLVTCACIIIRKNPDETKRKLLDWRMRFNIISGIARGLLYLHQDSRLRIIHRDLKTSNILLDTNMDPKIADFGLARSFLGDQVEGKTHRVAGTYGYMPPEYAARGHFSVKSDVFSYGVIVLEIVSGKKNREFSDPENNNNLLGHAWRLWTEERALELLDELIGEQCLESEVTRCIQVGLLCVQQRPNVRPDMSSVVLMLNGEKSLPKPKVPGFYTESDVTTETNSSSENHTLCSVNELSITMIDAR*


CDS Sequence:
>Vu_13888.1
ATGTCTACGATTTCTTATTGTTCCTTAGACAGTTTAGCAGTGAGTGAATCCATCCAAGATATTAAGAACGAGACTTTGGTTTCAGCAGGTGGAATTACTGAACTGGGTTTCTTCAGTCCAGGAAATTCAGCAAGAAGATATTTGGGAATATGGTACCCAAATGTATCCCCTTTCACTGTGGTATGGGTGGCAAACCGAAATACACCTCTTGAGAATAATTCAGGAGTTCTCAAACTCAACCAAAAAGGGGTTCTTGAGCTATTCAATGGCACAAACAACATCATTTGGTCATCACCCAACAGATCAAGCAATACAGTGAATGATCCAATTACTCGTCTTTTGGATTCTGGAAATTTTGTAGTGAGAAATGGAGGGGAAACAAAGGAGGATAGCATCTTGTGGCAGAGTTTTGATTATCCGGGTGATACACAGATGCCAGAAATGAAGTTTGGATGGAACCTAGAGACTGGTGTGGAAAGATATATAGCATCTTGGAAAAGTGATGAGGATCCTGCAGAGGGAGAATATGTTATAAAAGTGGATCTTAGAGGATATCCTCAAATAATAAAGTTCAAGGGAACTGATATAAAAGCAAGAGCAGGGCCATGGAATGGCTTGTCTCTGGTTGGAAATCCTATTCCAGCTCGTGGTACGTCTGCAAAATTTGTGTTCAATGAAAAAGAGGTGTATTTTTGGTACAGTCTTAGTGATGAATTGGAATTCTTTGTGTACACACTGACCCCTTCAGGCACAGGACAAAGTTGGTTTTGGACAACTGAAACAAGGACGAGGCAAGTGGTCTCAAGTGGGGAGGAAGATCAATGCGAGAATTATGCCTTCTGTGGTGCAAATTCTGTATGCATTTATGATGGTAACTTTCCTATTTGTGAATGCCTAAGAGGGTATGTTCCTAAGTTTCCTGATGAGTGGAATATATCAATTTGGCACAATGGCTGTGTGCCAAGGAATAAATCTAACTGCACGAACATATACACAGATGGCTTCTTGAAATACAAGCACATGAAGTTGCCAGACACTTCTTCCTCATGGTTTGATGCAACCATGAACCTTGATGAATGTATGAAGTTGTGCATTAGAAACTGTTCTTGTACAGCATGTGCAAATTTAGATGTTCGTGACGAAGGAAGTGGTTGTCTGCTTTGGTTTAATGATCTGGTTGACATGAGGAATTTCTCTCAGTGGGGACAAGACTTTTACATCAGAGTCCCTGCTTCCGAATTAGATCATGCTGGCCATGGAAAAATCACCATAAAGATAGCAGCAATTACAGTTGGTGTGATTATTTTCGGATTAGTCACATGTGCATGCATAATTATAAGAAAAAATCCAGACGAAACCAAGAGGAAGTTGCTAGATTGGCGCATGAGATTCAACATTATCAGTGGCATTGCTCGAGGACTTCTCTATCTGCATCAAGATTCCAGACTAAGGATTATTCACAGAGATCTTAAAACTAGCAATATTTTACTAGACACAAATATGGATCCCAAAATAGCAGACTTTGGCTTGGCTCGATCATTTTTGGGAGATCAAGTTGAGGGAAAGACTCATAGGGTGGCTGGAACATATGGGTACATGCCTCCTGAGTATGCTGCACGTGGACATTTTTCAGTGAAATCAGATGTGTTTAGTTATGGTGTGATAGTACTAGAGATTGTAAGTGGGAAGAAAAACAGGGAATTTTCAGACCCAGAAAACAACAATAATCTTCTTGGCCATGCATGGAGATTATGGACTGAAGAGAGAGCACTCGAACTGCTTGATGAATTGATAGGAGAACAATGCCTAGAGTCTGAAGTCACTCGATGCATACAGGTCGGGCTATTGTGTGTGCAACAAAGACCAAACGTCAGACCAGACATGTCATCGGTGGTTCTAATGTTGAATGGTGAAAAATCATTACCAAAGCCAAAGGTTCCTGGCTTTTACACTGAATCAGATGTTACAACCGAAACAAATTCTTCATCAGAAAATCACACACTATGCTCAGTTAATGAGCTTTCCATCACAATGATAGATGCAAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_13888::LG3:39960993-39962993(+)
TTTTTGTTAATTTGATGCAAATAAATCATTTCCGTCAATTTCATCAAACGGCGTTAATGAATGTGTGACGTGGCCTTACACGTGTCAATACTGTCCTCAGGCCACGTCACACATTCATTAACGCCGTTTGATGAAATTGACGGAAATGATTTATTTGCATCAAATTAACAAAAATAAGGACCCAATTGAGACGCCAAAAAATAAAGGGACCTATTTAAATTCTGAACAAAAATAGGGACCTATTAAGACATTAAACCTATTTTATTTAATCAAACCACGTAATACGAAATAGGACATATAAGTTTATTTTAGTTTAATAACTTTATTCTTTAAAAAACATAACAATCGGCATCATGTAATATGAAAGAAAATATAAAAAAGTATTAATTTATTTTGTTAATATATTTTAAAAATATTTATCGATACCGTGAAAAGATCTGCTAATAGTTTTATAAATAAATAACTAGTAAGTAAAAGGGCAATTTTTTTTTTCTTTTTGGACGGATAGGTATACCATCGGTTCTCTCACACACACCATTGTAGTTTCCAATCATAACAGAGTATAGATTCTTTGCTTTGGTGCAGTTGTATTGTATCATCTTATTTCTTTGTTCTTTGGGTCATGGCATAATAACGTTTGAATTCAGTCCAATATTTTCATGATATTGCTTATTCACTTGAAAATGTTTAAATGAACTTTTTAAAAGTATTAAAAAAAATTAAGAATAAAATAAAATATATATAAAAAATAAAGTTAACTTGTATAAAAACCAAGAAAAGTCAAAGTCATTTTTAAGATGTTAATTTTCAAGTTGATTTGGACATGTATCGATTTGAAGGTGGTGACTGATTACGGAACATTTAAGTAAAAAATAATAGGTGAAACTGAGCTTTTTAATTTAAACGTGATTCAATGTATAATCTTCTTGATTCTATAAAATTGGAAATGTCATTATGAATCGGTCAAAACATGTGACTGACTTCAATTATTCAACCTTGCTATTAGTAGTACTAGGGACTCCTTTGGCATGATTTGGACTTCAAGCAACAAAGTTTAAAAACCCATTAAATTTATGGACTTTAGGCCGACTTTGGAATATCATCAAGCAATTAAGTCTCTGGTGGATTGCTTAAAAGTCCAACATGGATAACCGATTGTTATGTAACAGGAAATTTCGGAGAAAGAAATGCCTTTTTCATCTTCATTTTAAATATTGGAATAAATATTTTTTATCTCTAGTAGATATCTAATATACTTCTCAAAAAACCATTATTAATTGTTATTTCGAATTAATAAATTTAGTTAAAATGAACTTCAAATAATTATAAATTTATTTTAAAAATTTTAAACTTAATTTAATTTGATAAAATCAATCTGTAAATTGAGGTTTCTATCCTATATGCATATCTCTAACAAAAGAACCTTTTTTCACTAAGGATTTTCTGAACACACTCTTACTACTGATTAGGATCGACCGACCGGGCATGCTTAATCAATATCGAGGTGGGATCGACAGTCCAATCCGTCCGATCGGGTTTCTCCAGTCGTTGGCTGGAGACAGCATTTGAATGTTCATGAATGCGTAATTAATGAGGTAACGATCATTGTCGAGCAGTTAAGGTGAGTATATTCTCTTAAACCATATAAATAACAATAGATTGAGAAGATAGATTGAGAAGGTAAATTTTCTGTTTTGACTAATTTTCGATAGACTTGGGCAGATAAATTCTGACTTGCGCGTCGGAGTGTTTTCTGCATGTCACCTCACTTTGATATTGAGAGACTAAGAATCAGGAGGTAAGGCGGACGCGAGAATGACCGATCGGTGGAGAAGGAGCGTTTCCAAACAGTAAGAGCAGGAGTTTCCCTCAATCCCTTTGAGCAGAAACCCACACCAAAGCTAGCGTATACATTAATGGTAATTAAAATAGAGAGTGAGAGCGCAATCCCATTTGTGCTATCACAATGTTATCTATTTTGTTGTTCTTATTCTCGTACA


Gene Sequence:
>Vu_13888(+)
ATGTCTACGATTTCTTATTGTTCCTTAGACAGTTTAGCAGTGAGTGAATCCATCCAAGATATTAAGAACGAGACTTTGGTTTCAGCAGGTGGAATTACTGAACTGGGTTTCTTCAGTCCAGGAAATTCAGCAAGAAGATATTTGGGAATATGGTACCCAAATGTATCCCCTTTCACTGTGGTATGGGTGGCAAACCGAAATACACCTCTTGAGAATAATTCAGGAGTTCTCAAACTCAACCAAAAAGGGGTTCTTGAGCTATTCAATGGCACAAACAACATCATTTGGTCATCACCCAACAGATCAAGCAATACAGTGAATGATCCAATTACTCGTCTTTTGGATTCTGGAAATTTTGTAGTGAGAAATGGAGGGGAAACAAAGGAGGATAGCATCTTGTGGCAGAGTTTTGATTATCCGGGTGATACACAGATGCCAGAAATGAAGTTTGGATGGAACCTAGAGACTGGTGTGGAAAGATATATAGCATCTTGGAAAAGTGATGAGGATCCTGCAGAGGGAGAATATGTTATAAAAGTGGATCTTAGAGGATATCCTCAAATAATAAAGTTCAAGGGAACTGATATAAAAGCAAGAGCAGGGCCATGGAATGGCTTGTCTCTGGTTGGAAATCCTATTCCAGCTCGTGGTACGTCTGCAAAATTTGTGTTCAATGAAAAAGAGGTGTATTTTTGGTACAGTCTTAGTGATGAATTGGAATTCTTTGTGTACACACTGACCCCTTCAGGCACAGGACAAAGTTGGTTTTGGACAACTGAAACAAGGACGAGGCAAGTGGTCTCAAGTGGGGAGGAAGATCAATGCGAGAATTATGCCTTCTGTGGTGCAAATTCTGTATGCATTTATGATGGTAACTTTCCTATTTGTGAATGCCTAAGAGGGTATGTTCCTAAGTTTCCTGATGAGTGGAATATATCAATTTGGCACAATGGCTGTGTGCCAAGGAATAAATCTAACTGCACGAACATATACACAGATGGCTTCTTGAAATACAAGCACATGAAGTTGCCAGACACTTCTTCCTCATGGTTTGATGCAACCATGAACCTTGATGAATGTATGAAGTTGTGCATTAGAAACTGTTCTTGTACAGCATGTGCAAATTTAGATGTTCGTGACGAAGGAAGTGGTTGTCTGCTTTGGTTTAATGATCTGGTTGACATGAGGAATTTCTCTCAGTGGGGACAAGACTTTTACATCAGAGTCCCTGCTTCCGAATTAGGTATTGTGTTCAATTTCTTGTTGATTATTGCATTATTCTAAGAGCTGCAGTGGTTAAATTCAGTGACTTATTATGTTGTTTCTTTCAGATCATGCTGGCCATGGAAAAATCACCATAAAGATAGCAGCAATTACAGTTGGTGTGATTATTTTCGGATTAGTCACATGTGCATGCATAATTATAAGAAAAAATCCAGGTAAGTACGTAGATATAATTTACCATCAAATGTTATGTATTAGGAATAAAGAAAAGAAGAAAACATAATGTATGCATAGTACTTGTTAGTGTTTAACTATTGTTATTTTCTAACCATTCAGGGATAGCTAGAAAACTTTACAGCAAGCATAAGCAGAAAAAGGAAGACCTTGAATTTCCAACTTTCGATTTTCTGGTCATTGCTAATGCTACCCAAAACTTTTCAACCAAAAACAAGCTTGGTGAAGGTGGTTTTGGACCAGTATACAAGGTGACGAACAGAGACAGTTTCCAAACATTCTGTTTTTCTCAAGAACTTTCTAACTTTAGCAGATGATTTTTTCTATCAGGGCATACTGTTAGATGGACAAGAGTTAGCAGTGAAAAGACTCTCAGAGAATTCCGGACAAGGGTTAGAAGAGTTCAAAAATGAAGTTGCTTTGATTGCAAAACTTCAGCACCGTAATCTTGTAAAGCTCCTGGGCTGTTGCATTGAAGGAGAAGAAAAAATGCTAATTTATGAATACATGCCAAACAAAAGCTTGGACTTCTTTGTTTTTGGTTAGAATTCTCACAACTATATCAATCATCTGTGGCAATCTTCTTATTTCTTATTTGTGACTTAAGAATATAGGTACAACTATGCTAAATATGTGTAATGTTTTCCTAGACGAAACCAAGAGGAAGTTGCTAGATTGGCGCATGAGATTCAACATTATCAGTGGCATTGCTCGAGGACTTCTCTATCTGCATCAAGATTCCAGACTAAGGATTATTCACAGAGATCTTAAAACTAGCAATATTTTACTAGACACAAATATGGATCCCAAAATAGCAGACTTTGGCTTGGCTCGATCATTTTTGGGAGATCAAGTTGAGGGAAAGACTCATAGGGTGGCTGGAACATAGTAAGCTATTTTTTATCTGTTTGATATTTCTGTTTTCGTGTTTCAACAATTTACAGTGAAAACTTTGTTTTCAGTGGGTACATGCCTCCTGAGTATGCTGCACGTGGACATTTTTCAGTGAAATCAGATGTGTTTAGTTATGGTGTGATAGTACTAGAGATTGTAAGTGGGAAGAAAAACAGGGAATTTTCAGACCCAGAAAACAACAATAATCTTCTTGGCCATGTAAGCATTCTGATATAACTATGCTGATAATTAGTACAAAATTTAATAATCATCTGCATCACACTAATTTAATTCTCACCTTCTTAGGCATGGAGATTATGGACTGAAGAGAGAGCACTCGAACTGCTTGATGAATTGATAGGAGAACAATGCCTAGAGTCTGAAGTCACTCGATGCATACAGGTCGGGCTATTGTGTGTGCAACAAAGACCAAACGTCAGACCAGACATGTCATCGGTGGTTCTAATGTTGAATGGTGAAAAATCATTACCAAAGCCAAAGGTTCCTGGCTTTTACACTGAATCAGATGTTACAACCGAAACAAATTCTTCATCAGAAAATCACACACTATGCTCAGTTAATGAGCTTTCCATCACAATGATAGATGCAAGATAG