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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_13866 LG3 36909196 36914699 PREDICTED: protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 36912626 intron_variant
G/T 36912687 intron_variant
A/G 36913213 downstream_gene_variant
T/A 36913315 downstream_gene_variant
A/T 36913326 downstream_gene_variant
G/T 36913961 downstream_gene_variant
G/T 36914073 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_13866.1
MNVEAVDEGENSDRPASGNVETEKDEEQNMKVNLAEREVNNQDGDAYRKPLVGMLFESEDFAKSFYDAYARDVGFSTHVGQFSRAKPDGPIITWDFACSREVFKRKNIVSCNAMLRVERKDANWIVTKFVEDHNHSLASSRKVQNRQPSRHSVGAARNVIVTFDARNESCASLNGNHSEPISSYEISLEHSLEKEIEADYETICNTPVLRTPSPMEQQAANMYTNKIFAKFQEELVETFAYTASNVDNDGVISPLNIENLTIRFNSLCQEAIKLAEEGAISVETYNVAMNALREGAKRVGIMKKNIAKVKPRNTQGNGCCPEDNSKKSPSSISDVIPSLWPWQDSVSNHLNHSGLGLPVTDLNHPTMAPVSIHQDGGPPDNSVVLMCFKSMTWIIENKNSSQSSKIAVINMKLQDYGKSPIGETEVQFRVTRVTLEPMLRSMTYISQQLNAPVNRVAVINLRFYIIQLQDTKTTTGQTEVKFQVSRDTLGSMLRSMAYIREQL*


CDS Sequence:
>Vu_13866.1
ATGAACGTTGAGGCAGTAGATGAAGGGGAAAACAGTGATAGACCTGCTTCTGGAAATGTTGAAACTGAAAAAGATGAGGAACAAAATATGAAAGTAAACTTGGCTGAAAGAGAAGTAAATAACCAAGATGGTGATGCTTATAGGAAGCCACTTGTGGGCATGCTGTTTGAATCTGAAGATTTTGCAAAATCATTTTATGATGCATATGCAAGAGATGTAGGATTTAGCACACATGTTGGTCAATTCAGCCGTGCTAAGCCTGATGGTCCAATTATAACTTGGGACTTTGCTTGTTCCAGAGAGGTATTTAAAAGGAAGAACATAGTAAGTTGCAATGCAATGCTTAGGGTAGAGAGAAAAGATGCAAACTGGATAGTGACAAAATTTGTTGAGGACCATAACCATTCCCTTGCTTCCTCTAGAAAGGTGCAGAACCGTCAACCCAGTAGACATTCTGTAGGTGCTGCTAGGAATGTTATAGTGACATTTGATGCCCGTAATGAGTCTTGTGCTTCCTTGAATGGAAATCATTCAGAGCCCATTAGTTCTTATGAAATATCACTTGAACATTCATTGGAAAAAGAAATAGAAGCAGATTATGAGACTATTTGTAACACGCCTGTACTGAGGACTCCATCACCAATGGAACAACAGGCAGCAAATATGTACACTAACAAGATTTTTGCAAAGTTTCAGGAGGAACTGGTGGAAACTTTTGCATATACTGCAAGTAATGTTGACAATGATGGTGTTATCAGTCCACTTAACATTGAAAATCTCACTATACGTTTTAATAGTTTATGTCAAGAAGCCATTAAGCTTGCTGAAGAAGGGGCAATTTCCGTTGAGACTTATAATGTAGCAATGAATGCTTTGAGAGAGGGTGCTAAAAGGGTAGGTATTATGAAGAAAAATATTGCAAAAGTCAAACCTAGAAACACTCAGGGTAATGGATGCTGTCCAGAAGACAATAGCAAGAAGAGCCCGTCATCAATTTCGGATGTCATCCCATCACTGTGGCCTTGGCAAGATTCAGTGTCAAATCACTTGAATCATAGTGGCCTTGGGCTTCCTGTTACTGATCTGAATCATCCTACTATGGCTCCTGTTTCTATTCACCAGGATGGTGGCCCTCCAGATAACTCTGTTGTCCTCATGTGTTTCAAGTCTATGACTTGGATCATCGAAAATAAGAATTCAAGCCAATCTAGTAAAATTGCAGTCATCAACATGAAGCTGCAAGATTATGGTAAGAGCCCTATAGGAGAGACAGAAGTGCAATTCAGGGTGACAAGGGTAACTTTGGAGCCTATGTTGAGATCAATGACTTACATTAGTCAACAGTTAAATGCACCAGTCAATAGAGTTGCTGTCATCAATCTGAGGTTCTACATCATCCAGCTCCAGGATACGAAGACAACTACTGGGCAAACTGAGGTGAAATTCCAAGTTTCTAGAGATACTCTCGGCTCCATGCTGAGATCTATGGCCTACATCCGGGAGCAGCTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_13866::LG3:36907196-36909196(+)
TTTCTACCTCAAAATATAAAATATTCCAAATATTATTTTCACTCCATATATATCAATTTATACATGTTATTAGCATTTTAAATATGTTTTTAATGACGGAGACTAAATTCAATCATATATTGAAGTAATCTATGTTTTAAGGAATATTGTTATGAATCTTATATTAGAATAATTAAATTTTTTTCAAATGTAGTTATAAGTTAATTTGTAAAAGTGATTTCAGAATATAATTACTAATAATACAAACTATTTTTAACTTATAAAAATAATTTACTTATTTTTTATAAAATAATTTTTTTCTTATTTTACTGAATGTTCTTTCAGAATTTCCTATTCTATAATATCTATATTTATATAAATAAATACAGATAAATGTTGGTGAGTTAAAGACTTCATTCACTTTATTCATATAAATAATAATATCTAGTATGATTTAAAATTTAAAAAAAATGGGAAAATTTGAGTATGATGTGTGAAAGTACAATGAGATTTGGAATTACAAATTTTTGTTTCTTGTTTTTGGACACTCCCACTCTTCCACGGTGTGACTCAAGCTCTTCTTCCTCTCCTCAAAATCGCTAATATCCAACGACAAGGGTTTGTGGACATAAAACGCTGCGTTTTCATTTCATTCACAATCTCCGGCTCAAACCAGTTTCTTCTTTTGGTCCTCAGGTGAGTGAATTCTGCTTTCTTGTTCATTTACAGCATATAATGCGAACAAGTTTGGATTTTTAAATGAATTTATTTATCTATTTTTATGGTAGTGGAAGTTATTGTATTTGTTGGAGATGATGTATTCTCAATGTGTAGTTTTTTTTTTCTGAAGAAAGAGAGAAAACATGTTATTGAATTAAATGGTTTATGTAAAAAATTTGAAGCAAAATTGAGTAGGTGGTCAGGTAAATTATTCTTATCATATGTGGGAGTATTTACTTTGCACATTTTTAATTTTAATGTGATTCAATGGTCGTCTGAGGTGAGGAAAAAAGGTTATTGGATTGAAGAGTTTGGTGCATTTTTTTTTGGAACAATAATGGATAGGTGTTCTAAAAACTATCTCTAATCATAGGATTAAGTATTTCCTTGCAAATTTAGGTTTTTATTTTATGTGATTTATATTTCTTTAGACCAGGCAAAGGTAGTGCAGCTTATTTTCTAGCCCAATTTCAACACTGTAGCAGATAGTCCCTCATGGTTTAATAAAATTACTGTCATGGAAAATTTCCAAAGGATCTCGCAGTTGTTAATTTAAGCTTCAATAATCCTACAGGAACTTTTTTTCTGGCTTTATGTTGTGATTTTTTTAAATTTGGTTTAAAACTTTCGTTTGCTAAACTTTTATATTATTGTATTCTTTAATATTCAACATCTCAACTTGATGCCTGTTCTTTATATAGAATAAGTTTACATTTGTAGAAACCTCTAACATTAAAATGTGACTTATTTTAAGTGCTTTTATCTTTTCACATGAAAATTAAATTTAGTTTCATTTTATACCAATTTCAATTTGATTCTCCTTGAAAAATAATTCCCTAGTTTCAATTAAGGGTTTTCTGAACACAGATATAATTTTTCTCCAAAGTTAATCAAAATTGGGATGTTATGGTTCTTAGACCGAAACTCACAATTTTATTTTTAAATTAAATCACCCAATCTGTCTAAAACCTTGCTTTCTGGGTTAGAATAAACTAGCATTATTATGCAGTAGGATCTTTAATATCTCTAATTGGTTGTCAGTATTGTTCATATGAACTTTTTAAACTTTTGGACATTCCTTAAACCTTCTGGGTTATATAATTTGAAAATTACTTCCTAAGTGCATAATTTGTATATATTCTATGAACTCTTGCTGACTGGTGTTTTTATTCAATGCATTATGTAGGTAGAGATAATGGCGGAAATTTCCATCATTGCTTCTAAAGGATTAGCACAAGTCATGTTTTCCAGTCCTTTCAAGGAAAACCAATGAATCCTTTGTATCATTTGCTAAGCTATCA


Gene Sequence:
>Vu_13866(+)
ATGAACGTTGAGGCAGTAGATGAAGGGGAAAACAGTGATAGACCTGCTTCTGGAAATGTTGAAACTGAAAAAGATGAGGAACAAAATATGAAAGTAAACTTGGCTGAAAGAGAAGTAAATAACCAAGATGGTGATGCTTATAGGAAGCCACTTGTGGGCATGCTGTTTGAATCTGAAGATTTTGCAAAATCATTTTATGATGCATATGCAAGAGATGTAGGATTTAGCACACATGTTGGTCAATTCAGCCGTGCTAAGCCTGATGGTCCAATTATAACTTGGGACTTTGCTTGTTCCAGAGAGGTATTTAAAAGGAAGAACATAGTAAGTTGCAATGCAATGCTTAGGGTAGAGAGAAAAGATGCAAACTGGATAGTGACAAAATTTGTTGAGGACCATAACCATTCCCTTGCTTCCTCTAGAAAGGTGCAGAACCGTCAACCCAGTAGACATTCTGTAGGTGCTGCTAGGAATGTTATAGTGACATTTGATGCCCGTAATGAGTCTTGTGCTTCCTTGAATGGAAATCATTCAGAGCCCATTAGTTCTGTTAGGAACTCTTTTCCAGCAGAACAATGTCATCCAATGAGAAACATTGGCTCACTTACCTATGCAAGATCTTCTCAAAAGAGGACCCTTGGAAGAGATGCTCAAAATCTTCTGAATTATTTTAAGAAGATGCAGGGTGAAAACCCTGGCTTCTATTATGCAATACAACTAGATGATGAAAACCGTATGACCAATGCATTCTGGGCGGATGCAAGGTCAAGAACAGCTTATAATTACTTTGGTGATGCTGTAATCTTTGACACGATGTATAGACCAAATCAATACCAAATCCCATTTGCTCCATTTACCGGATTCAATCACCACGGCCAAATGGTTTTATTTGGTTGTTCATTACTTCTAGACGAATCGGAGTCTTCCTTTACATGGCTATTCAAGACGTGGCTATCTGCTATGAATGATCGACCACCTGTTTCCATAACCACAGACCAAGATAGAGCCATACAAGCAGCAGTTTCTCACGTGTTCCCGGAAACTCGCCACTGTATTTGTAAGTGGCACATTTTAAGAGAAGGTCAAGAAAGATTGGCTCATATTTACCTTGCTCATCCTTCACTCTATGGAGATCTATATGGCTGTATCAATTTTTCTGAGACTACTGAGGATTTTGAATCAACATGGAAGTCTCTTCTGGATAAATATGATCTCCAGAAAAATGATTGGCTTCAGGCAGTATATAATGCTCGTAAACAATGGGCCCCTGTTTACTTTCGTGATACTTTCTTTGCTGCTATTACTTCAAACCACGGGGTAAACTCCTTTTTTGATGGCTATGTAAATCAACAGACAACCATACCTTTATTCTTTAGGCAGTATGAAATATCACTTGAACATTCATTGGAAAAAGAAATAGAAGCAGATTATGAGACTATTTGTAACACGCCTGTACTGAGGACTCCATCACCAATGGAACAACAGGCAGCAAATATGTACACTAACAAGATTTTTGCAAAGTTTCAGGAGGAACTGGTGGAAACTTTTGCATATACTGCAAGTAATGTTGACAATGATGGTGTTATCAGTAAATACAGGGTTGCAAAATATGAACATGATCACAAGGCATACATGGTCACATTAAATATGTCTGAAATGAAGGCAAACTGCAGCTGTCAGATGTTTGAATACTCTGGCATTCTTTGTCGACATGTATTGACTGTTTTCACTGTAACAAATGTCCTTACCCTTCCATCACACTACATTTTAAAGCGATGGACAAGGAATGCAAAATCTGGTTTTGGAACTGATGAAAAAACAACAGGTCCACTTAACATTGAAAATCTCACTATACGTTTTAATAGTTTATGTCAAGAAGCCATTAAGCTTGCTGAAGAAGGGGCAATTTCCGTTGAGACTTATAATGTAGCAATGAATGCTTTGAGAGAGGGTGCTAAAAGGGTAGGTATTATGAAGAAAAATATTGCAAAAGTCAAACCTAGAAACACTCAGGGTAATGGATGCTGTCCAGAAGACAATAGCAAGAAGAGCCCGTCATCAATTTCGGATGTCATCCCATCACTGTGGCCTTGGCAAGATTCAGTGTCAAATCACTTGAATCATAGTGGCCTTGGGCTTCCTGTTACTGATCTGAATCATCCTACTATGGCTCCTGTTTCTATTCACCAGGATGGTGGCCCTCCAGATAACTCTGTATTGATTGGAATCACCCTTGTATTTATTAGTCGTTTCATCTACTTAAGCTGATTACTTCTTTACTTGACTGTTACTTATCTATGCAGGTTGTCCTCATGTGTTTCAAGTCTATGACTTGGATCATCGAAAATAAGAATTCAAGCCAATCTAGTAAAATTGCAGTCATCAACATGAAGGTATGTATAACCTATGTTCTCTTTACAATTATCATTTTTTAACCGAGAAACAGATATCTCAATATCTCGTGTCTCGTACTTTGATTAATTTAATGTGGTTTCAATATTCTCTGTAGTTGTAAGAAATCAGCTGCTTCCAGATGTCTATCTAACACTCATGCTCTCTGTTTAAAATATTAAAAATCTAGGTTATTTCACTTATCATATTGTTTTCCATGTGTAGATAACAGGTACAACGTGCTGAAATATTCTTTCCTCCCTGTTAATTTATTTTTCCCTTCCTCTTGTAGCTGCAAGATTATGGTAAGAGCCCTATAGGAGAGACAGAAGTGCAATTCAGGGTGACAAGGGTAACTTTGGAGCCTATGTTGAGATCAATGACTTACATTAGTCAACAGTTAAATGCACCAGTCAATAGAGTTGCTGTCATCAATCTGAGGGTATGTAAACTCAGATCATAATCATATACTCTGACTAGATCCTAAGCATTTCACAATCAAGTATAATCTTTTTGTCAATGTACTTATCCACATCAAATGCTCCCATTTCATATAAATGAAACCTCCAAATATGAGGATTACAATCTTTAAAGTTTGAGAAGTTCCACTGTGATCACACTAATAGTATGCTGAAGTATTTATTACTGAACTGTTTAACCCTTCAACAGAAATTCTTTACCACTATTTGGCATAACCATCTATTTAGAATGTGTTACTGTCAAAAGATGTTATGTAAAAGACTAACCACCATAAACACTTGAATTTGTAGGATCTAGACCAATGAATTTTTGTTAGGAAGTTACGTGTATATGAGAGGAGAAAGAGAAGTAAGTAGAAGTTAGAAGTTACGTGTATATGAGAGGAGAAAGAGAAGTAAGTAGAAGTTAGTTAGCCTAACTGCAATAACAGTTAGGAAAGGCGGGATGTGTAGTATAAGAGAGGGAATAATTGATTAGAGAGGGGGTGGTTGTTTTGTGAAGTTGTACAGGAAGCGTGAAGCCTGTAGGGGGAGGTTAAGCTCTCTAACTGTATCCCGAACTTGGATTCGTGCTTGTGAATAATACAACGAGAGTTATACAGTAATTTCGGATGTGTTGAGGGTGCGTTTACCTTAGGTTCTTGAATTAGGAACCTAACAATTTTTTTATTTTTGTAACGTGTGCTCTTGTACAAAAGCCTTTTAAACGTTGGCAACTTTAAGACTCATGTACTTAGTGTTGATAATATAGCTTAATAAGAGGAAGGAAGACAACAATAATTTGATAAACACCCAAGCACCTGGGGAATCCACTCTCAAAAGCTAGTTATTAAAGAGAAAGAACCACACACTTAAATACTCCACCAAACATCATATACTACTTGAAGTGGAAATCAGGCACGCCATAATACCCAAGTTCTTATCATAACATCGCTCATTAGAGTTAATGTCGTTATTAGAATCCCGCTATCATTTGGTTTAAATGTGTTATGGCTTATGTACAATGTTAAGCCTTTTATTCTACAAAATCTGGGACGCAAACATTGTAATAAGAACTAACTAGCTTATGTATATTGCTAGATAAAGAAACCAATCACGAACTTTGACCTAATAGCTTAAACCCTTAGAGTAGCTGTTTCTTTATATCATATAAGAGCCATTGTTTTGGCCTGGACAAATATTGGGGAAACAGCAGTATGAGTAGGTGTTATAGTCCAGTGATGAGCAGTGAGATGGTGGAAGACATGGCTTGGTTTGGTTAATAGTTGTAATAAGTTGGAAAGTACATGAAAAAGGTGGGCCAAGTCTTTTTGGCAATTGGGTTCCCCAAATCTCAACAAGTGGTATTAGAGATTTTATGATTAATTTATTAAGAGTTCAATCTTTGTCACTCCCGTTCTTAAGTTGAATATTTGCACATGGTGGAGCTGGTCTTTGTATTGAACATGCTACAAGTCCAGTGGTTTTTTGTGGGAACGTGTTAGATGTAAATTCAATCACAAACCATTTGTTAGCTTAAGCTGTTTGGAGAGTTGGTCCATGATATGTACAGCGTCTATCATATTCAGAAGCACATTGAGAGAACAGTTGATGTCGATATGACAAGGAGGAGGTCAGTTGCGTGGTCTCTAGAAGTGAATGCTCCTAAACAAAAGTATTTGTGAATCATTGGGTTTAATGCTTTAGAGAATTTGTAAAATTTAATCAAACTGGATGTTGAAGTCTCCGTATTATATGGAACTGAAGTAGATTCTGTAGCATATTTAATGTTCCATAATGGTACAAAATATACTAATAAGTCCAATTTTGATATTAGAAGTTCAAATAACTTGTATGGTGGATAATTAATAAATTTATTAATTTTCATTTTGTCTTAAAGGATATGGGTGTAGGACGGGAGCTTTTGGATTACTAGTTTATTTGTAACTAGTTATAAGACTATATTAATCCAGACAATCTGATAGCTACATGGTTATTTTCCTTTCTATTGGATATTTATCTGAATTGGGAACATCCAGCAGTTAATTCCGGAGAATATGATATCGTCAAATGCAAAATAAAATGTTTTCTTTTACCATGACACAAGTTTGAATCCCGGAATCGTTTCTGGTGGGAGAACTTTACCTAACTACCACCCCTTGAGTTGCATGAACAATTGTTTTTACGCAACTTCTACTAAAATCTAACTTTCGATTATAGAATTCACCATGTTAGTGATTTTAGATAGTCCAGCAGTATTTACATTATTTTAGACTTGATATTGACCCCGTTATTTTTATTATTTTAGATGGTGAACTTTAAGCTTTTCAACTTTACAAAATCTATTGAGATTTGCACCCATTTATACTATAATTTGACCATATATGTAGTCAATATGAGATCTCCAATAGATTCCATATTTCTTCTACAGACATGATTAAGTATGCAACATTATGCAGTGTAAGAAAAAAGTTTCGTTGTGTTCTAGAACATTGTGTTGTGTCCAACATATTTTGTCTAATTTTATAGTTCTACATCATCCAGCTCCAGGATACGAAGACAACTACTGGGCAAACTGAGGTGAAATTCCAAGTTTCTAGAGATACTCTCGGCTCCATGCTGAGATCTATGGCCTACATCCGGGAGCAGCTCTAG

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